MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens XH7 chromosome

Total Repeats: 1259

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017191	AAAAGA	2	12	4197	4208	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384166628
2	NC_017191	TGAAGA	2	12	8494	8505	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384166631
3	NC_017191	ACGAAT	2	12	17892	17903	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384166638
4	NC_017191	TTCGGC	2	12	19804	19815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384166641
5	NC_017191	GAAGGT	2	12	24139	24150	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384166646
6	NC_017191	TTAAAT	2	12	24645	24656	50 %	50 %	0 %	0 %	384166646
7	NC_017191	GAAAAA	2	12	43272	43283	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384166665
8	NC_017191	TTGTCG	2	12	44087	44098	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384166666
9	NC_017191	AGCGGA	2	12	50531	50542	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384166674
10	NC_017191	TTGCCA	2	12	53941	53952	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384166678
11	NC_017191	ATTGTT	2	12	54531	54542	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384166679
12	NC_017191	GAATCG	2	12	56146	56157	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384166681
13	NC_017191	TGTTAG	2	12	57603	57614	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384166683
14	NC_017191	GTGAGA	2	12	68410	68421	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384166692
15	NC_017191	ATCTGA	2	12	71301	71312	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384166695
16	NC_017191	AGCTGC	2	12	72140	72151	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384166695
17	NC_017191	TGTCGG	2	12	73881	73892	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384166697
18	NC_017191	GACGGA	2	12	79586	79597	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384166702
19	NC_017191	AGGATC	2	12	83256	83267	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384166707
20	NC_017191	GGAAAA	2	12	85106	85117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384166710
21	NC_017191	TGGCAC	2	12	93920	93931	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384166714
22	NC_017191	GTGAAG	2	12	93998	94009	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384166714
23	NC_017191	GCAAAA	2	12	96121	96132	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384166714
24	NC_017191	TGCCGA	2	12	98699	98710	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384166716
25	NC_017191	ATGAAA	2	12	104476	104487	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384166723
26	NC_017191	CATTTA	2	12	109090	109101	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384166731
27	NC_017191	TCTGGT	2	12	109155	109166	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384166731
28	NC_017191	GAAGCT	2	12	109672	109683	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384166732
29	NC_017191	CTTGCA	2	12	110817	110828	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384166733
30	NC_017191	CTGTAG	2	12	111024	111035	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384166734
31	NC_017191	ACACAA	2	12	113539	113550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384166736
32	NC_017191	AACGAA	2	12	118454	118465	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384166737
33	NC_017191	AATCAC	2	12	121154	121165	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384166740
34	NC_017191	AGTTGA	2	12	121241	121252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384166740
35	NC_017191	AAACAG	2	12	121318	121329	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384166740
36	NC_017191	TAAAGG	2	12	126367	126378	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384166744
37	NC_017191	GTCGGT	2	12	132988	132999	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384166756
38	NC_017191	AATAAA	2	12	134367	134378	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384166759
39	NC_017191	CATTAA	2	12	136520	136531	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384166762
40	NC_017191	GAAAAG	2	12	138219	138230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384166764
41	NC_017191	AAACAA	2	12	138260	138271	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	384166764
42	NC_017191	AAAAAG	2	12	139988	139999	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384166766
43	NC_017191	CGGTTG	2	12	145229	145240	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384166772
44	NC_017191	AATGGC	2	12	146150	146161	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384166774
45	NC_017191	ATTTTT	2	12	149521	149532	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384166778
46	NC_017191	GGTTTT	2	12	165857	165868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384166784
47	NC_017191	ACGGAT	2	12	167379	167390	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384166786
48	NC_017191	GCTCCG	2	12	170631	170642	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384166789
49	NC_017191	TAAATA	2	12	172283	172294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384166791
50	NC_017191	TCTGAT	2	12	172303	172314	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384166791
51	NC_017191	ATCGTC	2	12	175247	175258	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384166793
52	NC_017191	GTTGAA	2	12	186164	186175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384166804
53	NC_017191	TGTTGA	2	12	186379	186390	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384166804
54	NC_017191	AGACAA	2	12	187045	187056	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384166804
55	NC_017191	TGGCTG	2	12	189786	189797	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384166808
56	NC_017191	GAAATG	2	12	190298	190309	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384166808
57	NC_017191	AGATGA	2	12	191428	191439	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384166809
58	NC_017191	GAAAAT	2	12	192949	192960	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384166810
59	NC_017191	AGCGAT	2	12	193396	193407	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384166810
60	NC_017191	AATTAA	2	12	194745	194756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384166810
61	NC_017191	TTAATA	2	12	195853	195864	50 %	50 %	0 %	0 %	384166810
62	NC_017191	TTTATT	2	12	198155	198166	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384166812
63	NC_017191	GTGAAA	2	12	198243	198254	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384166812
64	NC_017191	TGCGGA	2	12	200947	200958	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384166815
65	NC_017191	TATCTT	2	12	203048	203059	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384166818
66	NC_017191	GATTTT	2	12	203618	203629	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384166818
