MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis serovar finitimus YBT-020 chromosome

Total Repeats: 2485

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017200	AAAGGC	2	12	1268	1279	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384177911
2	NC_017200	CTATTA	2	12	1855	1866	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_017200	TCTTTG	2	12	3656	3667	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384177914
4	NC_017200	TGAAGA	2	12	8083	8094	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384177916
5	NC_017200	ATTCTT	2	12	8431	8442	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384177916
6	NC_017200	TTTCGT	2	12	10906	10917	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_017200	CATTTG	2	12	14818	14829	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384177917
8	NC_017200	GGCAAT	2	12	17419	17430	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384177919
9	NC_017200	GAACTG	2	12	17749	17760	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384177919
10	NC_017200	CAGGAA	2	12	18977	18988	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384177920
11	NC_017200	GACAGG	2	12	20958	20969	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384177922
12	NC_017200	TTTCGT	2	12	30682	30693	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017200	ATGCAC	2	12	35092	35103	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384177935
14	NC_017200	TGTAGA	2	12	37924	37935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384177938
15	NC_017200	GAAAAT	2	12	38590	38601	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384177939
16	NC_017200	TTGAAA	2	12	40087	40098	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384177942
17	NC_017200	GCACGT	2	12	52473	52484	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384177955
18	NC_017200	ATTAAC	2	12	56866	56877	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384177959
19	NC_017200	TATTGA	2	12	66467	66478	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384177968
20	NC_017200	CAGGTA	2	12	70236	70247	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384177971
21	NC_017200	CTGGTG	2	12	74074	74085	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384177974
22	NC_017200	CTTTTT	2	12	74488	74499	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_017200	AGCGGG	2	12	75954	75965	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384177975
24	NC_017200	GTATCT	2	12	79276	79287	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384177981
25	NC_017200	AGCGGT	2	12	79913	79924	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384177982
26	NC_017200	GATGTT	2	12	82163	82174	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017200	TTATAT	2	12	82183	82194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017200	TATATT	2	12	82278	82289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017200	AGTCAA	2	12	93156	93167	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_017200	TTTAAT	2	12	100890	100901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384177990
31	NC_017200	GAAAAA	2	12	101043	101054	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384177990
32	NC_017200	GCAGTA	2	12	103685	103696	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384177993
33	NC_017200	GAACAA	2	12	104159	104170	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384177993
34	NC_017200	TGACAT	2	12	109475	109486	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_017200	GTAGAA	2	12	110164	110175	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384178002
36	NC_017200	TCTGGT	2	12	110994	111005	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384178003
37	NC_017200	GAAGCT	2	12	111594	111605	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384178004
38	NC_017200	GCAAGA	2	12	123109	123120	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384178013
39	NC_017200	AGTAGA	2	12	123214	123225	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384178013
40	NC_017200	AGCATT	2	12	123874	123885	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384178013
41	NC_017200	AGCGTG	2	12	123987	123998	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384178013
42	NC_017200	ATTCGA	2	12	124507	124518	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384178013
43	NC_017200	AAGTTG	2	12	124761	124772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384178013
44	NC_017200	GCTAAA	2	12	125147	125158	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384178014
45	NC_017200	GAAACT	2	12	125354	125365	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384178014
46	NC_017200	CAAGCT	2	12	125948	125959	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384178014
47	NC_017200	AACTGA	2	12	127194	127205	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384178017
48	NC_017200	TAAAGG	2	12	127416	127427	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384178017
49	NC_017200	GAAATC	2	12	128620	128631	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384178019
50	NC_017200	ACAAGC	2	12	130969	130980	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384178024
51	NC_017200	TTGAAG	2	12	134148	134159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384178032
52	NC_017200	AAAGGT	2	12	134258	134269	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384178032
53	NC_017200	TAGTTG	2	12	134845	134856	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384178034
54	NC_017200	CTGAAA	2	12	137388	137399	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384178038
55	NC_017200	TAAACA	2	12	139075	139086	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384178041
56	NC_017200	TTAGGT	2	12	140996	141007	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384178044
57	NC_017200	ATTTTT	2	12	143348	143359	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384178048
58	NC_017200	ATATCC	2	12	144415	144426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384178049
59	NC_017200	TGCAAT	2	12	147451	147462	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384178054
60	NC_017200	TACAAG	2	12	148973	148984	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384178055
61	NC_017200	TTAGAT	2	12	159043	159054	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384178060
62	NC_017200	CCTGAA	2	12	161677	161688	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384178062
63	NC_017200	GAAAAG	3	18	161704	161721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384178062
