MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Zymomonas mobilis subsp. mobilis ATCC 10988 plasmid pZMOB02

Total Repeats: 50

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017183	GGCG	2	8	1265	1272	0 %	0 %	75 %	25 %	384410889
2	NC_017183	TCGA	2	8	1321	1328	25 %	25 %	25 %	25 %	384410889
3	NC_017183	CTGA	2	8	1509	1516	25 %	25 %	25 %	25 %	384410889
4	NC_017183	AGAC	2	8	1879	1886	50 %	0 %	25 %	25 %	384410889
5	NC_017183	CTAC	2	8	1906	1913	25 %	25 %	0 %	50 %	384410889
6	NC_017183	CAAG	2	8	5197	5204	50 %	0 %	25 %	25 %	384410890
7	NC_017183	CAGA	2	8	6021	6028	50 %	0 %	25 %	25 %	384410890
8	NC_017183	GGCA	2	8	6494	6501	25 %	0 %	50 %	25 %	384410890
9	NC_017183	CAGG	2	8	6608	6615	25 %	0 %	50 %	25 %	384410890
10	NC_017183	CGTT	2	8	6834	6841	0 %	50 %	25 %	25 %	384410890
11	NC_017183	AAAT	2	8	6997	7004	75 %	25 %	0 %	0 %	384410890
12	NC_017183	CGTC	2	8	7642	7649	0 %	25 %	25 %	50 %	384410890
13	NC_017183	GACC	2	8	7748	7755	25 %	0 %	25 %	50 %	384410890
14	NC_017183	ACCT	2	8	8040	8047	25 %	25 %	0 %	50 %	384410891
15	NC_017183	CTTC	2	8	8542	8549	0 %	50 %	0 %	50 %	384410891
16	NC_017183	CCCG	2	8	9079	9086	0 %	0 %	25 %	75 %	384410891
17	NC_017183	CTGA	2	8	9273	9280	25 %	25 %	25 %	25 %	384410891
18	NC_017183	GGAT	2	8	9422	9429	25 %	25 %	50 %	0 %	384410892
19	NC_017183	TGGC	2	8	9993	10000	0 %	25 %	50 %	25 %	384410892
20	NC_017183	GATC	2	8	10504	10511	25 %	25 %	25 %	25 %	384410892
21	NC_017183	TTTC	2	8	11961	11968	0 %	75 %	0 %	25 %	384410893
22	NC_017183	ATCC	2	8	12320	12327	25 %	25 %	0 %	50 %	384410893
23	NC_017183	TCCA	2	8	12848	12855	25 %	25 %	0 %	50 %	384410893
24	NC_017183	CAAG	2	8	13467	13474	50 %	0 %	25 %	25 %	384410893
25	NC_017183	ATAA	2	8	13891	13898	75 %	25 %	0 %	0 %	384410893
26	NC_017183	CCTT	2	8	14021	14028	0 %	50 %	0 %	50 %	384410893
27	NC_017183	TGTT	2	8	14312	14319	0 %	75 %	25 %	0 %	384410893
28	NC_017183	AAAT	2	8	14455	14462	75 %	25 %	0 %	0 %	384410893
29	NC_017183	TCGT	2	8	14596	14603	0 %	50 %	25 %	25 %	384410893
30	NC_017183	CATC	2	8	14930	14937	25 %	25 %	0 %	50 %	384410893
31	NC_017183	TAAA	2	8	15174	15181	75 %	25 %	0 %	0 %	384410893
32	NC_017183	AGTC	2	8	16592	16599	25 %	25 %	25 %	25 %	384410895
33	NC_017183	CGGG	2	8	16762	16769	0 %	0 %	75 %	25 %	384410895
34	NC_017183	AACC	2	8	17535	17542	50 %	0 %	0 %	50 %	384410897
35	NC_017183	AGGC	2	8	17754	17761	25 %	0 %	50 %	25 %	384410897
36	NC_017183	TTTG	2	8	19127	19134	0 %	75 %	25 %	0 %	384410898
37	NC_017183	ATGT	2	8	19562	19569	25 %	50 %	25 %	0 %	384410898
38	NC_017183	TTCA	2	8	19780	19787	25 %	50 %	0 %	25 %	384410898
39	NC_017183	GTAA	2	8	19833	19840	50 %	25 %	25 %	0 %	384410898
40	NC_017183	GCCT	2	8	21414	21421	0 %	25 %	25 %	50 %	384410901
41	NC_017183	TCAC	2	8	21661	21668	25 %	25 %	0 %	50 %	384410901
42	NC_017183	CGCC	2	8	22883	22890	0 %	0 %	25 %	75 %	384410902
43	NC_017183	TTAA	2	8	23780	23787	50 %	50 %	0 %	0 %	384410903
44	NC_017183	AAAC	2	8	24591	24598	75 %	0 %	0 %	25 %	384410905
45	NC_017183	TTCA	2	8	25026	25033	25 %	50 %	0 %	25 %	384410905
46	NC_017183	CTGA	2	8	25995	26002	25 %	25 %	25 %	25 %	384410908
47	NC_017183	GAAA	2	8	27573	27580	75 %	0 %	25 %	0 %	384410909
48	NC_017183	GGAT	2	8	28335	28342	25 %	25 %	50 %	0 %	384410910
49	NC_017183	AAGC	2	8	28428	28435	50 %	0 %	25 %	25 %	384410910
50	NC_017183	GATG	2	8	28550	28557	25 %	25 %	50 %	0 %	384410911

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.