MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Bacillus amyloliquefaciens TA208 chromosome

Total Repeats: 51938

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017188	ACA	2	6	40	45	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017188	CAA	2	6	82	87	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017188	TTG	2	6	246	251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017188	CTA	2	6	288	293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017188	CGA	2	6	500	505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384157613
6	NC_017188	GAA	2	6	625	630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384157613
7	NC_017188	GAA	2	6	667	672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384157613
8	NC_017188	GCA	2	6	802	807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384157613
9	NC_017188	GTG	2	6	940	945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384157613
10	NC_017188	TCT	2	6	952	957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384157613
11	NC_017188	TCA	2	6	977	982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384157613
12	NC_017188	GAT	2	6	1051	1056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384157613
13	NC_017188	GAA	2	6	1123	1128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384157613
14	NC_017188	CCG	2	6	1234	1239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384157613
15	NC_017188	GTT	2	6	1375	1380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384157613
16	NC_017188	GCT	2	6	1423	1428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384157613
17	NC_017188	ATT	2	6	1444	1449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384157613
18	NC_017188	CAG	2	6	1504	1509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384157613
19	NC_017188	TTC	2	6	1608	1613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384157613
20	NC_017188	GAA	2	6	1630	1635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384157613
21	NC_017188	CTG	2	6	1690	1695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384157613
22	NC_017188	TGA	2	6	1698	1703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384157613
23	NC_017188	AGC	2	6	1706	1711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384157613
24	NC_017188	CAG	3	9	1714	1722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384157613
25	NC_017188	ATA	2	6	1749	1754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384157613
26	NC_017188	CTA	2	6	1876	1881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017188	TAC	2	6	1883	1888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017188	AGG	2	6	1926	1931	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017188	AAC	2	6	2009	2014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384157614
30	NC_017188	AGA	3	9	2114	2122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384157614
31	NC_017188	TGC	2	6	2164	2169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384157614
32	NC_017188	TTC	2	6	2178	2183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384157614
33	NC_017188	CAT	2	6	2331	2336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384157614
34	NC_017188	ATT	2	6	2456	2461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384157614
35	NC_017188	CGT	2	6	2537	2542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384157614
36	NC_017188	TGA	2	6	2582	2587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384157614
37	NC_017188	TTA	2	6	2611	2616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384157614
38	NC_017188	TTC	2	6	2655	2660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384157614
39	NC_017188	GCT	2	6	2666	2671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384157614
40	NC_017188	TCG	2	6	2728	2733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384157614
41	NC_017188	CTT	2	6	2770	2775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384157614
42	NC_017188	CAA	2	6	2795	2800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384157614
43	NC_017188	TCA	2	6	2844	2849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384157614
44	NC_017188	AGT	2	6	2870	2875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384157614
45	NC_017188	ATG	2	6	3028	3033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384157614
46	NC_017188	TGC	2	6	3087	3092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017188	TCA	2	6	3119	3124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017188	CGG	2	6	3291	3296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384157615
49	NC_017188	CAA	2	6	3336	3341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384157615
50	NC_017188	CGC	2	6	3355	3360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384157615
51	NC_017188	GTC	2	6	3418	3423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384157615
52	NC_017188	ATC	2	6	3526	3531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384157616
53	NC_017188	TGA	2	6	3665	3670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384157616
54	NC_017188	AGC	2	6	3743	3748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384157616
55	NC_017188	GAG	3	9	3834	3842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384157616
56	NC_017188	AGC	2	6	4005	4010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384157616
57	NC_017188	ATT	2	6	4227	4232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384157616
58	NC_017188	GAT	2	6	4246	4251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384157616
59	NC_017188	CAG	2	6	4303	4308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384157616
60	NC_017188	ACG	2	6	4312	4317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384157616
61	NC_017188	GAA	2	6	4357	4362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384157616
62	NC_017188	GAT	2	6	4390	4395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384157616
63	NC_017188	GAT	2	6	4411	4416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384157616
64	NC_017188	CAC	2	6	4470	4475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384157616
65	NC_017188	GAC	2	6	4593	4598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384157617
66	NC_017188	TCG	2	6	4621	4626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384157617
67	NC_017188	GAA	2	6	4665	4670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384157617
68	NC_017188	AGT	2	6	4694	4699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384157617
