MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Bacillus amyloliquefaciens LL3 chromosome

Total Repeats: 3152

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017190	ATATT	2	10	144	153	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017190	AAAAG	2	10	385	394	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017190	ATCGG	2	10	775	784	20 %	20 %	40 %	20 %	384162405
4	NC_017190	ATTAT	2	10	1911	1920	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017190	AATTT	2	10	2272	2281	40 %	60 %	0 %	0 %	384162406
6	NC_017190	CGCAC	2	10	3596	3605	20 %	0 %	20 %	60 %	384162408
7	NC_017190	AGTGA	2	10	4548	4557	40 %	20 %	40 %	0 %	384162408
8	NC_017190	TTGCA	2	10	5649	5658	20 %	40 %	20 %	20 %	384162410
9	NC_017190	GGGAC	2	10	6190	6199	20 %	0 %	60 %	20 %	384162410
10	NC_017190	TTCGG	2	10	7337	7346	0 %	40 %	40 %	20 %	384162411
11	NC_017190	ACGAT	2	10	8670	8679	40 %	20 %	20 %	20 %	384162411
12	NC_017190	TCGTG	2	10	10843	10852	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017190	GGACG	2	10	11717	11726	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
14	NC_017190	AATAT	2	10	15026	15035	60 %	40 %	0 %	0 %	384162412
15	NC_017190	CTTCA	2	10	15401	15410	20 %	40 %	0 %	40 %	384162412
16	NC_017190	AATAA	2	10	15718	15727	80 %	20 %	0 %	0 %	384162412
17	NC_017190	CCTTT	2	10	15772	15781	0 %	60 %	0 %	40 %	384162412
18	NC_017190	CGGAA	2	10	18316	18325	40 %	0 %	40 %	20 %	384162414
19	NC_017190	CCAAG	2	10	21865	21874	40 %	0 %	20 %	40 %	384162417
20	NC_017190	ATCTG	2	10	22431	22440	20 %	40 %	20 %	20 %	384162418
21	NC_017190	TCAGG	2	10	22726	22735	20 %	20 %	40 %	20 %	384162418
22	NC_017190	AAGAA	2	10	23417	23426	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017190	ACTCC	2	10	24827	24836	20 %	20 %	0 %	60 %	384162420
24	NC_017190	AATTA	2	10	25196	25205	60 %	40 %	0 %	0 %	384162421
25	NC_017190	GAGCT	2	10	26127	26136	20 %	20 %	40 %	20 %	384162421
26	NC_017190	GACCT	2	10	29330	29339	20 %	20 %	20 %	40 %	384162425
27	NC_017190	ATGAC	2	10	30014	30023	40 %	20 %	20 %	20 %	384162426
28	NC_017190	GAAGC	2	10	30891	30900	40 %	0 %	40 %	20 %	384162428
29	NC_017190	TTGCT	2	10	31033	31042	0 %	60 %	20 %	20 %	384162429
30	NC_017190	GATAT	2	10	31372	31381	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017190	TCGTG	2	10	32583	32592	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017190	GGACG	2	10	33457	33466	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
33	NC_017190	AAGAA	2	10	37217	37226	80 %	0 %	20 %	0 %	384162431
34	NC_017190	AAAAG	2	10	37731	37740	80 %	0 %	20 %	0 %	384162432
35	NC_017190	AAAGA	2	10	37858	37867	80 %	0 %	20 %	0 %	384162432
36	NC_017190	CTGAT	2	10	37894	37903	20 %	40 %	20 %	20 %	384162432
37	NC_017190	AAATG	2	10	40042	40051	60 %	20 %	20 %	0 %	384162433
38	NC_017190	GAAAA	2	10	41845	41854	80 %	0 %	20 %	0 %	384162437
39	NC_017190	GCAGA	2	10	43829	43838	40 %	0 %	40 %	20 %	384162439
40	NC_017190	TCAAA	2	10	51656	51665	60 %	20 %	0 %	20 %	384162447
41	NC_017190	TTTTG	2	10	54144	54153	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017190	AAGCA	2	10	58524	58533	60 %	0 %	20 %	20 %	384162456
43	NC_017190	AACAC	2	10	61410	61419	60 %	0 %	0 %	40 %	384162460
44	NC_017190	AACGG	2	10	63672	63681	40 %	0 %	40 %	20 %	384162461
45	NC_017190	ATGAT	2	10	66315	66324	40 %	40 %	20 %	0 %	384162463
46	NC_017190	CGGCG	2	10	66856	66865	0 %	0 %	60 %	40 %	384162463
47	NC_017190	GGAGA	2	10	68903	68912	40 %	0 %	60 %	0 %	384162464
