MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens LL3 chromosome

Total Repeats: 1288

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017190	AAAAGA	2	12	4197	4208	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384162408
2	NC_017190	TGAAGA	2	12	8494	8505	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384162411
3	NC_017190	ACGAAT	2	12	22709	22720	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384162418
4	NC_017190	TTCGGC	2	12	24621	24632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162420
5	NC_017190	GAAGGT	2	12	28956	28967	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384162425
6	NC_017190	TTAAAT	2	12	29462	29473	50 %	50 %	0 %	0 %	384162425
7	NC_017190	GAAAAA	2	12	48088	48099	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384162444
8	NC_017190	TTGTCG	2	12	48903	48914	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384162445
9	NC_017190	AGCGGA	2	12	55347	55358	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384162452
10	NC_017190	TTGCCA	2	12	58757	58768	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384162456
11	NC_017190	ATTGTT	2	12	59347	59358	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384162457
12	NC_017190	GAATCG	2	12	60962	60973	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384162459
13	NC_017190	TGTTAG	2	12	62419	62430	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384162461
14	NC_017190	GTGAGA	2	12	73226	73237	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384162470
15	NC_017190	ATCTGA	2	12	76117	76128	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384162473
16	NC_017190	AGCTGC	2	12	76956	76967	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384162473
17	NC_017190	TGTCGG	2	12	78697	78708	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384162475
18	NC_017190	GACGGA	2	12	84396	84407	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384162480
19	NC_017190	AGGATC	2	12	88066	88077	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384162485
20	NC_017190	GGAAAA	2	12	89916	89927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162488
21	NC_017190	TGGCAC	2	12	98731	98742	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384162492
22	NC_017190	GTGAAG	2	12	98809	98820	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384162492
23	NC_017190	GCAAAA	2	12	100932	100943	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384162492
24	NC_017190	TGCCGA	2	12	103510	103521	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384162494
25	NC_017190	ATGAAA	2	12	109287	109298	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384162501
26	NC_017190	CATTTA	2	12	113901	113912	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384162509
27	NC_017190	TCTGGT	2	12	113966	113977	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384162509
28	NC_017190	GAAGCT	2	12	114483	114494	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384162510
29	NC_017190	CTTGCA	2	12	115628	115639	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384162511
30	NC_017190	CTGTAG	2	12	115835	115846	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384162512
31	NC_017190	ACACAA	2	12	118350	118361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384162514
32	NC_017190	AACGAA	2	12	123265	123276	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384162515
33	NC_017190	AATCAC	2	12	125968	125979	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384162518
34	NC_017190	AGTTGA	2	12	126055	126066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162518
35	NC_017190	AAACAG	2	12	126132	126143	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384162518
36	NC_017190	TAAAGG	2	12	131181	131192	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384162522
37	NC_017190	GTCGGT	2	12	137802	137813	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384162535
38	NC_017190	AATAAA	2	12	139181	139192	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384162538
39	NC_017190	CATTAA	2	12	141334	141345	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384162541
40	NC_017190	GAAAAG	2	12	143033	143044	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162543
41	NC_017190	AAACAA	2	12	143074	143085	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	384162543
42	NC_017190	AAAAAG	2	12	144802	144813	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384162545
43	NC_017190	CGGTTG	2	12	150043	150054	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384162551
44	NC_017190	AATGGC	2	12	150964	150975	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384162553
45	NC_017190	ATTTTT	2	12	154335	154346	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384162557
46	NC_017190	GGTTTT	2	12	164759	164770	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384162563
47	NC_017190	TTGCTC	2	12	165615	165626	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384162565
48	NC_017190	ACGGAT	2	12	166280	166291	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384162565
49	NC_017190	TGAGAG	2	12	168168	168179	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384162567
50	NC_017190	GCTCCG	2	12	169532	169543	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384162568
51	NC_017190	TAAATA	2	12	171184	171195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384162570
52	NC_017190	TCTGAT	2	12	171204	171215	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384162570
53	NC_017190	ATCGTC	2	12	174148	174159	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384162572
54	NC_017190	GTTGAA	2	12	185064	185075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162583
55	NC_017190	TGTTGA	2	12	185279	185290	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384162583
56	NC_017190	AGACAA	2	12	185945	185956	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384162583
57	NC_017190	TGGCTG	2	12	188686	188697	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384162587
58	NC_017190	GAAATG	2	12	189198	189209	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384162587
59	NC_017190	AGATGA	2	12	190328	190339	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384162588
