MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Zymomonas mobilis subsp. mobilis ATCC 10988 plasmid pZMOB03

Total Repeats: 308

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017181	TTC	2	6	164	169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410859
2	NC_017181	AAT	2	6	292	297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410859
3	NC_017181	TTG	2	6	363	368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410859
4	NC_017181	TTG	2	6	489	494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410859
5	NC_017181	GAA	2	6	531	536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410859
6	NC_017181	TCT	2	6	584	589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410859
7	NC_017181	ATT	2	6	1089	1094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410860
8	NC_017181	GAA	2	6	1271	1276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410860
9	NC_017181	TTC	2	6	1285	1290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410860
10	NC_017181	GTT	2	6	1329	1334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410860
11	NC_017181	TTA	2	6	1367	1372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410860
12	NC_017181	CCA	2	6	1480	1485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384410861
13	NC_017181	AAT	3	9	1788	1796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410861
14	NC_017181	CAT	2	6	1802	1807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410861
15	NC_017181	AAC	2	6	1935	1940	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384410861
16	NC_017181	CTG	2	6	1979	1984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410861
17	NC_017181	TTG	2	6	1985	1990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410861
18	NC_017181	CCT	2	6	2002	2007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384410861
19	NC_017181	ATA	2	6	2035	2040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410861
20	NC_017181	TAT	2	6	2195	2200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410862
21	NC_017181	GCC	2	6	2226	2231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384410862
22	NC_017181	ATG	2	6	2251	2256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410862
23	NC_017181	AAG	2	6	2282	2287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410862
24	NC_017181	TGA	2	6	2483	2488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410862
25	NC_017181	TGG	2	6	2564	2569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384410862
26	NC_017181	ATC	2	6	2574	2579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410862
27	NC_017181	TCT	2	6	2778	2783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410862
28	NC_017181	CGA	2	6	2791	2796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410862
29	NC_017181	GAT	2	6	2814	2819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410862
30	NC_017181	TGG	2	6	2891	2896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384410862
31	NC_017181	TTG	2	6	3217	3222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410863
32	NC_017181	ACT	2	6	3236	3241	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410863
33	NC_017181	CAA	2	6	3246	3251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384410863
34	NC_017181	CGT	2	6	3333	3338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410863
35	NC_017181	GTT	2	6	3450	3455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410863
36	NC_017181	GCA	2	6	3995	4000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410863
37	NC_017181	TTC	2	6	4006	4011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410863
38	NC_017181	TCC	2	6	4024	4029	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384410863
39	NC_017181	TTA	2	6	4094	4099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410863
40	NC_017181	GTG	2	6	4166	4171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384410863
41	NC_017181	GTC	2	6	4322	4327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410863
42	NC_017181	ATA	2	6	4364	4369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410863
43	NC_017181	TGT	2	6	4391	4396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410863
44	NC_017181	CCG	2	6	4679	4684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384410863
45	NC_017181	CAT	2	6	4797	4802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410863
46	NC_017181	TGT	2	6	4858	4863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410863
47	NC_017181	AAG	2	6	4885	4890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410863
48	NC_017181	CTG	2	6	4912	4917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410863
49	NC_017181	CAC	2	6	5001	5006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384410863
50	NC_017181	TTG	2	6	5024	5029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410863
51	NC_017181	TCT	2	6	5051	5056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410863
52	NC_017181	TCT	2	6	5081	5086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410863
53	NC_017181	GAA	2	6	5108	5113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410863
54	NC_017181	ATC	2	6	5528	5533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410864
55	NC_017181	TTC	2	6	5538	5543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410864
56	NC_017181	CAT	2	6	5747	5752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410864
57	NC_017181	CTG	2	6	5780	5785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410865
58	NC_017181	TTG	2	6	6011	6016	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410865
59	NC_017181	TCA	2	6	6551	6556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410866
60	NC_017181	GAT	2	6	6580	6585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410866
61	NC_017181	AGC	2	6	6649	6654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410866
62	NC_017181	TTA	2	6	6725	6730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410866
63	NC_017181	GAT	2	6	6743	6748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410866
64	NC_017181	GCT	2	6	6760	6765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410866
65	NC_017181	CTT	2	6	6875	6880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410866
66	NC_017181	TGT	2	6	6954	6959	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410866
67	NC_017181	GAT	2	6	6964	6969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410866
68	NC_017181	ATA	2	6	6982	6987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410866
69	NC_017181	AGT	2	6	7204	7209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410867
70	NC_017181	TTC	2	6	7210	7215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410867
71	NC_017181	CTG	2	6	7360	7365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410867
72	NC_017181	CTT	2	6	7410	7415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410867
73	NC_017181	TTC	2	6	7495	7500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410867
74	NC_017181	TGG	2	6	7501	7506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384410867
75	NC_017181	ATT	2	6	7508	7513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410867
76	NC_017181	GCT	2	6	7901	7906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410868
77	NC_017181	TCA	2	6	7916	7921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410868
78	NC_017181	GTT	2	6	7956	7961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410868
79	NC_017181	ATG	2	6	8245	8250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410869
80	NC_017181	CAG	2	6	8569	8574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410870
81	NC_017181	AGA	2	6	8583	8588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410870
82	NC_017181	GAA	2	6	8675	8680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410870
83	NC_017181	ATG	2	6	8790	8795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410870
84	NC_017181	TCT	2	6	8937	8942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410871
85	NC_017181	GAA	3	9	9021	9029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410872
86	NC_017181	AAG	2	6	9096	9101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410872
87	NC_017181	TCT	2	6	9370	9375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410873
88	NC_017181	TCT	2	6	9490	9495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410873
89	NC_017181	TTC	2	6	9606	9611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410873
90	NC_017181	CTC	2	6	9636	9641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384410873
91	NC_017181	GCT	2	6	9763	9768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410873
