MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Amycolatopsis mediterranei S699 chromosome

Total Repeats: 8273

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_017186	CGGCGC	2	12	9236196	9236207	0 %	0 %	50 %	50 %	384153732
7502	NC_017186	CGCTGG	2	12	9238641	9238652	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384153734
7503	NC_017186	AACTGG	2	12	9238855	9238866	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384153735
7504	NC_017186	TCTGCT	2	12	9240114	9240125	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384153736
7505	NC_017186	AGCACC	2	12	9248451	9248462	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384153744
7506	NC_017186	CCGGCG	2	12	9249166	9249177	0 %	0 %	50 %	50 %	384153744
7507	NC_017186	CCGGCC	2	12	9249295	9249306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384153744
7508	NC_017186	GTCGAC	2	12	9251020	9251031	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384153746
7509	NC_017186	AGCGCG	2	12	9252025	9252036	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384153747
7510	NC_017186	ACGCCG	2	12	9252450	9252461	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384153748
7511	NC_017186	CGCCGT	2	12	9252843	9252854	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384153748
7512	NC_017186	TCCCGG	2	12	9253533	9253544	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384153749
7513	NC_017186	CGAGGT	2	12	9256491	9256502	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384153751
7514	NC_017186	GGCGCT	2	12	9257892	9257903	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384153753
7515	NC_017186	TGCGGC	2	12	9258167	9258178	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384153753
7516	NC_017186	CGCGAG	2	12	9259737	9259748	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384153755
7517	NC_017186	GGTGCT	2	12	9260427	9260438	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384153756
7518	NC_017186	GCGTGC	2	12	9260702	9260713	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384153756
7519	NC_017186	CACCGG	2	12	9262401	9262412	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384153758
7520	NC_017186	GCAGGT	2	12	9262870	9262881	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384153759
7521	NC_017186	GGTCGA	2	12	9264540	9264551	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384153760
7522	NC_017186	CGTCGG	2	12	9266508	9266519	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384153762
7523	NC_017186	CGACCT	2	12	9268578	9268589	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384153764
7524	NC_017186	ACGCCG	2	12	9268766	9268777	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384153764
7525	NC_017186	CTCGAC	2	12	9268912	9268923	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384153764
7526	NC_017186	TCCCAG	2	12	9269189	9269200	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384153765
7527	NC_017186	ACGCGG	2	12	9269482	9269493	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384153765
7528	NC_017186	GTGGGC	2	12	9270734	9270745	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	384153766
7529	NC_017186	CAGGTC	2	12	9271312	9271323	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384153767
7530	NC_017186	CGACGC	2	12	9271856	9271867	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384153768
7531	NC_017186	CGGCGA	2	12	9272859	9272870	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384153769
7532	NC_017186	ACTTCC	2	12	9274184	9274195	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	384153770
7533	NC_017186	ACCTCG	2	12	9274936	9274947	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384153771
7534	NC_017186	CGGCTT	2	12	9276741	9276752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384153773
7535	NC_017186	ACGGCG	2	12	9278054	9278065	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384153774
7536	NC_017186	ACGCCC	2	12	9278598	9278609	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384153775
7537	NC_017186	AGATCA	2	12	9280271	9280282	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384153776
7538	NC_017186	TCGCGC	2	12	9280388	9280399	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384153776
7539	NC_017186	CAGCAC	2	12	9283358	9283369	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384153779
7540	NC_017186	CCAGGT	2	12	9284073	9284084	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384153780
7541	NC_017186	CCGTGG	2	12	9284432	9284443	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384153780
7542	NC_017186	TTTCCC	2	12	9286229	9286240	0 %	50 %	0 %	50 %	384153782
7543	NC_017186	TTGCCG	2	12	9286451	9286462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384153782
7544	NC_017186	TGCCGA	2	12	9286536	9286547	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384153782
7545	NC_017186	ATGCCG	2	12	9289975	9289986	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384153787
7546	NC_017186	GCACGA	2	12	9291056	9291067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384153787
7547	NC_017186	GTGCTG	2	12	9293070	9293081	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384153790
7548	NC_017186	TCGTGG	2	12	9293215	9293226	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384153790
7549	NC_017186	CGGGAG	2	12	9294945	9294956	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
7550	NC_017186	CCGGCG	2	12	9297411	9297422	0 %	0 %	50 %	50 %	384153794
7551	NC_017186	CGAGGA	2	12	9298277	9298288	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384153795
7552	NC_017186	TCGAGG	2	12	9299125	9299136	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384153795
7553	NC_017186	CGGCCG	2	12	9300516	9300527	0 %	0 %	50 %	50 %	384153796
7554	NC_017186	CGACCC	2	12	9301022	9301033	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384153797
7555	NC_017186	ACCCCG	2	12	9301261	9301272	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384153797
7556	NC_017186	CAGGCG	2	12	9302171	9302182	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384153798
7557	NC_017186	GCCGGT	2	12	9302300	9302311	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384153798
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7559	NC_017186	CCGGAC	2	12	9302703	9302714	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384153798
