Tetra-nucleotide Coding Repeats of Zymomonas mobilis subsp. mobilis ATCC 10988 plasmid pZMOB01
Total Repeats: 53
S.No. | Genome ID | Motif | Iterations | Length | Start | End | A% | T% | G% | C% | Protein ID |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | NC_017180 | ACAA | 2 | 8 | 8 | 15 | 75 % | 0 % | 0 % | 25 % | 384410830 |
2 | NC_017180 | CTCA | 2 | 8 | 70 | 77 | 25 % | 25 % | 0 % | 50 % | 384410830 |
3 | NC_017180 | TTAT | 2 | 8 | 569 | 576 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 384410831 |
4 | NC_017180 | CAAC | 2 | 8 | 1109 | 1116 | 50 % | 0 % | 0 % | 50 % | 384410831 |
5 | NC_017180 | TCTG | 2 | 8 | 1977 | 1984 | 0 % | 50 % | 25 % | 25 % | 384410832 |
6 | NC_017180 | TGCG | 2 | 8 | 2120 | 2127 | 0 % | 25 % | 50 % | 25 % | 384410832 |
7 | NC_017180 | GCCG | 2 | 8 | 2590 | 2597 | 0 % | 0 % | 50 % | 50 % | 384410832 |
8 | NC_017180 | TGCC | 2 | 8 | 2787 | 2794 | 0 % | 25 % | 25 % | 50 % | 384410832 |
9 | NC_017180 | GGTG | 2 | 8 | 2847 | 2854 | 0 % | 25 % | 75 % | 0 % | 384410832 |
10 | NC_017180 | CGCC | 2 | 8 | 2916 | 2923 | 0 % | 0 % | 25 % | 75 % | 384410832 |
11 | NC_017180 | GACC | 2 | 8 | 3153 | 3160 | 25 % | 0 % | 25 % | 50 % | 384410832 |
12 | NC_017180 | TATT | 2 | 8 | 3414 | 3421 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 384410832 |
13 | NC_017180 | ATGT | 2 | 8 | 3931 | 3938 | 25 % | 50 % | 25 % | 0 % | 384410832 |
14 | NC_017180 | AGCT | 2 | 8 | 4499 | 4506 | 25 % | 25 % | 25 % | 25 % | 384410832 |
15 | NC_017180 | GTAA | 2 | 8 | 5991 | 5998 | 50 % | 25 % | 25 % | 0 % | 384410833 |
16 | NC_017180 | ATAA | 3 | 12 | 6330 | 6341 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 384410833 |
17 | NC_017180 | AGGC | 2 | 8 | 7213 | 7220 | 25 % | 0 % | 50 % | 25 % | 384410834 |
18 | NC_017180 | TCTT | 2 | 8 | 7692 | 7699 | 0 % | 75 % | 0 % | 25 % | 384410834 |
19 | NC_017180 | GAAA | 2 | 8 | 7872 | 7879 | 75 % | 0 % | 25 % | 0 % | 384410834 |
20 | NC_017180 | GTCA | 2 | 8 | 7961 | 7968 | 25 % | 25 % | 25 % | 25 % | 384410834 |
21 | NC_017180 | CTAT | 2 | 8 | 8009 | 8016 | 25 % | 50 % | 0 % | 25 % | 384410834 |
22 | NC_017180 | AAAT | 2 | 8 | 9497 | 9504 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 384410834 |
23 | NC_017180 | CAGC | 2 | 8 | 10400 | 10407 | 25 % | 0 % | 25 % | 50 % | 384410835 |
24 | NC_017180 | CCGG | 2 | 8 | 10420 | 10427 | 0 % | 0 % | 50 % | 50 % | 384410835 |
25 | NC_017180 | CAGC | 2 | 8 | 10627 | 10634 | 25 % | 0 % | 25 % | 50 % | 384410836 |
