MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens LL3 chromosome

Total Repeats: 131

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017190	TTTGAA	2	12	17431	17442	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017190	AACACC	2	12	80088	80099	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017190	AGTCAA	2	12	96540	96551	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_017190	TTAACT	2	12	149599	149610	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_017190	GAAAAT	2	12	191849	191860	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017190	AGCGAT	2	12	192296	192307	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_017190	AATTAA	2	12	193645	193656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017190	TTAATA	2	12	194753	194764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017190	GATAAA	2	12	299057	299068	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017190	TATTGA	2	12	300464	300475	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017190	TGATAA	2	12	372922	372933	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017190	GAAAAA	2	12	379097	379108	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017190	TTTTGT	2	12	477118	477129	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017190	AAAAAT	2	12	548929	548940	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017190	ATTAAT	2	12	608487	608498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017190	AAAAGG	2	12	623381	623392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017190	TCAATC	2	12	639816	639827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017190	CTTTCT	2	12	652076	652087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017190	TTTCTC	2	12	673722	673733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017190	AGAAAA	2	12	686112	686123	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017190	AAAAAT	2	12	710544	710555	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017190	GTTTAC	2	12	724310	724321	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_017190	ACAAAA	2	12	730637	730648	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_017190	TCCCTT	2	12	772039	772050	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017190	CTTTTT	2	12	810765	810776	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_017190	TAAGCA	2	12	846451	846462	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_017190	TCGAAA	2	12	889727	889738	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_017190	AAAAAG	2	12	898059	898070	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017190	AAAAAT	2	12	907738	907749	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017190	TTATAT	2	12	908860	908871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017190	GTGCTG	2	12	911688	911699	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_017190	CATCTT	2	12	913540	913551	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017190	TTTATA	2	12	931960	931971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017190	ATAAAA	2	12	949667	949678	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017190	CTCAAA	2	12	974185	974196	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017190	CTTTTT	2	12	975765	975776	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_017190	AAAAAG	2	12	998263	998274	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017190	ATAATG	2	12	1062758	1062769	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017190	TCTTTT	2	12	1068861	1068872	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017190	GAAAAG	2	12	1077868	1077879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017190	TTACTA	2	12	1083025	1083036	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_017190	AAGGAG	2	12	1098482	1098493	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017190	GAAAAA	2	12	1143247	1143258	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017190	GTTAAC	2	12	1246546	1246557	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_017190	ATGGAA	2	12	1278609	1278620	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017190	TAATTG	2	12	1396182	1396193	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017190	ATCATT	2	12	1409661	1409672	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017190	AGAAAA	2	12	1411868	1411879	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017190	ATCATT	2	12	1412905	1412916	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_017190	AAAAGA	2	12	1438325	1438336	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017190	ATAAAA	2	12	1471597	1471608	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017190	CCTGTA	2	12	1486804	1486815	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017190	ATCTAA	2	12	1487154	1487165	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_017190	GCATAT	2	12	1488371	1488382	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_017190	AATACA	2	12	1505867	1505878	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_017190	AATAAA	2	12	1507503	1507514	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017190	ACAAAA	2	12	1507563	1507574	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_017190	AATAAA	2	12	1508820	1508831	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017190	TCAAAC	2	12	1515259	1515270	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017190	CTTTTT	2	12	1559612	1559623	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_017190	TTTTGT	2	12	1712336	1712347	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017190	GTTTAA	2	12	1841344	1841355	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017190	TGAATT	2	12	1848537	1848548	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017190	AACAAA	2	12	1867622	1867633	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_017190	GATCTT	2	12	1889566	1889577	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_017190	AAGAGA	2	12	1988077	1988088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017190	ATAAAA	2	12	1995916	1995927	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017190	ATGATA	2	12	2009386	2009397	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017190	GTGAAT	2	12	2027159	2027170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017190	TATTGC	2	12	2028358	2028369	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_017190	CCTTCC	2	12	2070321	2070332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_017190	TTTATT	2	12	2165392	2165403	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017190	AGCACT	2	12	2166430	2166441	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017190	TTTTAT	2	12	2183872	2183883	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017190	AAATTT	2	12	2210350	2210361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017190	ATGATA	2	12	2218810	2218821	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017190	CTTTTT	2	12	2219073	2219084	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_017190	ATTGAT	2	12	2222916	2222927	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017190	TTTTCA	2	12	2226482	2226493	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_017190	GATGAG	2	12	2229287	2229298	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017190	AAATAA	2	12	2252426	2252437	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017190	TAATGA	2	12	2273634	2273645	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017190	TATAAT	2	12	2276461	2276472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017190	ATATTT	2	12	2285507	2285518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017190	TCCTTT	2	12	2404804	2404815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017190	CGTCAT	2	12	2440605	2440616	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017190	TTTATA	2	12	2444700	2444711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017190	CAATCT	2	12	2488906	2488917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017190	TTCTAA	2	12	2547367	2547378	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_017190	TTTGTC	2	12	2551387	2551398	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_017190	TGACTT	2	12	2573488	2573499	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_017190	TGATCC	2	12	2585582	2585593	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017190	CACCAT	2	12	2586142	2586153	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_017190	ACAGAC	2	12	2600591	2600602	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017190	GAATCA	2	12	2727629	2727640	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_017190	CCCTCT	2	12	2746920	2746931	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_017190	ATTGGA	2	12	2759034	2759045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017190	GCTTTT	2	12	2791545	2791556	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_017190	CTCTTT	2	12	2793718	2793729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017190	CTTATA	2	12	2806823	2806834	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_017190	TTTAAG	2	12	2820526	2820537	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017190	GGAAAA	2	12	2834997	2835008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017190	CTTATC	2	12	2879007	2879018	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017190	AAGGCA	2	12	2903970	2903981	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_017190	CTAAAA	2	12	2919001	2919012	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_017190	ATTATC	2	12	3079039	3079050	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_017190	CCGCGG	2	12	3086537	3086548	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
108	NC_017190	TTTTAT	2	12	3168271	3168282	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017190	CTCGTC	2	12	3177313	3177324	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
110	NC_017190	ACTTCC	2	12	3219431	3219442	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_017190	CAAAGT	2	12	3220290	3220301	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_017190	TAATGA	2	12	3240726	3240737	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017190	GTGCCG	2	12	3281124	3281135	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017190	GAAAAA	2	12	3305154	3305165	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017190	CGGGAT	2	12	3342884	3342895	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_017190	CTTTTT	2	12	3371845	3371856	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_017190	TTTCAT	2	12	3422598	3422609	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_017190	TCTTAT	2	12	3450179	3450190	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_017190	TAGAAT	2	12	3573795	3573806	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017190	GCGATC	2	12	3610693	3610704	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017190	ATCTCC	2	12	3663215	3663226	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_017190	AATATA	2	12	3733909	3733920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017190	AGCTCC	2	12	3755625	3755636	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
124	NC_017190	TCAGGC	2	12	3756052	3756063	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017190	ATCATT	2	12	3843815	3843826	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_017190	CTCTAT	2	12	3913896	3913907	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017190	ACAAAT	2	12	3967103	3967114	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_017190	CATGTA	2	12	3968924	3968935	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_017190	AGAAAC	2	12	3973319	3973330	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_017190	GCATAA	2	12	3984904	3984915	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_017190	GAAAAA	2	12	3992747	3992758	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.