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7561	NC_017186	GCCGGT	2	12	9302863	9302874	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384153799
7562	NC_017186	GGCGAG	2	12	9302968	9302979	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	384153799
7563	NC_017186	CATGCC	2	12	9303960	9303971	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384153800
7564	NC_017186	TGCTGA	2	12	9304812	9304823	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384153801
7565	NC_017186	CGTTCG	2	12	9304893	9304904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384153801
7566	NC_017186	GGCCCA	2	12	9306312	9306323	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384153802
7567	NC_017186	GGGCGC	2	12	9306413	9306424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7568	NC_017186	CCGGAC	2	12	9307366	9307377	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384153803
7569	NC_017186	TCGACG	2	12	9307611	9307622	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384153804
7570	NC_017186	GCCAGC	2	12	9309534	9309545	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384153806
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7572	NC_017186	CGACTA	2	12	9314127	9314138	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384153811
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7578	NC_017186	CGACCA	2	12	9318626	9318637	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384153816
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7580	NC_017186	CGTCGA	2	12	9322334	9322345	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384153818
7581	NC_017186	CAGCCT	2	12	9323185	9323196	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384153819
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7583	NC_017186	GCTCCG	2	12	9325646	9325657	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384153821
7584	NC_017186	GGCGAT	2	12	9326277	9326288	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384153821
7585	NC_017186	GCAAGG	2	12	9326333	9326344	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384153821
7586	NC_017186	CGAACC	2	12	9328325	9328336	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384153823
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7588	NC_017186	GCGGCC	2	12	9329945	9329956	0 %	0 %	50 %	50 %	384153826
7589	NC_017186	CGCGAA	2	12	9330299	9330310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384153827
7590	NC_017186	GCCGTC	2	12	9331539	9331550	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384153828
7591	NC_017186	CCATCC	2	12	9331838	9331849	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	384153828
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7595	NC_017186	GTGCCC	2	12	9337003	9337014	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
7596	NC_017186	CGTGAC	2	12	9338754	9338765	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384153833
7597	NC_017186	CGGCAC	2	12	9344012	9344023	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
7598	NC_017186	GACCAC	2	12	9348283	9348294	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384153844
7599	NC_017186	GACGGC	2	12	9348846	9348857	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384153845
7600	NC_017186	GCGAGC	2	12	9349087	9349098	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384153845
7601	NC_017186	CGGCGT	2	12	9350702	9350713	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384153847
7602	NC_017186	GGGCGC	2	12	9351192	9351203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384153847
7603	NC_017186	AACACC	2	12	9354809	9354820	50 %	0 %	0 %	50 %	384153852
7604	NC_017186	CCGGCC	2	12	9355088	9355099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384153852
7605	NC_017186	CCAGCT	2	12	9355565	9355576	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384153853
7606	NC_017186	CCGGCC	2	12	9356138	9356149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384153854
7607	NC_017186	CGGCCA	2	12	9357216	9357227	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384153856
7608	NC_017186	TCCGGG	2	12	9357916	9357927	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384153857
7609	NC_017186	TCTCGA	2	12	9358349	9358360	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384153857
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7611	NC_017186	CCGGGA	2	12	9358993	9359004	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384153857
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7717	NC_017186	CCTCGG	2	12	9495929	9495940	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384153994
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7720	NC_017186	CCGCTG	2	12	9501763	9501774	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384153999
7721	NC_017186	GTCGAG	2	12	9502107	9502118	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384153999
7722	NC_017186	GCCGTT	2	12	9502386	9502397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384153999
7723	NC_017186	GCTACG	2	12	9503919	9503930	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384154000
7724	NC_017186	AACACC	2	12	9504719	9504730	50 %	0 %	0 %	50 %	384154000
7725	NC_017186	GCCGAG	2	12	9505394	9505405	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384154001
7726	NC_017186	CCGCGA	2	12	9506490	9506501	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384154002
7727	NC_017186	CCGCCA	2	12	9507532	9507543	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384154003
7728	NC_017186	CGAGCA	2	12	9507663	9507674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384154003
7729	NC_017186	CGAGCG	2	12	9508570	9508581	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384154004
7730	NC_017186	CGGAGC	2	12	9510371	9510382	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384154005
7731	NC_017186	GACCGA	2	12	9510400	9510411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384154005
7732	NC_017186	CGACGT	2	12	9511735	9511746	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384154006
7733	NC_017186	CCAGCT	2	12	9511984	9511995	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384154006
