MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar finitimus YBT-020 plasmid pBMB28

Total Repeats: 103

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017199	CATTA	2	10	610	619	40 %	40 %	0 %	20 %	384177765
2	NC_017199	TCAAA	2	10	1813	1822	60 %	20 %	0 %	20 %	384177767
3	NC_017199	CATTT	2	10	3365	3374	20 %	60 %	0 %	20 %	384177767
4	NC_017199	ATTTA	2	10	5233	5242	40 %	60 %	0 %	0 %	384177767
5	NC_017199	CATCA	2	10	5568	5577	40 %	20 %	0 %	40 %	384177767
6	NC_017199	ATGAA	2	10	6372	6381	60 %	20 %	20 %	0 %	384177767
7	NC_017199	GATAA	2	10	7136	7145	60 %	20 %	20 %	0 %	384177767
8	NC_017199	AGCAA	2	10	8922	8931	60 %	0 %	20 %	20 %	384177767
9	NC_017199	AATTG	2	10	10100	10109	40 %	40 %	20 %	0 %	384177768
10	NC_017199	AAAAG	2	10	11578	11587	80 %	0 %	20 %	0 %	384177771
11	NC_017199	TATAT	2	10	12704	12713	40 %	60 %	0 %	0 %	384177772
12	NC_017199	AAAAG	2	10	15475	15484	80 %	0 %	20 %	0 %	384177775
13	NC_017199	AAAAG	2	10	16274	16283	80 %	0 %	20 %	0 %	384177776
14	NC_017199	GAAAG	2	10	17286	17295	60 %	0 %	40 %	0 %	384177776
15	NC_017199	TGAAA	2	10	19612	19621	60 %	20 %	20 %	0 %	384177779
16	NC_017199	ATTTT	2	10	21486	21495	20 %	80 %	0 %	0 %	384177780
17	NC_017199	CTTTT	2	10	21997	22006	0 %	80 %	0 %	20 %	384177781
18	NC_017199	GTAAA	2	10	22880	22889	60 %	20 %	20 %	0 %	384177782
19	NC_017199	AAGAA	2	10	25998	26007	80 %	0 %	20 %	0 %	384177788
20	NC_017199	TGATC	2	10	26043	26052	20 %	40 %	20 %	20 %	384177788
21	NC_017199	TAAAA	2	10	26330	26339	80 %	20 %	0 %	0 %	384177788
22	NC_017199	AAAAT	2	10	26347	26356	80 %	20 %	0 %	0 %	384177788
23	NC_017199	GGATT	2	10	30601	30610	20 %	40 %	40 %	0 %	384177794
24	NC_017199	TTTTG	2	10	32424	32433	0 %	80 %	20 %	0 %	384177795
25	NC_017199	AATCG	2	10	34321	34330	40 %	20 %	20 %	20 %	384177796
26	NC_017199	AGAAA	2	10	41625	41634	80 %	0 %	20 %	0 %	384177801
27	NC_017199	GAGCG	2	10	44030	44039	20 %	0 %	60 %	20 %	384177806
28	NC_017199	TCAAA	2	10	44418	44427	60 %	20 %	0 %	20 %	384177807
29	NC_017199	ACAAG	2	10	45647	45656	60 %	0 %	20 %	20 %	384177811
30	NC_017199	TTATA	2	10	47246	47255	40 %	60 %	0 %	0 %	384177811
31	NC_017199	ATTTT	2	10	49245	49254	20 %	80 %	0 %	0 %	384177813
32	NC_017199	TACTT	2	10	49676	49685	20 %	60 %	0 %	20 %	384177814
33	NC_017199	AAAAT	2	10	50394	50403	80 %	20 %	0 %	0 %	384177815
34	NC_017199	TTAAG	2	10	50989	50998	40 %	40 %	20 %	0 %	384177816
35	NC_017199	CACAA	2	10	52789	52798	60 %	0 %	0 %	40 %	384177818
36	NC_017199	TCCGT	2	10	53134	53143	0 %	40 %	20 %	40 %	384177818
37	NC_017199	AAAGA	2	10	55369	55378	80 %	0 %	20 %	0 %	384177820
38	NC_017199	CAAAG	2	10	55977	55986	60 %	0 %	20 %	20 %	384177820
39	NC_017199	AAAAC	2	10	56056	56065	80 %	0 %	0 %	20 %	384177820
40	NC_017199	AACAA	2	10	56496	56505	80 %	0 %	0 %	20 %	384177820
41	NC_017199	TTGTT	2	10	57819	57828	0 %	80 %	20 %	0 %	384177821
42	NC_017199	GTTTT	2	10	58386	58395	0 %	80 %	20 %	0 %	384177821
43	NC_017199	TTATG	2	10	58848	58857	20 %	60 %	20 %	0 %	384177822
44	NC_017199	CATTA	2	10	59162	59171	40 %	40 %	0 %	20 %	384177822
45	NC_017199	GAGAA	2	10	59265	59274	60 %	0 %	40 %	0 %	384177822
46	NC_017199	TTTAA	2	10	59420	59429	40 %	60 %	0 %	0 %	384177823
47	NC_017199	ATGGA	2	10	59664	59673	40 %	20 %	40 %	0 %	384177824
48	NC_017199	AAATG	2	10	60253	60262	60 %	20 %	20 %	0 %	384177826
49	NC_017199	ATTTT	2	10	61441	61450	20 %	80 %	0 %	0 %	384177829
50	NC_017199	GTATT	2	10	63808	63817	20 %	60 %	20 %	0 %	384177835
51	NC_017199	ATATT	2	10	65403	65412	40 %	60 %	0 %	0 %	384177839