26 | NC_017180 | TGAT | 2 | 8 | 10849 | 10856 | 25 % | 50 % | 25 % | 0 % | 384410836 |
27 | NC_017180 | AATT | 2 | 8 | 13887 | 13894 | 50 % | 50 % | 0 % | 0 % | 384410839 |
28 | NC_017180 | AGTC | 2 | 8 | 15214 | 15221 | 25 % | 25 % | 25 % | 25 % | 384410840 |
29 | NC_017180 | CATC | 2 | 8 | 15734 | 15741 | 25 % | 25 % | 0 % | 50 % | 384410842 |
30 | NC_017180 | TTTG | 2 | 8 | 15810 | 15817 | 0 % | 75 % | 25 % | 0 % | 384410842 |
31 | NC_017180 | CATG | 2 | 8 | 16599 | 16606 | 25 % | 25 % | 25 % | 25 % | 384410843 |
32 | NC_017180 | AAAT | 2 | 8 | 16858 | 16865 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 384410844 |
33 | NC_017180 | TCAT | 2 | 8 | 17036 | 17043 | 25 % | 50 % | 0 % | 25 % | 384410844 |
34 | NC_017180 | CTGA | 2 | 8 | 17590 | 17597 | 25 % | 25 % | 25 % | 25 % | 384410847 |
35 | NC_017180 | TTCT | 2 | 8 | 18039 | 18046 | 0 % | 75 % | 0 % | 25 % | 384410848 |
36 | NC_017180 | TCAA | 2 | 8 | 18770 | 18777 | 50 % | 25 % | 0 % | 25 % | 384410848 |
37 | NC_017180 | GAAA | 2 | 8 | 18994 | 19001 | 75 % | 0 % | 25 % | 0 % | 384410848 |
38 | NC_017180 | TTAT | 2 | 8 | 19231 | 19238 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 384410848 |
39 | NC_017180 | TCAA | 2 | 8 | 19731 | 19738 | 50 % | 25 % | 0 % | 25 % | 384410849 |
40 | NC_017180 | CATA | 2 | 8 | 20193 | 20200 | 50 % | 25 % | 0 % | 25 % | 384410849 |
41 | NC_017180 | AAGG | 2 | 8 | 22835 | 22842 | 50 % | 0 % | 50 % | 0 % | 384410851 |
42 | NC_017180 | AACA | 2 | 8 | 23042 | 23049 | 75 % | 0 % | 0 % | 25 % | 384410852 |
43 | NC_017180 | TGGA | 2 | 8 | 23793 | 23800 | 25 % | 25 % | 50 % | 0 % | 384410853 |
44 | NC_017180 | GAGC | 2 | 8 | 23910 | 23917 | 25 % | 0 % | 50 % | 25 % | 384410853 |
45 | NC_017180 | GTCA | 2 | 8 | 23954 | 23961 | 25 % | 25 % | 25 % | 25 % | 384410853 |
46 | NC_017180 | TTGT | 2 | 8 | 24129 | 24136 | 0 % | 75 % | 25 % | 0 % | 384410853 |
47 | NC_017180 | TCCA | 2 | 8 | 27484 | 27491 | 25 % | 25 % | 0 % | 50 % | 384410855 |
48 | NC_017180 | CACC | 2 | 8 | 27503 | 27510 | 25 % | 0 % | 0 % | 75 % | 384410855 |
49 | NC_017180 | AGTA | 2 | 8 | 27771 | 27778 | 50 % | 25 % | 25 % | 0 % | 384410855 |
50 | NC_017180 | GGGA | 2 | 8 | 28277 | 28284 | 25 % | 0 % | 75 % | 0 % | 384410855 |
51 | NC_017180 | CAAG | 4 | 16 | 30925 | 30940 | 50 % | 0 % | 25 % | 25 % | 384410857 |
52 | NC_017180 | ACGC | 2 | 8 | 31489 | 31496 | 25 % | 0 % | 25 % | 50 % | 384410857 |
53 | NC_017180 | GCCT | 2 | 8 | 32051 | 32058 | 0 % | 25 % | 25 % | 50 % | 384410857 |