MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Amycolatopsis mediterranei S699 chromosome

Total Repeats: 205207

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017186	GGT	2	6	42	47	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384145137
2	NC_017186	AGC	2	6	80	85	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145137
3	NC_017186	GGC	2	6	141	146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384145137
4	NC_017186	CGG	2	6	214	219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384145137
5	NC_017186	GAT	2	6	369	374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384145137
6	NC_017186	GCC	3	9	375	383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384145137
7	NC_017186	CCG	2	6	389	394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384145137
8	NC_017186	GCA	2	6	402	407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145137
9	NC_017186	GCC	2	6	426	431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384145137
10	NC_017186	GAC	2	6	472	477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145137
11	NC_017186	CGA	2	6	480	485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145137
12	NC_017186	CGA	2	6	489	494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145137
13	NC_017186	CGA	2	6	501	506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145137
14	NC_017186	CGC	2	6	522	527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384145137
15	NC_017186	CTG	2	6	766	771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145137
16	NC_017186	TCA	2	6	854	859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384145137
17	NC_017186	CGA	2	6	870	875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145137
18	NC_017186	GCG	2	6	894	899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384145137
19	NC_017186	TCG	2	6	923	928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145137
20	NC_017186	TTC	2	6	973	978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384145137
21	NC_017186	TCG	2	6	1016	1021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145137
22	NC_017186	GGA	2	6	1059	1064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384145137
23	NC_017186	TCA	2	6	1094	1099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384145137
24	NC_017186	GCC	2	6	1110	1115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384145137
25	NC_017186	TCC	2	6	1139	1144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384145137
26	NC_017186	AAG	2	6	1147	1152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384145137
27	NC_017186	GCG	2	6	1153	1158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384145137
28	NC_017186	CAG	2	6	1276	1281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145137
29	NC_017186	TGC	2	6	1310	1315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145137
30	NC_017186	CAT	2	6	1362	1367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384145137
31	NC_017186	TTC	2	6	1384	1389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384145137
32	NC_017186	CGA	2	6	1401	1406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145137
33	NC_017186	CGG	2	6	1515	1520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384145137
34	NC_017186	AAG	2	6	1552	1557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384145137
35	NC_017186	CGG	2	6	1582	1587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384145137
36	NC_017186	AGC	2	6	1625	1630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145137
37	NC_017186	TCC	2	6	2621	2626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384145138
38	NC_017186	CGA	2	6	2711	2716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145138
39	NC_017186	CGG	2	6	2724	2729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384145138
40	NC_017186	CCT	2	6	2751	2756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384145138
41	NC_017186	GTC	3	9	2950	2958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145138
42	NC_017186	GAC	2	6	2971	2976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145138
43	NC_017186	CCG	2	6	3083	3088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384145138
44	NC_017186	CGC	2	6	3102	3107	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384145138
45	NC_017186	GGC	2	6	3138	3143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384145138
46	NC_017186	GCG	2	6	3161	3166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384145138
47	NC_017186	ACG	2	6	3232	3237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145138
48	NC_017186	CCG	2	6	3262	3267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384145138
49	NC_017186	GCT	2	6	3276	3281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145138
50	NC_017186	TCG	2	6	3295	3300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145138
51	NC_017186	TGG	2	6	3353	3358	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384145138
52	NC_017186	ACA	2	6	3395	3400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384145138
53	NC_017186	GCG	2	6	3419	3424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384145138
54	NC_017186	ACG	2	6	3425	3430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145138
55	NC_017186	GAA	2	6	3445	3450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384145138
56	NC_017186	TCG	2	6	3506	3511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145138
57	NC_017186	CAC	2	6	3555	3560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384145138
58	NC_017186	TCA	2	6	3578	3583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384145138
59	NC_017186	CGT	2	6	3606	3611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145138
60	NC_017186	GTC	2	6	3769	3774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145139
61	NC_017186	ACG	2	6	3805	3810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145139
62	NC_017186	CGG	2	6	3942	3947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384145139
63	NC_017186	CGA	2	6	3963	3968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145139
64	NC_017186	CTG	2	6	3985	3990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145139
65	NC_017186	GCG	2	6	3991	3996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384145139
66	NC_017186	CGG	2	6	4071	4076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384145139
67	NC_017186	GAA	2	6	4141	4146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384145139
68	NC_017186	GAT	2	6	4191	4196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384145139
69	NC_017186	ATG	2	6	4219	4224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384145139
70	NC_017186	CTC	2	6	4249	4254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384145139
71	NC_017186	GTC	2	6	4267	4272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145139
72	NC_017186	GTC	2	6	4315	4320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145139
73	NC_017186	GCT	2	6	4329	4334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145139
74	NC_017186	CGA	2	6	4356	4361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145139
75	NC_017186	GAC	2	6	4375	4380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145139
76	NC_017186	CAA	2	6	4437	4442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384145139
77	NC_017186	CGC	2	6	4527	4532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384145139
78	NC_017186	CGG	2	6	4548	4553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384145139
79	NC_017186	GAA	2	6	4563	4568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384145139
80	NC_017186	CGG	2	6	4572	4577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384145139
81	NC_017186	CGC	2	6	4764	4769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384145140
82	NC_017186	GGT	2	6	4810	4815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384145140
83	NC_017186	ACG	2	6	4818	4823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145140
84	NC_017186	CCG	2	6	4854	4859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384145140
85	NC_017186	GGA	2	6	4948	4953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384145140
86	NC_017186	CGA	2	6	4999	5004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145140
