MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Zymomonas mobilis subsp. mobilis ATCC 10988 plasmid pZMOB03

Total Repeats: 66

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017181	TTC	2	6	944	949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017181	AAT	2	6	978	983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017181	TAT	2	6	987	992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017181	AAT	2	6	2095	2100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017181	TGA	2	6	2121	2126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017181	ATA	2	6	2132	2137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017181	AAG	2	6	2157	2162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017181	AAT	2	6	2168	2173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017181	TAA	2	6	2915	2920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017181	TAA	2	6	5295	5300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017181	ATT	2	6	5361	5366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017181	AAT	2	6	5440	5445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017181	TCA	2	6	6046	6051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017181	AAT	2	6	6065	6070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017181	CAT	2	6	6327	6332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017181	GAA	2	6	6369	6374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017181	GAT	2	6	6512	6517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017181	TAA	2	6	8058	8063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017181	AGT	2	6	8094	8099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017181	ATC	2	6	8115	8120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017181	TCG	2	6	8133	8138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017181	ATG	2	6	8155	8160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017181	TCA	2	6	8293	8298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017181	CTC	2	6	8486	8491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_017181	ATC	2	6	8493	8498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017181	ACC	2	6	11122	11127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_017181	GCT	2	6	11143	11148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017181	TCA	2	6	11321	11326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017181	GCA	2	6	11503	11508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017181	ACC	2	6	11511	11516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_017181	ACT	2	6	11536	11541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017181	TAT	2	6	14189	14194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017181	GCT	2	6	14231	14236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017181	CTG	2	6	14358	14363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017181	GAA	2	6	14522	14527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017181	GTC	2	6	14562	14567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017181	ACC	2	6	14832	14837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_017181	ACA	2	6	15076	15081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017181	TAT	2	6	15182	15187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017181	AAT	2	6	18006	18011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017181	AGC	2	6	18084	18089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017181	GTC	2	6	18092	18097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017181	ATC	2	6	18103	18108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017181	CTT	2	6	18139	18144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017181	AAG	2	6	18569	18574	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017181	AGA	3	9	18655	18663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017181	CAT	2	6	18669	18674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017181	AGA	2	6	18700	18705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017181	TCT	2	6	18732	18737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017181	CTT	2	6	18756	18761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017181	CTT	2	6	18780	18785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017181	AAG	2	6	18880	18885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017181	ATC	2	6	19206	19211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017181	ATC	2	6	19296	19301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017181	CAT	2	6	19905	19910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017181	TAT	2	6	20060	20065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017181	ACG	2	6	20107	20112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017181	TGG	2	6	20145	20150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017181	TCT	2	6	20154	20159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017181	TTA	2	6	20293	20298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017181	AAT	2	6	20345	20350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017181	ATC	2	6	21714	21719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017181	TGG	2	6	21763	21768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017181	TCC	2	6	25806	25811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_017181	TTA	2	6	31575	31580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017181	AAT	2	6	31660	31665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.