MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Zymomonas mobilis subsp. mobilis ATCC 10988 plasmid pZMOB02

Total Repeats: 294

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017183	GCA	2	6	134	139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410888
2	NC_017183	GAA	2	6	1041	1046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410889
3	NC_017183	TGG	2	6	1048	1053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384410889
4	NC_017183	GCG	2	6	1069	1074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384410889
5	NC_017183	TGG	2	6	1093	1098	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384410889
6	NC_017183	TCG	2	6	1117	1122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410889
7	NC_017183	CAG	2	6	1233	1238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410889
8	NC_017183	GCG	2	6	1289	1294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384410889
9	NC_017183	CGC	2	6	1673	1678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384410889
10	NC_017183	GAT	2	6	1680	1685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410889
11	NC_017183	TCC	2	6	1756	1761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384410889
12	NC_017183	GCG	2	6	1806	1811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384410889
13	NC_017183	CGA	2	6	2300	2305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410889
14	NC_017183	GCT	2	6	4713	4718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410890
15	NC_017183	TGA	2	6	4736	4741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410890
16	NC_017183	GAA	2	6	4755	4760	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410890
17	NC_017183	AGG	2	6	4798	4803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384410890
18	NC_017183	TGC	2	6	5057	5062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410890
19	NC_017183	GAA	2	6	5082	5087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410890
20	NC_017183	AGA	2	6	5111	5116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410890
21	NC_017183	GAG	2	6	5136	5141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384410890
22	NC_017183	GCC	2	6	5145	5150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384410890
23	NC_017183	GCT	2	6	5250	5255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410890
24	NC_017183	TGG	2	6	5260	5265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384410890
25	NC_017183	CGA	2	6	5300	5305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410890
26	NC_017183	CTG	2	6	5449	5454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410890
27	NC_017183	GTT	2	6	5490	5495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410890
28	NC_017183	GGT	2	6	5592	5597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384410890
29	NC_017183	CCG	2	6	5696	5701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384410890
30	NC_017183	AAC	2	6	5884	5889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384410890
31	NC_017183	GTA	2	6	5994	5999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410890
32	NC_017183	CGA	2	6	6040	6045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410890
33	NC_017183	TGC	2	6	6173	6178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410890
34	NC_017183	TGC	2	6	6182	6187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410890
35	NC_017183	GAT	2	6	6297	6302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410890
36	NC_017183	AGT	2	6	6431	6436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410890
37	NC_017183	ACC	2	6	6461	6466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384410890
38	NC_017183	AGC	2	6	6529	6534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410890
39	NC_017183	CGA	2	6	6575	6580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410890
40	NC_017183	TTA	2	6	6616	6621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410890
41	NC_017183	GCA	2	6	6659	6664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410890
42	NC_017183	TGG	2	6	6727	6732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384410890
43	NC_017183	AAG	2	6	6744	6749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410890
44	NC_017183	TGA	2	6	6776	6781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410890
45	NC_017183	TGC	2	6	6782	6787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410890
46	NC_017183	GAA	2	6	6791	6796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410890
47	NC_017183	GAT	2	6	6965	6970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410890
48	NC_017183	AGG	2	6	7006	7011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384410890
49	NC_017183	CGT	3	9	7076	7084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410890
50	NC_017183	ATG	2	6	7122	7127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410890
51	NC_017183	AGC	2	6	7144	7149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410890
52	NC_017183	AAG	2	6	7197	7202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410890
53	NC_017183	TGC	2	6	7298	7303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410890
54	NC_017183	TGA	2	6	7355	7360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410890
55	NC_017183	CCA	2	6	7432	7437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384410890
56	NC_017183	TGC	2	6	7496	7501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410890
57	NC_017183	CGT	2	6	7602	7607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410890
58	NC_017183	GGC	2	6	7851	7856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384410890
59	NC_017183	CGG	2	6	7880	7885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384410890
60	NC_017183	GAA	2	6	7917	7922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410890
61	NC_017183	GAA	2	6	7928	7933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410890
62	NC_017183	ACT	2	6	7950	7955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410891
63	NC_017183	TCG	2	6	7963	7968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410891
64	NC_017183	TGA	2	6	8000	8005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410891
65	NC_017183	GGA	2	6	8066	8071	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384410891
66	NC_017183	AGG	2	6	8080	8085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384410891
67	NC_017183	GAA	2	6	8301	8306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410891
68	NC_017183	TCG	2	6	8476	8481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410891
69	NC_017183	CGA	2	6	8510	8515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410891
70	NC_017183	ATG	2	6	8607	8612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410891
71	NC_017183	CTG	3	9	8616	8624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410891
72	NC_017183	GGC	2	6	8637	8642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384410891
73	NC_017183	GAA	2	6	8726	8731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410891
74	NC_017183	TCG	2	6	8800	8805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410891
75	NC_017183	CGG	2	6	8831	8836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384410891
76	NC_017183	ATA	2	6	8878	8883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410891
77	NC_017183	GCC	3	9	8887	8895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384410891
78	NC_017183	TTC	2	6	8991	8996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410891
79	NC_017183	GCG	2	6	9152	9157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384410891
80	NC_017183	AGA	2	6	9284	9289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410891
81	NC_017183	CGC	2	6	9293	9298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384410891
82	NC_017183	ATC	2	6	9303	9308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410891