64	NC_017200	ATAAAG	2	12	161741	161752	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384178062
65	NC_017200	GATGGT	2	12	162530	162541	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384178063
66	NC_017200	CGCATC	2	12	163894	163905	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384178065
67	NC_017200	ATTGTA	2	12	164274	164285	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384178065
68	NC_017200	AAAAGA	2	12	165565	165576	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384178066
69	NC_017200	AATACA	2	12	170539	170550	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_017200	GTATGT	2	12	184143	184154	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017200	CAAAGA	2	12	185537	185548	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384178085
72	NC_017200	AGTGGA	2	12	189648	189659	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384178088
73	NC_017200	TATGTT	2	12	189983	189994	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017200	CGGTAT	2	12	190844	190855	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384178089
75	NC_017200	CCATCT	2	12	192095	192106	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	384178091
76	NC_017200	ATTTTG	2	12	192918	192929	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384178092
77	NC_017200	CAAATT	2	12	196158	196169	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384178095
78	NC_017200	GTGGTT	2	12	202034	202045	0 %	50 %	50 %	0 %	384178102
79	NC_017200	GTGGTT	2	12	204061	204072	0 %	50 %	50 %	0 %	384178103
80	NC_017200	AAGTTA	2	12	205727	205738	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384178104
81	NC_017200	TCTGGA	2	12	205739	205750	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384178104
82	NC_017200	TTCTTT	2	12	210709	210720	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384178110
83	NC_017200	TAAATA	2	12	210945	210956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017200	TATGAA	2	12	218975	218986	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384178125
85	NC_017200	AAAATA	2	12	219196	219207	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017200	AAGGGG	2	12	219280	219291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017200	CGCTTG	2	12	222718	222729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384178129
88	NC_017200	AGAGGT	2	12	224501	224512	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384178130
89	NC_017200	TAGTGA	2	12	230267	230278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384178136
90	NC_017200	TTACGT	2	12	232935	232946	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384178138
91	NC_017200	ATTGAA	2	12	233925	233936	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384178139
92	NC_017200	GAAAGA	2	12	238735	238746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384178144
93	NC_017200	GAGAAT	2	12	239796	239807	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384178145
94	NC_017200	CAACGT	2	12	239950	239961	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384178145
95	NC_017200	AAAAGA	2	12	240437	240448	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384178145
96	NC_017200	TTTCAT	2	12	244428	244439	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_017200	GCTGTT	2	12	247947	247958	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384178158
98	NC_017200	AGACGA	2	12	248168	248179	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384178158
99	NC_017200	TGAAAA	2	12	253956	253967	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384178162
100	NC_017200	AAGGTC	2	12	254291	254302	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384178162
101	NC_017200	ATAAAG	2	12	254938	254949	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384178163
102	NC_017200	GTTTCC	2	12	256843	256854	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384178166
103	NC_017200	AAAACA	2	12	256971	256982	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	384178166
104	NC_017200	GTAGAC	2	12	263074	263085	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384178172
105	NC_017200	AGCTGA	2	12	272354	272365	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384178176
106	NC_017200	TAATTG	2	12	275828	275839	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384178179
107	NC_017200	GGATAT	2	12	276594	276605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384178180
108	NC_017200	GGCATG	2	12	280331	280342	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384178184
109	NC_017200	CCCATT	2	12	286900	286911	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	384178190
110	NC_017200	TTATAT	2	12	304925	304936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384178197
111	NC_017200	GTATTT	2	12	315869	315880	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384178201
112	NC_017200	AGAAGT	2	12	316827	316838	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017200	TGTACG	2	12	335857	335868	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384178210
114	NC_017200	ACAAAT	2	12	336620	336631	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384178210
115	NC_017200	TTATGA	2	12	338094	338105	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384178211
116	NC_017200	ATATTG	2	12	340249	340260	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384178214
117	NC_017200	GATGCA	2	12	340641	340652	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384178214
118	NC_017200	ATTGAT	2	12	341671	341682	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384178215
119	NC_017200	TAAAAT	2	12	343815	343826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384178217
120	NC_017200	GCAGGC	2	12	345589	345600	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384178220
121	NC_017200	CAGAAG	2	12	345743	345754	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384178220
122	NC_017200	ACAACT	2	12	347515	347526	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384178220
123	NC_017200	AGGTGA	2	12	347655	347666	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384178220
124	NC_017200	CAAATC	2	12	348515	348526	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384178221
125	NC_017200	TTGCAA	2	12	353315	353326	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384178224
126	NC_017200	AAACAA	2	12	353868	353879	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	384178225
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128	NC_017200	AATTAA	2	12	357028	357039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384178229
