MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Zymomonas mobilis subsp. mobilis ATCC 10988 plasmid pZMOB04

Total Repeats: 56

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017184	TGAG	2	8	255	262	25 %	25 %	50 %	0 %	384410913
2	NC_017184	CATT	2	8	444	451	25 %	50 %	0 %	25 %	384410914
3	NC_017184	GTAT	2	8	717	724	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017184	GCCT	2	8	2241	2248	0 %	25 %	25 %	50 %	384410917
5	NC_017184	TCAC	2	8	2488	2495	25 %	25 %	0 %	50 %	384410917
6	NC_017184	GATT	2	8	3212	3219	25 %	50 %	25 %	0 %	384410918
7	NC_017184	ATTC	2	8	3274	3281	25 %	50 %	0 %	25 %	384410919
8	NC_017184	GCAG	2	8	5229	5236	25 %	0 %	50 %	25 %	384410922
9	NC_017184	TTAA	2	8	6172	6179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017184	TTAA	2	8	6225	6232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017184	ACCG	2	8	6306	6313	25 %	0 %	25 %	50 %	384410924
12	NC_017184	CTTT	2	8	6573	6580	0 %	75 %	0 %	25 %	384410925
13	NC_017184	GTTT	2	8	6666	6673	0 %	75 %	25 %	0 %	384410925
14	NC_017184	TAAA	2	8	6849	6856	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017184	TGTT	2	8	7180	7187	0 %	75 %	25 %	0 %	384410926
16	NC_017184	CATC	2	8	7476	7483	25 %	25 %	0 %	50 %	384410926
17	NC_017184	GCTT	2	8	7598	7605	0 %	50 %	25 %	25 %	384410927
18	NC_017184	ATCC	2	8	7721	7728	25 %	25 %	0 %	50 %	384410927
19	NC_017184	CCAT	3	12	8038	8049	25 %	25 %	0 %	50 %	384410928
20	NC_017184	CTGC	2	8	8172	8179	0 %	25 %	25 %	50 %	384410928
21	NC_017184	CCGC	2	8	8410	8417	0 %	0 %	25 %	75 %	384410928
22	NC_017184	GACT	2	8	8966	8973	25 %	25 %	25 %	25 %	384410928
23	NC_017184	AGGC	2	8	9421	9428	25 %	0 %	50 %	25 %	384410928
24	NC_017184	GATA	2	8	9556	9563	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017184	TCAG	2	8	9808	9815	25 %	25 %	25 %	25 %	384410929
26	NC_017184	GAAA	2	8	10840	10847	75 %	0 %	25 %	0 %	384410931
27	NC_017184	GACA	2	8	10958	10965	50 %	0 %	25 %	25 %	384410931
28	NC_017184	CAAA	2	8	11483	11490	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017184	ATTG	2	8	11496	11503	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017184	ACGC	2	8	11513	11520	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017184	GATG	2	8	11559	11566	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017184	AACA	2	8	11586	11593	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017184	GCCA	2	8	11734	11741	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017184	TCAA	2	8	11930	11937	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_017184	GTCA	2	8	12015	12022	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017184	TGGA	2	8	12379	12386	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017184	TAAT	2	8	12429	12436	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017184	AATA	2	8	12461	12468	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017184	ATTT	2	8	12533	12540	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017184	GCCC	2	8	12734	12741	0 %	0 %	25 %	75 %	384410932
41	NC_017184	CGCC	2	8	13154	13161	0 %	0 %	25 %	75 %	384410932
42	NC_017184	CTGA	2	8	13198	13205	25 %	25 %	25 %	25 %	384410932
43	NC_017184	CTTG	2	8	13766	13773	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017184	AAGG	2	8	13825	13832	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017184	AGGA	2	8	13984	13991	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017184	GCAA	2	8	14486	14493	50 %	0 %	25 %	25 %	384410935
47	NC_017184	TTCT	2	8	14927	14934	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_017184	TCTA	2	8	15153	15160	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017184	TTAA	2	8	15713	15720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017184	GGTC	2	8	16389	16396	0 %	25 %	50 %	25 %	384410938
51	NC_017184	TGAT	2	8	16672	16679	25 %	50 %	25 %	0 %	384410938
52	NC_017184	AACC	2	8	16750	16757	50 %	0 %	0 %	50 %	384410938
53	NC_017184	ACTT	2	8	17222	17229	25 %	50 %	0 %	25 %	384410938
54	NC_017184	ATTC	2	8	17672	17679	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017184	ATTA	2	8	17688	17695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017184	ATAA	2	8	18454	18461	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.