83	NC_017183	GCG	2	6	9321	9326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384410891
84	NC_017183	GCT	2	6	9381	9386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410891
85	NC_017183	GGA	2	6	9392	9397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384410891
86	NC_017183	ACA	2	6	9434	9439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384410892
87	NC_017183	CAT	2	6	9586	9591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410892
88	NC_017183	AAC	2	6	9819	9824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384410892
89	NC_017183	GGA	2	6	9825	9830	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384410892
90	NC_017183	TCG	2	6	9903	9908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410892
91	NC_017183	CCG	2	6	9933	9938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384410892
92	NC_017183	CGC	2	6	10122	10127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384410892
93	NC_017183	GGT	2	6	10198	10203	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384410892
94	NC_017183	TGC	2	6	10248	10253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410892
95	NC_017183	TGC	2	6	10333	10338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410892
96	NC_017183	GCC	2	6	10409	10414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384410892
97	NC_017183	CGC	2	6	10474	10479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384410892
98	NC_017183	TGC	2	6	10483	10488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410892
99	NC_017183	CGA	2	6	10573	10578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410892
100	NC_017183	TGC	2	6	10618	10623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410892
101	NC_017183	TCT	2	6	11824	11829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410893
102	NC_017183	TAA	2	6	12033	12038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410893
103	NC_017183	GTG	2	6	12048	12053	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384410893
104	NC_017183	ATC	2	6	12082	12087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410893
105	NC_017183	TTC	2	6	12112	12117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410893
106	NC_017183	TTA	2	6	12161	12166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410893
107	NC_017183	TAT	2	6	12226	12231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410893
108	NC_017183	ATC	2	6	12247	12252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410893
109	NC_017183	TTC	2	6	12277	12282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410893
110	NC_017183	TTA	2	6	12284	12289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410893
111	NC_017183	CTT	2	6	12303	12308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410893
112	NC_017183	ATT	2	6	12395	12400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410893
113	NC_017183	TGA	2	6	12448	12453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410893
114	NC_017183	GGA	2	6	12466	12471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384410893
115	NC_017183	ATA	2	6	12503	12508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410893
116	NC_017183	TCA	2	6	12512	12517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410893
117	NC_017183	ACA	2	6	12577	12582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384410893
118	NC_017183	CAT	2	6	12588	12593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410893
119	NC_017183	TCA	2	6	12659	12664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410893
120	NC_017183	TGT	2	6	12842	12847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410893
121	NC_017183	CTT	2	6	12888	12893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410893
122	NC_017183	ATC	2	6	13111	13116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410893
123	NC_017183	CCG	2	6	13187	13192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384410893
124	NC_017183	TAT	2	6	13212	13217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410893
125	NC_017183	TCA	2	6	13433	13438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410893
126	NC_017183	CAT	2	6	13503	13508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410893
127	NC_017183	TTG	2	6	13540	13545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410893
128	NC_017183	TCC	2	6	13620	13625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384410893
129	NC_017183	AGA	2	6	13696	13701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410893
130	NC_017183	TTC	2	6	13708	13713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410893
131	NC_017183	GAT	2	6	13881	13886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410893
132	NC_017183	TGA	2	6	13919	13924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410893
133	NC_017183	ATC	2	6	13933	13938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410893
134	NC_017183	ATA	2	6	14038	14043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410893
135	NC_017183	GGC	2	6	14193	14198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384410893
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137	NC_017183	GTT	2	6	14275	14280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410893
138	NC_017183	TAA	2	6	14298	14303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410893
139	NC_017183	TTC	2	6	14329	14334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410893
140	NC_017183	TTA	2	6	14420	14425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410893
141	NC_017183	CCG	2	6	14520	14525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384410893
142	NC_017183	TGA	2	6	14569	14574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410893
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145	NC_017183	GGA	2	6	14855	14860	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384410893
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152	NC_017183	GTC	2	6	15147	15152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410893
153	NC_017183	TCT	2	6	15248	15253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410893
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157	NC_017183	AGA	2	6	15459	15464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410893
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159	NC_017183	TGA	2	6	16409	16414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410894
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161	NC_017183	CCA	2	6	16427	16432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384410894
162	NC_017183	TCC	2	6	16513	16518	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384410895
163	NC_017183	ATG	2	6	16600	16605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410895
164	NC_017183	ATG	2	6	16619	16624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410895
165	NC_017183	ATC	2	6	16649	16654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410895
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242	NC_017183	TAC	2	6	24305	24310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410904
243	NC_017183	CAA	2	6	24335	24340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384410904
244	NC_017183	GCT	2	6	24342	24347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410904
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247	NC_017183	ATA	2	6	24558	24563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410904
248	NC_017183	TTC	2	6	24723	24728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410905
249	NC_017183	TCG	2	6	24782	24787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410905
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252	NC_017183	TTC	2	6	24972	24977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410905
253	NC_017183	CCT	2	6	25554	25559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384410906
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.