MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Zymomonas mobilis subsp. mobilis ATCC 10988 plasmid pZMOB01

Total Repeats: 270

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017180	GAT	2	6	78	83	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410830
2	NC_017180	ATT	2	6	144	149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410830
3	NC_017180	TTG	3	9	328	336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410830
4	NC_017180	ATA	2	6	339	344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410830
5	NC_017180	GAA	2	6	357	362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410830
6	NC_017180	ATG	2	6	395	400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410831
7	NC_017180	ATC	2	6	434	439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410831
8	NC_017180	ATT	2	6	516	521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410831
9	NC_017180	GAG	2	6	548	553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384410831
10	NC_017180	GAA	2	6	563	568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410831
11	NC_017180	TTG	2	6	627	632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410831
12	NC_017180	GAC	2	6	647	652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410831
13	NC_017180	ATA	2	6	665	670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410831
14	NC_017180	TGT	2	6	682	687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410831
15	NC_017180	AGG	2	6	910	915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384410831
16	NC_017180	AAC	2	6	1074	1079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384410831
17	NC_017180	CGA	2	6	1204	1209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410831
18	NC_017180	CCG	2	6	1225	1230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384410831
19	NC_017180	GTT	2	6	1264	1269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410831
20	NC_017180	GAT	2	6	1370	1375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410831
21	NC_017180	CCT	2	6	1445	1450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384410831
22	NC_017180	TGT	2	6	1631	1636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410831
23	NC_017180	AGC	2	6	1651	1656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410831
24	NC_017180	CAA	2	6	1762	1767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384410831
25	NC_017180	TTA	2	6	1851	1856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410831
26	NC_017180	CTT	2	6	1898	1903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410831
27	NC_017180	CTG	2	6	2179	2184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410832
28	NC_017180	CCG	2	6	2226	2231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384410832
29	NC_017180	GTG	2	6	2269	2274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384410832
30	NC_017180	AAT	2	6	2335	2340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410832
31	NC_017180	TCA	2	6	2411	2416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410832
32	NC_017180	GTG	2	6	2434	2439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384410832
33	NC_017180	TCC	2	6	2518	2523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384410832
34	NC_017180	TGA	2	6	2546	2551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410832
35	NC_017180	GAA	2	6	2739	2744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410832
36	NC_017180	CAT	2	6	2946	2951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410832
37	NC_017180	GAC	2	6	2977	2982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410832
38	NC_017180	GAC	2	6	3052	3057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410832
39	NC_017180	CTC	2	6	3067	3072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384410832
40	NC_017180	ACC	2	6	3100	3105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384410832
41	NC_017180	TGG	2	6	3170	3175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384410832
42	NC_017180	CCT	2	6	3290	3295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384410832
43	NC_017180	GCC	2	6	3428	3433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384410832
44	NC_017180	ATC	2	6	3697	3702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410832
45	NC_017180	TGA	3	9	3726	3734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410832
46	NC_017180	GGT	2	6	3753	3758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384410832
47	NC_017180	ACT	2	6	3831	3836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410832
48	NC_017180	ACA	2	6	3854	3859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384410832
49	NC_017180	GGT	2	6	4012	4017	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384410832
50	NC_017180	TGG	2	6	4019	4024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384410832
51	NC_017180	GGC	2	6	4056	4061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384410832
52	NC_017180	TGA	2	6	4104	4109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410832
53	NC_017180	CAT	2	6	4239	4244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410832
54	NC_017180	CAG	2	6	4273	4278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410832
55	NC_017180	TGA	2	6	4389	4394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410832
56	NC_017180	GGC	2	6	4440	4445	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384410832
57	NC_017180	CTT	2	6	4608	4613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410832
58	NC_017180	GCT	2	6	4668	4673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410832
59	NC_017180	GAA	2	6	4867	4872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410832
60	NC_017180	AGG	2	6	4913	4918	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384410832
61	NC_017180	CGC	2	6	5050	5055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384410832
62	NC_017180	AGG	2	6	5142	5147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384410832
63	NC_017180	GAG	2	6	5769	5774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384410833
64	NC_017180	TAT	2	6	5928	5933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410833
65	NC_017180	GCA	2	6	6023	6028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410833
66	NC_017180	GTT	3	9	6053	6061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410833
67	NC_017180	GTT	2	6	6072	6077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410833
68	NC_017180	TTA	2	6	6173	6178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410833
69	NC_017180	ATA	2	6	6223	6228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410833
