MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens TA208 chromosome

Total Repeats: 143

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017188	TTTGAA	2	12	12622	12633	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017188	AGTCAA	2	12	91731	91742	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_017188	TTTATT	2	12	192245	192256	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017188	GTGAAA	2	12	192333	192344	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017188	AGAGTG	2	12	275852	275863	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017188	GATAAA	2	12	294379	294390	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017188	TATTGA	2	12	295786	295797	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017188	TGATAA	2	12	368246	368257	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017188	GAAAAA	2	12	374421	374432	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017188	GGAAAA	2	12	415937	415948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017188	AGGAGC	2	12	416358	416369	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017188	TTTTGT	2	12	478846	478857	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017188	AAAAAT	2	12	550526	550537	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017188	ATTAAT	2	12	566299	566310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017188	GAAAAA	2	12	579684	579695	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017188	AAAAGG	2	12	581193	581204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017188	TCAATC	2	12	597628	597639	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017188	CAAAAG	2	12	599392	599403	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_017188	CCGGCT	2	12	599425	599436	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017188	CTTTCT	2	12	609888	609899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017188	TTTCTC	2	12	631534	631545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017188	AGAAAA	2	12	643924	643935	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017188	TCAGTA	2	12	647454	647465	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_017188	TCATAA	2	12	647487	647498	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_017188	AAAAAT	2	12	668344	668355	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017188	GTTTAC	2	12	682110	682121	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_017188	ACAAAA	2	12	688437	688448	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_017188	TCCCTT	2	12	730258	730269	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_017188	CTTTTT	2	12	768984	768995	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_017188	AAAAAT	2	12	790994	791005	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017188	CTTTTT	2	12	809166	809177	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_017188	AAAAAG	2	12	820789	820800	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017188	AAAAAT	2	12	830467	830478	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017188	TTATAT	2	12	831589	831600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017188	GTGCTG	2	12	834417	834428	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_017188	CATCTT	2	12	836269	836280	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017188	ACTCTC	2	12	837638	837649	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017188	TTTATA	2	12	855870	855881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017188	ATAAAA	2	12	873578	873589	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017188	CTCAAA	2	12	898150	898161	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017188	CTTTTT	2	12	899730	899741	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_017188	AAAAAG	2	12	922242	922253	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017188	ATAATG	2	12	986740	986751	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017188	TCTTTT	2	12	992843	992854	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_017188	GAAAAG	2	12	1001851	1001862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017188	TTACTA	2	12	1007008	1007019	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_017188	AAGGAG	2	12	1022465	1022476	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017188	TAAATA	2	12	1171968	1171979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017188	TATAAA	2	12	1181015	1181026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017188	GCCTTT	2	12	1186353	1186364	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017188	GCATAT	2	12	1202251	1202262	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_017188	CGCCTG	2	12	1202755	1202766	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
53	NC_017188	AATATT	2	12	1210407	1210418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017188	TCCTCA	2	12	1229083	1229094	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_017188	TTTTTA	2	12	1229232	1229243	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017188	AGTTGT	2	12	1232106	1232117	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017188	ATAAAA	2	12	1238608	1238619	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017188	ATAAAA	2	12	1240881	1240892	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017188	AAATTT	2	12	1247525	1247536	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017188	ATAAAA	2	12	1257039	1257050	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017188	GATAAT	2	12	1263212	1263223	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017188	ATAAAA	2	12	1269004	1269015	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017188	ATAAAA	2	12	1274584	1274595	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017188	AATAAA	2	12	1276139	1276150	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017188	TAAAAA	2	12	1280392	1280403	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017188	ATAAAA	2	12	1295735	1295746	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017188	CGGCAA	2	12	1303959	1303970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017188	ACAAAA	2	12	1310175	1310186	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_017188	ATAAAA	2	12	1310240	1310251	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017188	TTATTT	2	12	1318096	1318107	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017188	AAAACG	2	12	1318319	1318330	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_017188	GGAAGG	2	12	1382267	1382278	