MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Arcobacter sp. L

Total Repeats: 115

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017192	TTTATA	2	12	6049	6060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017192	AAATAT	2	12	8137	8148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017192	CCTTGA	2	12	70437	70448	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017192	ACAAAA	2	12	73490	73501	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_017192	CAAATC	2	12	75971	75982	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017192	TTTCTT	2	12	76075	76086	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_017192	AAGAAC	2	12	78751	78762	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_017192	AAATGA	2	12	90049	90060	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017192	TTCATT	2	12	114256	114267	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_017192	ATTTTT	2	12	155607	155618	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017192	AATTAA	2	12	199723	199734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017192	ATAATT	2	12	201774	201785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017192	GAAATT	2	12	223533	223544	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017192	ATTTAA	2	12	227082	227093	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017192	TGGATT	2	12	246472	246483	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017192	ACTTAA	2	12	249828	249839	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_017192	GGTTTA	2	12	264107	264118	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017192	ATAATT	2	12	347541	347552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017192	AATAAA	2	12	361145	361156	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017192	AAATAT	2	12	387898	387909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017192	CAAAAA	2	12	481152	481163	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_017192	TTAAAT	2	12	490203	490214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017192	GGAGCA	2	12	552974	552985	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_017192	AAAATA	2	12	569100	569111	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017192	TATAAT	2	12	598331	598342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017192	ATTTTA	2	12	636105	636116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017192	TATAAA	2	12	642049	642060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017192	TTTTAA	2	12	702857	702868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017192	ATCAAA	2	12	874711	874722	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_017192	AAATTA	2	12	908436	908447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017192	TAAATA	2	12	908519	908530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017192	AATACT	2	12	909504	909515	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_017192	TTCTAT	2	12	941054	941065	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_017192	TTTTCC	2	12	943424	943435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017192	TTTAAT	2	12	963212	963223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017192	ATTTTA	2	12	963924	963935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017192	TTAAAA	2	12	1041907	1041918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017192	ATGAAG	2	12	1050936	1050947	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017192	TAAGTT	2	12	1109033	1109044	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017192	AGAAAA	2	12	1125983	1125994	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017192	TATAAA	2	12	1163384	1163395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017192	AAAATA	2	12	1202714	1202725	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017192	TTATTT	2	12	1234943	1234954	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017192	TTTTAT	2	12	1250926	1250937	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017192	TATAAT	2	12	1271105	1271116	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017192	ATTAGA	2	12	1302178	1302189	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017192	AAATAA	2	12	1307646	1307657	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017192	ACCAGT	2	12	1352630	1352641	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017192	TATTAA	2	12	1360839	1360850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017192	AATATA	2	12	1372386	1372397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017192	ACTTCT	2	12	1409696	1409707	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017192	AAATTT	2	12	1417410	1417421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017192	TTAAAA	2	12	1448461	1448472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017192	TTTTTC	2	12	1456581	1456592	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_017192	ATTAAT	2	12	1458544	1458555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017192	AAAGTT	2	12	1476896	1476907	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017192	TAAAAA	2	12	1476930	1476941	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017192	AAAAGA	2	12	1484579	1484590	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017192	TTATAA	2	12	1493293	1493304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017192	TCTTTT	2	12	1499035	1499046	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_017192	TTTATA	2	12	1559259	1559270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017192	TATAAA	2	12	1573589	1573600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017192	TAAATA	2	12	1701995	1702006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017192	AATTAA	2	12	1766212	1766223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017192	ATTTTA	2	12	1786962	1786973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017192	ATATAA	2	12	1799026	1799037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017192	TAAAAA	2	12	1821056	1821067	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017192	TATTTT	2	12	1878918	1878929	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017192	TATTTT	2	12	1885156	1885167	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017192	ATCTGG	2	12	1923458	1923469	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_017192	AAGTTC	2	12	1923760	1923771	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_017192	TTTTAT	2	12	1923967	1923978	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017192	AGTTTT	2	12	1924617	1924628	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017192	TCAGTT	2	12	1945663	1945674	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_017192	TGTAAT	2	12	1956879	1956890	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017192	ATTTAA	2	12	1989407	1989418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017192	TTATAT	2	12	2022811	2022822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017192	CCACAA	2	12	2045729	2045740	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017192	TTTTAA	2	12	2073924	2073935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017192	AATTAA	2	12	2097376	2097387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017192	TCAAAA	2	12	2102571	2102582	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_017192	TATTTT	2	12	2107663	2107674	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017192	ATAATT	2	12	2113708	2113719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017192	TAAAAA	2	12	2137285	2137296	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017192	TGAAAA	2	12	2157183	2157194	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017192	TAAAAA	2	12	2295088	2295099	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017192	AAATTT	2	12	2297860	2297871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017192	CAACTA	2	12	2328615	2328626	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017192	ATTTTT	2	12	2331719	2331730	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017192	GTAATA	2	12	2335506	2335517	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017192	TAAATA	2	12	2342049	2342060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017192	TCAAAG	2	12	2342370	2342381	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_017192	ACTTTA	2	12	2342467	2342478	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_017192	TTTTTA	2	12	2352629	2352640	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017192	TAAGTT	2	12	2435342	2435353	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017192	TTTAAT	2	12	2440290	2440301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017192	AATAAA	2	12	2465034	2465045	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017192	TTTTTA	2	12	2493950	2493961	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017192	ATAAAA	2	12	2550391	2550402	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017192	TTAATA	2	12	2560083	2560094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017192	ATTTTT	2	12	2588057	2588068	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017192	AGAATA	2	12	2598443	2598454	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017192	AAAAAG	2	12	2604941	2604952	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017192	AATTTT	2	12	2605377	2605388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017192	TATTTA	2	12	2630770	2630781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017192	AAGCTT	2	12	2700195	2700206	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_017192	ATTTAT	2	12	2722167	2722178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017192	TTGTAT	2	12	2754825	2754836	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017192	GTTTTT	2	12	2754851	2754862	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017192	TTTTGC	2	12	2793007	2793018	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_017192	AATTAT	2	12	2809413	2809424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017192	TAATAG	2	12	2878594	2878605	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017192	ATTAAT	2	12	2886508	2886519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017192	TTATTC	2	12	2909539	2909550	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_017192	TATTTA	2	12	2910127	2910138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.