60	NC_017190	TTTATT	2	12	197055	197066	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384162590
61	NC_017190	GTGAAA	2	12	197143	197154	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384162590
62	NC_017190	TGCGGA	2	12	199847	199858	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384162593
63	NC_017190	TATCTT	2	12	201948	201959	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384162596
64	NC_017190	GATTTT	2	12	202518	202529	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384162596
65	NC_017190	TGTCTA	2	12	202863	202874	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384162596
66	NC_017190	TGAACA	2	12	207375	207386	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384162601
67	NC_017190	CTTTTC	2	12	208133	208144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384162602
68	NC_017190	AAGCGA	2	12	212920	212931	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384162609
69	NC_017190	GAACAT	2	12	218842	218853	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384162615
70	NC_017190	TGAGGC	2	12	220204	220215	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384162618
71	NC_017190	GAAAAA	2	12	221031	221042	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384162619
72	NC_017190	TTTTAT	2	12	223439	223450	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384162622
73	NC_017190	AATACA	2	12	225544	225555	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384162625
74	NC_017190	CTGCCG	2	12	226792	226803	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384162626
75	NC_017190	GAGACG	2	12	228734	228745	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384162629
76	NC_017190	TCCACA	2	12	229452	229463	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	384162629
77	NC_017190	ATGCCG	2	12	232575	232586	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384162632
78	NC_017190	TCCACG	2	12	233166	233177	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384162632
79	NC_017190	GAGGAT	2	12	235046	235057	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384162635
80	NC_017190	TTTTAG	2	12	239652	239663	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384162641
81	NC_017190	GCGGAA	2	12	243354	243365	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384162648
82	NC_017190	CGTTTG	2	12	244509	244520	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384162649
83	NC_017190	AGCGGG	2	12	245229	245240	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384162649
84	NC_017190	CAGGAT	2	12	250423	250434	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384162655
85	NC_017190	CCTGAA	2	12	255869	255880	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384162663
86	NC_017190	CGGCAG	2	12	256474	256485	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384162663
87	NC_017190	TGAGAT	2	12	258994	259005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384162666
88	NC_017190	ATGAGC	2	12	261652	261663	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384162668
89	NC_017190	TTTTCA	2	12	261674	261685	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384162668
90	NC_017190	TCATTG	2	12	263776	263787	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384162671
91	NC_017190	GAAGAG	2	12	264141	264152	50 %	0 %	50 %	0 %	384162671
92	NC_017190	CCACAG	2	12	264176	264187	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384162671
93	NC_017190	TTCTGC	2	12	266181	266192	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384162673
94	NC_017190	TCAAAG	2	12	266350	266361	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384162674
95	NC_017190	TGATTT	2	12	268307	268318	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384162677
96	NC_017190	GAAGCG	2	12	268533	268544	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384162677
97	NC_017190	ATCGGA	2	12	269669	269680	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384162679
98	NC_017190	AAAATC	2	12	271908	271919	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384162681
99	NC_017190	CTGTCA	2	12	272691	272702	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384162681
100	NC_017190	CATTGA	2	12	272830	272841	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384162681
101	NC_017190	TAAAAA	2	12	274787	274798	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384162683
102	NC_017190	AGAGTG	2	12	280531	280542	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384162688
103	NC_017190	TTGCCG	2	12	280792	280803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162688
104	NC_017190	GGAAAA	2	12	285542	285553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384162693
105	NC_017190	AGGATG	2	12	289141	289152	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384162695
106	NC_017190	AGAATG	2	12	289296	289307	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384162695
107	NC_017190	ATTGAT	2	12	292293	292304	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384162698
108	NC_017190	AGCGAC	2	12	294042	294053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384162700
109	NC_017190	GATCTC	2	12	295222	295233	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384162701
110	NC_017190	GTCGAG	2	12	306753	306764	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384162710
111	NC_017190	TTTGAG	2	12	307194	307205	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384162710
112	NC_017190	GAGCAG	2	12	307497	307508	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384162710
113	NC_017190	CAAACC	2	12	308095	308106	50 %	0 %	0 %	50 %	384162711
114	NC_017190	TCAGCT	2	12	309914	309925	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384162714
115	NC_017190	TTTCAA	2	12	311471	311482	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384162715
116	NC_017190	GAGCCG	2	12	312845	312856	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384162717
117	NC_017190	AGCGGA	2	12	316039	316050	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384162721
118	NC_017190	CGGCGA	2	12	323511	323522	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384162721
119	NC_017190	CGGAAA	2	12	324041	324052	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384162721
