MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens XH7 chromosome

Total Repeats: 147

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017191	TTTGAA	2	12	12614	12625	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017191	AACACC	2	12	75278	75289	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017191	AGTCAA	2	12	91729	91740	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_017191	TTAACT	2	12	144785	144796	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_017191	TTATTT	2	12	156223	156234	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017191	GATAAA	2	12	300289	300300	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017191	TATTGA	2	12	301696	301707	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017191	TGATAA	2	12	374156	374167	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017191	GAAAAA	2	12	380331	380342	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017191	GGAAAA	2	12	421847	421858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017191	AGGAGC	2	12	422268	422279	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017191	TTTTGT	2	12	484868	484879	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017191	AAAAAT	2	12	556548	556559	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017191	ATTAAT	2	12	572321	572332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017191	AAAAGG	2	12	587215	587226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017191	TCAATC	2	12	603650	603661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017191	CTTTCT	2	12	615910	615921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017191	TTTCTC	2	12	637556	637567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017191	AGAAAA	2	12	649946	649957	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017191	AAAAAT	2	12	674366	674377	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017191	GTTTAC	2	12	688132	688143	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_017191	ACAAAA	2	12	694459	694470	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_017191	TCCCTT	2	12	731672	731683	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017191	CTTTTT	2	12	770398	770409	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_017191	AAAAAT	2	12	792441	792452	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017191	CTTTTT	2	12	810614	810625	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_017191	AAAAAG	2	12	822237	822248	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017191	AAAAAT	2	12	831951	831962	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017191	TTATAT	2	12	833073	833084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017191	GTGCTG	2	12	835901	835912	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_017191	CATCTT	2	12	837753	837764	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017191	ACTCTC	2	12	839122	839133	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_017191	TTTATA	2	12	857354	857365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017191	ATAAAA	2	12	875061	875072	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017191	CTCAAA	2	12	899633	899644	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017191	CTTTTT	2	12	901213	901224	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_017191	AAAAAG	2	12	923725	923736	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017191	ATAATG	2	12	988223	988234	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017191	TCTTTT	2	12	994326	994337	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017191	GAAAAG	2	12	1003334	1003345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017191	TTACTA	2	12	1008491	1008502	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_017191	AAGGAG	2	12	1023948	1023959	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017191	TAAATA	2	12	1173545	1173556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017191	TATAAA	2	12	1182592	1182603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017191	ATCATT	2	12	1187305	1187316	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_017191	GCCTTT	2	12	1187930	1187941	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017191	GCATAT	2	12	1203828	1203839	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017191	CGCCTG	2	12	1204332	1204343	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017191	AATATT	2	12	1211984	1211995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017191	TCCTCA	2	12	1230660	1230671	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017191	TTTTTA	2	12	1230809	1230820	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017191	AGTTGT	2	12	1233683	1233694	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017191	TTAAAG	2	12	1237984	1237995	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017191	ATAAAA	2	12	1240185	1240196	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017191	AAAAAG	2	12	1240381	1240392	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017191	ATAAAA	2	12	1242458	1242469	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017191	AAATTT	2	12	1249102	1249113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017191	ATAAAA	2	12	1258616	1258627	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017191	GATAAT	2	12	1264789	1264800	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017191	CGACAT	2	12	1266904	1266915	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017191	GCGATT	2	12	1266978	1266989	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_017191	ATAAAA	2	12	1270581	1270592	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017191	ATAAAA	2	12	1276161	1276172	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017191	AATAAA	2	12	1277716	1277727	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017191	TAAAAA	2	12	1281969	1281980	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017191	ATAAAA	2	12	1297312	1297323	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017191	AATAAA	2	12	1301900	1301911	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017191	CGGCAA	2	12	1305536	1305547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017191	ACAAAA	2	12	1311752	1311763	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_017191	ATAAAA	2	12	1311817	1311828	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017191	GGAAGG	2	12	