MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar finitimus YBT-020 plasmid pBMB28

Total Repeats: 326

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017199	TCC	2	6	174	179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_017199	ATT	2	6	347	352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017199	GAA	2	6	395	400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017199	ATA	2	6	806	811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017199	AGA	2	6	866	871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017199	GCG	2	6	893	898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017199	CAT	2	6	1226	1231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017199	TTA	2	6	1232	1237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017199	ATA	2	6	1282	1287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017199	TAT	2	6	1290	1295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017199	TTA	2	6	1337	1342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017199	ATT	2	6	1350	1355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017199	TAA	2	6	1401	1406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017199	AAG	2	6	1468	1473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017199	ATT	2	6	1645	1650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017199	GGA	2	6	1664	1669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017199	AAT	2	6	9439	9444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017199	ACC	2	6	10218	10223	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_017199	TAG	2	6	10231	10236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017199	ATT	2	6	10337	10342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017199	GAA	2	6	10352	10357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017199	CAT	2	6	10407	10412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017199	TAT	3	9	10881	10889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017199	AAT	2	6	10895	10900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017199	GAA	2	6	10965	10970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017199	AAT	2	6	11003	11008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017199	TAT	2	6	12155	12160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017199	ATA	2	6	16219	16224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017199	AGT	2	6	19315	19320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017199	ATC	2	6	19372	19377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017199	AGG	2	6	19402	19407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017199	ATT	2	6	20144	20149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017199	TAA	2	6	21883	21888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017199	CCT	2	6	22125	22130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_017199	TTA	2	6	22168	22173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017199	TTA	2	6	22186	22191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017199	TCT	2	6	22195	22200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017199	ATT	2	6	22210	22215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017199	CAA	2	6	22336	22341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017199	TTG	2	6	23303	23308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017199	ATA	2	6	23340	23345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017199	CCT	2	6	24103	24108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_017199	AAT	2	6	24113	24118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017199	AAT	2	6	24157	24162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017199	ATT	2	6	24163	24168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017199	GTA	2	6	24220	24225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017199	TAA	2	6	24320	24325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017199	TAT	2	6	24340	24345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017199	TAA	2	6	24385	24390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017199	TAC	2	6	24494	24499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017199	TAA	2	6	24737	24742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017199	TAA	2	6	25165	25170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017199	ATT	2	6	25463	25468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017199	TAA	2	6	25573	25578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017199	TCC	2	6	26393	26398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_017199	ACA	2	6	26452	26457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017199	CAT	2	6	26651	26656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017199	AGA	2	6	26692	26697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017199	TTC	2	6	26702	26707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017199	CTT	2	6	26718	26723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017199	TTA	2	6	26746	26751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017199	CCT	2	6	27201	27206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_017199	ATG	2	6	27335	27340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017199	GAG	2	6	27576	27581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017199	ATT	2	6	28929	28934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017199	TAT	2	6	29040	29045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017199	TGT	2	6	29055	29060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017199	CGG	2	6	29171	29176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017199	CAT	2	6	29250	29255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017199	ACT	2	6	29316	29321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017199	TAA	2	6	31524	31529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017199	ATT	3	9	31559	31567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017199	TTA	2	6	31570	31575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017199	TGA	2	6	31611	31616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017199	TTG	2	6	31764	31769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017199	GAA	2	6	31868	31873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017199	TTG	2	6	31883	31888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017199	TAA	2	6	32016	32021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017199	GAA	2	6	32028	32033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017199	TGA	3	9	32034	32042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017199	TAA	2	6	32055	32060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017199	AAG	2	6	32131	32136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017199	TAG	2	6	32152	32157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017199	AAG	2	6	32174	32179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017199	CCT	2	6	33338	33343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_017199	AAG	2	6	33715	33720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017199	GAA	2	6	33725	33730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017199	TCC	2	6	33735	33740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_017199	TCT	2	6	33765	33770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017199	TAA	2	6	33971	33976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017199	ATT	2	6	34017	34022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017199	GGT	2	6	34069	34074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017199	AGG	2	6	34078	34083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017199	TTA	2	6	36089	36094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017199	AGG	2	6	36114	36119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017199	CTT	2	6	36499	36504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017199	AAT	2	6	36696	36701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017199	GTT	2	6	36706	36711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017199	AGG	2	6	36742	36747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017199	AGT	2	6	42337	42342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017199	ATC	2	6	42365	42370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017199	AAT	2	6	42431	42436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017199	AAC	2	6	42437	42442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017199	TTA	2	6	42480	42485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017199	ATT	2	6	43661	43666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017199	ATT	2	6	43778	43783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017199	AAT	2	6	43867	43872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017199	ATG	2	6	43879	43884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017199	AAC	2	6	45205	45210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017199	TGG	2	6	48317	48322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017199	GGA	2	6	48323	48328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017199	AGG	2	6	50656	50661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017199	AGG	2	6	51218	51223	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017199	AAG	2	6	51224	51229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017199	AGG	2	6	57662	57667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017199	AGG	2	6	60033	60038	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017199	AGG	2	6	60534	60539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017199	GTG	2	6	61282	61287	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017199	TCA	2	6	61357	61362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017199	ATT	2	6	63011	63016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017199	ACT	2	6	63023	63028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017199	TTA	2	6	63074	63079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017199	GAA	2	6	63147	63152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017199	TGA	2	6	63597	63602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017199	TGT	2	6	63934	63939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017199	TTA	2	6	64432	64437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017199	GGA	2	6	64443	64448	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017199	AGG	2	6	65046	65051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017199	TTA	2	6	65129	65134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017199	GGT	2	6	65304	65309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017199	TGG	2	6	66956	66961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017199	ATA	2	6	67891	67896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017199	TAG	2	6	68240	68245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017199	TGG	2	6	68258	68263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017199	GCC	2	6	68352	68357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_017199	AGG	2	6	68679	68684	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017199	TGA	2	6	70061	70066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017199	TGA	2	6	70200	70205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017199	TAT	2	6	70206	70211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017199	ATA	2	6	70321	70326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017199	CAT	2	6	70328	70333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_017199	TAA	2	6	70612	70617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_017199	ATT	2	6	121994	121999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.