MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar finitimus YBT-020 chromosome

Total Repeats: 68169

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017200	ATT	2	6	577	582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384177911
2	NC_017200	TAT	2	6	641	646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384177911
3	NC_017200	TCC	2	6	680	685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384177911
4	NC_017200	GAT	2	6	708	713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384177911
5	NC_017200	GCT	2	6	798	803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384177911
6	NC_017200	ATC	2	6	947	952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384177911
7	NC_017200	ATA	2	6	991	996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384177911
8	NC_017200	TAA	2	6	1013	1018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384177911
9	NC_017200	GAT	2	6	1047	1052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384177911
10	NC_017200	AAG	2	6	1084	1089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384177911
11	NC_017200	GAA	2	6	1119	1124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384177911
12	NC_017200	CCA	2	6	1155	1160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384177911
13	NC_017200	AGA	2	6	1178	1183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384177911
14	NC_017200	CCA	2	6	1230	1235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384177911
15	NC_017200	AGC	2	6	1418	1423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384177911
16	NC_017200	ATT	2	6	1440	1445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384177911
17	NC_017200	CTC	2	6	1604	1609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384177911
18	NC_017200	GAA	2	6	1626	1631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384177911
19	NC_017200	ACA	2	6	1650	1655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384177911
20	NC_017200	GAA	2	6	1722	1727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384177911
21	NC_017200	AGT	2	6	1744	1749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384177911
22	NC_017200	AAG	2	6	1959	1964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384177912
23	NC_017200	TCT	2	6	1990	1995	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384177912
24	NC_017200	ACA	2	6	1999	2004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384177912
25	NC_017200	GAA	2	6	2041	2046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384177912
26	NC_017200	AAG	2	6	2185	2190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384177912
27	NC_017200	TGA	2	6	2231	2236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384177912
28	NC_017200	GAA	2	6	2314	2319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384177912
29	NC_017200	CAT	2	6	2320	2325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384177912
30	NC_017200	TGT	2	6	2529	2534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384177912
31	NC_017200	GAA	2	6	2584	2589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384177912
32	NC_017200	TTA	2	6	2603	2608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384177912
33	NC_017200	TAT	2	6	2621	2626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384177912
34	NC_017200	TAT	2	6	2642	2647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384177912
35	NC_017200	TCT	2	6	2648	2653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384177912
36	NC_017200	TAA	2	6	2787	2792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384177912
37	NC_017200	TGT	2	6	2793	2798	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384177912
38	NC_017200	AGT	2	6	2862	2867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384177912
39	NC_017200	AGA	2	6	2868	2873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384177912
40	NC_017200	ATG	2	6	3020	3025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384177912
41	NC_017200	ATT	2	6	3031	3036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384177912
42	NC_017200	AGA	2	6	3332	3337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384177913
43	NC_017200	ATT	2	6	3362	3367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384177913
44	NC_017200	AAC	2	6	3717	3722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384177914
45	NC_017200	TGA	2	6	3747	3752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384177914
46	NC_017200	TGT	2	6	3754	3759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384177914
47	NC_017200	AGA	2	6	3772	3777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384177914
48	NC_017200	AAG	2	6	3808	3813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384177914
49	NC_017200	TAC	2	6	4023	4028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384177914
50	NC_017200	AGA	2	6	4072	4077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384177914
51	NC_017200	AAG	2	6	4140	4145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384177914
52	NC_017200	AAC	2	6	4173	4178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384177914
53	NC_017200	TGA	2	6	4219	4224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384177914
54	NC_017200	TTC	2	6	4232	4237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384177914
55	NC_017200	ACA	2	6	4276	4281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384177914
56	NC_017200	TTC	2	6	4353	4358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384177914
57	NC_017200	GAT	2	6	4364	4369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384177914
58	NC_017200	TAT	2	6	4371	4376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384177914
59	NC_017200	GAT	2	6	4385	4390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384177914
60	NC_017200	ACG	2	6	4448	4453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384177914
61	NC_017200	AAG	2	6	4485	4490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384177914
62	NC_017200	ATG	2	6	4616	4621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384177915
63	NC_017200	TCG	2	6	4727	4732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384177915
64	NC_017200	ATA	2	6	4733	4738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384177915
65	NC_017200	TGA	2	6	4743	4748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384177915
66	NC_017200	TGA	2	6	4767	4772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384177915
67	NC_017200	GAA	2	6	4789	4794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384177915
68	NC_017200	ATA	2	6	4796	4801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384177915
69	NC_017200	CTG	2	6	4865	4870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384177915