70	NC_017180	TCA	2	6	6233	6238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410833
71	NC_017180	AAT	2	6	6281	6286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410833
72	NC_017180	ATT	2	6	6316	6321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410833
73	NC_017180	AAT	2	6	6475	6480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410833
74	NC_017180	CAG	2	6	6501	6506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410833
75	NC_017180	TCT	2	6	6605	6610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410833
76	NC_017180	ATA	2	6	6767	6772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410833
77	NC_017180	TAT	2	6	6987	6992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410834
78	NC_017180	GAA	2	6	6999	7004	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410834
79	NC_017180	TAT	2	6	7005	7010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410834
80	NC_017180	TGT	2	6	7071	7076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410834
81	NC_017180	GCA	2	6	7081	7086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410834
82	NC_017180	ATA	2	6	7142	7147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410834
83	NC_017180	ATA	2	6	7166	7171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410834
84	NC_017180	ATG	2	6	7343	7348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410834
85	NC_017180	AGA	2	6	7533	7538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410834
86	NC_017180	ATT	2	6	7588	7593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410834
87	NC_017180	TAA	2	6	7605	7610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410834
88	NC_017180	TGG	2	6	7686	7691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384410834
89	NC_017180	ATC	2	6	7772	7777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410834
90	NC_017180	CTT	2	6	7811	7816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410834
91	NC_017180	TAA	2	6	7943	7948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410834
92	NC_017180	GAT	2	6	8140	8145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410834
93	NC_017180	TAA	2	6	8151	8156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410834
94	NC_017180	AAT	2	6	8167	8172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410834
95	NC_017180	CGT	2	6	8200	8205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410834
96	NC_017180	AAC	2	6	8217	8222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384410834
97	NC_017180	CAA	2	6	8261	8266	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384410834
98	NC_017180	TAA	2	6	8304	8309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410834
99	NC_017180	CAA	2	6	8351	8356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384410834
100	NC_017180	CTT	2	6	8417	8422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410834
101	NC_017180	GGT	2	6	8431	8436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384410834
102	NC_017180	ATT	2	6	8567	8572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410834
103	NC_017180	CAA	2	6	8714	8719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384410834
104	NC_017180	TGC	2	6	8732	8737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410834
105	NC_017180	GCT	2	6	8752	8757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410834
106	NC_017180	GTG	2	6	8807	8812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384410834
107	NC_017180	GGA	2	6	8893	8898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384410834
108	NC_017180	CAA	2	6	8900	8905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384410834
109	NC_017180	TTA	2	6	8985	8990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410834
110	NC_017180	TGC	2	6	9165	9170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410834
111	NC_017180	CTG	2	6	9173	9178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410834
112	NC_017180	GTA	2	6	9203	9208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410834
113	NC_017180	AAT	2	6	9460	9465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410834
114	NC_017180	TCG	2	6	9483	9488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410834
115	NC_017180	AAT	3	9	9502	9510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384410834
116	NC_017180	AGA	2	6	10379	10384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410835
117	NC_017180	TGC	2	6	10698	10703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410836
118	NC_017180	AGA	2	6	10816	10821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384410836
119	NC_017180	GAT	2	6	10953	10958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410837
120	NC_017180	GTC	2	6	10966	10971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410837
121	NC_017180	ACG	2	6	10996	11001	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410837
122	NC_017180	GGC	2	6	11096	11101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384410837
123	NC_017180	CAA	3	9	11132	11140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384410837
124	NC_017180	TCT	2	6	11185	11190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410837
125	NC_017180	CTG	2	6	11411	11416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384410837
126	NC_017180	GAT	2	6	11640	11645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410838
127	NC_017180	GCA	2	6	11717	11722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410838
128	NC_017180	TTA	2	6	11749	11754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384410838
129	NC_017180	TCA	2	6	11777	11782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410838
130	NC_017180	TTG	2	6	11821	11826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384410838
131	NC_017180	CTA	2	6	13121	13126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384410839
132	NC_017180	CGC	2	6	13148	13153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384410839
133	NC_017180	TAG	2	6	13197	13202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410839
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152	NC_017180	TGA	2	6	14335	14340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384410839
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164	NC_017180	CTT	2	6	16173	16178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384410843
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255	NC_017180	GCA	2	6	31118	31123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384410857
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.