MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar finitimus YBT-020 chromosome

Total Repeats: 1060

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017200	TTATC	2	10	184	193	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017200	TTTTA	2	10	9280	9289	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017200	TCGTG	2	10	10388	10397	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017200	GATAT	2	10	10961	10970	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017200	ATGGT	2	10	11373	11382	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017200	CTGAA	2	10	13138	13147	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_017200	TGGAA	2	10	20165	20174	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017200	TAAAA	2	10	20321	20330	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017200	TTTCC	2	10	21700	21709	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
10	NC_017200	ATATT	2	10	21753	21762	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017200	TTTTA	2	10	21931	21940	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017200	TTGTC	2	10	28544	28553	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017200	TTTTA	2	10	29056	29065	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017200	TCGTG	2	10	30164	30173	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017200	GATAT	2	10	30737	30746	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017200	ATGGT	2	10	31149	31158	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017200	CTGAA	2	10	32914	32923	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017200	TAAAT	2	10	34269	34278	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017200	ATTTT	2	10	54160	54169	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017200	ATTTA	2	10	64522	64531	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017200	ATAAG	2	10	71732	71741	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017200	GGAAG	2	10	80420	80429	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017200	TTTTA	2	10	82449	82458	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017200	TCGTG	2	10	83557	83566	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_017200	ATGGT	2	10	84315	84324	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017200	AGCGA	2	10	84848	84857	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_017200	CTGAA	2	10	86078	86087	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_017200	TTTTA	2	10	88163	88172	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017200	TCGTG	2	10	89271	89280	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_017200	ATGGT	2	10	90028	90037	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017200	CTGAA	2	10	91793	91802	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017200	AGTGA	2	10	97966	97975	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017200	TATAA	2	10	100460	100469	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017200	TATGA	2	10	100492	100501	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017200	ATATA	2	10	102472	102481	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017200	AAAGA	2	10	113249	113258	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017200	TAAAA	2	10	122903	122912	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017200	AATCC	2	10	122913	122922	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
39	NC_017200	GGGCT	2	10	147271	147280	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
40	NC_017200	TCGTG	2	10	152338	152347	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_017200	ATGGT	2	10	153096	153105	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017200	CTGAA	2	10	154861	154870	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_017200	TACTT	2	10	165971	165980	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_017200	TGAAA	2	10	172071	172080	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017200	AAACT	2	10	180203	180212	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_017200	TATAA	2	10	180298	180307	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017200	TGGAA	2	10	180325	180334	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017200	AAAAG	2	10	188174	188183	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017200	TAAAA	2	10	200429	200438	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017200	AATAA	2	10	203646	203655	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017200	AAAAG	2	10	207428	207437	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017200	TTCTT	2	10	211023	211032	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_017200	GTAAT	2	10	218725	218734	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017200	ATTAC	2	10	219427	219436	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_017200	GTAAT	2	10	219465	219474	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017200	CCCCA	2	10	219640	219649	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
57	NC_017200	ACGTT	2	10	241695	241704	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_017200	TAAAA	2	10	246722	246731	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017200	CCTCA	2	10	249673	249682	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
60	NC_017200	TGTTT	2	10	259000	259009	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017200	AAGAG	2	10	262013	262022	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017200	TCTAC	2	10	264011	264020	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
63	NC_017200	ATAAG	2	10	265448	265457	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017200	GATAA	2	10	265763	265772	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017200	TTTTA	2	10	266092	266101	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017200	TCGTG	2	10	267200	267209	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
67	NC_017200	ATGGT	2	10	267958	267967	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017200	CTGAA	2	10	269723	269732	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_017200	AAGAA	2	10	271085	271094	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017200	TTTAT	2	10	274002	274011	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017200	ATCTT	2	10	284038	284047	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_017200	TCGTG	2	10	289193	289202	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
73	NC_017200	ATGGT	2	10	289951	289960	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017200	CTGAA	2	10	291717	291726	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_017200	TATTT	2	10	293021	293030	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017200	TCGTG	2	10	296388	296397	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