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7735	NC_017186	GCCGAC	2	12	9514304	9514315	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384154007
7736	NC_017186	AGCTGC	2	12	9514429	9514440	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384154007
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7746	NC_017186	CCGCGA	2	12	9525013	9525024	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384154020
7747	NC_017186	GGGCCT	2	12	9527368	9527379	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384154022
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7749	NC_017186	CTCACC	2	12	9530061	9530072	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	384154024
7750	NC_017186	GGCACC	2	12	9531217	9531228	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384154026
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7754	NC_017186	GGTTCG	2	12	9536143	9536154	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384154031
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7759	NC_017186	TCACCG	2	12	9541772	9541783	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384154036
7760	NC_017186	GCCGAG	2	12	9541798	9541809	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384154036
7761	NC_017186	TCGACC	2	12	9546716	9546727	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384154042
7762	NC_017186	CTCGGT	2	12	9547413	9547424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384154042
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7764	NC_017186	CGGCGC	2	12	9549610	9549621	0 %	0 %	50 %	50 %	384154045
7765	NC_017186	GCGCCG	2	12	9549633	9549644	0 %	0 %	50 %	50 %	384154045
7766	NC_017186	GCCTCG	2	12	9551359	9551370	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384154046
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7768	NC_017186	GGAACC	2	12	9555391	9555402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384154049
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7770	NC_017186	GGTCAC	2	12	9557383	9557394	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384154051
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7772	NC_017186	ACTGGT	2	12	9558611	9558622	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384154054
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7779	NC_017186	CGGTCG	2	12	9566108	9566119	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384154059
7780	NC_017186	GGGCCA	2	12	9566274	9566285	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384154059
7781	NC_017186	GATCGC	2	12	9567673	9567684	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384154061
7782	NC_017186	CAGGCG	2	12	9569774	9569785	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384154063
7783	NC_017186	AGCTCC	2	12	9570915	9570926	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384154066
7784	NC_017186	CGCCCT	2	12	9572809	9572820	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	384154066
7785	NC_017186	ACCCTC	2	12	9573035	9573046	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	384154066
7786	NC_017186	TTACCT	2	12	9578133	9578144	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7787	NC_017186	CCGCGT	2	12	9579844	9579855	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384154073
7788	NC_017186	GTCGCT	2	12	9582661	9582672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384154077
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7792	NC_017186	GCCGTT	2	12	9584210	9584221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384154078
7793	NC_017186	GCCCTT	2	12	9585836	9585847	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384154078
7794	NC_017186	ACCGCG	2	12	9589083	9589094	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384154083
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7802	NC_017186	TGCAGG	2	12	9594421	9594432	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384154087
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7804	NC_017186	CTGGCC	2	12	9595089	9595100	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	384154088
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7813	NC_017186	AGCCCC	2	12	9603526	9603537	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384154095
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7815	NC_017186	GGTCGA	2	12	9605218	9605229	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	384154096
7816	NC_017186	CACGAC	2	12	9605851	9605862	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384154097
7817	NC_017186	CGGCCG	2	12	9608148	9608159	0 %	0 %	50 %	50 %	384154099
7818	NC_017186	GGACGC	2	12	9609305	9609316	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384154101
7819	NC_017186	GCGTCC	2	12	9610165	9610176	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
7820	NC_017186	CTCGGT	2	12	9610177	9610188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7821	NC_017186	TCAAGG	2	12	9611420	9611431	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384154103
7822	NC_017186	TCAGCC	2	12	9614014	9614025	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	384154105
7823	NC_017186	GATCAC	2	12	9615297	9615308	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7824	NC_017186	CACCCC	2	12	9622144	9622155	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
7825	NC_017186	CCTGGT	2	12	9624572	9624583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384154118
7826	NC_017186	CCGCGA	2	12	9626619	9626630	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	384154119
7827	NC_017186	CGACGG	2	12	9628475	9628486	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	384154121
7828	NC_017186	GCAACC	2	12	9630533	9630544	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
7829	NC_017186	GCAGGA	2	12	9630946	9630957	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
7830	NC_017186	GTCGAC	2	12	9635347	9635358	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384154125
7831	NC_017186	GGCCGT	2	12	9636115	9636126	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	384154125
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7836	NC_017186	GTCGAC	2	12	9645796	9645807	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	384154133
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