MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus subtilis subsp. subtilis str. RO-NN-1 chromosome

Total Repeats: 141

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017195	TTTCCC	2	12	3133	3144	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_017195	ATAAAT	2	12	45395	45406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017195	ATCCTC	2	12	69932	69943	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017195	ATATTG	2	12	71999	72010	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017195	TTCTTT	2	12	210954	210965	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017195	CTGTTT	2	12	228775	228786	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_017195	GTTTTT	2	12	270254	270265	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017195	AAATGA	2	12	294701	294712	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017195	TTTTGT	2	12	317007	317018	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017195	TTCATT	2	12	328187	328198	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_017195	TTTTTA	2	12	359779	359790	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017195	ATTTTT	2	12	368063	368074	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017195	CAGCGG	2	12	369628	369639	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017195	GAGAAA	2	12	369833	369844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017195	GTTCAG	2	12	375767	375778	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_017195	ATGATA	2	12	423623	423634	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017195	AGAGAC	2	12	441587	441598	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_017195	TTTTTA	2	12	443407	443418	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017195	TCCTTT	2	12	487281	487292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017195	AAACAA	2	12	510372	510383	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017195	ATTTTT	2	12	522753	522764	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017195	ATACAG	2	12	548179	548190	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_017195	GTTTTC	2	12	558776	558787	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_017195	TTCAAA	2	12	595575	595586	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_017195	CGTGAT	2	12	658775	658786	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017195	TTTTGA	2	12	673510	673521	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017195	CTTTCT	2	12	683052	683063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017195	ACATAT	2	12	765480	765491	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_017195	TACTTT	2	12	833088	833099	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_017195	CCCGCA	2	12	909347	909358	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_017195	GAACAA	2	12	923028	923039	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_017195	CTTTTT	2	12	933405	933416	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_017195	GCGGAA	2	12	939892	939903	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_017195	GTCATT	2	12	969086	969097	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_017195	TTTTGA	2	12	975452	975463	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017195	CTTTTT	2	12	986220	986231	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_017195	CCGCTG	2	12	999951	999962	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017195	TCTTTT	2	12	1052398	1052409	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_017195	CGGAAG	2	12	1053282	1053293	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017195	GAATTT	2	12	1081717	1081728	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017195	CTTTTT	2	12	1092680	1092691	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_017195	GGATAG	2	12	1114819	1114830	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017195	CGGACC	2	12	1131873	1131884	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
44	NC_017195	TTTGAA	2	12	1188288	1188299	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017195	GGTTAA	2	12	1202044	1202055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017195	TATAAT	2	12	1235708	1235719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017195	CTAAGA	2	12	1242202	1242213	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017195	TAGTTT	2	12	1242412	1242423	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017195	TATACT	2	12	1247568	1247579	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_017195	GTTAAC	2	12	1277404	1277415	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_017195	AAATCA	2	12	1312066	1312077	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_017195	AATTCA	2	12	1363445	1363456	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_017195	TCTGTT	2	12	1370585	1370596	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_017195	CGGAAT	2	12	1393821	1393832	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_017195	ATGAAA	2	12	1404541	1404552	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017195	TACATA	2	12	1421747	1421758	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_017195	ATAATT	2	12	1428978	1428989	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017195	AAAGGA	2	12	1439511	1439522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017195	ATCATT	2	12	1457963	1457974	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_017195	TATGGC	2	12	1458222	1458233	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_017195	ATCATT	2	12	1461372	1461383	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_017195	TTTGCT	2	12	1469866	1469877	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_017195	AATATG	2	12	1697299	1697310	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017195	AACAAA	2	12	1708685	1708696	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_017195	TCCTTC	2	12	1716050	1716061	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_017195	AACATG	2	12	1758126	1758137	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_017195	ACTGCA	2	12	1859281	1859292	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017195	CATAAT	2	12	1859498	1859509	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_017195	TTTGCC	2	12	1859667	1859678	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017195	GATTTT	2	12	1859920	1859931	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017195	