48	NC_017190	TTTCA	2	10	72209	72218	20 %	60 %	0 %	20 %	384162470
49	NC_017190	GAAAA	2	10	72987	72996	80 %	0 %	20 %	0 %	384162470
50	NC_017190	GTTCG	2	10	73335	73344	0 %	40 %	40 %	20 %	384162470
51	NC_017190	TTATT	2	10	78033	78042	20 %	80 %	0 %	0 %	384162475
52	NC_017190	TGAAG	2	10	82539	82548	40 %	20 %	40 %	0 %	384162478
53	NC_017190	GATCA	2	10	83452	83461	40 %	20 %	20 %	20 %	384162479
54	NC_017190	TAAAA	2	10	83791	83800	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017190	AGCGG	2	10	85544	85553	20 %	0 %	60 %	20 %	384162481
56	NC_017190	ATTGA	2	10	88618	88627	40 %	40 %	20 %	0 %	384162487
57	NC_017190	ATGCG	2	10	88926	88935	20 %	20 %	40 %	20 %	384162487
58	NC_017190	TCGTG	2	10	92597	92606	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
59	NC_017190	GGACG	2	10	93297	93306	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
60	NC_017190	TCAAA	2	10	98272	98281	60 %	20 %	0 %	20 %	384162491
61	NC_017190	GAACA	2	10	99004	99013	60 %	0 %	20 %	20 %	384162492
62	NC_017190	CGGAA	2	10	103247	103256	40 %	0 %	40 %	20 %	384162494
63	NC_017190	CCGTA	2	10	104120	104129	20 %	20 %	20 %	40 %	384162495
64	NC_017190	GAAAA	2	10	108265	108274	80 %	0 %	20 %	0 %	384162500
65	NC_017190	TGAAA	2	10	112205	112214	60 %	20 %	20 %	0 %	384162505
66	NC_017190	TGAAT	2	10	113378	113387	40 %	40 %	20 %	0 %	384162508
67	NC_017190	TTACG	2	10	115055	115064	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_017190	TAAAA	2	10	115695	115704	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017190	TTGAA	2	10	115775	115784	40 %	40 %	20 %	0 %	384162512
70	NC_017190	GACCG	2	10	116429	116438	20 %	0 %	40 %	40 %	384162513
71	NC_017190	GTGAA	2	10	120755	120764	40 %	20 %	40 %	0 %	384162515
72	NC_017190	ACCGG	2	10	121594	121603	20 %	0 %	40 %	40 %	384162515
73	NC_017190	ATCAA	2	10	122965	122974	60 %	20 %	0 %	20 %	384162515
74	NC_017190	GTGCT	2	10	123251	123260	0 %	40 %	40 %	20 %	384162515
75	NC_017190	CTGAC	2	10	123791	123800	20 %	20 %	20 %	40 %	384162515
76	NC_017190	GTCCT	2	10	124028	124037	0 %	40 %	20 %	40 %	384162515
77	NC_017190	CAATT	2	10	126270	126279	40 %	40 %	0 %	20 %	384162518
78	NC_017190	CTGAA	2	10	126501	126510	40 %	20 %	20 %	20 %	384162518
79	NC_017190	CAAAA	2	10	130496	130505	80 %	0 %	0 %	20 %	384162521
80	NC_017190	AATCA	2	10	131823	131832	60 %	20 %	0 %	20 %	384162523
81	NC_017190	TGGTA	2	10	134185	134194	20 %	40 %	40 %	0 %	384162527
82	NC_017190	AAAGT	2	10	135100	135109	60 %	20 %	20 %	0 %	384162529
83	NC_017190	TAAAT	2	10	141945	141954	60 %	40 %	0 %	0 %	384162542
84	NC_017190	AAACA	2	10	143515	143524	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_017190	TTATC	2	10	144597	144606	20 %	60 %	0 %	20 %	384162545
86	NC_017190	TAAAT	2	10	146277	146286	60 %	40 %	0 %	0 %	384162546
87	NC_017190	CGTTT	2	10	147620	147629	0 %	60 %	20 %	20 %	384162548
88	NC_017190	ATGGA	2	10	147687	147696	40 %	20 %	40 %	0 %	384162548
89	NC_017190	GCACC	2	10	148776	148785	20 %	0 %	20 %	60 %	384162549
90	NC_017190	TTGTG	2	10	148921	148930	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017190	TGCTT	2	10	149700	149709	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_017190	ATTCC	2	10	150523	150532	20 %	40 %	0 %	40 %	384162552
93	NC_017190	CGGCC	2	10	153341	153350	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
94	NC_017190	TTTTC	2	10	154043	154052	0 %	80 %	0 %	20 %	384162557
95	NC_017190	TTCAT	2	10	154456	154465	20 %	60 %	0 %	20 %	384162557
96	NC_017190	GATCA	2	10	154651	154660	40 %	20 %	20 %	20 %	384162558
