MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Clostridium difficile BI1

Total Repeats: 3083

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017179	TTAAA	2	10	2322	2331	60 %	40 %	0 %	0 %	384359321
2	NC_017179	TAAAA	2	10	2993	3002	80 %	20 %	0 %	0 %	384359322
3	NC_017179	TTGTT	2	10	4891	4900	0 %	80 %	20 %	0 %	384359324
4	NC_017179	AAGAA	2	10	5992	6001	80 %	0 %	20 %	0 %	384359324
5	NC_017179	ATATT	2	10	6204	6213	40 %	60 %	0 %	0 %	384359325
6	NC_017179	AGTGT	2	10	6667	6676	20 %	40 %	40 %	0 %	384359325
7	NC_017179	AAAGA	2	10	6903	6912	80 %	0 %	20 %	0 %	384359325
8	NC_017179	AGATA	2	10	7370	7379	60 %	20 %	20 %	0 %	384359325
9	NC_017179	TAAAT	2	10	7757	7766	60 %	40 %	0 %	0 %	384359325
10	NC_017179	AAGAA	2	10	8665	8674	80 %	0 %	20 %	0 %	384359326
11	NC_017179	GCTCT	2	10	8900	8909	0 %	40 %	20 %	40 %	384359327
12	NC_017179	ATTTA	2	10	9910	9919	40 %	60 %	0 %	0 %	384359330
13	NC_017179	CTAGA	2	10	10572	10581	40 %	20 %	20 %	20 %	384359330
14	NC_017179	AGATA	2	10	23343	23352	60 %	20 %	20 %	0 %	384359333
15	NC_017179	TTTGT	2	10	25740	25749	0 %	80 %	20 %	0 %	384359335
16	NC_017179	AATAA	2	10	25813	25822	80 %	20 %	0 %	0 %	384359335
17	NC_017179	TTAAT	2	10	26225	26234	40 %	60 %	0 %	0 %	384359335
18	NC_017179	AAATA	2	10	27221	27230	80 %	20 %	0 %	0 %	384359335
19	NC_017179	AAATT	2	10	28732	28741	60 %	40 %	0 %	0 %	384359339
20	NC_017179	GAAAT	2	10	39337	39346	60 %	20 %	20 %	0 %	384359340
21	NC_017179	ATATT	2	10	40638	40647	40 %	60 %	0 %	0 %	384359341
22	NC_017179	GTTCA	2	10	40740	40749	20 %	40 %	20 %	20 %	384359341
23	NC_017179	AGTTA	2	10	40831	40840	40 %	40 %	20 %	0 %	384359341
24	NC_017179	ATATT	2	10	42109	42118	40 %	60 %	0 %	0 %	384359341
25	NC_017179	AGGTA	2	10	43099	43108	40 %	20 %	40 %	0 %	384359341
26	NC_017179	AATGG	2	10	43178	43187	40 %	20 %	40 %	0 %	384359341
27	NC_017179	TAATT	2	10	43472	43481	40 %	60 %	0 %	0 %	384359341
28	NC_017179	TACAT	2	10	44870	44879	40 %	40 %	0 %	20 %	384359342
29	NC_017179	AAAAT	2	10	44950	44959	80 %	20 %	0 %	0 %	384359342
30	NC_017179	TTGAA	2	10	44983	44992	40 %	40 %	20 %	0 %	384359342
31	NC_017179	TGGAA	2	10	45452	45461	40 %	20 %	40 %	0 %	384359342
32	NC_017179	AAGGT	2	10	46502	46511	40 %	20 %	40 %	0 %	384359343
33	NC_017179	AGATG	2	10	48938	48947	40 %	20 %	40 %	0 %	384359346
34	NC_017179	TTTTG	2	10	53851	53860	0 %	80 %	20 %	0 %	384359349
35	NC_017179	TAGAT	2	10	55182	55191	40 %	40 %	20 %	0 %	384359350
36	NC_017179	GAGTG	2	10	59430	59439	20 %	20 %	60 %	0 %	384359353
37	NC_017179	ATGTT	2	10	61795	61804	20 %	60 %	20 %	0 %	384359354
38	NC_017179	CAAAT	2	10	63109	63118	60 %	20 %	0 %	20 %	384359355
39	NC_017179	AAATA	2	10	65634	65643	80 %	20 %	0 %	0 %	384359358
40	NC_017179	TAAAA	2	10	66546	66555	80 %	20 %	0 %	0 %	384359358
41	NC_017179	ATTCA	2	10	67759	67768	40 %	40 %	0 %	20 %	384359359
42	NC_017179	GAAGA	2	10	69075	69084	60 %	0 %	40 %	0 %	384359360
43	NC_017179	AGAAA	2	10	70246	70255	80 %	0 %	20 %	0 %	384359360
44	NC_017179	ATATA	2	10	70684	70693	60 %	40 %	0 %	0 %	384359360
