MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Zymomonas mobilis subsp. mobilis ATCC 10988 plasmid pZMOB04

Total Repeats: 234

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017184	TTG	2	6	273	278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410914
2	NC_017184	ATT	2	6	346	351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410914
3	NC_017184	TAT	2	6	383	388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410914
4	NC_017184	CTG	2	6	408	413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410914
5	NC_017184	ACC	2	6	438	443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384410914
6	NC_017184	AAC	2	6	569	574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384410914
7	NC_017184	TAC	2	6	685	690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017184	TGA	2	6	697	702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017184	GTG	2	6	806	811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017184	AAT	2	6	855	860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017184	ATT	2	6	883	888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410915
12	NC_017184	AAT	2	6	891	896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410915
13	NC_017184	GAT	2	6	1211	1216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017184	AAG	2	6	1274	1279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017184	AAT	2	6	1384	1389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017184	ATC	2	6	1427	1432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410916
17	NC_017184	GCT	2	6	1473	1478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410916
18	NC_017184	ATG	2	6	1483	1488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410916
19	NC_017184	GCT	2	6	1497	1502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410916
20	NC_017184	TAT	2	6	1533	1538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410916
21	NC_017184	GAC	2	6	1545	1550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410916
22	NC_017184	TGA	2	6	1622	1627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410916
23	NC_017184	AGA	2	6	1746	1751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410917
24	NC_017184	TGC	2	6	1759	1764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410917
25	NC_017184	CGC	2	6	1820	1825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384410917
26	NC_017184	GGC	2	6	1892	1897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384410917
27	NC_017184	TTC	3	9	1910	1918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410917
28	NC_017184	TTA	2	6	1967	1972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410917
29	NC_017184	TTC	2	6	2008	2013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410917
30	NC_017184	CAG	2	6	2026	2031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410917
31	NC_017184	GGC	2	6	2088	2093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384410917
32	NC_017184	ATC	2	6	2221	2226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410917
33	NC_017184	CGA	2	6	2261	2266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410917
34	NC_017184	GGC	2	6	2288	2293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384410917
35	NC_017184	ACG	2	6	2400	2405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410917
36	NC_017184	GGT	2	6	2634	2639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017184	CTT	2	6	2760	2765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017184	AGC	2	6	2929	2934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017184	TCA	2	6	3059	3064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410918
40	NC_017184	TTA	2	6	3149	3154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410918
41	NC_017184	ATT	2	6	3263	3268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017184	CAA	2	6	3350	3355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384410919
43	NC_017184	CGA	3	9	3394	3402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410919
44	NC_017184	TCA	2	6	3497	3502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410919
45	NC_017184	TCA	2	6	3541	3546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410919
46	NC_017184	ATC	2	6	3561	3566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410919
47	NC_017184	CAT	2	6	3578	3583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410919
48	NC_017184	GAG	2	6	3590	3595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384410919
49	NC_017184	AAG	2	6	3606	3611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410919
50	NC_017184	ATA	2	6	3670	3675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410919
51	NC_017184	AGC	2	6	3789	3794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410919
52	NC_017184	AAT	2	6	3918	3923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410919
53	NC_017184	CAT	2	6	4001	4006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017184	ATA	2	6	4031	4036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017184	CAA	3	9	4134	4142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384410920
56	NC_017184	GAA	2	6	4190	4195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410920
57	NC_017184	AGA	2	6	4276	4281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410920
58	NC_017184	CCA	2	6	4355	4360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384410920
59	NC_017184	ATT	2	6	4437	4442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410921
60	NC_017184	TAT	2	6	4582	4587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410921
61	NC_017184	TGT	2	6	4662	4667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410921
62	NC_017184	GGC	2	6	4676	4681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384410921
63	NC_017184	ATA	2	6	4750	4755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410921
64	NC_017184	TGA	2	6	4806	4811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410921
65	NC_017184	ATG	2	6	4864	4869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410921
66	NC_017184	TGA	2	6	4871	4876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410921
67	NC_017184	TGT	2	6	4947	4952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410922
68	NC_017184	CGT	2	6	5074	5079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410922
69	NC_017184	GCC	2	6	5186	5191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384410922
70	NC_017184	TCG	2	6	5213	5218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410922
71	NC_017184	TGA	2	6	5252	5257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410922
72	NC_017184	GCC	2	6	5386	5391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384410922
73	NC_017184	CTG	2	6	5448	5453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410922
74	NC_017184	GAA	2	6	5466	5471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410922
75	NC_017184	TAA	2	6	5507	5512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410922
76	NC_017184	CCG	2	6	5556	5561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384410922
77	NC_017184	AAG	2	6	5562	5567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410922
78	NC_017184	GCC	2	6	5582	5587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384410922
79	NC_017184	GGC	2	6	5653	5658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384410922
80	NC_017184	GCA	2	6	5715	5720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410922
81	NC_017184	TCT	2	6	5728	5733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410922
82	NC_017184	ACG	3	9	5984	5992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410923
83	NC_017184	CCT	2	6	6057	6062	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_017184	AGG	2	6	6065	6070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017184	AAT	2	6	6100	6105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017184	TGC	2	6	6115	6120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017184	TGT	2	6	6147	6152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017184	ATT	2	6	6294	6299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410924
89	NC_017184	AAT	3	9	6315	6323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410924
90	NC_017184	TAA	2	6	6523	6528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410924
91	NC_017184	TGT	2	6	6540	6545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410924
