MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Zymomonas mobilis subsp. mobilis ATCC 10988 plasmid pZMOB04

Total Repeats: 160

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017184	TTG	2	6	273	278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410914
2	NC_017184	ATT	2	6	346	351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410914
3	NC_017184	TAT	2	6	383	388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410914
4	NC_017184	CTG	2	6	408	413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410914
5	NC_017184	ACC	2	6	438	443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384410914
6	NC_017184	AAC	2	6	569	574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384410914
7	NC_017184	ATT	2	6	883	888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410915
8	NC_017184	AAT	2	6	891	896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410915
9	NC_017184	ATC	2	6	1427	1432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410916
10	NC_017184	GCT	2	6	1473	1478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410916
11	NC_017184	ATG	2	6	1483	1488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410916
12	NC_017184	GCT	2	6	1497	1502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410916
13	NC_017184	TAT	2	6	1533	1538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410916
14	NC_017184	GAC	2	6	1545	1550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410916
15	NC_017184	TGA	2	6	1622	1627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410916
16	NC_017184	AGA	2	6	1746	1751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410917
17	NC_017184	TGC	2	6	1759	1764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410917
18	NC_017184	CGC	2	6	1820	1825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384410917
19	NC_017184	GGC	2	6	1892	1897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384410917
20	NC_017184	TTC	3	9	1910	1918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410917
21	NC_017184	TTA	2	6	1967	1972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410917
22	NC_017184	TTC	2	6	2008	2013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410917
23	NC_017184	CAG	2	6	2026	2031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410917
24	NC_017184	GGC	2	6	2088	2093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384410917
25	NC_017184	ATC	2	6	2221	2226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410917
26	NC_017184	CGA	2	6	2261	2266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410917
27	NC_017184	GGC	2	6	2288	2293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384410917
28	NC_017184	ACG	2	6	2400	2405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410917
29	NC_017184	TCA	2	6	3059	3064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410918
30	NC_017184	TTA	2	6	3149	3154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410918
31	NC_017184	CAA	2	6	3350	3355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384410919
32	NC_017184	CGA	3	9	3394	3402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410919
33	NC_017184	TCA	2	6	3497	3502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410919
34	NC_017184	TCA	2	6	3541	3546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410919
35	NC_017184	ATC	2	6	3561	3566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410919
36	NC_017184	CAT	2	6	3578	3583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410919
37	NC_017184	GAG	2	6	3590	3595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384410919
38	NC_017184	AAG	2	6	3606	3611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410919
39	NC_017184	ATA	2	6	3670	3675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410919
40	NC_017184	AGC	2	6	3789	3794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410919
41	NC_017184	AAT	2	6	3918	3923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410919
42	NC_017184	CAA	3	9	4134	4142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384410920
43	NC_017184	GAA	2	6	4190	4195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410920
44	NC_017184	AGA	2	6	4276	4281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410920
45	NC_017184	CCA	2	6	4355	4360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384410920
46	NC_017184	ATT	2	6	4437	4442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410921
47	NC_017184	TAT	2	6	4582	4587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410921
48	NC_017184	TGT	2	6	4662	4667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410921
49	NC_017184	GGC	2	6	4676	4681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384410921
50	NC_017184	ATA	2	6	4750	4755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410921
51	NC_017184	TGA	2	6	4806	4811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410921
52	NC_017184	ATG	2	6	4864	4869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410921
53	NC_017184	TGA	2	6	4871	4876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410921
54	NC_017184	TGT	2	6	4947	4952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410922
55	NC_017184	CGT	2	6	5074	5079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410922
56	NC_017184	GCC	2	6	5186	5191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384410922
57	NC_017184	TCG	2	6	5213	5218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410922
58	NC_017184	TGA	2	6	5252	5257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410922
59	NC_017184	GCC	2	6	5386	5391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384410922
60	NC_017184	CTG	2	6	5448	5453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410922
61	NC_017184	GAA	2	6	5466	5471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410922
62	NC_017184	TAA	2	6	5507	5512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410922
63	NC_017184	CCG	2	6	5556	5561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384410922
64	NC_017184	AAG	2	6	5562	5567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410922
65	NC_017184	GCC	2	6	5582	5587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384410922
66	NC_017184	GGC	2	6	5653	5658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384410922
67	NC_017184	GCA	2	6	5715	5720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410922
68	NC_017184	TCT	2	6	5728	5733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410922
69	NC_017184	ACG	3	9	5984	5992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410923
70	NC_017184	ATT	2	6	6294	6299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410924
71	NC_017184	AAT	3	9	6315	6323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410924
72	NC_017184	TAA	2	6	6523	6528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410924
73	NC_017184	TGT	2	6	6540	6545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410924
74	NC_017184	ATA	2	6	6618	6623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410925
75	NC_017184	CAG	2	6	6636	6641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410925
76	NC_017184	ATT	2	6	6644	6649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410925
