MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus subtilis subsp. subtilis str. RO-NN-1 chromosome

Total Repeats: 499

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017195	TCGTG	2	10	10822	10831	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017195	GGACG	2	10	11695	11704	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3	NC_017195	GGAAA	2	10	23859	23868	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017195	GTTCC	2	10	24660	24669	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_017195	GAAAA	2	10	30043	30052	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017195	TCGTG	2	10	31291	31300	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_017195	GGACG	2	10	32164	32173	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
8	NC_017195	ATAGG	2	10	48412	48421	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017195	TGAAA	2	10	55585	55594	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017195	ACTTC	2	10	60499	60508	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
11	NC_017195	GGAAG	2	10	61293	61302	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017195	AACGG	2	10	62458	62467	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017195	ACAAA	2	10	69270	69279	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_017195	CTTGG	2	10	71143	71152	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017195	TCGTG	2	10	91471	91480	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017195	GGACG	2	10	92167	92176	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
17	NC_017195	AATAG	2	10	95902	95911	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017195	TCGTG	2	10	97328	97337	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_017195	GGACG	2	10	98024	98033	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
20	NC_017195	TATAA	2	10	101144	101153	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017195	ACATG	2	10	110882	110891	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_017195	TAAGA	2	10	117169	117178	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017195	TGACA	2	10	119675	119684	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_017195	TTACG	2	10	119796	119805	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_017195	TTGTG	2	10	153636	153645	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017195	TTGGG	2	10	154580	154589	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017195	TCGTG	2	10	161830	161839	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_017195	GGACG	2	10	162526	162535	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
29	NC_017195	AATTG	2	10	165922	165931	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017195	AATAG	2	10	166016	166025	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017195	TCGTG	2	10	167445	167454	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017195	GGACG	2	10	168141	168150	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
33	NC_017195	TCGTG	2	10	172451	172460	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_017195	GGACG	2	10	173147	173156	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
35	NC_017195	CAATA	2	10	176846	176855	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_017195	TTTTC	2	10	176887	176896	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_017195	TAAAA	2	10	176908	176917	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017195	CCCTT	2	10	191061	191070	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
39	NC_017195	TGCTT	2	10	193940	193949	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_017195	ATAAA	2	10	193959	193968	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017195	ACAAG	2	10	199766	199775	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_017195	CTTGT	2	10	199863	199872	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_017195	CTTAT	2	10	202247	202256	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_017195	TTTCA	2	10	208623	208632	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_017195	GAATA	2	10	210873	210882	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017195	AAAGT	2	10	219309	219318	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017195	TCAAA	2	10	223190	223199	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_017195	TTATT	2	10	244128	244137	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017195	CTTCA	2	10	255829	255838	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
50	NC_017195	TTGCT	2	10	266213	266222	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_017195	AGCTG	2	10	266625	266634	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
52	NC_017195	ATTTG	2	10	268645	268654	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017195	TGCGC	2	10	330559	330568	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
54	NC_017195	TTTTA	2	10	366092	366101	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017195	GCTGA	2	10	370232	370241	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_017195	ACCGG	2	10	371028	371037	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
57	NC_017195	ATTTG	2	10	371983	371992	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017195	ATTTG	2	10	372781	372790	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017195	GGAAC	2	10	374549	374558	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_017195	GCATT	2	10	375435	375444	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_017195	AATAC	2	10	375957	375966	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_017195	ACTTT	2	10	427488	427497	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_017195	GACAT	2	10	438655	438664	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_017195	ATCGG	2	10	449717	449726	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
65	NC_017195	TCACC	2	10	449791	449800	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
66	NC_017195	AAAGA	2	10	459870	459879	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017195	ATTTT	2	10	479858	479867	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017195	CCGAA	2	10	482474	482483	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
69	NC_017195	TGTTA	2	10	486390	486399	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017195	GGAAG	2	10	487369	487378	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017195	TGTTT	2	10	488265	488274	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017195	ATAAA	2	10	501935	501944	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017195	GTACG	2	10	503932	503941	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