87	NC_017186	CTC	2	6	5006	5011	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384145140
88	NC_017186	TGC	2	6	5013	5018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145140
89	NC_017186	AGC	2	6	5067	5072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145140
90	NC_017186	ACG	2	6	5101	5106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145140
91	NC_017186	GAC	2	6	5153	5158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145140
92	NC_017186	GCT	2	6	5182	5187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145140
93	NC_017186	TCG	2	6	5205	5210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145140
94	NC_017186	CGC	2	6	5220	5225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384145140
95	NC_017186	GTC	2	6	5287	5292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145140
96	NC_017186	GCC	2	6	5300	5305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384145140
97	NC_017186	GCT	2	6	5542	5547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145140
98	NC_017186	TGC	3	9	5571	5579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145140
99	NC_017186	CGA	2	6	5581	5586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145140
100	NC_017186	CCG	2	6	5664	5669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384145140
101	NC_017186	CGA	2	6	5674	5679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145140
102	NC_017186	GTG	2	6	5714	5719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384145140
103	NC_017186	CGC	2	6	5990	5995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384145141
104	NC_017186	GCC	2	6	6049	6054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384145141
105	NC_017186	CGG	2	6	6062	6067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384145141
106	NC_017186	CGC	2	6	6087	6092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384145141
107	NC_017186	TGA	2	6	6154	6159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384145141
108	NC_017186	TGC	2	6	6322	6327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145141
109	NC_017186	GCT	2	6	6335	6340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145141
110	NC_017186	CGG	2	6	6352	6357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384145141
111	NC_017186	CGT	2	6	6371	6376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145141
112	NC_017186	CGT	2	6	6696	6701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145142
113	NC_017186	CAC	2	6	6782	6787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384145142
114	NC_017186	AGG	2	6	6795	6800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384145142
115	NC_017186	TCG	2	6	6801	6806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145142
116	NC_017186	CGA	2	6	6817	6822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145142
117	NC_017186	CCA	2	6	6840	6845	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384145142
118	NC_017186	CTC	2	6	6860	6865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384145142
119	NC_017186	CGG	2	6	6871	6876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384145142
120	NC_017186	CGT	2	6	6883	6888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145142
121	NC_017186	CGA	2	6	6889	6894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145142
122	NC_017186	TCC	2	6	6963	6968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384145142
123	NC_017186	GGC	2	6	6974	6979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384145142
124	NC_017186	CGG	2	6	7009	7014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384145142
125	NC_017186	GGT	2	6	7036	7041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384145142
126	NC_017186	GAA	2	6	7054	7059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384145142
127	NC_017186	GCT	2	6	7060	7065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145142
128	NC_017186	CGG	2	6	7081	7086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384145142
129	NC_017186	CAC	2	6	7162	7167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384145142
130	NC_017186	ACG	2	6	7205	7210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145142
131	NC_017186	CAA	2	6	7258	7263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384145142
132	NC_017186	CGA	2	6	7285	7290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145142
133	NC_017186	CGA	2	6	7300	7305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145142
134	NC_017186	GCA	2	6	7404	7409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145142
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136	NC_017186	GGC	2	6	7544	7549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384145142
137	NC_017186	CGT	2	6	7585	7590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145142
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139	NC_017186	GAC	2	6	7649	7654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145142
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149	NC_017186	ATC	2	6	8060	8065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384145142
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152	NC_017186	GCT	3	9	8233	8241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145142
153	NC_017186	CTG	2	6	8246	8251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145142
154	NC_017186	CGC	2	6	8265	8270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384145142
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156	NC_017186	GAC	2	6	8417	8422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145142
157	NC_017186	GCT	2	6	8500	8505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384145142
158	NC_017186	CGA	2	6	8521	8526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145142
159	NC_017186	CGC	2	6	8527	8532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384145142
160	NC_017186	CGA	2	6	8539	8544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145142
161	NC_017186	CGC	2	6	8582	8587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384145142
162	NC_017186	TCA	2	6	8592	8597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384145142
163	NC_017186	CTT	2	6	8620	8625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384145142
164	NC_017186	GCC	2	6	8702	8707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384145143
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239	NC_017186	CGG	2	6	11754	11759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384145144
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241	NC_017186	ATC	2	6	13851	13856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384145145
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245	NC_017186	ACG	2	6	15127	15132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145146
246	NC_017186	GGA	2	6	15191	15196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384145146
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248	NC_017186	CGC	2	6	15205	15210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384145146
249	NC_017186	CTC	2	6	15259	15264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384145146
250	NC_017186	ACC	2	6	15290	15295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384145146
251	NC_017186	TCC	2	6	15317	15322	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384145146
252	NC_017186	CGG	2	6	15330	15335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384145146
253	NC_017186	CAG	2	6	15412	15417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145146
254	NC_017186	CGC	2	6	15448	15453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384145146
255	NC_017186	TCC	2	6	15524	15529	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384145146
256	NC_017186	CAT	2	6	15543	15548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384145146
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258	NC_017186	CAG	3	9	15580	15588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384145146
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375	NC_017186	CAC	2	6	24155	24160	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384145156
376	NC_017186	CGC	2	6	24161	24166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384145156
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