CGTAAT	2	12	1867470	1867481	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_017195	CAGGAT	2	12	1889561	1889572	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_017195	TGAAAT	2	12	1899213	1899224	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017195	TTTTAA	2	12	1915113	1915124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017195	ATAGAG	2	12	1922483	1922494	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017195	AAGAGA	2	12	1985879	1985890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017195	ATCATT	2	12	2020408	2020419	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_017195	AGCTCC	2	12	2025440	2025451	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017195	TTTTTA	2	12	2026327	2026338	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017195	TCCATT	2	12	2051068	2051079	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017195	ATTTTC	2	12	2051431	2051442	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_017195	TATCAC	2	12	2131498	2131509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017195	TTATGT	2	12	2151532	2151543	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017195	TTTCGA	2	12	2293733	2293744	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_017195	ATTTTG	2	12	2294709	2294720	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017195	CTTTTC	2	12	2374377	2374388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017195	TTCTAA	2	12	2447554	2447565	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_017195	TGACTT	2	12	2473653	2473664	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_017195	ACAGAC	2	12	2500545	2500556	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017195	TTATAA	2	12	2503368	2503379	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017195	TTGAAT	2	12	2538627	2538638	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017195	ATAAAC	2	12	2545019	2545030	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_017195	CCAAAT	2	12	2578074	2578085	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017195	GTTCAC	2	12	2618220	2618231	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017195	ACAAAA	2	12	2658109	2658120	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_017195	GCCGGA	2	12	2665693	2665704	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017195	CCCTCT	2	12	2709961	2709972	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_017195	CTCTTT	2	12	2757619	2757630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017195	TTTAAG	2	12	2784409	2784420	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017195	TATTCA	2	12	2785053	2785064	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_017195	TGATTT	2	12	2801393	2801404	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017195	CTTATC	2	12	2835981	2835992	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017195	TAAAAA	2	12	2852347	2852358	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017195	AAAAGA	2	12	2879138	2879149	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017195	CTTATA	2	12	2962497	2962508	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_017195	TGCAAA	2	12	3064820	3064831	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_017195	ATTATC	2	12	3083186	3083197	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_017195	CCTAAA	2	12	3094854	3094865	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017195	CTCTAT	2	12	3099126	3099137	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017195	CGCTGA	2	12	3108793	3108804	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017195	GCCTCC	2	12	3123132	3123143	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_017195	CATTTA	2	12	3207985	3207996	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_017195	AAAATG	2	12	3215909	3215920	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017195	AAAAAC	2	12	3239624	3239635	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_017195	CAAAAA	2	12	3288622	3288633	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_017195	GAAGTT	2	12	3290082	3290093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017195	CTCAGT	2	12	3307121	3307132	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017195	AAACAT	2	12	3356582	3356593	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_017195	CTTTTT	2	12	3362501	3362512	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_017195	TTTCTT	2	12	3373364	3373375	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_017195	TCAAAT	2	12	3374328	3374339	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_017195	AAAAAC	2	12	3429878	3429889	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_017195	GTATAT	2	12	3430637	3430648	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017195	ATTTAA	2	12	3473148	3473159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017195	GTATAC	2	12	3504443	3504454	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_017195	TTTTAT	2	12	3509064	3509075	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017195	TCACTT	2	12	3534795	3534806	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017195	TTCTTT	2	12	3542284	3542295	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_017195	TAAAAA	2	12	3553793	3553804	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017195	TGAGGA	2	12	3591375	3591386	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017195	TCAAAA	2	12	3605435	3605446	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_017195	CTTTTG	2	12	3687419	3687430	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_017195	TATCTT	2	12	3696691	3696702	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_017195	GAATAT	2	12	3821603	3821614	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017195	TGCACC	2	12	3834959	3834970	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
136	NC_017195	ATAACA	2	12	3838675	3838686	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_017195	TGATAA	2	12	3873926	3873937	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017195	TTGCCC	2	12	3918762	3918773	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
139	NC_017195	TTTTTC	2	12	3921186	3921197	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
140	NC_017195	CCCTTT	2	12	3941722	3941733	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_017195	AGAAAT	2	12	4009339	4009350	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.