67	NC_017191	TGTCTA	2	12	203963	203974	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384166818
68	NC_017191	TCGGCA	2	12	204226	204237	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384166818
69	NC_017191	AAACTG	2	12	206363	206374	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384166821
70	NC_017191	TGAACA	2	12	208491	208502	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384166823
71	NC_017191	CTTTTC	2	12	209249	209260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384166824
72	NC_017191	AAGCGA	2	12	214016	214027	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384166830
73	NC_017191	GAACAT	2	12	219955	219966	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384166837
74	NC_017191	TGAGGC	2	12	221317	221328	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384166840
75	NC_017191	GAAAAA	2	12	222144	222155	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384166841
76	NC_017191	TTTTAT	2	12	224552	224563	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384166844
77	NC_017191	AATACA	2	12	226657	226668	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384166847
78	NC_017191	CTGCCG	2	12	227906	227917	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384166848
79	NC_017191	GAGACG	2	12	229848	229859	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384166851
80	NC_017191	TCCACA	2	12	230566	230577	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384166851
81	NC_017191	ATGCCG	2	12	233686	233697	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384166854
82	NC_017191	TCCACG	2	12	234277	234288	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384166854
83	NC_017191	GAGGAT	2	12	236172	236183	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384166856
84	NC_017191	TTTTAG	2	12	240803	240814	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384166861
85	NC_017191	GCGGAA	2	12	244586	244597	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384166869
86	NC_017191	CGTTTG	2	12	245742	245753	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384166871
87	NC_017191	AGCGGG	2	12	246462	246473	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384166871
88	NC_017191	CAGGAT	2	12	251655	251666	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384166877
89	NC_017191	CCTGAA	2	12	257100	257111	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384166882
90	NC_017191	CGGCAG	2	12	257705	257716	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384166882
91	NC_017191	TGAGAT	2	12	260225	260236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384166885
92	NC_017191	ATGAGC	2	12	262883	262894	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384166887
93	NC_017191	TTTTCA	2	12	262905	262916	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384166887
94	NC_017191	TCATTG	2	12	265007	265018	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384166890
95	NC_017191	GAAGAG	2	12	265372	265383	50 %	0 %	50 %	0 %	384166890
96	NC_017191	CCACAG	2	12	265407	265418	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384166890
97	NC_017191	TTCTGC	2	12	267412	267423	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384166892
98	NC_017191	TCAAAG	2	12	267581	267592	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384166893
99	NC_017191	TGATTT	2	12	269538	269549	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384166896
100	NC_017191	GAAGCG	2	12	269764	269775	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384166896
101	NC_017191	ATCGGA	2	12	270900	270911	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384166898
102	NC_017191	AAAATC	2	12	273139	273150	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384166900
103	NC_017191	CTGTCA	2	12	273922	273933	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384166900
104	NC_017191	CATTGA	2	12	274061	274072	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384166900
105	NC_017191	TAAAAA	2	12	276018	276029	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384166902
106	NC_017191	AGAGTG	2	12	281762	281773	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384166907
107	NC_017191	TTGCCG	2	12	282023	282034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384166907
108	NC_017191	GGAAAA	2	12	286774	286785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384166912
109	NC_017191	AGGATG	2	12	290373	290384	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384166916
110	NC_017191	AGAATG	2	12	290528	290539	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384166916
111	NC_017191	ATTGAT	2	12	293525	293536	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384166919
112	NC_017191	AGCGAC	2	12	295274	295285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384166921
113	NC_017191	GATCTC	2	12	296454	296465	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384166922
114	NC_017191	GTCGAG	2	12	307985	307996	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384166931
115	NC_017191	TTTGAG	2	12	308426	308437	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384166931
116	NC_017191	GAGCAG	2	12	308729	308740	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384166931
117	NC_017191	CAAACC	2	12	309327	309338	50 %	0 %	0 %	50 %	384166932
118	NC_017191	TCAGCT	2	12	311146	311157	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384166935
119	NC_017191	TTTCAA	2	12	312703	312714	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384166936
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223	NC_017191	CATTGG	2	12	644897	644908	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384167274
224	NC_017191	ATGAAA	2	12	646276	646287	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384167276
225	NC_017191	TCAGTA	2	12	653476	653487	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384167282
226	NC_017191	TCATAA	2	12	653509	653520	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384167282
227	NC_017191	GGCTAC	2	12	657198	657209	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384167286
228	NC_017191	GCGTGA	2	12	659552	659563	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384167290
229	NC_017191	TGGGTC	2	12	660471	660482	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384167292
230	NC_017191	TACAGA	2	12	666438	666449	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384167303
231	NC_017191	CCGAAG	2	12	667840	667851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384167305
232	NC_017191	AGGTGA	2	12	669651	669662	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384167305
233	NC_017191	CAACAT	2	12	673972	673983	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384167309
234	NC_017191	CAAGCA	2	12	690077	690088	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384167324
