MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar finitimus YBT-020 chromosome

Total Repeats: 3865

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017200	CAAAT	2	10	1321	1330	60 %	20 %	0 %	20 %	384177911
2	NC_017200	TACAA	2	10	1935	1944	60 %	20 %	0 %	20 %	384177912
3	NC_017200	TTTAA	2	10	2263	2272	40 %	60 %	0 %	0 %	384177912
4	NC_017200	ATTGA	2	10	4316	4325	40 %	40 %	20 %	0 %	384177914
5	NC_017200	ATTAA	2	10	5200	5209	60 %	40 %	0 %	0 %	384177915
6	NC_017200	AACCC	2	10	6328	6337	40 %	0 %	0 %	60 %	384177915
7	NC_017200	ATTCT	2	10	8267	8276	20 %	60 %	0 %	20 %	384177916
8	NC_017200	GGTTC	2	10	14374	14383	0 %	40 %	40 %	20 %	384177917
9	NC_017200	TGAAA	2	10	17959	17968	60 %	20 %	20 %	0 %	384177919
10	NC_017200	GTCAA	2	10	19016	19025	40 %	20 %	20 %	20 %	384177920
11	NC_017200	AGATG	2	10	26320	26329	40 %	20 %	40 %	0 %	384177928
12	NC_017200	AAGCG	2	10	26802	26811	40 %	0 %	40 %	20 %	384177928
13	NC_017200	TTTTA	2	10	28431	28440	20 %	80 %	0 %	0 %	384177932
14	NC_017200	AAAAG	2	10	35378	35387	80 %	0 %	20 %	0 %	384177935
15	NC_017200	AAGAC	2	10	35674	35683	60 %	0 %	20 %	20 %	384177935
16	NC_017200	GTGAA	2	10	36422	36431	40 %	20 %	40 %	0 %	384177936
17	NC_017200	GTATT	2	10	36512	36521	20 %	60 %	20 %	0 %	384177936
18	NC_017200	CAATA	2	10	39193	39202	60 %	20 %	0 %	20 %	384177940
19	NC_017200	AAACA	2	10	40324	40333	80 %	0 %	0 %	20 %	384177942
20	NC_017200	AATGA	2	10	42216	42225	60 %	20 %	20 %	0 %	384177944
21	NC_017200	ATCGT	2	10	45412	45421	20 %	40 %	20 %	20 %	384177947
22	NC_017200	ATATT	2	10	45686	45695	40 %	60 %	0 %	0 %	384177947
23	NC_017200	ATTAG	2	10	46400	46409	40 %	40 %	20 %	0 %	384177948
24	NC_017200	AAGTG	2	10	46573	46582	40 %	20 %	40 %	0 %	384177948
25	NC_017200	AAGAC	2	10	48181	48190	60 %	0 %	20 %	20 %	384177951
26	NC_017200	TGCGA	2	10	57448	57457	20 %	20 %	40 %	20 %	384177959
27	NC_017200	GATTT	2	10	57525	57534	20 %	60 %	20 %	0 %	384177959
28	NC_017200	AAGGT	2	10	59939	59948	40 %	20 %	40 %	0 %	384177961
29	NC_017200	TATTT	2	10	60079	60088	20 %	80 %	0 %	0 %	384177961
30	NC_017200	TTGGA	2	10	62760	62769	20 %	40 %	40 %	0 %	384177965
31	NC_017200	AAAGA	2	10	63594	63603	80 %	0 %	20 %	0 %	384177966
32	NC_017200	TTATG	2	10	65081	65090	20 %	60 %	20 %	0 %	384177968
33	NC_017200	AATGA	2	10	68992	69001	60 %	20 %	20 %	0 %	384177969
34	NC_017200	GATTA	2	10	69467	69476	40 %	40 %	20 %	0 %	384177970
35	NC_017200	GAAAA	2	10	70088	70097	80 %	0 %	20 %	0 %	384177971
36	NC_017200	GAACA	2	10	72842	72851	60 %	0 %	20 %	20 %	384177973
37	NC_017200	GAAAA	2	10	75226	75235	80 %	0 %	20 %	0 %	384177975
38	NC_017200	GAGCA	2	10	75587	75596	40 %	0 %	40 %	20 %	384177975
39	NC_017200	ATTTA	2	10	76109	76118	40 %	60 %	0 %	0 %	384177976
40	NC_017200	AAAAC	2	10	79129	79138	80 %	0 %	0 %	20 %	384177980
41	NC_017200	AAATA	2	10	79775	79784	80 %	20 %	0 %	0 %	384177982
42	NC_017200	GTATG	2	10	81950	81959	20 %	40 %	40 %	0 %	384177983
43	NC_017200	TGTTA	2	10	81998	82007	20 %	60 %	20 %	0 %	384177983
44	NC_017200	GAACA	2	10	95545	95554	60 %	0 %	20 %	20 %	384177987
45	NC_017200	GAACA	2	10	95767	95776	60 %	0 %	20 %	20 %	384177987
