MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Bacillus subtilis subsp. subtilis str. RO-NN-1 chromosome

Total Repeats: 1219

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017195	TATGAT	2	12	5413	5424	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384173667
2	NC_017195	TGAAGA	2	12	8475	8486	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384173668
3	NC_017195	CGGTGT	2	12	16789	16800	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384173670
4	NC_017195	CAAAAG	2	12	17546	17557	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384173671
5	NC_017195	GCAAAA	2	12	17932	17943	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384173671
6	NC_017195	AAAAAC	2	12	36925	36936	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	384173686
7	NC_017195	GAAGTT	2	12	39995	40006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384173689
8	NC_017195	CAGATC	2	12	43059	43070	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384173694
9	NC_017195	AGCAAA	2	12	48604	48615	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384173700
10	NC_017195	ATTACT	2	12	49186	49197	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384173700
11	NC_017195	TCAGAA	2	12	53205	53216	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384173705
12	NC_017195	GAGCGG	2	12	54108	54119	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384173706
13	NC_017195	GCTGAA	2	12	54530	54541	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384173707
14	NC_017195	CGGCAG	2	12	65799	65810	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384173718
15	NC_017195	AGGAAA	2	12	66583	66594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384173719
16	NC_017195	TGAGCT	2	12	66710	66721	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384173719
17	NC_017195	GATATC	2	12	81053	81064	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384173731
18	NC_017195	CAGTCA	2	12	83399	83410	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384173733
19	NC_017195	TGAGGA	2	12	85833	85844	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384173736
20	NC_017195	CCAAAT	2	12	88853	88864	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384173741
21	NC_017195	ATTAAA	2	12	101523	101534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384173743
22	NC_017195	TAAAAT	2	12	101761	101772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384173743
23	NC_017195	AAACTG	2	12	104910	104921	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384173746
24	NC_017195	CATTTA	2	12	118646	118657	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384173762
25	NC_017195	TCTGGT	2	12	118711	118722	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384173762
26	NC_017195	GAAGCT	2	12	119228	119239	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384173763
27	NC_017195	TTCGAT	2	12	119297	119308	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384173763
28	NC_017195	CTTGCT	2	12	120370	120381	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384173764
29	NC_017195	CTGTAG	2	12	120581	120592	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384173765
30	NC_017195	TCGGCT	2	12	122376	122387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384173767
31	NC_017195	AGTTGA	2	12	130812	130823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384173772
32	NC_017195	TGCTGT	2	12	130848	130859	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384173772
33	NC_017195	TTTGAA	2	12	132106	132117	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384173772
34	NC_017195	AAGTGG	2	12	132359	132370	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384173772
35	NC_017195	GAAACT	2	12	132957	132968	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384173773
36	NC_017195	TCAAAA	2	12	134345	134356	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384173774
37	NC_017195	TAAAGG	2	12	135915	135926	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384173776
38	NC_017195	GTCGGT	2	12	142533	142544	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384173789
39	NC_017195	ATCGAA	2	12	142626	142637	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384173789
40	NC_017195	GAAAAG	2	12	147753	147764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384173798
41	NC_017195	AAACAA	2	12	147794	147805	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	384173798
42	NC_017195	CTGTTG	2	12	155080	155091	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384173809
43	NC_017195	GTAAAT	2	12	182603	182614	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384173823
44	NC_017195	TCTGAT	2	12	182624	182635	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384173823
45	NC_017195	TTTTTG	2	12	182671	182682	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	384173823
46	NC_017195	AAAAAG	2	12	183497	183508	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384173824
47	NC_017195	GTAAAA	2	12	189100	189111	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384173827
48	NC_017195	TGACGT	2	12	192163	192174	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384173830
49	NC_017195	TATGCA	2	12	195351	195362	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384173834
50	NC_017195	GGCCGC	2	12	196385	196396	0 %	0 %	50 %	50 %	384173835
51	NC_017195	AGGATG	2	12	198331	198342	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384173836
52	NC_017195	GCGATG	2	12	200752	200763	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384173839
53	NC_017195	AGCGGA	2	12	201036	201047	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384173839
54	NC_017195	GAAATG	2	12	201517	201528	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384173839
55	NC_017195	GAATTT	2	12	216471	216482	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384173855
56	NC_017195	AGCACA	2	12	217353	217364	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384173856
57	NC_017195	AGGCGA	2	12	220712	220723	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384173859
58	NC_017195	ATTCAA	2	12	221861	221872	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384173860
59	NC_017195	GGCAAA	2	12	225405	225416	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384173862
60	NC_017195	AAGGAA	2	12	226075	226086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384173863
61	NC_017195	TTGGCG	2	12	227436	227447	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384173865
62	NC_017195	CAGGAC	2	12	232265	232276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384173870
63	NC_017195	TCAGCC	2	12	240277	240288	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384173880
64	NC_017195	CAAGCA	2	12	243056	243067	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384173882
65	NC_017195	AAGTCC	2	12	243783	243794	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384173882
66	NC_017195	ATATGA	2	12	246558	246569	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384173884
67	NC_017195	GTCAGA	2	12	247447	247458	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384173885
68	NC_017195	ATGCCG	2	12	253574	253585	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384173893
69	NC_017195	ACTCTT	2	12	257794	257805	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384173895
70	NC_017195	ACAAGA	2	12	261019	261030	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384173897
71	NC_017195	AGCGGA	2	12	269006	269017	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384173909
72	NC_017195	CGGAAA	2	12	269969	269980	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384173910