45	NC_017179	AAAAG	2	10	71140	71149	80 %	0 %	20 %	0 %	384359360
46	NC_017179	CAAAT	2	10	71472	71481	60 %	20 %	0 %	20 %	384359360
47	NC_017179	ACTCT	2	10	71828	71837	20 %	40 %	0 %	40 %	384359360
48	NC_017179	AATTT	2	10	71940	71949	40 %	60 %	0 %	0 %	384359361
49	NC_017179	GAATA	2	10	74173	74182	60 %	20 %	20 %	0 %	384359363
50	NC_017179	AAGAA	2	10	74915	74924	80 %	0 %	20 %	0 %	384359365
51	NC_017179	ACAGA	2	10	78782	78791	60 %	0 %	20 %	20 %	384359369
52	NC_017179	GTTAG	2	10	80191	80200	20 %	40 %	40 %	0 %	384359369
53	NC_017179	TACAT	2	10	80827	80836	40 %	40 %	0 %	20 %	384359370
54	NC_017179	CCATA	2	10	81101	81110	40 %	20 %	0 %	40 %	384359370
55	NC_017179	TGTGG	2	10	81618	81627	0 %	40 %	60 %	0 %	384359370
56	NC_017179	AGAAA	2	10	82973	82982	80 %	0 %	20 %	0 %	384359371
57	NC_017179	AAATT	2	10	83181	83190	60 %	40 %	0 %	0 %	384359371
58	NC_017179	AATAG	2	10	83658	83667	60 %	20 %	20 %	0 %	384359371
59	NC_017179	AGCTA	2	10	86172	86181	40 %	20 %	20 %	20 %	384359374
60	NC_017179	AAATG	2	10	86963	86972	60 %	20 %	20 %	0 %	384359375
61	NC_017179	TAAAC	2	10	88144	88153	60 %	20 %	0 %	20 %	384359377
62	NC_017179	TTACT	2	10	88794	88803	20 %	60 %	0 %	20 %	384359377
63	NC_017179	AAAAC	2	10	89056	89065	80 %	0 %	0 %	20 %	384359377
64	NC_017179	AGAAT	2	10	89651	89660	60 %	20 %	20 %	0 %	384359378
65	NC_017179	GTTTA	2	10	94526	94535	20 %	60 %	20 %	0 %	384359385
66	NC_017179	GAAAA	2	10	94892	94901	80 %	0 %	20 %	0 %	384359386
67	NC_017179	AAAAT	2	10	95791	95800	80 %	20 %	0 %	0 %	384359388
68	NC_017179	TTCTA	2	10	98720	98729	20 %	60 %	0 %	20 %	384359391
69	NC_017179	AATTA	2	10	98828	98837	60 %	40 %	0 %	0 %	384359391
70	NC_017179	AGTAG	2	10	101178	101187	40 %	20 %	40 %	0 %	384359392
71	NC_017179	GGTAA	2	10	101868	101877	40 %	20 %	40 %	0 %	384359392
72	NC_017179	TAATA	2	10	102881	102890	60 %	40 %	0 %	0 %	384359392
73	NC_017179	GGTAT	2	10	104597	104606	20 %	40 %	40 %	0 %	384359393
74	NC_017179	TGAGA	2	10	114160	114169	40 %	20 %	40 %	0 %	384359402
75	NC_017179	AATTA	2	10	114769	114778	60 %	40 %	0 %	0 %	384359403
76	NC_017179	AAAGA	2	10	115291	115300	80 %	0 %	20 %	0 %	384359405
77	NC_017179	TAATG	2	10	117540	117549	40 %	40 %	20 %	0 %	384359410
78	NC_017179	AGAAA	2	10	118810	118819	80 %	0 %	20 %	0 %	384359413
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80	NC_017179	TAAGA	2	10	119325	119334	60 %	20 %	20 %	0 %	384359414
81	NC_017179	TAAAA	2	10	122342	122351	80 %	20 %	0 %	0 %	384359419
82	NC_017179	TTATG	2	10	127312	127321	20 %	60 %	20 %	0 %	384359429
83	NC_017179	TAGTA	2	10	127452	127461	40 %	40 %	20 %	0 %	384359429
84	NC_017179	ATATC	2	10	130474	130483	40 %	40 %	0 %	20 %	384359433
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86	NC_017179	TAAAT	2	10	147524	147533	60 %	40 %	0 %	0 %	384359438
87	NC_017179	AATAT	2	10	161719	161728	60 %	40 %	0 %	0 %	384359440
88	NC_017179	CAACT	2	10	161855	161864	40 %	20 %	0 %	40 %	384359440
89	NC_017179	AATTA	2	10	163406	163415	60 %	40 %	0 %	0 %	384359441
90	NC_017179	ATAAA	2	10	163627	163636	80 %	20 %	0 %	0 %	384359441
