MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens TA208 chromosome

Total Repeats: 507

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017188	ATATT	2	10	144	153	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017188	AAAAG	2	10	385	394	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017188	ATTAT	2	10	1911	1920	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017188	AATAA	2	10	10909	10918	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017188	CCTTT	2	10	10963	10972	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
6	NC_017188	AAGAA	2	10	18608	18617	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017188	GATAT	2	10	26563	26572	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017188	TCGTG	2	10	27774	27783	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_017188	GGACG	2	10	28648	28657	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017188	TTTTG	2	10	49335	49344	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017188	TAAAA	2	10	78982	78991	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017188	TCGTG	2	10	87788	87797	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017188	GGACG	2	10	88488	88497	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
14	NC_017188	TTACG	2	10	110246	110255	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
15	NC_017188	TAAAA	2	10	110886	110895	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017188	TTGTG	2	10	144109	144118	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017188	CGGCC	2	10	148529	148538	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
18	NC_017188	TCGTG	2	10	151985	151994	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_017188	GGACG	2	10	152685	152694	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
20	NC_017188	AAAAC	2	10	163874	163883	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_017188	CTTGG	2	10	191899	191908	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_017188	AAATT	2	10	208933	208942	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017188	TCCTT	2	10	211671	211680	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
24	NC_017188	AGATT	2	10	217525	217534	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017188	TATGA	2	10	222410	222419	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017188	TAATT	2	10	234513	234522	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017188	CGTTT	2	10	234581	234590	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_017188	GCAAA	2	10	236847	236856	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_017188	AAATC	2	10	237639	237648	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_017188	CTTTT	2	10	242718	242727	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_017188	ACAGG	2	10	259054	259063	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017188	GAAGG	2	10	303066	303075	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017188	TATCA	2	10	338588	338597	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_017188	AGGGA	2	10	388808	388817	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017188	TGATT	2	10	397358	397367	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017188	AAGAA	2	10	407604	407613	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017188	CTATA	2	10	408895	408904	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_017188	GGACG	2	10	419078	419087	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
39	NC_017188	TTTAT	2	10	423677	423686	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017188	AAAAC	2	10	429390	429399	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_017188	ATAAA	2	10	447589	447598	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017188	ATTTT	2	10	466730	466739	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017188	TAAAT	2	10	468780	468789	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017188	AATTA	2	10	468812	468821	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017188	AATTG	2	10	468845	468854	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017188	TGAAG	2	10	470955	470964	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017188	TAATT	2	10	476584	476593	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017188	CAACT	2	10	476687	476696	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
49	NC_017188	TGAAG	2	10	477304	477313	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017188	CTGTA	2	10	477319	477328	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_017188	GCTAG	2	10	478138	478147	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
52	NC_017188	CTATT	2	10	478169	478178	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_017188	AAAAT	2	10	478944	478953	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017188	GTTTT	2	10	480539	480548	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017188	AAGTG	2	10	480600	480609	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017188	AGAAA	2	10	481257	481266	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017188	TTGTT	2	10	489564	489573	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017188	AGAAA	2	10	490325	490334	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017188	TATCT	2	10	495869	495878	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_017188	CTGAA	2	10	499300	499309	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_017188	TAAAC	2	10	506135	506144	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_017188	ATAAA	2	10	512170	512179	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017188	AAAGG	2	10	518015	518024	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017188	CAATT	2	10	542045	542054	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_017188	GGAAG	2	10	543341	543350	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017188	TCGTG	2	10	546629	546638	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
67	NC_017188	GGACG	2	10	547387	547396	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
68	NC_017188	AAACG	2	10	550625	550634	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_017188	AAGAA	2	10	565989	565998	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017188	AAAAG	2	10	566410	566419	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017188	TACTG	2	10	566925	566934	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_017188	CAGAG	2	10	569674	569683	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
73	NC_017188	CGGAT	2	10	570895	570904	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