92	NC_017184	ATA	2	6	6618	6623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410925
93	NC_017184	CAG	2	6	6636	6641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410925
94	NC_017184	ATT	2	6	6644	6649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410925
95	NC_017184	GTT	2	6	6719	6724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410925
96	NC_017184	ATT	2	6	6857	6862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017184	GAC	2	6	7063	7068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017184	AAT	2	6	7083	7088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017184	TAC	2	6	7144	7149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017184	ATG	2	6	7171	7176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410926
101	NC_017184	AAG	2	6	7206	7211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410926
102	NC_017184	CAA	2	6	7315	7320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384410926
103	NC_017184	CTT	2	6	7452	7457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410926
104	NC_017184	ATG	2	6	7663	7668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410927
105	NC_017184	TGA	2	6	7694	7699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410927
106	NC_017184	CTT	2	6	7740	7745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410927
107	NC_017184	TTA	2	6	7835	7840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017184	AGG	2	6	8007	8012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384410928
109	NC_017184	ATC	2	6	8153	8158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410928
110	NC_017184	TTA	3	9	8238	8246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410928
111	NC_017184	AAT	2	6	8248	8253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410928
112	NC_017184	TCC	2	6	8322	8327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384410928
113	NC_017184	CTT	2	6	8378	8383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410928
114	NC_017184	CTT	2	6	8392	8397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410928
115	NC_017184	GGC	2	6	8502	8507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384410928
116	NC_017184	TCC	2	6	8584	8589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384410928
117	NC_017184	AAG	2	6	8646	8651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410928
118	NC_017184	CGG	2	6	8676	8681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384410928
119	NC_017184	GAC	2	6	8765	8770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410928
120	NC_017184	AGA	2	6	8865	8870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410928
121	NC_017184	CGG	2	6	9027	9032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384410928
122	NC_017184	GCG	2	6	9279	9284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384410928
123	NC_017184	TTC	2	6	9404	9409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410928
124	NC_017184	TCT	2	6	9775	9780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410929
125	NC_017184	TTA	2	6	10074	10079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410930
126	NC_017184	TCT	2	6	10124	10129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410930
127	NC_017184	TCT	2	6	10215	10220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410930
128	NC_017184	GCT	2	6	10268	10273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017184	GAT	2	6	10305	10310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017184	ATC	2	6	10368	10373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017184	CCT	2	6	10400	10405	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_017184	ATC	2	6	10512	10517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017184	TAA	2	6	10539	10544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017184	ACC	2	6	10593	10598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_017184	TTA	2	6	10642	10647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017184	ATA	2	6	10651	10656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017184	CAA	2	6	10664	10669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017184	ATT	2	6	10719	10724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017184	TGC	2	6	10739	10744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_017184	CAT	2	6	10790	10795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410931
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143	NC_017184	ATC	2	6	11012	11017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410931
144	NC_017184	TAA	2	6	11030	11035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410931
145	NC_017184	TGC	2	6	11105	11110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410931
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147	NC_017184	TGA	2	6	11204	11209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410931
148	NC_017184	ATC	2	6	11243	11248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_017184	TTC	2	6	11386	11391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_017184	ATG	2	6	11428	11433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017184	GGA	2	6	11577	11582	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017184	AAT	2	6	11666	11671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017184	AGC	2	6	11827	11832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_017184	GCT	2	6	11924	11929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_017184	TTC	2	6	11958	11963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_017184	TCG	2	6	12261	12266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_017184	AAT	2	6	12359	12364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_017184	TAC	2	6	12403	12408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_017184	TAT	2	6	12414	12419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_017184	TAT	3	9	12452	12460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_017184	TAT	2	6	12515	12520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_017184	TAT	2	6	12546	12551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_017184	TGT	2	6	12634	12639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410932
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165	NC_017184	TGA	2	6	12822	12827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410932
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168	NC_017184	TAG	2	6	12977	12982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410932
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170	NC_017184	TAG	2	6	13130	13135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410932
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173	NC_017184	TAT	2	6	13433	13438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_017184	ACA	2	6	13487	13492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384410933
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178	NC_017184	TTA	2	6	13892	13897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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192	NC_017184	GCT	3	9	14740	14748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
193	NC_017184	ATA	2	6	14761	14766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
194	NC_017184	TAT	2	6	14975	14980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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219	NC_017184	TGT	2	6	17342	17347	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
220	NC_017184	GTT	2	6	17393	17398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
221	NC_017184	AGA	2	6	17497	17502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
222	NC_017184	AAT	2	6	17521	17526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
223	NC_017184	TCA	2	6	17566	17571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
224	NC_017184	TAA	2	6	17617	17622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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231	NC_017184	GCC	2	6	18030	18035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384410939
232	NC_017184	GCA	2	6	18272	18277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
233	NC_017184	TTA	2	6	18335	18340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
234	NC_017184	ATT	2	6	18441	18446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.