120	NC_017190	GATGAC	2	12	325479	325490	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384162721
121	NC_017190	CGGCGA	2	12	334278	334289	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384162722
122	NC_017190	CGGAAA	2	12	334808	334819	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384162722
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124	NC_017190	ATCAAA	2	12	348868	348879	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384162733
125	NC_017190	TGCTCG	2	12	357835	357846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384162742
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228	NC_017190	GCGGGA	2	12	664510	664521	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384163101
229	NC_017190	TTTGAT	2	12	670764	670775	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384163104
230	NC_017190	ATCGAA	2	12	675952	675963	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384163109
231	NC_017190	GCTGAC	2	12	676590	676601	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384163109
232	NC_017190	ATGCTG	2	12	680894	680905	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384163111
233	NC_017190	CATTGG	2	12	681063	681074	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384163111
234	NC_017190	ATGAAA	2	12	682442	682453	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384163113
235	NC_017190	TCAGTA	2	12	689642	689653	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384163119
236	NC_017190	TCATAA	2	12	689675	689686	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384163119
237	NC_017190	GGCTAC	2	12	693364	693375	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384163123
238	NC_017190	GCGTGA	2	12	695718	695729	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384163127
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240	NC_017190	CCGAAG	2	12	704018	704029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384163139
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247	NC_017190	GGCTCA	2	12	731633	731644	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384163163
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249	NC_017190	GCAATT	2	12	732753	732764	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384163164
250	NC_017190	TAAACC	2	12	744962	744973	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384163170
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255	NC_017190	TCAGGA	2	12	751593	751604	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384163172
256	NC_017190	AAGCCG	2	12	752427	752438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384163172
257	NC_017190	AAGCCG	2	12	752709	752720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384163172
258	NC_017190	AAGCCG	2	12	752991	753002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384163172
259	NC_017190	AAACCG	2	12	754456	754467	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	384163173
260	NC_017190	AAAAGA	2	12	754764	754775	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384163173
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263	NC_017190	GAGGAA	2	12	765888	765899	50 %	0 %	50 %	0 %	384163187
264	NC_017190	CGACAT	2	12	767148	767159	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384163189
265	NC_017190	CTGATC	2	12	769845	769856	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384163192
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272	NC_017190	CGAGAT	2	12	779080	779091	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384163200
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299	NC_017190	CTGCTA	2	12	867336	867347	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384163299
300	NC_017190	TGATCA	2	12	867944	867955	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384163300
301	NC_017190	ATTGAC	2	12	868770	868781	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384163300
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322	NC_017190	GAATCC	2	12	945704	945715	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384163382
323	NC_017190	AAATAT	2	12	961135	961146	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384163398
324	NC_017190	TGTGCT	2	12	963180	963191	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	384163400
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326	NC_017190	ATGCCG	2	12	982502	982513	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384163418
327	NC_017190	CTGATT	2	12	990361	990372	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384163425
328	NC_017190	TTTGAA	2	12	992072	992083	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384163427
329	NC_017190	GCAAGG	2	12	995638	995649	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384163432
330	NC_017190	GGAAAA	2	12	996289	996300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384163433
331	NC_017190	CGGACT	2	12	997615	997626	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384163435
332	NC_017190	TCAGCT	2	12	1003033	1003044	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384163443
333	NC_017190	CAGCTG	2	12	1012756	1012767	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384163456
334	NC_017190	TATCGG	2	12	1015780	1015791	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384163459
335	NC_017190	ATGACA	2	12	1017899	1017910	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384163461
336	NC_017190	TTTCGA	2	12	1019029	1019040	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384163462
337	NC_017190	CGCCTC	2	12	1020538	1020549	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384163465
338	NC_017190	AGTGAG	2	12	1020984	1020995	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384163466
339	NC_017190	TATGAA	2	12	1025315	1025326	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384163469
340	NC_017190	GCTGGA	2	12	1025410	1025421	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384163469
341	NC_017190	TAAAAT	2	12	1029900	1029911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384163474
342	NC_017190	TGGATA	2	12	1030944	1030955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384163477
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