97	NC_017190	TCGTG	2	10	156797	156806	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
98	NC_017190	GGACG	2	10	157497	157506	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
99	NC_017190	CAGTG	2	10	160735	160744	20 %	20 %	40 %	20 %	384162560
100	NC_017190	ATTAT	2	10	163054	163063	40 %	60 %	0 %	0 %	384162561
101	NC_017190	TTGAA	2	10	163704	163713	40 %	40 %	20 %	0 %	384162562
102	NC_017190	TTCCT	2	10	165410	165419	0 %	60 %	0 %	40 %	384162564
103	NC_017190	GCCGT	2	10	166043	166052	0 %	20 %	40 %	40 %	384162565
104	NC_017190	TGGCT	2	10	167817	167826	0 %	40 %	40 %	20 %	384162566
105	NC_017190	CGTTT	2	10	167920	167929	0 %	60 %	20 %	20 %	384162566
106	NC_017190	GCGGA	2	10	168312	168321	20 %	0 %	60 %	20 %	384162567
107	NC_017190	AAAAC	2	10	168685	168694	80 %	0 %	0 %	20 %	384162567
108	NC_017190	CTTTT	2	10	169843	169852	0 %	80 %	0 %	20 %	384162569
109	NC_017190	TCCTT	2	10	171703	171712	0 %	60 %	0 %	40 %	384162570
110	NC_017190	TGCTT	2	10	172333	172342	0 %	60 %	20 %	20 %	384162571
111	NC_017190	TTTTG	2	10	175490	175499	0 %	80 %	20 %	0 %	384162573
112	NC_017190	TTTGC	2	10	175565	175574	0 %	60 %	20 %	20 %	384162573
113	NC_017190	CTGAA	2	10	176225	176234	40 %	20 %	20 %	20 %	384162573
114	NC_017190	AGAAA	2	10	178073	178082	80 %	0 %	20 %	0 %	384162574
115	NC_017190	ATCAG	2	10	178690	178699	40 %	20 %	20 %	20 %	384162575
116	NC_017190	GTGTT	2	10	179183	179192	0 %	60 %	40 %	0 %	384162575
117	NC_017190	CCTTG	2	10	179810	179819	0 %	40 %	20 %	40 %	384162577
118	NC_017190	TAAAA	2	10	180974	180983	80 %	20 %	0 %	0 %	384162578
119	NC_017190	CCGTT	2	10	181432	181441	0 %	40 %	20 %	40 %	384162579
120	NC_017190	AAGAT	2	10	182531	182540	60 %	20 %	20 %	0 %	384162580
121	NC_017190	AAGGT	2	10	183477	183486	40 %	20 %	40 %	0 %	384162581
122	NC_017190	CTGAG	2	10	184065	184074	20 %	20 %	40 %	20 %	384162582
123	NC_017190	AGTGA	2	10	184448	184457	40 %	20 %	40 %	0 %	384162582
124	NC_017190	CATTG	2	10	184670	184679	20 %	40 %	20 %	20 %	384162583
125	NC_017190	GGAAG	2	10	185359	185368	40 %	0 %	60 %	0 %	384162583
126	NC_017190	GATCA	2	10	186854	186863	40 %	20 %	20 %	20 %	384162584
127	NC_017190	TGAAA	2	10	187171	187180	60 %	20 %	20 %	0 %	384162584
128	NC_017190	ACAAG	2	10	187450	187459	60 %	0 %	20 %	20 %	384162585
129	NC_017190	CTGCA	2	10	189592	189601	20 %	20 %	20 %	40 %	384162587
130	NC_017190	ATTGA	2	10	194618	194627	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017190	GATAA	2	10	195467	195476	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017190	TTATA	2	10	196341	196350	40 %	60 %	0 %	0 %	384162589
133	NC_017190	CTTGG	2	10	196709	196718	0 %	40 %	40 %	20 %	384162590
134	NC_017190	GGCCG	2	10	200157	200166	0 %	0 %	60 %	40 %	384162593
135	NC_017190	AATAA	2	10	200703	200712	80 %	20 %	0 %	0 %	384162594
136	NC_017190	AAATC	2	10	205561	205570	60 %	20 %	0 %	20 %	384162599
137	NC_017190	TTTTA	2	10	206943	206952	20 %	80 %	0 %	0 %	384162601
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256	NC_017190	CGCGC	2	10	361313	361322	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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262	NC_017190	GCTGA	2	10	366376	366385	20 %	20 %	40 %	20 %	384162750
263	NC_017190	GGACA	2	10	367065	367074	40 %	0 %	40 %	20 %	384162750
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266	NC_017190	GTTCT	2	10	374747	374756	0 %	60 %	20 %	20 %	384162762
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