MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar finitimus YBT-020 plasmid pBMB28

Total Repeats: 36

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017199	AATGAG	2	12	4406	4417	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384177767
2	NC_017199	ATACAG	2	12	4644	4655	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384177767
3	NC_017199	CATAGA	2	12	7645	7656	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384177767
4	NC_017199	TCTGGT	2	12	17547	17558	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384177777
5	NC_017199	ATGGGA	2	12	18689	18700	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384177778
6	NC_017199	ATTGGT	2	12	19118	19129	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384177778
7	NC_017199	GAATAT	2	12	19423	19434	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384177779
8	NC_017199	TTATAC	2	12	23171	23182	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384177783
9	NC_017199	TTTAAT	2	12	27406	27417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384177790
10	NC_017199	ACTGTT	2	12	30852	30863	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384177794
11	NC_017199	AGCGAA	2	12	37815	37826	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384177801
12	NC_017199	TTTTCT	2	12	43316	43327	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384177804
13	NC_017199	AGCGGA	2	12	46273	46284	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384177811
14	NC_017199	CAAATA	2	12	49604	49615	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384177814
15	NC_017199	GATTGT	2	12	50551	50562	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384177815
16	NC_017199	AAAAAT	2	12	53069	53080	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384177818
17	NC_017199	ATGAAA	2	12	56984	56995	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384177820
18	NC_017199	AGTGGT	2	12	58544	58555	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384177821
19	NC_017199	GAAGAG	2	12	64262	64273	50 %	0 %	50 %	0 %	384177836
20	NC_017199	GTAGAC	2	12	69198	69209	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384177844
21	NC_017199	AAATGA	2	12	71806	71817	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384177846
22	NC_017199	TAGTTT	2	12	74659	74670	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384177848
23	NC_017199	AGTTTT	2	12	76470	76481	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384177851
24	NC_017199	CAATAA	2	12	76854	76865	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384177851
25	NC_017199	ATAGAA	2	12	76873	76884	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384177851
26	NC_017199	TCAATT	2	12	77314	77325	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384177851
27	NC_017199	AGAACT	2	12	78515	78526	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384177852
28	NC_017199	GATATG	2	12	79332	79343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384177852
29	NC_017199	GTAAAT	2	12	87943	87954	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384177861
30	NC_017199	TAAATG	2	12	96248	96259	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384177869
31	NC_017199	CTAAAA	2	12	97339	97350	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384177870
32	NC_017199	ATATTT	2	12	100351	100362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384177872
33	NC_017199	TCAAAG	2	12	102061	102072	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384177874
34	NC_017199	AACGAA	2	12	102433	102444	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384177874
35	NC_017199	GCCCAT	2	12	105358	105369	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384177878
36	NC_017199	TTTTCC	2	12	106707	106718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384177881

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.