77	NC_017184	GTT	2	6	6719	6724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410925
78	NC_017184	ATG	2	6	7171	7176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410926
79	NC_017184	AAG	2	6	7206	7211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410926
80	NC_017184	CAA	2	6	7315	7320	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384410926
81	NC_017184	CTT	2	6	7452	7457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410926
82	NC_017184	ATG	2	6	7663	7668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410927
83	NC_017184	TGA	2	6	7694	7699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410927
84	NC_017184	CTT	2	6	7740	7745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410927
85	NC_017184	AGG	2	6	8007	8012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384410928
86	NC_017184	ATC	2	6	8153	8158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410928
87	NC_017184	TTA	3	9	8238	8246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410928
88	NC_017184	AAT	2	6	8248	8253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410928
89	NC_017184	TCC	2	6	8322	8327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384410928
90	NC_017184	CTT	2	6	8378	8383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410928
91	NC_017184	CTT	2	6	8392	8397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410928
92	NC_017184	GGC	2	6	8502	8507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384410928
93	NC_017184	TCC	2	6	8584	8589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384410928
94	NC_017184	AAG	2	6	8646	8651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410928
95	NC_017184	CGG	2	6	8676	8681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384410928
96	NC_017184	GAC	2	6	8765	8770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410928
97	NC_017184	AGA	2	6	8865	8870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410928
98	NC_017184	CGG	2	6	9027	9032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384410928
99	NC_017184	GCG	2	6	9279	9284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384410928
100	NC_017184	TTC	2	6	9404	9409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410928
101	NC_017184	TCT	2	6	9775	9780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410929
102	NC_017184	TTA	2	6	10074	10079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410930
103	NC_017184	TCT	2	6	10124	10129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410930
104	NC_017184	TCT	2	6	10215	10220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410930
105	NC_017184	CAT	2	6	10790	10795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410931
106	NC_017184	ACA	2	6	10801	10806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384410931
107	NC_017184	AAG	2	6	10880	10885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410931
108	NC_017184	ATC	2	6	11012	11017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410931
109	NC_017184	TAA	2	6	11030	11035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410931
110	NC_017184	TGC	2	6	11105	11110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410931
111	NC_017184	CAT	2	6	11174	11179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410931
112	NC_017184	TGA	2	6	11204	11209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410931
113	NC_017184	TGT	2	6	12634	12639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410932
114	NC_017184	ATC	2	6	12709	12714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410932
115	NC_017184	TGA	2	6	12822	12827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410932
116	NC_017184	GCA	2	6	12949	12954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410932
117	NC_017184	ACC	2	6	12962	12967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384410932
118	NC_017184	TAG	2	6	12977	12982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410932
119	NC_017184	CGG	2	6	12992	12997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384410932
120	NC_017184	TAG	2	6	13130	13135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410932
121	NC_017184	TAT	2	6	13305	13310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410932
122	NC_017184	GCT	2	6	13364	13369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410932
123	NC_017184	ACA	2	6	13487	13492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384410933
124	NC_017184	GCA	2	6	13718	13723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410933
125	NC_017184	ATG	2	6	13752	13757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410933
126	NC_017184	GTT	2	6	14004	14009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410934
127	NC_017184	CAA	2	6	14013	14018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384410934
128	NC_017184	TTC	2	6	14041	14046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410934
129	NC_017184	AAC	2	6	14125	14130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384410934
130	NC_017184	GTT	2	6	14186	14191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410934
131	NC_017184	GCA	2	6	14194	14199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410934
132	NC_017184	ATC	2	6	14201	14206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410934
133	NC_017184	AAG	2	6	14226	14231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410934
134	NC_017184	TAT	2	6	14384	14389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410935
135	NC_017184	CTT	2	6	14453	14458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410935
136	NC_017184	ATA	2	6	14503	14508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410935
137	NC_017184	AAT	2	6	15184	15189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410936
138	NC_017184	CTA	2	6	15294	15299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410936
139	NC_017184	GAA	2	6	15414	15419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410936
140	NC_017184	CTG	2	6	15447	15452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410936
141	NC_017184	TCA	2	6	15549	15554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410936
142	NC_017184	TTG	2	6	15598	15603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410936
143	NC_017184	GAT	2	6	15860	15865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410937
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151	NC_017184	GTT	2	6	17134	17139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410938
152	NC_017184	GTT	2	6	17169	17174	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410938
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156	NC_017184	AAC	2	6	17912	17917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384410939
157	NC_017184	CAT	2	6	17927	17932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410939
158	NC_017184	TAC	2	6	17962	17967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410939
159	NC_017184	GCA	2	6	17976	17981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410939
160	NC_017184	GCC	2	6	18030	18035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384410939

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.