46	NC_017200	TGAAG	2	10	96707	96716	40 %	20 %	40 %	0 %	384177987
47	NC_017200	AGAAA	2	10	96729	96738	80 %	0 %	20 %	0 %	384177987
48	NC_017200	GAAAA	2	10	96853	96862	80 %	0 %	20 %	0 %	384177987
49	NC_017200	AATTG	2	10	97673	97682	40 %	40 %	20 %	0 %	384177987
50	NC_017200	TGAAA	2	10	98789	98798	60 %	20 %	20 %	0 %	384177988
51	NC_017200	ACGTA	2	10	99752	99761	40 %	20 %	20 %	20 %	384177989
52	NC_017200	TGTTT	2	10	100842	100851	0 %	80 %	20 %	0 %	384177990
53	NC_017200	TACGT	2	10	101830	101839	20 %	40 %	20 %	20 %	384177991
54	NC_017200	CATTC	2	10	103617	103626	20 %	40 %	0 %	40 %	384177993
55	NC_017200	GAAAA	2	10	104505	104514	80 %	0 %	20 %	0 %	384177993
56	NC_017200	AAAAG	2	10	108605	108614	80 %	0 %	20 %	0 %	384177998
57	NC_017200	GATTG	2	10	108954	108963	20 %	40 %	40 %	0 %	384177999
58	NC_017200	GAAAA	2	10	110202	110211	80 %	0 %	20 %	0 %	384178002
59	NC_017200	AGAAA	2	10	113822	113831	80 %	0 %	20 %	0 %	384178007
60	NC_017200	AATCA	2	10	120016	120025	60 %	20 %	0 %	20 %	384178009
61	NC_017200	AACAT	2	10	121607	121616	60 %	20 %	0 %	20 %	384178010
62	NC_017200	ACGTG	2	10	122297	122306	20 %	20 %	40 %	20 %	384178012
63	NC_017200	TCGTA	2	10	123334	123343	20 %	40 %	20 %	20 %	384178013
64	NC_017200	CATGG	2	10	126660	126669	20 %	20 %	40 %	20 %	384178015
65	NC_017200	TGGTA	2	10	130422	130431	20 %	40 %	40 %	0 %	384178023
66	NC_017200	GTGCG	2	10	137662	137671	0 %	20 %	60 %	20 %	384178038
67	NC_017200	GAAAT	2	10	142287	142296	60 %	20 %	20 %	0 %	384178046
68	NC_017200	CATTT	2	10	142549	142558	20 %	60 %	0 %	20 %	384178047
69	NC_017200	AATAA	2	10	143736	143745	80 %	20 %	0 %	0 %	384178048
70	NC_017200	TTATT	2	10	144460	144469	20 %	80 %	0 %	0 %	384178049
71	NC_017200	GAGCA	2	10	145301	145310	40 %	0 %	40 %	20 %	384178050
72	NC_017200	AAAAG	2	10	145964	145973	80 %	0 %	20 %	0 %	384178052
73	NC_017200	GGAAA	2	10	149289	149298	60 %	0 %	40 %	0 %	384178056
74	NC_017200	CTTAT	2	10	159105	159114	20 %	60 %	0 %	20 %	384178060
75	NC_017200	CAAAA	2	10	161552	161561	80 %	0 %	0 %	20 %	384178062
76	NC_017200	ATTAC	2	10	162813	162822	40 %	40 %	0 %	20 %	384178063
77	NC_017200	ACAGC	2	10	164850	164859	40 %	0 %	20 %	40 %	384178065
78	NC_017200	CGTAG	2	10	165045	165054	20 %	20 %	40 %	20 %	384178065
79	NC_017200	CAACA	2	10	166571	166580	60 %	0 %	0 %	40 %	384178067
80	NC_017200	TTTCA	2	10	166633	166642	20 %	60 %	0 %	20 %	384178067
81	NC_017200	AAAAT	2	10	168325	168334	80 %	20 %	0 %	0 %	384178069
82	NC_017200	TAAAT	2	10	170633	170642	60 %	40 %	0 %	0 %	384178071
83	NC_017200	TGAAC	2	10	172835	172844	40 %	20 %	20 %	20 %	384178072
84	NC_017200	AGCGC	2	10	173495	173504	20 %	0 %	40 %	40 %	384178072
85	NC_017200	ATAAA	2	10	173570	173579	80 %	20 %	0 %	0 %	384178072
86	NC_017200	AAATC	2	10	174162	174171	60 %	20 %	0 %	20 %	384178073
87	NC_017200	TATCG	2	10	174829	174838	20 %	40 %	20 %	20 %	384178073
88	NC_017200	GAAGC	2	10	176081	176090	40 %	0 %	40 %	20 %	384178074
89	NC_017200	TTCAT	2	10	182513	182522	20 %	60 %	0 %	20 %	384178082
90	NC_017200	AGAAT	2	10	182579	182588	60 %	20 %	20 %	0 %	384178082
