MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens LL3 chromosome

Total Repeats: 2647

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017190	ATCGG	2	10	775	784	20 %	20 %	40 %	20 %	384162405
2	NC_017190	AATTT	2	10	2272	2281	40 %	60 %	0 %	0 %	384162406
3	NC_017190	CGCAC	2	10	3596	3605	20 %	0 %	20 %	60 %	384162408
4	NC_017190	AGTGA	2	10	4548	4557	40 %	20 %	40 %	0 %	384162408
5	NC_017190	TTGCA	2	10	5649	5658	20 %	40 %	20 %	20 %	384162410
6	NC_017190	GGGAC	2	10	6190	6199	20 %	0 %	60 %	20 %	384162410
7	NC_017190	TTCGG	2	10	7337	7346	0 %	40 %	40 %	20 %	384162411
8	NC_017190	ACGAT	2	10	8670	8679	40 %	20 %	20 %	20 %	384162411
9	NC_017190	AATAT	2	10	15026	15035	60 %	40 %	0 %	0 %	384162412
10	NC_017190	CTTCA	2	10	15401	15410	20 %	40 %	0 %	40 %	384162412
11	NC_017190	AATAA	2	10	15718	15727	80 %	20 %	0 %	0 %	384162412
12	NC_017190	CCTTT	2	10	15772	15781	0 %	60 %	0 %	40 %	384162412
13	NC_017190	CGGAA	2	10	18316	18325	40 %	0 %	40 %	20 %	384162414
14	NC_017190	CCAAG	2	10	21865	21874	40 %	0 %	20 %	40 %	384162417
15	NC_017190	ATCTG	2	10	22431	22440	20 %	40 %	20 %	20 %	384162418
16	NC_017190	TCAGG	2	10	22726	22735	20 %	20 %	40 %	20 %	384162418
17	NC_017190	ACTCC	2	10	24827	24836	20 %	20 %	0 %	60 %	384162420
18	NC_017190	AATTA	2	10	25196	25205	60 %	40 %	0 %	0 %	384162421
19	NC_017190	GAGCT	2	10	26127	26136	20 %	20 %	40 %	20 %	384162421
20	NC_017190	GACCT	2	10	29330	29339	20 %	20 %	20 %	40 %	384162425
21	NC_017190	ATGAC	2	10	30014	30023	40 %	20 %	20 %	20 %	384162426
22	NC_017190	GAAGC	2	10	30891	30900	40 %	0 %	40 %	20 %	384162428
23	NC_017190	TTGCT	2	10	31033	31042	0 %	60 %	20 %	20 %	384162429
24	NC_017190	AAGAA	2	10	37217	37226	80 %	0 %	20 %	0 %	384162431
25	NC_017190	AAAAG	2	10	37731	37740	80 %	0 %	20 %	0 %	384162432
26	NC_017190	AAAGA	2	10	37858	37867	80 %	0 %	20 %	0 %	384162432
27	NC_017190	CTGAT	2	10	37894	37903	20 %	40 %	20 %	20 %	384162432
28	NC_017190	AAATG	2	10	40042	40051	60 %	20 %	20 %	0 %	384162433
29	NC_017190	GAAAA	2	10	41845	41854	80 %	0 %	20 %	0 %	384162437
30	NC_017190	GCAGA	2	10	43829	43838	40 %	0 %	40 %	20 %	384162439
31	NC_017190	TCAAA	2	10	51656	51665	60 %	20 %	0 %	20 %	384162447
32	NC_017190	AAGCA	2	10	58524	58533	60 %	0 %	20 %	20 %	384162456
33	NC_017190	AACAC	2	10	61410	61419	60 %	0 %	0 %	40 %	384162460
34	NC_017190	AACGG	2	10	63672	63681	40 %	0 %	40 %	20 %	384162461
35	NC_017190	ATGAT	2	10	66315	66324	40 %	40 %	20 %	0 %	384162463
36	NC_017190	CGGCG	2	10	66856	66865	0 %	0 %	60 %	40 %	384162463
37	NC_017190	GGAGA	2	10	68903	68912	40 %	0 %	60 %	0 %	384162464
38	NC_017190	TTTCA	2	10	72209	72218	20 %	60 %	0 %	20 %	384162470
39	NC_017190	GAAAA	2	10	72987	72996	80 %	0 %	20 %	0 %	384162470
40	NC_017190	GTTCG	2	10	73335	73344	0 %	40 %	40 %	20 %	384162470
41	NC_017190	TTATT	2	10	78033	78042	20 %	80 %	0 %	0 %	384162475
42	NC_017190	TGAAG	2	10	82539	82548	40 %	20 %	40 %	0 %	384162478
43	NC_017190	GATCA	2	10	83452	83461	40 %	20 %	20 %	20 %	384162479
44	NC_017190	AGCGG	2	10	85544	85553	20 %	0 %	60 %	20 %	384162481
45	NC_017190	ATTGA	2	10	88618	88627	40 %	40 %	20 %	0 %	384162487
