MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Zymomonas mobilis subsp. mobilis ATCC 10988 plasmid pZMOB02

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017183	ACGGC	2	10	97	106	20 %	0 %	40 %	40 %	384410888
2	NC_017183	GATTT	2	10	4335	4344	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017183	CGATG	2	10	4988	4997	20 %	20 %	40 %	20 %	384410890
4	NC_017183	GCTGA	2	10	6273	6282	20 %	20 %	40 %	20 %	384410890
5	NC_017183	AAGCA	2	10	7213	7222	60 %	0 %	20 %	20 %	384410890
6	NC_017183	GCAAA	2	10	8179	8188	60 %	0 %	20 %	20 %	384410891
7	NC_017183	CTGCG	2	10	10007	10016	0 %	20 %	40 %	40 %	384410892
8	NC_017183	GCGGG	2	10	10881	10890	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
9	NC_017183	ATATA	2	10	11647	11656	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017183	ATAGA	2	10	12533	12542	60 %	20 %	20 %	0 %	384410893
11	NC_017183	ATTTT	2	10	13403	13412	20 %	80 %	0 %	0 %	384410893
12	NC_017183	ATGCC	2	10	14107	14116	20 %	20 %	20 %	40 %	384410893
13	NC_017183	TTCCT	2	10	14779	14788	0 %	60 %	0 %	40 %	384410893
14	NC_017183	ACCAT	2	10	15014	15023	40 %	20 %	0 %	40 %	384410893
15	NC_017183	AAGAG	2	10	15382	15391	60 %	0 %	40 %	0 %	384410893
16	NC_017183	TATAA	2	10	18597	18606	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017183	CTGAC	2	10	21227	21236	20 %	20 %	20 %	40 %	384410900
18	NC_017183	CTCAA	2	10	21711	21720	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_017183	TTTGA	2	10	25375	25384	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017183	CTGTT	2	10	25881	25890	0 %	60 %	20 %	20 %	384410907
21	NC_017183	TTCGC	2	10	28137	28146	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.