MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Arcobacter butzleri ED-1

Total Repeats: 227

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017187	TTAAA	2	10	13264	13273	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017187	ATTTT	2	10	48395	48404	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017187	AAAGC	2	10	50890	50899	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017187	ATTTT	2	10	50950	50959	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017187	AGATA	2	10	65679	65688	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017187	TAAAT	2	10	82870	82879	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017187	CAATA	2	10	104504	104513	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_017187	ATAAA	2	10	111054	111063	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017187	TATAA	2	10	114335	114344	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017187	TATAA	2	10	123163	123172	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017187	TTTCT	2	10	124676	124685	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017187	TAAAA	2	10	134258	134267	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017187	TATAG	2	10	137468	137477	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017187	ATTTT	2	10	143662	143671	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017187	TTAAT	2	10	147866	147875	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017187	AATAA	2	10	153851	153860	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017187	GTCTC	2	10	161032	161041	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
18	NC_017187	GTCTC	2	10	161258	161267	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
19	NC_017187	TTCTA	2	10	175183	175192	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_017187	TTTAT	2	10	213654	213663	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017187	AGTAA	2	10	226995	227004	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017187	AAATT	2	10	255939	255948	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017187	ATTTA	2	10	262202	262211	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017187	TAATT	2	10	273533	273542	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017187	TGAAA	2	10	309129	309138	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017187	TTCTA	2	10	318540	318549	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_017187	TATAA	2	10	322143	322152	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017187	TATAC	2	10	322253	322262	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_017187	TTGTT	2	10	344696	344705	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017187	TAAAT	2	10	346010	346019	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017187	TTAAT	2	10	346037	346046	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017187	CATTT	2	10	350582	350591	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_017187	AATTT	2	10	354919	354928	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017187	ATCTT	2	10	377745	377754	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_017187	ATATT	2	10	387339	387348	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017187	TTAAT	2	10	409036	409045	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017187	TTAAA	2	10	411156	411165	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017187	TTAAA	2	10	411245	411254	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017187	TTTTA	2	10	422644	422653	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017187	CTTTT	2	10	430936	430945	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_017187	TTAAA	2	10	447016	447025	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017187	TACCC	2	10	464931	464940	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
43	NC_017187	TAGGG	2	10	464943	464952	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017187	CTTTC	2	10	468859	468868	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
45	NC_017187	TTAAT	2	10	469959	469968	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017187	TTAGT	2	10	479147	479156	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017187	AACTA	2	10	497613	497622	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_017187	CAAAA	2	10	497919	497928	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_017187	AACTA	2	10	497997	498006	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_017187	AATAA	2	10	498033	498042	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017187	TTAAA	2	10	569683	569692	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017187	AATTA	2	10	580537	580546	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017187	TAAAA	2	10	600181	600190	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017187	TAAAT	2	10	605385	605394	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017187	ATAAA	2	10	610669	610678	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017187	CAATA	2	10	614841	614850	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_017187	TAATA	2	10	622215	622224	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017187	TTAAA	2	10	622276	622285	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017187	TAAAT	2	10	640727	640736	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017187	TAAAA	2	10	644660	644669	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017187	TAAAT	2	10	664133	664142	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017187	TAATA	2	10	675312	675321	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017187	ATAAA	2	10	699671	699680	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017187	ATTAA	2	10	704052	704061	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017187	TAAAT	2	10	708614	708623	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017187	TGTAA	2	10	711957	711966	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017187	ATTTC	2	10	712756	712765	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_017187	AATTA	2	10	750294	750303	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017187	ATAAA	2	10	760396	760405	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017187	AATTA	2	10	760489	760498	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017187	AGATA	4	20	760642	760661	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017187	TATAA	2	10	785852	785861	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017187	TGTAT	2	10	791478	791487	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017187	TCGTG	2	10	792292	792301	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
75	NC_017187	AGTGA	2	10	793623	793632	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017187	CCGTA	2	10	795081	795090	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
77	NC_017187	TTATT	2	10	812628	812637	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017187	TTTAT	2	10	814856	814865	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017187	ATTTT	2	10	819637	819646	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017187	ATTTT	2	10	820474	820483	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017187	ATATA	2	10	833380	833389	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017187	TAATG	2	10	833926	833935	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017187	TAATA	2	10	836097	836106	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017187	TAAAT	2	10	837626	837635	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017187	AGATA	5	25	838002	838026	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017187	TATAA	2	10	857739	857748	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017187	ATTAT	2	10	873883	873892	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017187	ATTTT	2	10	885978	885987	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017187	ATTTG	2	10	890224	890233	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017187	ATTTT	2	10	923880	923889	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017187	AATAA	2	10	933588	933597	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017187	ATAAA	2	10	933774	933783	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017187	TAAAT	2	10	984422	984431	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017187	ATTTT	2	10	990538	990547	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017187	TGAAG	2	10	1025522	1025531	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017187	TAAAG	2	10	1035484	1035493	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017187	ATTTA	2	10	1038415	1038424	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017187	ATTTT	2	10	1039092	1039101	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017187	ATATT	2	10	1062237	1062246	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017187	AATAT	2	10	1065562	1065571	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017187	TAAAA	2	10	1080465	1080474	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017187	ATAAA	2	10	1084505	1084514	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017187	AATAT	2	10	1084593	1084602	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017187	CTTTT	2	10	1118791	1118800	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_017187	TAATT	2	10	1121297	1121306	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017187	TAAAA	2	10	1121317	1121326	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017187	ATTAT	2	10	1152365	1152374	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017187	AAACT	2	10	1153370	1153379	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_017187	AAAAT	2	10	1161883	1161892	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017187	TTACA	2	10	1166908	1166917	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_017187	TATTT	2	10	1172202	1172211	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017187	ATAAA	2	10	1172231	1172240	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017187	TAAAT	2	10	1187551	1187560	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017187	AAAAT	2	10	1189998	1190007	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017187	TTTCT	2	10	1190262	1190271	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_017187	AAAAT	2	10	1196528	1196537	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017187	TTTAT	2	10	1206157	1206166	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017187	TATAA	2	10	1213146	1213155	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017187	TTATA	2	10	1244670	1244679	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017187	CTTAC	2	10	1247449	1247458	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
121	NC_017187	CTTAT	2	10	1259450	1259459	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_017187	AACTC	2	10	1266374	1266383	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
123	NC_017187	TTTAT	2	10	1268712	1268721	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017187	ATTTA	2	10	1268837	1268846	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017187	TATAA	2	10	1269180	1269189	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017187	ATTTG	2	10	1270822	1270831	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017187	ATTTA	2	10	1278111	1278120	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017187	TAGTT	2	10	1305310	1305319	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017187	TTATG	2	10	1331511	1331520	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017187	ATTTT	2	10	1355294	1355303	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017187	TTATA	2	10	1355577	1355586	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017187	ATTAG	2	10	1374448	1374457	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017187	AAAGA	2	10	1377145	1377154	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017187	AAATT	2	10	1378849	1378858	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017187	AATAT	2	10	1379807	1379816	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017187	TTTTA	2	10	1393236	1393245	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017187	TTATT	2	10	1397763	1397772	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017187	TTTTA	2	10	1411633	1411642	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017187	AAGTT	2	10	1412529	1412538	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017187	AGTTG	2	10	1418363	1418372	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017187	TTTTC	2	10	1449162	1449171	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_017187	TCTAT	2	10	1477035	1477044	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_017187	TTATT	2	10	1478574	1478583	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017187	AAATA	2	10	1496912	1496921	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017187	AGTTT	2	10	1508533	1508542	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017187	AGTTT	2	10	1526921	1526930	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.