73	NC_017195	AAAAAC	2	12	270963	270974	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	384173912
74	NC_017195	GCGGCA	2	12	280014	280025	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384173922
75	NC_017195	TATGCA	2	12	281452	281463	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384173923
76	NC_017195	CACATC	2	12	282533	282544	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384173924
77	NC_017195	CAAAAG	2	12	289003	289014	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384173930
78	NC_017195	AGCTGA	2	12	289157	289168	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384173930
79	NC_017195	ATTTTC	2	12	289214	289225	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384173930
80	NC_017195	GATTTG	2	12	293084	293095	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384173934
81	NC_017195	ACAGAA	2	12	296253	296264	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384173936
82	NC_017195	AAAATC	2	12	303006	303017	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384173944
83	NC_017195	ATCGTT	2	12	309561	309572	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384173949
84	NC_017195	CATCGG	2	12	309652	309663	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384173950
85	NC_017195	TGAGCC	2	12	311516	311527	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384173951
86	NC_017195	AAAAGA	2	12	313456	313467	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384173953
87	NC_017195	ACTATT	2	12	316564	316575	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384173956
88	NC_017195	ACGCTG	2	12	319409	319420	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384173957
89	NC_017195	ACAATG	2	12	323405	323416	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384173960
90	NC_017195	GCTGAA	2	12	327567	327578	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384173965
91	NC_017195	CAAGAA	2	12	328661	328672	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384173966
92	NC_017195	TATTGA	2	12	330107	330118	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384173969
93	NC_017195	GTCTTT	2	12	332304	332315	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384173971
94	NC_017195	ATGGGG	2	12	339276	339287	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	384173977
95	NC_017195	TATCGG	2	12	339490	339501	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384173977
96	NC_017195	ATGTCC	2	12	340101	340112	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384173978
97	NC_017195	GAAAAA	2	12	340525	340536	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384173978
98	NC_017195	TCATGG	2	12	340614	340625	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384173978
99	NC_017195	ATGACA	2	12	344705	344716	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384173982
100	NC_017195	ATGTGA	2	12	355334	355345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384173989
101	NC_017195	GAGCAA	2	12	357120	357131	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384173992
102	NC_017195	CTGATT	2	12	359640	359651	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384173996
103	NC_017195	AGTTTT	2	12	360564	360575	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384173998
104	NC_017195	AAAAGG	2	12	362070	362081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384174001
105	NC_017195	CAGCTG	2	12	364079	364090	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384174003
106	NC_017195	ATGGTA	2	12	365730	365741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384174004
107	NC_017195	AATGTC	2	12	392162	392173	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384174011
108	NC_017195	GATCAG	2	12	392945	392956	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384174011
109	NC_017195	ATCAGG	2	12	393234	393245	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384174011
110	NC_017195	CCTGAA	2	12	401180	401191	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384174019
111	NC_017195	ATGAAA	2	12	404835	404846	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384174024
112	NC_017195	GAAACA	2	12	406116	406127	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384174025
113	NC_017195	GAGGGC	2	12	406746	406757	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384174027
114	NC_017195	CTAAGC	2	12	406861	406872	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384174027
115	NC_017195	AAGAAA	2	12	411534	411545	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384174031
116	NC_017195	TTTATT	2	12	412778	412789	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384174031
117	NC_017195	GCTTGA	2	12	417308	417319	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384174035
118	NC_017195	TGAAAT	2	12	421313	421324	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384174038
119	NC_017195	TCAAGC	2	12	430345	430356	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384174050
120	NC_017195	CAGAAA	2	12	432238	432249	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384174053
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146	NC_017195	CTTTGA	2	12	516371	516382	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384174143
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217	NC_017195	CGTGGT	2	12	725663	725674	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384174356
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222	NC_017195	AGCAGG	2	12	736663	736674	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384174371
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225	NC_017195	AGGGCG	2	12	741198	741209	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384174374
226	NC_017195	GACGGA	2	12	750670	750681	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384174382
227	NC_017195	TGTCAT	2	12	760371	760382	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384174388
228	NC_017195	ATCAAA	2	12	762059	762070	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384174390
229	NC_017195	TATTCA	2	12	763979	763990	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384174393
230	NC_017195	CGGCCG	2	12	781261	781272	0 %	0 %	50 %	50 %	384174408
231	NC_017195	GTATGA	2	12	783527	783538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384174410
232	NC_017195	CCAGCA	2	12	791520	791531	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384174418
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329	NC_017195	TGTGCT	2	12	1083429	1083440	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384174722
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331	NC_017195	ATCTTT	2	12	1095342	1095353	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384174734
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333	NC_017195	ATGATC	2	12	1114026	1114037	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384174754
334	NC_017195	GATCTG	2	12	1119034	1119045	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384174758
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336	NC_017195	CCGGTG	2	12	1123533	1123544	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384174760
337	NC_017195	AACAGC	2	12	1124308	1124319	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384174760
338	NC_017195	CGGAAG	2	12	1124862	1124873	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384174760
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449	NC_017195	GGAAAA	2	12	1484161	1484172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384175174
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