69	NC_017188	GAA	2	6	4781	4786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384157617
70	NC_017188	CAG	2	6	4883	4888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384157618
71	NC_017188	ATG	2	6	4899	4904	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384157618
72	NC_017188	TCG	2	6	5010	5015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384157618
73	NC_017188	ACA	2	6	5016	5021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384157618
74	NC_017188	TCA	2	6	5160	5165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384157618
75	NC_017188	TTC	2	6	5172	5177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384157618
76	NC_017188	CGG	2	6	5218	5223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384157618
77	NC_017188	AAC	2	6	5416	5421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384157618
78	NC_017188	GGC	2	6	5720	5725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384157618
79	NC_017188	AAG	2	6	5779	5784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384157618
80	NC_017188	TGA	2	6	5824	5829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384157618
81	NC_017188	CAT	2	6	5851	5856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384157618
82	NC_017188	TTC	2	6	5947	5952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384157618
83	NC_017188	CTT	2	6	5969	5974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384157618
84	NC_017188	GGC	2	6	6037	6042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384157618
85	NC_017188	TTC	2	6	6118	6123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384157618
86	NC_017188	TTA	2	6	6413	6418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384157618
87	NC_017188	TTC	2	6	6422	6427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384157618
88	NC_017188	ATT	2	6	6446	6451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384157618
89	NC_017188	GCC	2	6	6478	6483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384157618
90	NC_017188	GCA	2	6	6496	6501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384157618
91	NC_017188	AGC	2	6	6534	6539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384157618
92	NC_017188	TGA	2	6	6541	6546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384157618
93	NC_017188	GCT	2	6	6840	6845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017188	CTA	2	6	6883	6888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017188	ATT	2	6	6975	6980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017188	TCG	2	6	7218	7223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384157619
97	NC_017188	ACC	2	6	7242	7247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384157619
98	NC_017188	TTG	2	6	7317	7322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384157619
99	NC_017188	TCC	2	6	7558	7563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384157619
100	NC_017188	CAT	2	6	7764	7769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384157619
101	NC_017188	GTC	2	6	7916	7921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384157619
102	NC_017188	CCG	2	6	7930	7935	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384157619
103	NC_017188	CTG	2	6	8009	8014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384157619
104	NC_017188	GAA	3	9	8330	8338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384157619
105	NC_017188	TTG	2	6	8349	8354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384157619
106	NC_017188	GAA	2	6	8390	8395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384157619
107	NC_017188	ATC	2	6	8408	8413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384157619
108	NC_017188	GAA	2	6	8417	8422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384157619
109	NC_017188	ATG	2	6	8448	8453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384157619
110	NC_017188	TCA	2	6	8529	8534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384157619
111	NC_017188	TTC	2	6	8684	8689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384157619
112	NC_017188	TAA	2	6	8692	8697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384157619
113	NC_017188	ATT	2	6	8765	8770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384157619
114	NC_017188	ATT	2	6	8810	8815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384157619
115	NC_017188	TGA	2	6	8830	8835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384157619
116	NC_017188	CTT	2	6	8848	8853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384157619
117	NC_017188	ATC	3	9	8990	8998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384157619
118	NC_017188	GAA	2	6	9004	9009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384157619
119	NC_017188	GAA	2	6	9032	9037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384157619
120	NC_017188	GAT	2	6	9095	9100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384157619
121	NC_017188	GAA	2	6	9125	9130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384157619
122	NC_017188	GAA	2	6	9284	9289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384157619
123	NC_017188	GCG	2	6	9312	9317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384157619
124	NC_017188	GAA	2	6	9437	9442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384157619
125	NC_017188	GAA	2	6	9449	9454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384157619
126	NC_017188	GAA	2	6	9458	9463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384157619
127	NC_017188	GAT	2	6	9540	9545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017188	TGT	2	6	9563	9568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017188	GAG	2	6	9662	9667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017188	CAA	2	6	9668	9673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017188	ACT	2	6	9760	9765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017188	GGC	2	6	9803	9808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017188	GCG	2	6	9863	9868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017188	CGA	2	6	10048	10053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017188	GCA	2	6	10122	10127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017188	CGC	2	6	10169	10174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_017188	TGT	2	6	10208	10213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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139	NC_017188	GGC	2	6	10242	10247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_017188	CAG	2	6	10291	10296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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143	NC_017188	GGA	2	6	10482	10487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017188	GAG	2	6	10530	10535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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254	NC_017188	TCC	2	6	18768	18773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