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017188	GAAAAA	2	12	1413941	1413952	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017188	TTTTAT	2	12	1446612	1446623	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017188	TTTTAT	2	12	1446872	1446883	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017188	TTTTAT	2	12	1447133	1447144	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017188	TCTCTT	2	12	1454716	1454727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017188	AAGATC	2	12	1553226	1553237	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_017188	TTATGC	2	12	1573354	1573365	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_017188	AATTCA	2	12	1594236	1594247	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_017188	CAAAAA	2	12	1697690	1697701	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_017188	AACAAA	2	12	1730424	1730435	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_017188	ACCATA	2	12	1749944	1749955	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017188	CCTCTC	2	12	1846077	1846088	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_017188	GAAAAA	2	12	1883148	1883159	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017188	AGTAAA	2	12	1916040	1916051	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017188	AGTTTG	2	12	1927501	1927512	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017188	TCTTTT	2	12	1960785	1960796	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_017188	AATGAT	2	12	1986205	1986216	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017188	TTTTCT	2	12	1987242	1987253	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_017188	AATGAT	2	12	1989449	1989460	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017188	CAATTA	2	12	2002897	2002908	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_017188	TTCCAT	2	12	2120541	2120552	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017188	GTTAAC	2	12	2152928	2152939	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_017188	ATTAAA	2	12	2203197	2203208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017188	TTTTTC	2	12	2305936	2305947	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_017188	TCCTTT	2	12	2320385	2320396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017188	TTTATA	2	12	2360280	2360291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017188	AACGGA	2	12	2381189	2381200	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_017188	CAATCT	2	12	2404297	2404308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017188	TGAAAA	2	12	2412800	2412811	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017188	TCGCCG	2	12	2434054	2434065	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
103	NC_017188	AAGCTC	2	12	2434431	2434442	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017188	TTCTAA	2	12	2462718	2462729	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_017188	TTTGTC	2	12	2466738	2466749	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_017188	TGACTT	2	12	2488839	2488850	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_017188	ACAGAC	2	12	2515941	2515952	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017188	GAATCA	2	12	2643003	2643014	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_017188	CCCTCT	2	12	2662293	2662304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_017188	ATTGGA	2	12	2674405	2674416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017188	CTCTTT	2	12	2709093	2709104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017188	CTTATA	2	12	2722198	2722209	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_017188	TTTAAG	2	12	2735901	2735912	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017188	GGAAAA	2	12	2750381	2750392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017188	CTTATC	2	12	2794385	2794396	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017188	AAGGCA	2	12	2819350	2819361	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_017188	CTAAAA	2	12	2834382	2834393	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_017188	TTTCTT	2	12	2848137	2848148	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_017188	AGGGAC	2	12	2906170	2906181	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_017188	AATTTT	2	12	2935416	2935427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017188	GCTTTC	2	12	2984190	2984201	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017188	CCAATG	2	12	2995752	2995763	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017188	ATATAC	2	12	2995940	2995951	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_017188	ATTATC	2	12	3032190	3032201	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_017188	CCGCGG	2	12	3039686	3039697	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
126	NC_017188	TTTAAG	2	12	3075811	3075822	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017188	TATAGA	2	12	3076079	3076090	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017188	GAATTT	2	12	3082002	3082013	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017188	CCCTTC	2	12	3083339	3083350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_017188	TGTTTT	2	12	3098177	3098188	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017188	TAATGA	2	12	3193710	3193721	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017188	AAATGA	2	12	3272313	3272324	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017188	TTTCAT	2	12	3375586	3375597	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_017188	TCTTAT	2	12	3403168	3403179	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
135	NC_017188	TAGAAT	2	12	3526974	3526985	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017188	GCGATC	2	12	3563873	3563884	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_017188	ATCTCC	2	12	3616392	3616403	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_017188	AATATA	2	12	3687098	3687109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017188	ATCATT	2	12	3796994	3797005	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
140	NC_017188	AGAAAC	2	12	3915602	3915613	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_017188	GCTCTT	2	12	3920651	3920662	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_017188	GCATAA	2	12	3927187	3927198	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
143	NC_017188	GAAAAA	2	12	3935030	3935041	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.