MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar finitimus YBT-020 plasmid pBMB28

Total Repeats: 95

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017199	TTCT	2	8	365	372	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017199	TTAG	2	8	822	829	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017199	CTAA	2	8	844	851	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017199	TTTC	2	8	1457	1464	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017199	AATT	2	8	10314	10321	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017199	ATAA	2	8	10936	10943	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017199	GATT	2	8	10952	10959	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017199	ATCA	2	8	11057	11064	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017199	ATTT	2	8	11083	11090	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017199	AAAC	2	8	20260	20267	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017199	TTCA	2	8	20274	20281	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017199	AGAA	2	8	23273	23280	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017199	TAAT	2	8	23330	23337	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017199	TAAA	2	8	24300	24307	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017199	ATTT	2	8	24416	24423	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017199	ATTA	2	8	25418	25425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017199	TATT	2	8	26518	26525	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017199	AACT	2	8	27237	27244	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017199	TAAA	2	8	28800	28807	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017199	ACAT	2	8	29259	29266	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017199	TCCT	2	8	29359	29366	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017199	TAAA	2	8	31427	31434	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017199	ATTA	2	8	31544	31551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017199	ATTG	2	8	31693	31700	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017199	TAAG	2	8	32381	32388	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017199	AATT	2	8	33893	33900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017199	ATGT	2	8	33989	33996	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017199	AACC	2	8	35904	35911	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_017199	TATG	2	8	35970	35977	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017199	TAAG	2	8	62997	63004	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017199	TGAC	2	8	63873	63880	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017199	TAAA	2	8	65180	65187	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017199	TTTA	2	8	65205	65212	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017199	TGTT	2	8	65605	65612	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017199	AATT	2	8	65621	65628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017199	GCAA	2	8	68045	68052	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017199	GCAA	2	8	68097	68104	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_017199	TGCT	2	8	68197	68204	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017199	GCGA	2	8	68314	68321	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017199	GAAG	2	8	70012	70019	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017199	AAAT	2	8	70115	70122	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017199	TTAT	2	8	70148	70155	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017199	TAAG	2	8	70177	70184	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017199	GTTA	2	8	70421	70428	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017199	TAAA	2	8	73629	73636	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017199	TAAA	2	8	73646	73653	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017199	ATTT	2	8	76126	76133	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017199	CATC	2	8	79682	79689	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017199	TTAG	2	8	79813	79820	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017199	ATAC	2	8	79914	79921	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017199	GTAG	2	8	82852	82859	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017199	ATTT	2	8	82953	82960	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017199	ATTC	2	8	85201	85208	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017199	ATAC	2	8	85314	85321	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017199	ATTA	2	8	87691	87698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017199	ATAA	2	8	87705	87712	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017199	AATG	2	8	94373	94380	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017199	TTTA	2	8	94736	94743	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017199	GATG	2	8	95402	95409	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017199	TTTG	2	8	95519	95526	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017199	AGTT	2	8	95618	95625	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017199	ATGT	2	8	97973	97980	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017199	TGAT	2	8	103114	103121	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017199	ATAA	2	8	103376	103383	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017199	GATG	2	8	105158	105165	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017199	TAAA	2	8	105456	105463	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017199	CTTT	2	8	105495	105502	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_017199	ATTT	2	8	108003	108010	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017199	AGAA	2	8	108126	108133	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017199	TAAT	2	8	108152	108159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017199	TAAG	2	8	108178	108185	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017199	TATT	2	8	109424	109431	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017199	TAAT	2	8	113904	113911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017199	ATGC	2	8	114397	114404	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_017199	TTCG	2	8	114467	114474	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_017199	AAGA	2	8	114677	114684	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017199	AATA	2	8	114909	114916	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017199	AAAC	2	8	120499	120506	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_017199	AAGG	2	8	120549	120556	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017199	CCTT	2	8	120570	120577	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_017199	TCTT	2	8	121742	121749	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_017199	AAAC	2	8	121798	121805	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_017199	TTTA	2	8	121932	121939	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017199	ACGT	2	8	124007	124014	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017199	ATGA	2	8	125065	125072	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017199	TCAT	2	8	125530	125537	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_017199	TTAA	2	8	129214	129221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017199	TGGA	2	8	130469	130476	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017199	AATT	2	8	130694	130701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017199	TATT	2	8	130714	130721	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017199	AGAA	2	8	130900	130907	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017199	AAAT	2	8	131040	131047	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017199	AATT	2	8	131292	131299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017199	GGAT	2	8	131964	131971	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017199	TCTT	2	8	138576	138583	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.