MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar finitimus YBT-020 chromosome

Total Repeats: 344

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017200	CTATTA	2	12	1855	1866	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_017200	TTTCGT	2	12	10906	10917	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_017200	TTTCGT	2	12	30682	30693	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_017200	CTTTTT	2	12	74488	74499	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_017200	GATGTT	2	12	82163	82174	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017200	TTATAT	2	12	82183	82194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017200	TATATT	2	12	82278	82289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017200	AGTCAA	2	12	93156	93167	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_017200	TGACAT	2	12	109475	109486	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_017200	AATACA	2	12	170539	170550	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_017200	GTATGT	2	12	184143	184154	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017200	TATGTT	2	12	189983	189994	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017200	TAAATA	2	12	210945	210956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017200	AAAATA	2	12	219196	219207	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017200	AAGGGG	2	12	219280	219291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017200	TTTCAT	2	12	244428	244439	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_017200	AGAAGT	2	12	316827	316838	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017200	TATAAA	2	12	361898	361909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017200	AAAAAT	2	12	391943	391954	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017200	AATAGA	2	12	392189	392200	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017200	TAAAAT	2	12	399732	399743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017200	GAAGGA	2	12	404912	404923	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017200	TAAAAA	2	12	407536	407547	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017200	CTTTTT	2	12	408592	408603	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_017200	TTGAAA	2	12	429307	429318	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017200	ATTTGA	2	12	434092	434103	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017200	TATAGA	2	12	445207	445218	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017200	AATGAT	2	12	463429	463440	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017200	TTTGCA	2	12	507924	507935	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_017200	TTTATA	2	12	515888	515899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017200	AGCTGA	2	12	518342	518353	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_017200	AAAAAT	2	12	523487	523498	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017200	ATTTTT	2	12	549935	549946	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017200	AGTCTA	2	12	550016	550027	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_017200	CCAATT	2	12	555782	555793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017200	TTTTCT	2	12	571891	571902	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_017200	ATCATT	2	12	627765	627776	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_017200	TAGAAA	2	12	777697	777708	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017200	ACTTAA	2	12	797545	797556	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017200	TTTTTA	2	12	811109	811120	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017200	AGTTTA	2	12	820506	820517	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017200	TTAAAA	2	12	820880	820891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017200	ATCAAT	2	12	876420	876431	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_017200	GTATAT	2	12	885280	885291	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017200	ATGTAA	2	12	908464	908475	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017200	AAATGT	2	12	954426	954437	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017200	GTTTTT	2	12	960030	960041	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017200	TTCGCT	2	12	960875	960886	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017200	GTATAT	2	12	970974	970985	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017200	AAGTAG	2	12	986355	986366	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017200	TGTACA	2	12	995840	995851	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_017200	ATATTT	2	12	1011411	1011422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017200	GTTTTG	2	12	1018654	1018665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017200	TGATGG	2	12	1064571	1064582	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017200	CTTTTT	2	12	1081052	1081063	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_017200	TAAAAA	2	12	1101174	1101185	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017200	CATTTT	2	12	1113219	1113230	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_017200	TCCAAT	2	12	1123922	1123933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017200	GAATTT	2	12	1129721	1129732	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017200	AGGACT	2	12	1131688	1131699	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_017200	ATGTAA	2	12	1132270	1132281	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017200	AATTAA	2	12	1162743	1162754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017200	CTTTTT	2	12	1164023	1164034	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_017200	TCTTTT	2	12	1167618	1167629	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_017200	AAATTT	2	12	1183272	1183283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017200	TGATTC	2	12	1196198	1196209	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_017200	TAATTT	2	12	1199133	1199144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017200	ATAATC	2	12	1233696	1233707	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_017200	CCTTTT	2	12	1235534	1235545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017200	TAATAT	2	12	1242421	1242432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017200	