91	NC_017179	AGAAA	2	10	164112	164121	80 %	0 %	20 %	0 %	384359442
92	NC_017179	ACTAA	2	10	164856	164865	60 %	20 %	0 %	20 %	384359442
93	NC_017179	AGAAA	2	10	166155	166164	80 %	0 %	20 %	0 %	384359444
94	NC_017179	TTAAT	2	10	166929	166938	40 %	60 %	0 %	0 %	384359445
95	NC_017179	TAATG	2	10	167266	167275	40 %	40 %	20 %	0 %	384359446
96	NC_017179	TGATA	2	10	167401	167410	40 %	40 %	20 %	0 %	384359446
97	NC_017179	AGAAA	2	10	169270	169279	80 %	0 %	20 %	0 %	384359448
98	NC_017179	GATGT	2	10	169722	169731	20 %	40 %	40 %	0 %	384359449
99	NC_017179	TGTGG	2	10	169796	169805	0 %	40 %	60 %	0 %	384359449
100	NC_017179	ATTGA	2	10	169886	169895	40 %	40 %	20 %	0 %	384359449
101	NC_017179	AAGAA	2	10	170580	170589	80 %	0 %	20 %	0 %	384359449
102	NC_017179	TAACT	2	10	174047	174056	40 %	40 %	0 %	20 %	384359451
103	NC_017179	CAAAA	2	10	178632	178641	80 %	0 %	0 %	20 %	384359455
104	NC_017179	AAATT	2	10	178688	178697	60 %	40 %	0 %	0 %	384359455
105	NC_017179	AGATA	2	10	179892	179901	60 %	20 %	20 %	0 %	384359457
106	NC_017179	GAACT	2	10	181664	181673	40 %	20 %	20 %	20 %	384359459
107	NC_017179	TTAAA	2	10	186440	186449	60 %	40 %	0 %	0 %	384359462
108	NC_017179	ATTTA	2	10	187730	187739	40 %	60 %	0 %	0 %	384359463
109	NC_017179	ATTAT	2	10	188011	188020	40 %	60 %	0 %	0 %	384359463
110	NC_017179	AAGAA	2	10	190694	190703	80 %	0 %	20 %	0 %	384359465
111	NC_017179	TAAAA	2	10	190714	190723	80 %	20 %	0 %	0 %	384359465
112	NC_017179	GAAAA	2	10	190748	190757	80 %	0 %	20 %	0 %	384359466
113	NC_017179	GCAAA	2	10	191384	191393	60 %	0 %	20 %	20 %	384359467
114	NC_017179	AAGTT	2	10	193343	193352	40 %	40 %	20 %	0 %	384359469
115	NC_017179	ATAGA	2	10	195193	195202	60 %	20 %	20 %	0 %	384359471
116	NC_017179	AAACT	2	10	196420	196429	60 %	20 %	0 %	20 %	384359472
117	NC_017179	TGAAA	2	10	200065	200074	60 %	20 %	20 %	0 %	384359474
118	NC_017179	AAATC	2	10	200991	201000	60 %	20 %	0 %	20 %	384359475
119	NC_017179	AATAC	2	10	201067	201076	60 %	20 %	0 %	20 %	384359475
120	NC_017179	AGAAA	2	10	201094	201103	80 %	0 %	20 %	0 %	384359475
121	NC_017179	AAAAG	2	10	201299	201308	80 %	0 %	20 %	0 %	384359475
122	NC_017179	AATTT	2	10	203993	204002	40 %	60 %	0 %	0 %	384359476
123	NC_017179	CTAAT	2	10	207172	207181	40 %	40 %	0 %	20 %	384359479
124	NC_017179	AAATA	2	10	208364	208373	80 %	20 %	0 %	0 %	384359481
125	NC_017179	AAGAA	2	10	208418	208427	80 %	0 %	20 %	0 %	384359481
126	NC_017179	TGGAA	2	10	213440	213449	40 %	20 %	40 %	0 %	384359485
127	NC_017179	TTAAT	2	10	216079	216088	40 %	60 %	0 %	0 %	384359487
128	NC_017179	AAGTT	2	10	217385	217394	40 %	40 %	20 %	0 %	384359488
129	NC_017179	TACTA	2	10	220241	220250	40 %	40 %	0 %	20 %	384359490
130	NC_017179	AGGAA	2	10	220388	220397	60 %	0 %	40 %	0 %	384359490
131	NC_017179	TTTGA	2	10	222102	222111	20 %	60 %	20 %	0 %	384359491
132	NC_017179	AAGGA	2	10	222148	222157	60 %	0 %	40 %	0 %	384359491
133	NC_017179	TAGAT	2	10	230005	230014	40 %	40 %	20 %	0 %	384359498
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