74	NC_017195	GAAAA	2	10	510548	510557	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017195	TGGAA	2	10	527499	527508	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017195	TTTAC	2	10	531506	531515	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_017195	GTTTT	2	10	535161	535170	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017195	GAATA	2	10	538400	538409	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017195	ATCAA	2	10	542686	542695	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_017195	AAATC	2	10	542740	542749	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_017195	GATTT	2	10	552579	552588	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017195	TATCA	2	10	557214	557223	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_017195	TTTTA	2	10	562038	562047	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017195	CAATT	2	10	580002	580011	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_017195	GTACA	2	10	586663	586672	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_017195	TTTCA	2	10	588934	588943	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_017195	GAGAG	2	10	589064	589073	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017195	GCTAG	2	10	602354	602363	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
89	NC_017195	GAAGG	2	10	602573	602582	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017195	AAACA	2	10	623837	623846	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_017195	TCGTG	2	10	625400	625409	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
92	NC_017195	GGACG	2	10	626096	626105	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
93	NC_017195	AAACG	2	10	629455	629464	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_017195	CGCTC	2	10	637772	637781	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
95	NC_017195	TTATT	2	10	650123	650132	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017195	ATCAC	2	10	650410	650419	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
97	NC_017195	GAAAT	2	10	650501	650510	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017195	GAAAT	2	10	653276	653285	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017195	TTTAA	2	10	653505	653514	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017195	GCAAA	2	10	661057	661066	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_017195	CAAAA	2	10	704541	704550	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_017195	CTTTA	2	10	715448	715457	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_017195	GTGAG	2	10	719058	719067	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017195	TCATT	2	10	723285	723294	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_017195	AAATG	2	10	727092	727101	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017195	AGTCA	2	10	728479	728488	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_017195	TTTCA	2	10	729310	729319	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_017195	AACCA	2	10	729854	729863	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
109	NC_017195	TAAAA	2	10	739138	739147	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017195	AGAAA	2	10	761835	761844	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017195	TTTGA	2	10	765167	765176	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017195	CTTGG	2	10	766991	767000	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
113	NC_017195	CGCTC	2	10	772737	772746	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
114	NC_017195	GGACG	2	10	778269	778278	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
115	NC_017195	ATATG	2	10	779082	779091	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017195	GGAAA	2	10	784463	784472	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017195	ACTTT	2	10	805335	805344	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_017195	TGTCT	2	10	823385	823394	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_017195	GATTT	2	10	855175	855184	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017195	AATTC	2	10	865533	865542	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_017195	AGTAA	2	10	875585	875594	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017195	TGAGC	2	10	880992	881001	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
123	NC_017195	AAACA	2	10	907966	907975	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_017195	ATCAA	2	10	909094	909103	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_017195	CATCT	2	10	909729	909738	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
126	NC_017195	TCGTG	2	10	927019	927028	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
127	NC_017195	GGACG	2	10	927715	927724	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
128	NC_017195	TCGGC	2	10	933482	933491	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
129	NC_017195	GTATA	2	10	944637	944646	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017195	GTTTC	2	10	944885	944894	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_017195	GGGTG	2	10	946892	946901	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017195	TATTG	2	10	968753	968762	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017195	ATCAT	2	10	974802	974811	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_017195	ATATT	2	10	998651	998660	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017195	AAATA	2	10	1000947	1000956	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017195	AGTGG	2	10	1032608	1032617	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017195	ATTAG	2	10	1042654	1042663	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017195	AAATT	2	10	1049934	1049943	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017195	ATTAC	2	10	1050635	1050644	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_017195	AATAA	2	10	1052423	1052432	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017195	AAAAT	2	10	1055160	1055169	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017195	ATTGA	2	10	1068337	1068346	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017195	ACCTA	2	10	1076705	1076714	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
144	NC_017195	GTTTT	2	10	1078850	1078859	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017195	AAGCG	2	10	1081199	1081208	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
146	NC_017195	GGAAC	2	10	1086321	1086330	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
147	NC_017195	TTTCT	2	10	1086331	1086340	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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288	NC_017195	AACTC	2	10	2222678	2222687	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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422	NC_017195	TTCCG	2	10	3288783	3288792	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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