52	NC_017199	CGAAA	2	10	65462	65471	60 %	0 %	20 %	20 %	384177839
53	NC_017199	GAGTG	2	10	65791	65800	20 %	20 %	60 %	0 %	384177840
54	NC_017199	CGAAA	2	10	69133	69142	60 %	0 %	20 %	20 %	384177844
55	NC_017199	GATTT	2	10	69610	69619	20 %	60 %	20 %	0 %	384177844
56	NC_017199	AAGAA	2	10	69906	69915	80 %	0 %	20 %	0 %	384177844
57	NC_017199	AAAGC	2	10	72358	72367	60 %	0 %	20 %	20 %	384177846
58	NC_017199	TACTA	2	10	73855	73864	40 %	40 %	0 %	20 %	384177848
59	NC_017199	ATAAA	2	10	74259	74268	80 %	20 %	0 %	0 %	384177848
60	NC_017199	TTTGA	2	10	74481	74490	20 %	60 %	20 %	0 %	384177848
61	NC_017199	TTTTC	2	10	74709	74718	0 %	80 %	0 %	20 %	384177848
62	NC_017199	AATTT	2	10	76429	76438	40 %	60 %	0 %	0 %	384177850
63	NC_017199	TTGAA	2	10	76460	76469	40 %	40 %	20 %	0 %	384177850
64	NC_017199	AAACT	2	10	77720	77729	60 %	20 %	0 %	20 %	384177851
65	NC_017199	GGGAA	2	10	79443	79452	40 %	0 %	60 %	0 %	384177852
66	NC_017199	AATTT	2	10	80738	80747	40 %	60 %	0 %	0 %	384177854
67	NC_017199	AAGAA	2	10	81459	81468	80 %	0 %	20 %	0 %	384177855
68	NC_017199	TAAAG	2	10	81828	81837	60 %	20 %	20 %	0 %	384177855
69	NC_017199	ACTTA	2	10	82245	82254	40 %	40 %	0 %	20 %	384177855
70	NC_017199	GAAAC	2	10	84003	84012	60 %	0 %	20 %	20 %	384177857
71	NC_017199	ACTAA	2	10	84054	84063	60 %	20 %	0 %	20 %	384177857
72	NC_017199	CATCA	2	10	84954	84963	40 %	20 %	0 %	40 %	384177857
73	NC_017199	TTTAA	2	10	86699	86708	40 %	60 %	0 %	0 %	384177859
74	NC_017199	TGGAT	2	10	87323	87332	20 %	40 %	40 %	0 %	384177860
75	NC_017199	TTCTT	2	10	90374	90383	0 %	80 %	0 %	20 %	384177864
76	NC_017199	AAATC	2	10	91384	91393	60 %	20 %	0 %	20 %	384177864
77	NC_017199	TAGCT	2	10	93749	93758	20 %	40 %	20 %	20 %	384177866
78	NC_017199	TGGGA	2	10	94171	94180	20 %	20 %	60 %	0 %	384177866
79	NC_017199	ATTTT	2	10	94446	94455	20 %	80 %	0 %	0 %	384177867
80	NC_017199	GAAAT	2	10	96755	96764	60 %	20 %	20 %	0 %	384177869
81	NC_017199	CTTTG	2	10	97010	97019	0 %	60 %	20 %	20 %	384177870
82	NC_017199	CGTTT	2	10	98955	98964	0 %	60 %	20 %	20 %	384177871
83	NC_017199	AAATC	2	10	106525	106534	60 %	20 %	0 %	20 %	384177880
84	NC_017199	GAAGA	2	10	108369	108378	60 %	0 %	40 %	0 %	384177883
85	NC_017199	CCTAT	2	10	108830	108839	20 %	40 %	0 %	40 %	384177883
86	NC_017199	AAGTA	2	10	109010	109019	60 %	20 %	20 %	0 %	384177883
87	NC_017199	CATTA	2	10	111026	111035	40 %	40 %	0 %	20 %	384177885
88	NC_017199	AATGA	2	10	111813	111822	60 %	20 %	20 %	0 %	384177885
89	NC_017199	GCAAA	2	10	112695	112704	60 %	0 %	20 %	20 %	384177885
90	NC_017199	TTTCT	2	10	115621	115630	0 %	80 %	0 %	20 %	384177888
91	NC_017199	GATTC	2	10	116885	116894	20 %	40 %	20 %	20 %	384177888
92	NC_017199	AATGA	2	10	118865	118874	60 %	20 %	20 %	0 %	384177889
93	NC_017199	TTCTT	2	10	126067	126076	0 %	80 %	0 %	20 %	384177898
94	NC_017199	GAATG	2	10	126081	126090	40 %	20 %	40 %	0 %	384177898
95	NC_017199	CCTTA	2	10	128541	128550	20 %	40 %	0 %	40 %	384177900
96	NC_017199	CATTT	2	10	129181	129190	20 %	60 %	0 %	20 %	384177901
97	NC_017199	TATCG	2	10	130259	130268	20 %	40 %	20 %	20 %	384177902
98	NC_017199	GGCTT	2	10	131636	131645	0 %	40 %	40 %	20 %	384177903
99	NC_017199	TCAAA	2	10	132168	132177	60 %	20 %	0 %	20 %	384177904
100	NC_017199	CTAAA	2	10	132723	132732	60 %	20 %	0 %	20 %	384177904
101	NC_017199	ACGAA	2	10	133280	133289	60 %	0 %	20 %	20 %	384177904
102	NC_017199	AAGTT	2	10	134561	134570	40 %	40 %	20 %	0 %	384177904
103	NC_017199	CGATT	2	10	138009	138018	20 %	40 %	20 %	20 %	384177908

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.