MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Zymomonas mobilis subsp. mobilis ATCC 10988 plasmid pZMOB01

Total Repeats: 135

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017180	AAG	2	6	5298	5303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017180	GTA	2	6	5349	5354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017180	GTA	2	6	5435	5440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017180	AAG	2	6	5448	5453	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017180	TAA	2	6	5502	5507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017180	TTC	2	6	5559	5564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017180	TGC	2	6	5579	5584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017180	TTA	2	6	5649	5654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017180	TAA	2	6	5658	5663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017180	TAA	3	9	6905	6913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017180	AAT	2	6	6938	6943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017180	TAA	2	6	9634	9639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017180	TTA	2	6	9845	9850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017180	GTT	2	6	9855	9860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017180	AGC	2	6	10045	10050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017180	CGC	2	6	10072	10077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_017180	AGC	2	6	10095	10100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017180	TGA	2	6	10101	10106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017180	CTT	2	6	10116	10121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017180	TTC	2	6	10141	10146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017180	TAG	2	6	10166	10171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017180	CGC	2	6	10189	10194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_017180	GTC	2	6	10209	10214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017180	ACA	2	6	10230	10235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017180	ACA	2	6	11961	11966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017180	CTC	2	6	11993	11998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_017180	AAT	2	6	11999	12004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017180	CAT	2	6	12026	12031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017180	ATC	2	6	12116	12121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017180	TAA	2	6	12126	12131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017180	GAT	2	6	12297	12302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017180	TGA	2	6	12319	12324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017180	ATT	2	6	12327	12332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017180	GGA	2	6	12469	12474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017180	AAT	2	6	12581	12586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017180	GTT	2	6	12610	12615	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017180	CCG	2	6	12664	12669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_017180	AAT	2	6	12947	12952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017180	ATT	2	6	13007	13012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017180	ATA	2	6	13034	13039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017180	GAT	2	6	13040	13045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017180	CAT	2	6	13052	13057	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017180	ATT	2	6	13108	13113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017180	AGA	2	6	14756	14761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017180	ATA	2	6	15069	15074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017180	AAT	2	6	15087	15092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017180	AAG	2	6	15109	15114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017180	AGT	2	6	15142	15147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017180	AAT	2	6	15313	15318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017180	TCC	2	6	15982	15987	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_017180	CAT	2	6	16040	16045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017180	AAT	2	6	16687	16692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017180	AAT	2	6	16710	16715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017180	AAC	2	6	16724	16729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017180	TAT	2	6	16792	16797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017180	GCG	2	6	19576	19581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017180	TTG	2	6	20364	20369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017180	CAT	3	9	20481	20489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_017180	CAG	2	6	20859	20864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017180	GAA	2	6	20865	20870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017180	TTC	2	6	20882	20887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017180	CTT	2	6	20901	20906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017180	CAA	2	6	20968	20973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017180	TCC	2	6	21181	21186	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_017180	CTG	2	6	21311	21316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017180	GAT	2	6	21341	21346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017180	GCC	2	6	21371	21376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_017180	CCT	2	6	21527	21532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_017180	ATC	2	6	21546	21551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017180	CAT	2	6	21552	21557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017180	TCC	2	6	21566	21571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_017180	GAC	2	6	21734	21739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017180	ACA	2	6	21748	21753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017180	AAC	2	6	21856	21861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017180	ATT	2	6	21904	21909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017180	TTC	2	6	24393	24398	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017180	AGC	2	6	24439	24444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017180	TGC	2	6	24511	24516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017180	TGA	2	6	24607	24612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017180	ATT	2	6	24634	24639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017180	CTG	2	6	24670	24675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017180	ATC	2	6	24745	24750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017180	GAA	2	6	24751	24756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017180	CAT	2	6	24816	24821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017180	GAT	2	6	24924	24929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017180	TTC	3	9	24940	24948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017180	CTA	2	6	24972	24977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017180	GAT	2	6	25055	25060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017180	TCG	2	6	25136	25141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017180	GCG	2	6	25193	25198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017180	AGC	2	6	25361	25366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017180	ACT	2	6	25367	25372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017180	GAT	2	6	25685	25690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017180	GAG	2	6	25864	25869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017180	ATA	2	6	25893	25898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017180	TCT	2	6	25904	25909	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017180	CTT	2	6	26086	26091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017180	ATT	2	6	26149	26154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017180	GCC	2	6	26263	26268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_017180	GGT	2	6	26289	26294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017180	ATT	2	6	26305	26310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017180	ACT	2	6	26382	26387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017180	TAA	2	6	26493	26498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017180	TTG	2	6	26614	26619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017180	ACA	3	9	26620	26628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017180	CGT	2	6	26700	26705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017180	ATT	2	6	26727	26732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017180	GAT	2	6	27282	27287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017180	TTA	2	6	27379	27384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017180	ATC	2	6	28387	28392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017180	AAG	2	6	28422	28427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017180	ATC	2	6	28453	28458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017180	TAA	2	6	28519	28524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017180	AAC	2	6	28552	28557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017180	GAT	2	6	28644	28649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017180	TCA	2	6	28699	28704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017180	TGC	2	6	28828	28833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017180	AAG	2	6	29057	29062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017180	AGA	3	9	29143	29151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017180	CAT	2	6	29176	29181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017180	AGA	2	6	29207	29212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017180	TCT	2	6	29239	29244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017180	CTT	2	6	29269	29274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017180	CTT	2	6	29293	29298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017180	TGA	2	6	29324	29329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017180	AAG	2	6	29404	29409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017180	TTC	2	6	29781	29786	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017180	TTA	2	6	29933	29938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017180	GTT	2	6	30027	30032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017180	TTA	2	6	30064	30069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017180	TTG	2	6	30180	30185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017180	ATC	2	6	30234	30239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017180	GCT	2	6	30718	30723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017180	ATA	2	6	30784	30789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017180	AAG	2	6	30807	30812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.