MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis serovar finitimus YBT-020 plasmid pBMB28

Total Repeats: 47

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017199	AATGAG	2	12	4406	4417	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384177767
2	NC_017199	ATACAG	2	12	4644	4655	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384177767
3	NC_017199	CATAGA	2	12	7645	7656	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384177767
4	NC_017199	TCTGGT	2	12	17547	17558	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384177777
5	NC_017199	ATGGGA	2	12	18689	18700	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384177778
6	NC_017199	ATTGGT	2	12	19118	19129	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384177778
7	NC_017199	GAATAT	2	12	19423	19434	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384177779
8	NC_017199	ATTCTA	2	12	22233	22244	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_017199	TTATAC	2	12	23171	23182	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384177783
10	NC_017199	TGATAA	2	12	24279	24290	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017199	TAACAA	2	12	24357	24368	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017199	TTTAAT	2	12	27406	27417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384177790
13	NC_017199	ACTGTT	2	12	30852	30863	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384177794
14	NC_017199	TTTATA	2	12	31937	31948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017199	AGCGAA	2	12	37815	37826	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384177801
16	NC_017199	TTTTCT	2	12	43316	43327	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384177804
17	NC_017199	AGCGGA	2	12	46273	46284	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384177811
18	NC_017199	CAAATA	2	12	49604	49615	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384177814
19	NC_017199	GATTGT	2	12	50551	50562	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384177815
20	NC_017199	AAAAAT	2	12	53069	53080	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384177818
21	NC_017199	ATGAAA	2	12	56984	56995	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384177820
22	NC_017199	AGTGGT	2	12	58544	58555	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384177821
23	NC_017199	GAAGAG	2	12	64262	64273	50 %	0 %	50 %	0 %	384177836
24	NC_017199	GTAGAC	2	12	69198	69209	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384177844
25	NC_017199	AAATGA	2	12	71806	71817	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384177846
26	NC_017199	TAGTTT	2	12	74659	74670	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384177848
27	NC_017199	ATGTTA	2	12	74964	74975	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017199	AGTTTT	2	12	76470	76481	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384177851
29	NC_017199	CAATAA	2	12	76854	76865	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384177851
30	NC_017199	ATAGAA	2	12	76873	76884	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384177851
31	NC_017199	TCAATT	2	12	77314	77325	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384177851
32	NC_017199	AGAACT	2	12	78515	78526	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384177852
33	NC_017199	GATATG	2	12	79332	79343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384177852
34	NC_017199	TTTTTA	2	12	81302	81313	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017199	GTAAAT	2	12	87943	87954	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384177861
36	NC_017199	ACCAGA	2	12	88937	88948	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017199	TTTATT	2	12	92152	92163	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017199	AAAAAC	2	12	93139	93150	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_017199	TAAATG	2	12	96248	96259	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384177869
40	NC_017199	CTAAAA	2	12	97339	97350	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384177870
41	NC_017199	ATATTT	2	12	100351	100362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384177872
42	NC_017199	TCAAAG	2	12	102061	102072	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384177874
43	NC_017199	AACGAA	2	12	102433	102444	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384177874
44	NC_017199	GCCCAT	2	12	105358	105369	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384177878
45	NC_017199	TTTTCC	2	12	106707	106718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384177881
46	NC_017199	ATTTTC	2	12	128370	128381	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_017199	ATCCCA	2	12	138822	138833	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.