92	NC_017181	CGA	2	6	9912	9917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410873
93	NC_017181	CGT	2	6	10042	10047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410873
94	NC_017181	CGC	2	6	10393	10398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384410873
95	NC_017181	CTT	2	6	10422	10427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410873
96	NC_017181	GGA	2	6	10484	10489	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384410873
97	NC_017181	GCC	2	6	10566	10571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384410873
98	NC_017181	AAC	2	6	10664	10669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384410873
99	NC_017181	AAG	2	6	10690	10695	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410873
100	NC_017181	GCA	2	6	10696	10701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410873
101	NC_017181	AAG	2	6	10712	10717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410873
102	NC_017181	AGG	2	6	10745	10750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384410873
103	NC_017181	AGA	2	6	10860	10865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410873
104	NC_017181	ATT	2	6	11644	11649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410874
105	NC_017181	TAA	2	6	11778	11783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410874
106	NC_017181	GAA	2	6	11797	11802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410874
107	NC_017181	AAG	2	6	11903	11908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410874
108	NC_017181	CTT	2	6	12113	12118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410874
109	NC_017181	AGC	2	6	12173	12178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410874
110	NC_017181	TCC	2	6	12210	12215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384410874
111	NC_017181	GCG	2	6	12471	12476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384410874
112	NC_017181	TCG	2	6	12548	12553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410874
113	NC_017181	TCA	2	6	12646	12651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410874
114	NC_017181	ATT	2	6	12729	12734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410874
115	NC_017181	AGA	2	6	12875	12880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410874
116	NC_017181	ATA	2	6	12946	12951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410874
117	NC_017181	TCA	2	6	13233	13238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410874
118	NC_017181	AGG	2	6	13289	13294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384410874
119	NC_017181	CGC	3	9	13366	13374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384410874
120	NC_017181	GAT	2	6	13518	13523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410874
121	NC_017181	ATA	2	6	13524	13529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410874
122	NC_017181	ATC	2	6	13541	13546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410874
123	NC_017181	TGG	2	6	13577	13582	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384410874
124	NC_017181	GTT	2	6	13694	13699	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410874
125	NC_017181	CAA	2	6	13738	13743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384410874
126	NC_017181	GCT	2	6	13820	13825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410874
127	NC_017181	TCG	2	6	14037	14042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410874
128	NC_017181	TCC	2	6	14051	14056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384410874
129	NC_017181	ACC	2	6	15211	15216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384410875
130	NC_017181	GAC	2	6	15321	15326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410875
131	NC_017181	CCT	2	6	15453	15458	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384410875
132	NC_017181	ATG	2	6	15476	15481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410875
133	NC_017181	TCA	2	6	15500	15505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410875
134	NC_017181	CCA	2	6	15566	15571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384410875
135	NC_017181	ATC	2	6	15592	15597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410875
136	NC_017181	GCT	2	6	15806	15811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410875
137	NC_017181	TAA	2	6	15889	15894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410875
138	NC_017181	CAT	2	6	15940	15945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410875
139	NC_017181	TGC	2	6	15979	15984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410875
140	NC_017181	CAT	3	9	16002	16010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410875
141	NC_017181	AGA	2	6	16102	16107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410875
142	NC_017181	AGC	2	6	16123	16128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410875
143	NC_017181	TAT	2	6	16269	16274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410875
144	NC_017181	ACT	2	6	16448	16453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410875
145	NC_017181	CAA	2	6	16638	16643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384410875
146	NC_017181	GCG	2	6	16767	16772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384410875
147	NC_017181	TTC	2	6	16936	16941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410875
148	NC_017181	TGC	2	6	16966	16971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410875
149	NC_017181	ATC	2	6	16991	16996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410875
150	NC_017181	CCA	2	6	17017	17022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384410875
151	NC_017181	CGA	2	6	17174	17179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410875
152	NC_017181	GCA	2	6	17192	17197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410875
153	NC_017181	TGG	3	9	17260	17268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384410875
154	NC_017181	TGG	2	6	17315	17320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384410875
155	NC_017181	ATT	2	6	17339	17344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410875
156	NC_017181	ATA	2	6	17350	17355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410875
157	NC_017181	AAT	2	6	17377	17382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410875
158	NC_017181	CTT	2	6	17495	17500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410875
159	NC_017181	CTG	2	6	17571	17576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410875
160	NC_017181	TCT	2	6	17846	17851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410875
161	NC_017181	TCG	2	6	17900	17905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410875
162	NC_017181	TGA	2	6	19554	19559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410876
163	NC_017181	TTG	2	6	19567	19572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410876
164	NC_017181	ATA	2	6	19669	19674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410876
165	NC_017181	TCT	2	6	19680	19685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410876
166	NC_017181	TTG	2	6	20436	20441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410877
167	NC_017181	AAT	2	6	20905	20910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410877
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169	NC_017181	TGG	2	6	21084	21089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384410877
170	NC_017181	ATC	2	6	21126	21131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410877
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240	NC_017181	ATA	2	6	26716	26721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410880
241	NC_017181	TGA	2	6	26841	26846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410880
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244	NC_017181	ATA	2	6	26962	26967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410880
245	NC_017181	ACT	2	6	27009	27014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410880
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249	NC_017181	TGC	2	6	27194	27199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410880
250	NC_017181	CAA	3	9	27353	27361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384410880
251	NC_017181	CAT	2	6	27426	27431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410880
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253	NC_017181	CAT	2	6	27534	27539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410880
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.