46	NC_017190	ATGCG	2	10	88926	88935	20 %	20 %	40 %	20 %	384162487
47	NC_017190	TCAAA	2	10	98272	98281	60 %	20 %	0 %	20 %	384162491
48	NC_017190	GAACA	2	10	99004	99013	60 %	0 %	20 %	20 %	384162492
49	NC_017190	CGGAA	2	10	103247	103256	40 %	0 %	40 %	20 %	384162494
50	NC_017190	CCGTA	2	10	104120	104129	20 %	20 %	20 %	40 %	384162495
51	NC_017190	GAAAA	2	10	108265	108274	80 %	0 %	20 %	0 %	384162500
52	NC_017190	TGAAA	2	10	112205	112214	60 %	20 %	20 %	0 %	384162505
53	NC_017190	TGAAT	2	10	113378	113387	40 %	40 %	20 %	0 %	384162508
54	NC_017190	TTGAA	2	10	115775	115784	40 %	40 %	20 %	0 %	384162512
55	NC_017190	GACCG	2	10	116429	116438	20 %	0 %	40 %	40 %	384162513
56	NC_017190	GTGAA	2	10	120755	120764	40 %	20 %	40 %	0 %	384162515
57	NC_017190	ACCGG	2	10	121594	121603	20 %	0 %	40 %	40 %	384162515
58	NC_017190	ATCAA	2	10	122965	122974	60 %	20 %	0 %	20 %	384162515
59	NC_017190	GTGCT	2	10	123251	123260	0 %	40 %	40 %	20 %	384162515
60	NC_017190	CTGAC	2	10	123791	123800	20 %	20 %	20 %	40 %	384162515
61	NC_017190	GTCCT	2	10	124028	124037	0 %	40 %	20 %	40 %	384162515
62	NC_017190	CAATT	2	10	126270	126279	40 %	40 %	0 %	20 %	384162518
63	NC_017190	CTGAA	2	10	126501	126510	40 %	20 %	20 %	20 %	384162518
64	NC_017190	CAAAA	2	10	130496	130505	80 %	0 %	0 %	20 %	384162521
65	NC_017190	AATCA	2	10	131823	131832	60 %	20 %	0 %	20 %	384162523
66	NC_017190	TGGTA	2	10	134185	134194	20 %	40 %	40 %	0 %	384162527
67	NC_017190	AAAGT	2	10	135100	135109	60 %	20 %	20 %	0 %	384162529
68	NC_017190	TAAAT	2	10	141945	141954	60 %	40 %	0 %	0 %	384162542
69	NC_017190	TTATC	2	10	144597	144606	20 %	60 %	0 %	20 %	384162545
70	NC_017190	TAAAT	2	10	146277	146286	60 %	40 %	0 %	0 %	384162546
71	NC_017190	CGTTT	2	10	147620	147629	0 %	60 %	20 %	20 %	384162548
72	NC_017190	ATGGA	2	10	147687	147696	40 %	20 %	40 %	0 %	384162548
73	NC_017190	GCACC	2	10	148776	148785	20 %	0 %	20 %	60 %	384162549
74	NC_017190	ATTCC	2	10	150523	150532	20 %	40 %	0 %	40 %	384162552
75	NC_017190	TTTTC	2	10	154043	154052	0 %	80 %	0 %	20 %	384162557
76	NC_017190	TTCAT	2	10	154456	154465	20 %	60 %	0 %	20 %	384162557
77	NC_017190	GATCA	2	10	154651	154660	40 %	20 %	20 %	20 %	384162558
78	NC_017190	CAGTG	2	10	160735	160744	20 %	20 %	40 %	20 %	384162560
79	NC_017190	ATTAT	2	10	163054	163063	40 %	60 %	0 %	0 %	384162561
80	NC_017190	TTGAA	2	10	163704	163713	40 %	40 %	20 %	0 %	384162562
81	NC_017190	TTCCT	2	10	165410	165419	0 %	60 %	0 %	40 %	384162564
82	NC_017190	GCCGT	2	10	166043	166052	0 %	20 %	40 %	40 %	384162565
83	NC_017190	TGGCT	2	10	167817	167826	0 %	40 %	40 %	20 %	384162566
84	NC_017190	CGTTT	2	10	167920	167929	0 %	60 %	20 %	20 %	384162566
85	NC_017190	GCGGA	2	10	168312	168321	20 %	0 %	60 %	20 %	384162567
86	NC_017190	AAAAC	2	10	168685	168694	80 %	0 %	0 %	20 %	384162567
87	NC_017190	CTTTT	2	10	169843	169852	0 %	80 %	0 %	20 %	384162569
88	NC_017190	TCCTT	2	10	171703	171712	0 %	60 %	0 %	40 %	384162570
89	NC_017190	TGCTT	2	10	172333	172342	0 %	60 %	20 %	20 %	384162571
90	NC_017190	TTTTG	2	10	175490	175499	0 %	80 %	20 %	0 %	384162573