91	NC_017200	ATCGC	2	10	183542	183551	20 %	20 %	20 %	40 %	384178083
92	NC_017200	AAAAG	2	10	185388	185397	80 %	0 %	20 %	0 %	384178085
93	NC_017200	AGAGA	2	10	186694	186703	60 %	0 %	40 %	0 %	384178086
94	NC_017200	ACGTA	2	10	187236	187245	40 %	20 %	20 %	20 %	384178086
95	NC_017200	AAAGG	2	10	189108	189117	60 %	0 %	40 %	0 %	384178088
96	NC_017200	TTACT	2	10	189299	189308	20 %	60 %	0 %	20 %	384178088
97	NC_017200	AAAAG	2	10	191768	191777	80 %	0 %	20 %	0 %	384178090
98	NC_017200	CTTTT	2	10	192200	192209	0 %	80 %	0 %	20 %	384178091
99	NC_017200	TTTTA	2	10	193132	193141	20 %	80 %	0 %	0 %	384178092
100	NC_017200	AACGT	2	10	194626	194635	40 %	20 %	20 %	20 %	384178093
101	NC_017200	ATGGG	2	10	197698	197707	20 %	20 %	60 %	0 %	384178096
102	NC_017200	TATTT	2	10	198024	198033	20 %	80 %	0 %	0 %	384178097
103	NC_017200	CTAAA	2	10	198325	198334	60 %	20 %	0 %	20 %	384178097
104	NC_017200	TGCAA	2	10	198897	198906	40 %	20 %	20 %	20 %	384178098
105	NC_017200	TTAGT	2	10	199610	199619	20 %	60 %	20 %	0 %	384178099
106	NC_017200	GCAAA	2	10	200848	200857	60 %	0 %	20 %	20 %	384178101
107	NC_017200	ATAAA	2	10	201618	201627	80 %	20 %	0 %	0 %	384178101
108	NC_017200	TAAAT	2	10	202663	202672	60 %	40 %	0 %	0 %	384178102
109	NC_017200	TATGT	2	10	208092	208101	20 %	60 %	20 %	0 %	384178107
110	NC_017200	CGTTT	2	10	208343	208352	0 %	60 %	20 %	20 %	384178108
111	NC_017200	TGTAA	2	10	210887	210896	40 %	40 %	20 %	0 %	384178110
112	NC_017200	AGCGA	2	10	211099	211108	40 %	0 %	40 %	20 %	384178111
113	NC_017200	GATAT	2	10	211941	211950	40 %	40 %	20 %	0 %	384178111
114	NC_017200	TAATT	2	10	213346	213355	40 %	60 %	0 %	0 %	384178114
115	NC_017200	ATTGT	2	10	213706	213715	20 %	60 %	20 %	0 %	384178115
116	NC_017200	AATCA	2	10	215766	215775	60 %	20 %	0 %	20 %	384178119
117	NC_017200	GTTAA	2	10	218572	218581	40 %	40 %	20 %	0 %	384178124
118	NC_017200	AAGAA	2	10	220362	220371	80 %	0 %	20 %	0 %	384178127
119	NC_017200	TTTAT	2	10	221558	221567	20 %	80 %	0 %	0 %	384178128
120	NC_017200	TTTGT	2	10	225090	225099	0 %	80 %	20 %	0 %	384178131
121	NC_017200	TGGAA	2	10	226944	226953	40 %	20 %	40 %	0 %	384178134
122	NC_017200	TTTTA	2	10	228101	228110	20 %	80 %	0 %	0 %	384178134
123	NC_017200	TTTGT	2	10	228863	228872	0 %	80 %	20 %	0 %	384178135
124	NC_017200	CGGCA	2	10	229771	229780	20 %	0 %	40 %	40 %	384178135
125	NC_017200	TAATT	2	10	230588	230597	40 %	60 %	0 %	0 %	384178136
126	NC_017200	GAAAA	2	10	232050	232059	80 %	0 %	20 %	0 %	384178138
127	NC_017200	TGTTA	2	10	233576	233585	20 %	60 %	20 %	0 %	384178139
128	NC_017200	CATTT	2	10	235144	235153	20 %	60 %	0 %	20 %	384178141
129	NC_017200	CAGGA	2	10	235522	235531	40 %	0 %	40 %	20 %	384178141
130	NC_017200	TATTC	2	10	239303	239312	20 %	60 %	0 %	20 %	384178144
131	NC_017200	GAAGT	2	10	239686	239695	40 %	20 %	40 %	0 %	384178145
132	NC_017200	CATAT	2	10	239909	239918	40 %	40 %	0 %	20 %	384178145
133	NC_017200	TATTC	2	10	242928	242937	20 %	60 %	0 %	20 %	384178154
134	NC_017200	TACGT	2	10	245329	245338	20 %	40 %	20 %	20 %	384178156
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