TCCATT	2	12	1243715	1243726	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017200	AATAAA	2	12	1256459	1256470	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017200	AAATTG	2	12	1267832	1267843	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017200	TTTATT	2	12	1273776	1273787	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017200	CTTTTT	2	12	1310821	1310832	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_017200	TCCAGC	2	12	1321827	1321838	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017200	CCGCTT	2	12	1321928	1321939	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017200	AATATA	2	12	1331555	1331566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017200	AAGTAT	2	12	1361133	1361144	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017200	GGAGAG	2	12	1409267	1409278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017200	AAATTT	2	12	1417650	1417661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017200	AAAAAG	2	12	1441313	1441324	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017200	TAGAAA	2	12	1443804	1443815	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017200	GGATAA	2	12	1465686	1465697	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017200	AATGAA	2	12	1476628	1476639	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017200	AAAAGT	2	12	1477619	1477630	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017200	TGCTCA	2	12	1480595	1480606	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017200	TATATT	2	12	1485516	1485527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017200	ATCAAT	2	12	1496622	1496633	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_017200	CTTTTT	2	12	1509686	1509697	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_017200	ATTATA	2	12	1511057	1511068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017200	GAAAGG	2	12	1521662	1521673	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017200	ATACAA	2	12	1535974	1535985	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_017200	TATAGA	2	12	1546725	1546736	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017200	GTTTTT	2	12	1557541	1557552	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017200	TTTTAT	2	12	1615648	1615659	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017200	TTTTTA	2	12	1681540	1681551	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017200	ATTTTT	2	12	1723720	1723731	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017200	GAAAGA	2	12	1745463	1745474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017200	AGATAA	2	12	1745544	1745555	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017200	TTTCTA	2	12	1766737	1766748	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_017200	CTTTTG	2	12	1767891	1767902	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_017200	TGTTTG	2	12	1768822	1768833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017200	TATAAC	2	12	1780600	1780611	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_017200	TTATAA	2	12	1799077	1799088	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017200	TTTATT	2	12	1803829	1803840	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017200	GCAGAT	2	12	1836757	1836768	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_017200	GAAAAT	2	12	1860184	1860195	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017200	TTTTTA	2	12	1901588	1901599	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017200	GGTGTT	2	12	1923414	1923425	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017200	TATTGT	2	12	2004799	2004810	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017200	GAAAGA	2	12	2031143	2031154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017200	TGAAGT	2	12	2035152	2035163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017200	TATGAA	2	12	2043987	2043998	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017200	TCATAT	2	12	2047826	2047837	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_017200	AAAAAT	2	12	2076359	2076370	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017200	TATAAT	2	12	2081476	2081487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017200	ATTCTT	2	12	2115513	2115524	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_017200	CATATA	2	12	2125205	2125216	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_017200	CTTTTT	2	12	2143143	2143154	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_017200	CTTATG	2	12	2145672	2145683	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_017200	ATGAGT	2	12	2146363	2146374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017200	ATAAGT	2	12	2171896	2171907	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017200	TATGTG	2	12	2195703	2195714	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017200	GAATAG	2	12	2244392	2244403	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017200	TAGAAA	2	12	2244660	2244671	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017200	GATAGT	2	12	2248589	2248600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017200	TGGAAA	2	12	2255260	2255271	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017200	TAAAGA	2	12	2269722	2269733	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017200	AATTAC	2	12	2283248	2283259	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_017200	AGGAGA	2	12	2287320	2287331	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017200	TATAAT	2	12	2295826	2295837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017200	TAAAAA	2	12	2338225	2338236	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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252	NC_017200	AATAAG	2	12	3945113	3945124	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
253	NC_017200	TTTTAT	2	12	3985308	3985319	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
254	NC_017200	TTTTAT	2	12	3998938	3998949	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
255	NC_017200	AAAATA	2	12	3998959	3998970	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
256	NC_017200	TATTTT	2	12	4054111	4054122	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
257	NC_017200	TCTTTA	2	12	4063228	4063239	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.