91	NC_017190	TTTGC	2	10	175565	175574	0 %	60 %	20 %	20 %	384162573
92	NC_017190	CTGAA	2	10	176225	176234	40 %	20 %	20 %	20 %	384162573
93	NC_017190	AGAAA	2	10	178073	178082	80 %	0 %	20 %	0 %	384162574
94	NC_017190	ATCAG	2	10	178690	178699	40 %	20 %	20 %	20 %	384162575
95	NC_017190	GTGTT	2	10	179183	179192	0 %	60 %	40 %	0 %	384162575
96	NC_017190	CCTTG	2	10	179810	179819	0 %	40 %	20 %	40 %	384162577
97	NC_017190	TAAAA	2	10	180974	180983	80 %	20 %	0 %	0 %	384162578
98	NC_017190	CCGTT	2	10	181432	181441	0 %	40 %	20 %	40 %	384162579
99	NC_017190	AAGAT	2	10	182531	182540	60 %	20 %	20 %	0 %	384162580
100	NC_017190	AAGGT	2	10	183477	183486	40 %	20 %	40 %	0 %	384162581
101	NC_017190	CTGAG	2	10	184065	184074	20 %	20 %	40 %	20 %	384162582
102	NC_017190	AGTGA	2	10	184448	184457	40 %	20 %	40 %	0 %	384162582
103	NC_017190	CATTG	2	10	184670	184679	20 %	40 %	20 %	20 %	384162583
104	NC_017190	GGAAG	2	10	185359	185368	40 %	0 %	60 %	0 %	384162583
105	NC_017190	GATCA	2	10	186854	186863	40 %	20 %	20 %	20 %	384162584
106	NC_017190	TGAAA	2	10	187171	187180	60 %	20 %	20 %	0 %	384162584
107	NC_017190	ACAAG	2	10	187450	187459	60 %	0 %	20 %	20 %	384162585
108	NC_017190	CTGCA	2	10	189592	189601	20 %	20 %	20 %	40 %	384162587
109	NC_017190	TTATA	2	10	196341	196350	40 %	60 %	0 %	0 %	384162589
110	NC_017190	CTTGG	2	10	196709	196718	0 %	40 %	40 %	20 %	384162590
111	NC_017190	GGCCG	2	10	200157	200166	0 %	0 %	60 %	40 %	384162593
112	NC_017190	AATAA	2	10	200703	200712	80 %	20 %	0 %	0 %	384162594
113	NC_017190	AAATC	2	10	205561	205570	60 %	20 %	0 %	20 %	384162599
114	NC_017190	TTTTA	2	10	206943	206952	20 %	80 %	0 %	0 %	384162601
115	NC_017190	GATGC	2	10	207436	207445	20 %	20 %	40 %	20 %	384162601
116	NC_017190	AATCA	2	10	207546	207555	60 %	20 %	0 %	20 %	384162601
117	NC_017190	GTTAT	2	10	209484	209493	20 %	60 %	20 %	0 %	384162604
118	NC_017190	ATTGG	2	10	210529	210538	20 %	40 %	40 %	0 %	384162606
119	NC_017190	ATCGT	2	10	212637	212646	20 %	40 %	20 %	20 %	384162609
120	NC_017190	TTTCC	2	10	214899	214908	0 %	60 %	0 %	40 %	384162610
121	NC_017190	AAATG	2	10	215817	215826	60 %	20 %	20 %	0 %	384162611
122	NC_017190	CATGG	2	10	216079	216088	20 %	20 %	40 %	20 %	384162611
123	NC_017190	CCAAG	2	10	216221	216230	40 %	0 %	20 %	40 %	384162611
124	NC_017190	TCCTT	2	10	216468	216477	0 %	60 %	0 %	40 %	384162612
125	NC_017190	TATCG	2	10	217547	217556	20 %	40 %	20 %	20 %	384162614
126	NC_017190	GCCCG	2	10	218284	218293	0 %	0 %	40 %	60 %	384162614
127	NC_017190	AGATT	2	10	222322	222331	40 %	40 %	20 %	0 %	384162620
128	NC_017190	ACGGT	2	10	224857	224866	20 %	20 %	40 %	20 %	384162625
129	NC_017190	ACGGC	2	10	225950	225959	20 %	0 %	40 %	40 %	384162626
130	NC_017190	TATGA	2	10	227206	227215	40 %	40 %	20 %	0 %	384162627
131	NC_017190	AAGAA	2	10	227363	227372	80 %	0 %	20 %	0 %	384162628
132	NC_017190	AATAA	2	10	229334	229343	80 %	20 %	0 %	0 %	384162629
133	NC_017190	AAAAT	2	10	231502	231511	80 %	20 %	0 %	0 %	384162631
134	NC_017190	GGCCG	2	10	232055	232064	0 %	0 %	60 %	40 %	384162631
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