MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Zymomonas mobilis subsp. mobilis ATCC 10988 plasmid pZMOB03

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017181	AGCGC	2	10	436	445	20 %	0 %	40 %	40 %	384410859
2	NC_017181	GGCTT	2	10	1233	1242	0 %	40 %	40 %	20 %	384410860
3	NC_017181	ACCGC	2	10	4571	4580	20 %	0 %	20 %	60 %	384410863
4	NC_017181	AGCCA	2	10	5587	5596	40 %	0 %	20 %	40 %	384410864
5	NC_017181	CTGCG	2	10	5931	5940	0 %	20 %	40 %	40 %	384410865
6	NC_017181	CTGTT	2	10	8874	8883	0 %	60 %	20 %	20 %	384410871
7	NC_017181	TTTCA	2	10	11265	11274	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_017181	TCACA	2	10	13150	13159	40 %	20 %	0 %	40 %	384410874
9	NC_017181	TACTT	2	10	15197	15206	20 %	60 %	0 %	20 %	384410875
10	NC_017181	AAATA	2	10	15346	15355	80 %	20 %	0 %	0 %	384410875
11	NC_017181	CCCAG	2	10	15682	15691	20 %	0 %	20 %	60 %	384410875
12	NC_017181	AATCC	2	10	16487	16496	40 %	20 %	0 %	40 %	384410875
13	NC_017181	GATTA	2	10	21603	21612	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017181	AGGAT	2	10	21727	21736	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017181	ATCCT	2	10	21749	21758	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
16	NC_017181	TTTCT	2	10	22391	22400	0 %	80 %	0 %	20 %	384410878
17	NC_017181	GTATC	2	10	26179	26188	20 %	40 %	20 %	20 %	384410880
18	NC_017181	ATCGT	2	10	26293	26302	20 %	40 %	20 %	20 %	384410880
19	NC_017181	TCCAG	2	10	30447	30456	20 %	20 %	20 %	40 %	384410882
20	NC_017181	CATCG	2	10	30583	30592	20 %	20 %	20 %	40 %	384410882
21	NC_017181	AAGGC	2	10	30884	30893	40 %	0 %	40 %	20 %	384410882

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.