77	NC_017200	ATGGT	2	10	297146	297155	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017200	CTGAA	2	10	298911	298920	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_017200	TATGC	2	10	303180	303189	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_017200	ATAAA	2	10	304163	304172	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017200	TAAAA	2	10	308287	308296	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017200	TTTTA	2	10	308496	308505	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017200	TCGTG	2	10	309604	309613	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
84	NC_017200	ATGGT	2	10	310362	310371	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017200	CTGAA	2	10	312125	312134	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_017200	TTAGA	2	10	316095	316104	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017200	GTAAT	2	10	316849	316858	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017200	TTTTA	2	10	317112	317121	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017200	TCGTG	2	10	318220	318229	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
90	NC_017200	ATGGT	2	10	318978	318987	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017200	CTGAA	2	10	320743	320752	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_017200	TTTTA	2	10	324252	324261	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017200	TCGTG	2	10	325360	325369	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
94	NC_017200	ATGGT	2	10	326118	326127	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017200	CTGAA	2	10	327882	327891	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_017200	TATAT	2	10	353686	353695	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017200	TTTTA	2	10	355101	355110	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017200	AAAAC	2	10	366164	366173	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_017200	TCTAC	2	10	369232	369241	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
100	NC_017200	TTTAT	2	10	369295	369304	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017200	TTTAG	2	10	375440	375449	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017200	TTGTT	2	10	387392	387401	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017200	AAATA	2	10	387812	387821	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017200	AAAAT	2	10	396101	396110	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017200	GAGGT	2	10	397723	397732	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017200	ATTTA	2	10	404681	404690	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017200	TTTTA	2	10	421453	421462	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017200	TTTAA	2	10	431311	431320	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017200	TAAAT	2	10	433860	433869	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017200	GGCTT	2	10	433987	433996	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
111	NC_017200	AAAAT	2	10	443796	443805	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017200	TATCA	2	10	444948	444957	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_017200	TCTTT	2	10	462268	462277	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_017200	AATTA	2	10	465245	465254	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017200	TCACT	2	10	466866	466875	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
116	NC_017200	TGAAT	2	10	470568	470577	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017200	ATGCA	2	10	473552	473561	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_017200	ATATG	2	10	480291	480300	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017200	TTTTA	2	10	508202	508211	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017200	AATAA	2	10	510026	510035	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017200	AATTT	2	10	510230	510239	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017200	AGAAT	2	10	513904	513913	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017200	AAAAT	2	10	518449	518458	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017200	TATAG	2	10	544001	544010	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017200	GTATA	2	10	546269	546278	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017200	AAGAA	2	10	550000	550009	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017200	ATGAA	2	10	568997	569006	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017200	TTTCG	2	10	570088	570097	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
129	NC_017200	CACCC	2	10	585502	585511	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
130	NC_017200	AAGTT	2	10	589339	589348	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017200	AAAAG	2	10	606476	606485	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017200	AAGTG	2	10	607025	607034	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017200	TAATT	2	10	607790	607799	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017200	TTTTA	2	10	608610	608619	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017200	TCGTG	2	10	609718	609727	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
136	NC_017200	ATGGT	2	10	610475	610484	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017200	CTGAA	2	10	612236	612245	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
138	NC_017200	TTTTA	2	10	614450	614459	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017200	TTATG	2	10	614964	614973	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017200	TATAA	2	10	615010	615019	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017200	GTTTC	2	10	618812	618821	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
142	NC_017200	ACAAT	2	10	626263	626272	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_017200	AAATG	2	10	634922	634931	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017200	ACTTT	2	10	639803	639812	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_017200	TATAT	2	10	639826	639835	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017200	AAAAT	2	10	648284	648293	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017200	TTTTG	2	10	650681	650690	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017200	TGTAT	2	10	659223	659232	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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266	NC_017200	TGAAT	2	10	1209213	1209222	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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476	NC_017200	AATTT	2	10	2312837	2312846	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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491	NC_017200	TGTTT	2	10	2345363	2345372	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_017200	AAATT	2	10	2399522	2399531	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

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