255	NC_017188	TAT	2	6	18898	18903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
256	NC_017188	TCA	2	6	18970	18975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384157626
257	NC_017188	TCC	2	6	19311	19316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384157626
258	NC_017188	CTT	2	6	19436	19441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384157626
259	NC_017188	GTT	2	6	19533	19538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384157626
260	NC_017188	TAA	2	6	19561	19566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384157627
261	NC_017188	TCT	2	6	19662	19667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384157627
262	NC_017188	GAT	2	6	19840	19845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384157627
263	NC_017188	AAT	2	6	19951	19956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384157627
264	NC_017188	TCC	2	6	20186	20191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
265	NC_017188	AAG	2	6	20469	20474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384157628
266	NC_017188	CTG	2	6	20537	20542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384157628
267	NC_017188	GAA	2	6	20628	20633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384157628
268	NC_017188	CGA	2	6	20746	20751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384157628
269	NC_017188	TAT	2	6	20998	21003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384157628
270	NC_017188	GCC	2	6	21016	21021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384157628
271	NC_017188	TGA	2	6	21058	21063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384157628
272	NC_017188	TCA	3	9	21064	21072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384157628
273	NC_017188	TGC	2	6	21197	21202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384157628
274	NC_017188	CTG	2	6	21203	21208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384157628
275	NC_017188	CCT	2	6	21580	21585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
276	NC_017188	GGT	2	6	21658	21663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384157629
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279	NC_017188	CGT	2	6	21777	21782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384157629
280	NC_017188	CGT	2	6	21868	21873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384157629
281	NC_017188	ATC	2	6	21913	21918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384157629
282	NC_017188	TCT	2	6	21935	21940	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384157629
283	NC_017188	TGC	2	6	21963	21968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384157629
284	NC_017188	TCC	2	6	21971	21976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384157629
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286	NC_017188	CTT	2	6	22057	22062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384157629
287	NC_017188	ATT	2	6	22132	22137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384157629
288	NC_017188	TGT	2	6	22164	22169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384157629
289	NC_017188	CTG	2	6	22199	22204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
290	NC_017188	AAG	2	6	22246	22251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
291	NC_017188	GAA	2	6	22306	22311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384157630
292	NC_017188	CGT	2	6	22528	22533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384157630
293	NC_017188	TGA	2	6	22599	22604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384157630
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295	NC_017188	ACC	2	6	22629	22634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384157630
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297	NC_017188	GAA	2	6	22661	22666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384157630
298	NC_017188	CAT	2	6	22790	22795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
299	NC_017188	GCA	2	6	22998	23003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
300	NC_017188	TAA	2	6	23193	23198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384157631
301	NC_017188	ATG	2	6	23201	23206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384157631
302	NC_017188	AGG	2	6	23215	23220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
303	NC_017188	CAG	2	6	23266	23271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384157632
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307	NC_017188	CCG	2	6	23665	23670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384157632
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312	NC_017188	GCG	2	6	23912	23917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384157632
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323	NC_017188	CAG	2	6	24577	24582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384157632
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352	NC_017188	GAT	2	6	26551	26556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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372	NC_017188	GGA	2	6	27877	27882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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377	NC_017188	GGT	2	6	28396	28401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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380	NC_017188	CCA	2	6	28508	28513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
381	NC_017188	CAC	2	6	28723	28728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
382	NC_017188	GGA	2	6	28808	28813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
383	NC_017188	GCG	2	6	28842	28847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
384	NC_017188	AGG	2	6	28960	28965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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386	NC_017188	GGA	2	6	29048	29053	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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