70	NC_017200	TTA	2	6	4877	4882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384177915
71	NC_017200	TTC	2	6	4889	4894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384177915
72	NC_017200	TGG	2	6	4899	4904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384177915
73	NC_017200	GGC	3	9	4912	4920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384177915
74	NC_017200	TGG	2	6	4935	4940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384177915
75	NC_017200	GTA	2	6	4963	4968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384177915
76	NC_017200	ACA	2	6	5134	5139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384177915
77	NC_017200	AAC	2	6	5300	5305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384177915
78	NC_017200	GAA	2	6	5314	5319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384177915
79	NC_017200	ATA	2	6	5393	5398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384177915
80	NC_017200	GCA	2	6	5734	5739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384177915
81	NC_017200	CGC	2	6	5779	5784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384177915
82	NC_017200	ATT	2	6	5950	5955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384177915
83	NC_017200	ATT	2	6	6010	6015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384177915
84	NC_017200	GGC	2	6	6037	6042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384177915
85	NC_017200	TTA	3	9	6077	6085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384177915
86	NC_017200	TAT	2	6	6125	6130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384177915
87	NC_017200	TTC	2	6	6136	6141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384177915
88	NC_017200	ATT	2	6	6160	6165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384177915
89	NC_017200	GTT	2	6	6198	6203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384177915
90	NC_017200	ACA	2	6	6210	6215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384177915
91	NC_017200	ACA	2	6	6349	6354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384177915
92	NC_017200	CGT	2	6	6454	6459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384177915
93	NC_017200	CAA	3	9	6608	6616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384177916
94	NC_017200	TTG	2	6	6807	6812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384177916
95	NC_017200	TTG	2	6	6906	6911	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384177916
96	NC_017200	GCA	2	6	6953	6958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384177916
97	NC_017200	GAA	2	6	7275	7280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384177916
98	NC_017200	TAT	2	6	7318	7323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384177916
99	NC_017200	TAT	2	6	7372	7377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384177916
100	NC_017200	TGA	2	6	7477	7482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384177916
101	NC_017200	CGT	2	6	7520	7525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384177916
102	NC_017200	TAT	2	6	7542	7547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384177916
103	NC_017200	GTA	2	6	7676	7681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384177916
104	NC_017200	ATC	2	6	7761	7766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384177916
105	NC_017200	TTA	2	6	7776	7781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384177916
106	NC_017200	GAA	2	6	7979	7984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384177916
107	NC_017200	ATT	2	6	7997	8002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384177916
108	NC_017200	GAA	2	6	8006	8011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384177916
109	NC_017200	TGG	2	6	8065	8070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384177916
110	NC_017200	GTG	2	6	8184	8189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384177916
111	NC_017200	GTG	2	6	8193	8198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384177916
112	NC_017200	ATG	3	9	8217	8225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384177916
113	NC_017200	ACT	2	6	8246	8251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384177916
114	NC_017200	TAA	2	6	8281	8286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384177916
115	NC_017200	TAT	2	6	8353	8358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384177916
116	NC_017200	ATT	2	6	8399	8404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384177916
117	NC_017200	CAA	2	6	8445	8450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384177916
118	NC_017200	TCA	2	6	8480	8485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384177916
119	NC_017200	ATT	2	6	8579	8584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384177916
120	NC_017200	GAA	2	6	8681	8686	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384177916
121	NC_017200	TGA	2	6	8773	8778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384177916
122	NC_017200	GTG	2	6	8796	8801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384177916
123	NC_017200	TAG	2	6	8847	8852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384177916
124	NC_017200	TGA	2	6	8872	8877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384177916
125	NC_017200	CAG	2	6	8895	8900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384177916
126	NC_017200	TTA	2	6	8907	8912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384177916
127	NC_017200	GAT	2	6	9023	9028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384177916
128	NC_017200	GAA	2	6	9032	9037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384177916
129	NC_017200	AGA	2	6	9058	9063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384177916
130	NC_017200	ACC	2	6	14491	14496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384177917
131	NC_017200	GTA	2	6	14630	14635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384177917
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256	NC_017200	CTA	2	6	23515	23520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384177925
257	NC_017200	TCT	2	6	23556	23561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384177925
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259	NC_017200	TCA	2	6	23652	23657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384177925
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264	NC_017200	TAA	2	6	24159	24164	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384177926
265	NC_017200	ATC	2	6	24172	24177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384177926
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