235	NC_017191	CGGTTT	2	12	690537	690548	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384167324
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238	NC_017191	GGCTCA	2	12	695455	695466	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384167329
239	NC_017191	CATGAC	2	12	695791	695802	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384167329
240	NC_017191	GCAATT	2	12	696575	696586	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384167330
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247	NC_017191	AAGCCG	2	12	711778	711789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384167338
248	NC_017191	AAGCCG	2	12	712060	712071	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384167338
249	NC_017191	AAGCCG	2	12	712342	712353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384167338
250	NC_017191	AAGCCG	2	12	712624	712635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384167338
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254	NC_017191	TATCGG	2	12	715316	715327	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384167341
255	NC_017191	GAGGAA	2	12	725521	725532	50 %	0 %	50 %	0 %	384167353
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258	NC_017191	AGTCGG	2	12	731503	731514	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384167360
259	NC_017191	CAAAGG	2	12	733608	733619	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384167362
260	NC_017191	GTATTC	2	12	735180	735191	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384167364
261	NC_017191	GATACA	2	12	737102	737113	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384167366
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312	NC_017191	ATGACA	2	12	943361	943372	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384167577
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319	NC_017191	TGGATA	2	12	956409	956420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384167593
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323	NC_017191	CATTAT	2	12	967168	967179	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384167607
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330	NC_017191	GTATTG	2	12	993259	993270	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384167631
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332	NC_017191	GGAAGT	2	12	996779	996790	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384167633
333	NC_017191	TTGTCA	2	12	999659	999670	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384167637
334	NC_017191	GCTTGC	2	12	1005213	1005224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384167647
335	NC_017191	AAGCGA	2	12	1017265	1017276	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384167656
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338	NC_017191	CGCTTG	2	12	1023681	1023692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384167658
339	NC_017191	CCCGAT	2	12	1030510	1030521	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384167672
340	NC_017191	TCAAAA	2	12	1030983	1030994	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384167672
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342	NC_017191	TCAGCC	2	12	1049729	1049740	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384167690
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452	NC_017191	TACGGA	2	12	1383194	1383205	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384168111
453	NC_017191	CGATAA	2	12	1388052	1388063	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384168118
454	NC_017191	TGATTG	2	12	1388928	1388939	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384168120
455	NC_017191	GAAGTG	2	12	1393909	1393920	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384168127
456	NC_017191	CATGAA	2	12	1400401	1400412	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384168130
457	NC_017191	TTCATA	2	12	1413112	1413123	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384168147
458	NC_017191	TCAGGC	2	12	1414926	1414937	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384168149
459	NC_017191	ATATTC	2	12	1418799	1418810	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384168154
460	NC_017191	GGTTTT	2	12	1419320	1419331	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384168155
461	NC_017191	AGAATC	2	12	1420237	1420248	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384168157
462	NC_017191	TTTCCG	2	12	1421774	1421785	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384168160
463	NC_017191	CGATGC	2	12	1426724	1426735	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384168168
464	NC_017191	ATTCAC	2	12	1427020	1427031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384168169
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467	NC_017191	TGTCAT	2	12	1442052	1442063	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384168180
468	NC_017191	GGAAGC	2	12	1442676	1442687	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384168180
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472	NC_017191	TGACGT	2	12	1469862	1469873	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384168200
473	NC_017191	GCGTCG	2	12	1472583	1472594	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384168201
474	NC_017191	TCAGCA	2	12	1472835	1472846	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384168202
475	NC_017191	GATACT	2	12	1474203	1474214	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384168202
476	NC_017191	AATTCC	2	12	1483493	1483504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384168212
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480	NC_017191	TTGAAT	2	12	1503062	1503073	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384168226
481	NC_017191	GAGGCA	2	12	1509091	1509102	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384168227
482	NC_017191	GAAGAC	2	12	1509151	1509162	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384168227
483	NC_017191	CTATGC	2	12	1516203	1516214	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384168227
484	NC_017191	AACGAA	2	12	1516747	1516758	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384168227
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487	NC_017191	ATTTCA	2	12	1528343	1528354	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384168229
488	NC_017191	CGGAAA	2	12	1530707	1530718	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384168229
489	NC_017191	CTCATG	2	12	1534823	1534834	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384168233
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499	NC_017191	CATTGC	2	12	1570762	1570773	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384168280
500	NC_017191	ATGGAT	6	36	1570946	1570981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384168281

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