74	NC_017188	AGAAA	2	10	599305	599314	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017188	AGGAA	2	10	624459	624468	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017188	TAAAA	2	10	646200	646209	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017188	TAAAA	2	10	647235	647244	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017188	TCATT	2	10	647310	647319	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_017188	ATCAT	2	10	647772	647781	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_017188	CAACC	2	10	650069	650078	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
81	NC_017188	TTTTA	2	10	655737	655746	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017188	AAATC	2	10	657344	657353	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_017188	GGGTT	2	10	667499	667508	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017188	TCAAA	2	10	730271	730280	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_017188	ATCAG	2	10	735603	735612	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_017188	TTTGA	2	10	754914	754923	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017188	AAATA	2	10	760233	760242	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017188	AACTT	2	10	760279	760288	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_017188	GAAAA	2	10	766731	766740	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017188	AAAAC	2	10	771446	771455	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_017188	AAAAG	2	10	784856	784865	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017188	ATAAA	2	10	784995	785004	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017188	TGATA	2	10	790274	790283	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017188	TTATA	2	10	800683	800692	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017188	AAGGA	2	10	806923	806932	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017188	CCTTT	2	10	807918	807927	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
97	NC_017188	ATGAA	2	10	807931	807940	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017188	TCGTG	2	10	826159	826168	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
99	NC_017188	GGACG	2	10	826917	826926	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
100	NC_017188	GTTTC	2	10	852369	852378	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_017188	ATAAG	2	10	860341	860350	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017188	ATATA	2	10	872080	872089	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017188	TCCTT	2	10	874861	874870	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
104	NC_017188	GCAAA	2	10	874891	874900	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_017188	TAAAG	2	10	875580	875589	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017188	GTGAT	2	10	877330	877339	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017188	CCGCT	2	10	884367	884376	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
108	NC_017188	AGTTA	2	10	890915	890924	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017188	ATAAA	2	10	895559	895568	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017188	GTGTG	2	10	899748	899757	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017188	AAGTC	2	10	903071	903080	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_017188	ATATT	2	10	905014	905023	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017188	GGAAG	2	10	908961	908970	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017188	TTTTA	2	10	910363	910372	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017188	GACAA	2	10	921074	921083	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_017188	ATGAT	2	10	922232	922241	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017188	AGTGG	2	10	936550	936559	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017188	AAATT	2	10	953355	953364	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017188	ATTAC	2	10	954061	954070	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_017188	AATAA	2	10	955854	955863	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017188	CAAAA	2	10	959066	959075	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_017188	AGAAA	2	10	978708	978717	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017188	TTTCG	2	10	986490	986499	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
124	NC_017188	TGAAA	2	10	995866	995875	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017188	TGTGA	2	10	996614	996623	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017188	CCTTT	2	10	996634	996643	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
127	NC_017188	ATTTT	2	10	996730	996739	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017188	TTTAT	2	10	1009033	1009042	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017188	TAAAA	2	10	1036523	1036532	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017188	CAAAA	2	10	1036557	1036566	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_017188	AACAA	2	10	1041345	1041354	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_017188	AAATA	2	10	1045674	1045683	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017188	GCCCC	2	10	1048369	1048378	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
134	NC_017188	CTTTT	2	10	1054850	1054859	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_017188	TAAAA	2	10	1069565	1069574	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017188	GGGAG	2	10	1081256	1081265	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017188	TGTAA	2	10	1087350	1087359	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017188	TAAAA	2	10	1092307	1092316	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017188	CTGTC	2	10	1119444	1119453	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
140	NC_017188	AGCTG	2	10	1123149	1123158	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
141	NC_017188	CAGGT	2	10	1172935	1172944	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
142	NC_017188	AAAAT	2	10	1185387	1185396	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017188	ATAAA	2	10	1185515	1185524	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017188	GAAAC	2	10	1186474	1186483	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
145	NC_017188	CATAG	2	10	1187192	1187201	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
146	NC_017188	TAAAA	2	10	1189772	1189781	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017188	AACGA	2	10	1190317	1190326	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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