129	NC_017200	AAAGAT	2	12	357566	357577	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384178229
130	NC_017200	ATTTTT	2	12	358555	358566	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384178230
131	NC_017200	TATAAA	2	12	361898	361909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017200	GCGAAA	2	12	362978	362989	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384178237
133	NC_017200	ATTGAA	2	12	364606	364617	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384178238
134	NC_017200	ATTAAC	2	12	365241	365252	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384178238
135	NC_017200	GTAGAC	2	12	368295	368306	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384178241
136	NC_017200	AATGAC	2	12	370729	370740	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384178243
137	NC_017200	AGAATT	2	12	378587	378598	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384178249
138	NC_017200	AAAATC	2	12	379323	379334	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384178250
139	NC_017200	TATCGA	2	12	379952	379963	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384178250
140	NC_017200	ACCAGC	2	12	388566	388577	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384178257
141	NC_017200	AAAAAT	2	12	391943	391954	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017200	AATAGA	2	12	392189	392200	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017200	AAATTA	2	12	392400	392411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384178260
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145	NC_017200	AAAATC	2	12	396992	397003	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384178264
146	NC_017200	AATGAA	2	12	399295	399306	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384178269
147	NC_017200	TAAAAT	2	12	399732	399743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017200	AAAAAG	7	42	400957	400998	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384178273
149	NC_017200	GAAGGA	2	12	404912	404923	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017200	TAAAAA	2	12	407536	407547	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017200	CTTTTT	2	12	408592	408603	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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155	NC_017200	AAAAAG	2	12	411279	411290	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384178301
156	NC_017200	CTGGAT	2	12	412318	412329	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384178302
157	NC_017200	GATATG	2	12	412825	412836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384178302
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166	NC_017200	ATAATG	2	12	430434	430445	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384178321
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170	NC_017200	TATAGA	2	12	445207	445218	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
171	NC_017200	AGATAT	2	12	445480	445491	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384178334
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181	NC_017200	AATCTA	2	12	467927	467938	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384178357
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189	NC_017200	TGGAAT	2	12	479745	479756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384178372
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199	NC_017200	AGCTGA	2	12	518342	518353	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
200	NC_017200	GGAAAA	2	12	518667	518678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384178399
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216	NC_017200	AGTCTA	2	12	550016	550027	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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219	NC_017200	GAATTA	2	12	555724	555735	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384178439
220	NC_017200	CCAATT	2	12	555782	555793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
221	NC_017200	ATGACA	2	12	557101	557112	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384178440
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223	NC_017200	TTTCTT	2	12	562474	562485	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384178446
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226	NC_017200	GGAAGA	2	12	568439	568450	50 %	0 %	50 %	0 %	384178452
227	NC_017200	GCAAGT	2	12	569746	569757	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384178454
228	NC_017200	TGAAGA	2	12	571508	571519	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384178455
229	NC_017200	TTTTCT	2	12	571891	571902	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
230	NC_017200	CAAAAA	2	12	572257	572268	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	384178456
231	NC_017200	ATTTAT	2	12	572999	573010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384178456
232	NC_017200	GCGATG	2	12	574579	574590	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384178459
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234	NC_017200	CCAGGA	2	12	576371	576382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384178460
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236	NC_017200	ATGGAG	2	12	577460	577471	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384178461
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238	NC_017200	ATTTAA	2	12	580282	580293	50 %	50 %	0 %	0 %	384178463
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252	NC_017200	TACATT	2	12	638955	638966	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384178510
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465	NC_017200	AAAATA	2	12	1033486	1033497	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384178882
466	NC_017200	CAAATC	2	12	1037652	1037663	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384178884
467	NC_017200	TATCAA	2	12	1039818	1039829	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384178885
468	NC_017200	GAAATG	2	12	1042001	1042012	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384178887
469	NC_017200	ATAAAC	2	12	1048279	1048290	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384178892
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472	NC_017200	ACCATC	2	12	1057586	1057597	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384178901
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