MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Arcobacter butzleri ED-1

Total Repeats: 56

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017187	AGTTCA	2	12	24712	24723	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_017187	TAGTTG	2	12	68818	68829	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017187	TTTTTA	2	12	71398	71409	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017187	CTAATT	2	12	85356	85367	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_017187	TAAAAA	2	12	246017	246028	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017187	TTAAAA	2	12	307147	307158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017187	ACTTAA	2	12	325054	325065	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_017187	AAAATA	2	12	351009	351020	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017187	TAAAAA	2	12	357023	357034	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017187	TGAATA	2	12	419267	419278	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017187	TAATTA	2	12	488538	488549	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017187	AATATT	2	12	505684	505695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017187	ATAAAA	2	12	539749	539760	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017187	TAATTT	2	12	550750	550761	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017187	TAAAAG	2	12	576846	576857	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017187	TTATTT	2	12	589470	589481	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017187	TTAAAA	2	12	622304	622315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017187	TAGATT	2	12	820706	820717	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017187	TAATTT	2	12	821619	821630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017187	ATTGTA	2	12	836132	836143	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017187	AACCAC	2	12	889123	889134	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017187	AAATTA	2	12	1008203	1008214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017187	AAATAT	2	12	1128400	1128411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017187	TTTATA	2	12	1158463	1158474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017187	AAATAA	2	12	1172257	1172268	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017187	AAATAT	2	12	1172394	1172405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017187	AAATAA	2	12	1174628	1174639	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017187	ATTCAA	2	12	1190166	1190177	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_017187	TCACCA	2	12	1247463	1247474	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017187	TAAAGC	2	12	1269596	1269607	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_017187	CTTCAT	2	12	1277030	1277041	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017187	TAAATA	2	12	1278054	1278065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017187	TATTTA	2	12	1384229	1384240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017187	TAAAAA	2	12	1398187	1398198	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017187	TTTTAA	2	12	1423405	1423416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017187	AAGACT	2	12	1444269	1444280	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_017187	TAGTGA	2	12	1494799	1494810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017187	ATTTTT	2	12	1506966	1506977	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017187	CAAAAT	2	12	1546100	1546111	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_017187	TATTCA	2	12	1573305	1573316	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_017187	ATTTAA	2	12	1580897	1580908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017187	TTAATT	2	12	1589476	1589487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017187	ATTACA	2	12	1615847	1615858	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_017187	ATTTAT	2	12	1724183	1724194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017187	CTAAAA	2	12	1737888	1737899	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_017187	TTACTA	2	12	1737942	1737953	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_017187	ACTTTA	2	12	1759832	1759843	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017187	TTTAAT	2	12	1807660	1807671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017187	CTTTAA	2	12	1899671	1899682	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_017187	TATAAA	2	12	2036318	2036329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017187	TTCAAT	2	12	2122352	2122363	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_017187	TAAAAA	2	12	2159437	2159448	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017187	TTCTTA	2	12	2190686	2190697	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_017187	ATTTTA	2	12	2195916	2195927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017187	TAATAT	2	12	2198993	2199004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017187	TTTAAA	2	12	2210133	2210144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.