1383844	1383855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017191	GAAAAA	2	12	1415518	1415529	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017191	GCAATA	2	12	1425820	1425831	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_017191	TTTTAT	2	12	1448188	1448199	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017191	TTTTAT	2	12	1448449	1448460	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017191	TCTCTT	2	12	1456032	1456043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017191	AAGATC	2	12	1554542	1554553	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_017191	TTATGC	2	12	1574658	1574669	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_017191	TTTGTT	2	12	1576450	1576461	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017191	AATTCA	2	12	1595540	1595551	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_017191	TTAAAC	2	12	1602733	1602744	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_017191	CAAAAA	2	12	1698994	1699005	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_017191	AACAAA	2	12	1731728	1731739	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_017191	ACCATA	2	12	1751248	1751259	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017191	CCTCTC	2	12	1847381	1847392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_017191	GAAAAA	2	12	1884452	1884463	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017191	AGTTTG	2	12	1928805	1928816	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017191	TCTTTT	2	12	1962089	1962100	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_017191	AATGAT	2	12	1987509	1987520	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017191	TTTTCT	2	12	1988546	1988557	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_017191	AATGAT	2	12	1990753	1990764	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017191	CAATTA	2	12	2004201	2004212	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_017191	TTCCAT	2	12	2121845	2121856	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017191	GTTAAC	2	12	2154961	2154972	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_017191	AAGAAA	2	12	2183687	2183698	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017191	ATTAAA	2	12	2205232	2205243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017191	AATATT	2	12	2230424	2230435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017191	TGTAAA	2	12	2235573	2235584	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017191	TTTTTC	2	12	2307980	2307991	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_017191	TCCTTT	2	12	2322429	2322440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017191	CGTCAT	2	12	2358229	2358240	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017191	TTTATA	2	12	2362324	2362335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017191	CAATCT	2	12	2406341	2406352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017191	TCGCCG	2	12	2436098	2436109	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
105	NC_017191	AAGCTC	2	12	2436475	2436486	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017191	TTCTAA	2	12	2464762	2464773	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_017191	TTTGTC	2	12	2468782	2468793	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_017191	TGACTT	2	12	2490883	2490894	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_017191	ACAGAC	2	12	2517985	2517996	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017191	GAATCA	2	12	2645047	2645058	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_017191	CCCTCT	2	12	2664336	2664347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_017191	ATTGGA	2	12	2676448	2676459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017191	GCTTTT	2	12	2708963	2708974	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_017191	CTCTTT	2	12	2711136	2711147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017191	CTTATA	2	12	2724241	2724252	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_017191	TTTAAG	2	12	2737944	2737955	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017191	GGAAAA	2	12	2752424	2752435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017191	CTTATC	2	12	2796428	2796439	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017191	AAGGCA	2	12	2821393	2821404	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_017191	CTAAAA	2	12	2836425	2836436	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_017191	TTTCTT	2	12	2850183	2850194	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_017191	AGGGAC	2	12	2908216	2908227	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_017191	AATTTT	2	12	2937462	2937473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017191	GCTTTC	2	12	2986236	2986247	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017191	CCAATG	2	12	2997798	2997809	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017191	ATATAC	2	12	2997986	2997997	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_017191	ATTATC	2	12	3034236	3034247	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_017191	CCGCGG	2	12	3041732	3041743	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_017191	CCGCAG	2	12	3052047	3052058	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
130	NC_017191	TTTAAG	2	12	3077857	3077868	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017191	TATAGA	2	12	3078125	3078136	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017191	GAATTT	2	12	3084048	3084059	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017191	TAATGA	2	12	3195756	3195767	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017191	GAAAAA	2	12	3260199	3260210	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017191	CTTTTT	2	12	3326889	3326900	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_017191	TTTCAT	2	12	3377642	3377653	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_017191	TCTTAT	2	12	3405224	3405235	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
138	NC_017191	GCATAA	2	12	3498529	3498540	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_017191	TAGAAT	2	12	3528637	3528648	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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147	NC_017191	GAAAAA	2	12	3936722	3936733	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.