MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens LL3 chromosome

Total Repeats: 6392

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017190	ACA	2	6	40	45	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017190	CAA	2	6	82	87	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017190	TTG	2	6	246	251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017190	CTA	2	6	288	293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017190	CTA	2	6	1876	1881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017190	TAC	2	6	1883	1888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017190	AGG	2	6	1926	1931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017190	TGC	2	6	3087	3092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017190	TCA	2	6	3119	3124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017190	GCT	2	6	6840	6845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017190	CTA	2	6	6883	6888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017190	ATT	2	6	6975	6980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017190	GAT	2	6	9540	9545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017190	TGT	2	6	9563	9568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017190	GAG	2	6	9662	9667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017190	CAA	2	6	9668	9673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017190	ACT	2	6	9760	9765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017190	GGC	2	6	9803	9808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017190	GCG	2	6	9863	9868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017190	CGA	2	6	10048	10053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017190	GCA	2	6	10122	10127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017190	CGC	2	6	10169	10174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_017190	TGT	2	6	10208	10213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017190	GAA	2	6	10218	10223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017190	GGC	2	6	10242	10247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017190	CAG	2	6	10291	10296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017190	ATT	2	6	10332	10337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017190	AGA	2	6	10432	10437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017190	GGA	2	6	10482	10487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017190	GAG	2	6	10530	10535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017190	TGC	2	6	10627	10632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017190	GAA	2	6	10746	10751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017190	GGT	2	6	10820	10825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017190	GTC	2	6	10834	10839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017190	GGA	2	6	10946	10951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017190	ATC	2	6	10970	10975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017190	CAC	2	6	11181	11186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_017190	GAT	2	6	11252	11257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017190	CCT	2	6	11308	11313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_017190	GGT	2	6	11465	11470	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017190	CCA	2	6	11487	11492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_017190	AGG	2	6	11547	11552	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017190	CCA	2	6	11577	11582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_017190	CAC	2	6	11792	11797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_017190	GGA	2	6	11877	11882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017190	GCG	2	6	11911	11916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017190	AGG	2	6	12029	12034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017190	CGG	2	6	12085	12090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017190	GGA	2	6	12117	12122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017190	AGT	2	6	12238	12243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017190	AGA	2	6	12319	12324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017190	AGC	2	6	12780	12785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017190	TTC	2	6	12878	12883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017190	ACC	2	6	13106	13111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_017190	AGG	2	6	13141	13146	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017190	TAG	2	6	13249	13254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017190	GAG	2	6	13336	13341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017190	CGG	2	6	13596	13601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017190	TAC	2	6	13866	13871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017190	CGC	2	6	13896	13901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_017190	CCT	2	6	13954	13959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_017190	GGT	2	6	14090	14095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017190	CGT	2	6	14285	14290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017190	GAG	2	6	14334	14339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017190	GTT	2	6	14388	14393	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017190	GAT	2	6	14512	14517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017190	TGG	2	6	14647	14652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017190	CGC	2	6	14750	14755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_017190	TCA	2	6	14782	14787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017190	ATA	2	6	15845	15850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017190	TGT	2	6	17423	17428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017190	TGA	2	6	18846	18851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017190	GTG	2	6	20630	20635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017190	GTT	2	6	20832	20837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017190	TAT	2	6	23475	23480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017190	GGA	2	6	23494	23499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017190	TCC	2	6	23577	23582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_017190	TAT	2	6	23707	23712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017190	TCC	2	6	24995	25000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_017190	CCT	2	6	26389	26394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_017190	CTG	2	6	27008	27013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017190	AAG	2	6	27055	27060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017190	CAT	2	6	27599	27604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017190	GCA	2	6	27807	27812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017190	CAG	2	6	28075	28080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017190	GGA	2	6	30691	30696	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017190	TCT	2	6	30951	30956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017190	ATT	2	6	31264	31269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017190	ATG	2	6	31276	31281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017190	TGA	2	6	31312	31317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017190	GAT	2	6	31360	31365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017190	AAC	2	6	31366	31371	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017190	AAT	2	6	31382	31387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017190	ACT	2	6	31500	31505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017190	GGC	2	6	31543	31548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017190	GCG	2	6	31603	31608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017190	CGA	2	6	31788	31793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017190	GCA	2	6	31862	31867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017190	CGC	2	6	31909	31914	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_017190	TGT	2	6	31948	31953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017190	GAA	2	6	31958	31963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017190	GGC	2	6	31982	31987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017190	CAG	2	6	32031	32036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017190	ATT	2	6	32072	32077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017190	AGA	2	6	32172	32177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017190	GGA	2	6	32222	32227	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017190	GAG	2	6	32270	32275	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017190	TGC	2	6	32367	32372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017190	GAA	2	6	32486	32491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017190	GGT	2	6	32560	32565	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017190	GTC	2	6	32574	32579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017190	GGA	2	6	32686	32691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017190	ATC	2	6	32710	32715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017190	CAC	2	6	32921	32926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_017190	GAT	2	6	32992	32997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017190	CCT	2	6	33048	33053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_017190	GGT	2	6	33205	33210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017190	CCA	2	6	33227	33232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_017190	AGG	2	6	33287	33292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017190	CCA	2	6	33317	33322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_017190	CAC	2	6	33532	33537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_017190	GGA	2	6	33617	33622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017190	GCG	2	6	33651	33656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017190	AGG	2	6	33769	33774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017190	CGG	2	6	33825	33830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017190	GGA	2	6	33857	33862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017190	AGT	2	6	33978	33983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017190	AGA	2	6	34059	34064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017190	AGC	2	6	34520	34525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017190	TTC	2	6	34618	34623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017190	ACC	2	6	34846	34851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_017190	AGG	2	6	34881	34886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017190	TAG	2	6	34989	34994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017190	GAG	2	6	35076	35081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017190	CGG	2	6	35336	35341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017190	TAC	2	6	35606	35611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_017190	CGC	2	6	35636	35641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_017190	CCT	2	6	35694	35699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_017190	GGT	2	6	35830	35835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017190	CGT	2	6	36025	36030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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