MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Clostridium difficile BI1

Total Repeats: 13462

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017179	ATGC	2	8	457	464	25 %	25 %	25 %	25 %	384359320
2	NC_017179	AATA	2	8	583	590	75 %	25 %	0 %	0 %	384359320
3	NC_017179	AGAA	2	8	642	649	75 %	0 %	25 %	0 %	384359320
4	NC_017179	CAAA	3	12	692	703	75 %	0 %	0 %	25 %	384359320
5	NC_017179	AAAC	2	8	1976	1983	75 %	0 %	0 %	25 %	384359321
6	NC_017179	CAAA	2	8	2006	2013	75 %	0 %	0 %	25 %	384359321
7	NC_017179	TAGA	2	8	2046	2053	50 %	25 %	25 %	0 %	384359321
8	NC_017179	TAAT	2	8	2232	2239	50 %	50 %	0 %	0 %	384359321
9	NC_017179	TACT	2	8	2630	2637	25 %	50 %	0 %	25 %	384359321
10	NC_017179	CTTT	2	8	3164	3171	0 %	75 %	0 %	25 %	384359323
11	NC_017179	AATA	2	8	3313	3320	75 %	25 %	0 %	0 %	384359323
12	NC_017179	GGTT	2	8	3393	3400	0 %	50 %	50 %	0 %	384359323
13	NC_017179	AAAG	2	8	3413	3420	75 %	0 %	25 %	0 %	384359323
14	NC_017179	AAAT	2	8	3699	3706	75 %	25 %	0 %	0 %	384359323
15	NC_017179	GTAT	2	8	4215	4222	25 %	50 %	25 %	0 %	384359324
16	NC_017179	ATGG	2	8	4525	4532	25 %	25 %	50 %	0 %	384359324
17	NC_017179	TTTA	2	8	4542	4549	25 %	75 %	0 %	0 %	384359324
18	NC_017179	CTTT	2	8	4718	4725	0 %	75 %	0 %	25 %	384359324
19	NC_017179	TAAA	2	8	4830	4837	75 %	25 %	0 %	0 %	384359324
20	NC_017179	AAAT	2	8	5041	5048	75 %	25 %	0 %	0 %	384359324
21	NC_017179	TGAG	2	8	6217	6224	25 %	25 %	50 %	0 %	384359325
22	NC_017179	GATA	2	8	6653	6660	50 %	25 %	25 %	0 %	384359325
23	NC_017179	AAAG	2	8	6738	6745	75 %	0 %	25 %	0 %	384359325
24	NC_017179	AGTT	2	8	6895	6902	25 %	50 %	25 %	0 %	384359325
25	NC_017179	TAAA	2	8	7168	7175	75 %	25 %	0 %	0 %	384359325
26	NC_017179	ATAA	2	8	7953	7960	75 %	25 %	0 %	0 %	384359325
27	NC_017179	GTAA	2	8	8196	8203	50 %	25 %	25 %	0 %	384359325
28	NC_017179	AATG	2	8	8856	8863	50 %	25 %	25 %	0 %	384359326
29	NC_017179	ATTT	2	8	8920	8927	25 %	75 %	0 %	0 %	384359327
30	NC_017179	ATAA	2	8	8947	8954	75 %	25 %	0 %	0 %	384359327
31	NC_017179	TAAT	2	8	9062	9069	50 %	50 %	0 %	0 %	384359327
32	NC_017179	AAAT	2	8	9164	9171	75 %	25 %	0 %	0 %	384359328
33	NC_017179	AAAT	2	8	9346	9353	75 %	25 %	0 %	0 %	384359328
34	NC_017179	GATA	2	8	10070	10077	50 %	25 %	25 %	0 %	384359330
35	NC_017179	AGAT	2	8	10501	10508	50 %	25 %	25 %	0 %	384359330
36	NC_017179	AAAC	2	8	10755	10762	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017179	GTGA	2	8	11202	11209	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017179	GTTT	2	8	12412	12419	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017179	GAAG	2	8	12809	12816	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017179	AGAA	2	8	12817	12824	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017179	GGTG	2	8	14247	14254	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017179	CGTA	2	8	14913	14920	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017179	TCAT	2	8	15508	15515	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017179	AAAC	2	8	16048	16055	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017179	GTGA	2	8	16495	16502	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017179	GAAG	2	8	18200	18207	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017179	AGAA	2	8	18208	18215	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017179	GGTG	2	8	19638	19645	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017179	CGTA	2	8	20304	20311	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_017179	AGAA	2	8	21228	21235	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017179	AAGA	2	8	21920	21927	75 %	0 %	25 %	0 %	384359332
52	NC_017179	TAAT	2	8	22300	22307	50 %	50 %	0 %	0 %	384359332
53	NC_017179	TGAA	2	8	22390	22397	50 %	25 %	25 %	0 %	384359332
54	NC_017179	AAAT	2	8	22550	22557	75 %	25 %	0 %	0 %	384359332
55	NC_017179	TTCC	2	8	22588	22595	0 %	50 %	0 %	50 %	384359332
56	NC_017179	AATT	2	8	23053	23060	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017179	CAAG	2	8	24181	24188	50 %	0 %	25 %	25 %	384359333
58	NC_017179	AAAT	2	8	24370	24377	75 %	25 %	0 %	0 %	384359333
59	NC_017179	AATA	2	8	24436	24443	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017179	TAAA	2	8	24615	24622	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017179	GGAA	2	8	25438	25445	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017179	ATGT	2	8	26286	26293	25 %	50 %	25 %	0 %	384359335
63	NC_017179	AGAT	2	8	26309	26316	50 %	25 %	25 %	0 %	384359335
64	NC_017179	AGTG	2	8	27201	27208	25 %	25 %	50 %	0 %	384359335
65	NC_017179	CAAG	2	8	27611	27618	50 %	0 %	25 %	25 %	384359336
66	NC_017179	ATGG	2	8	28022	28029	25 %	25 %	50 %	0 %	384359337
67	NC_017179	GAAA	2	8	28458	28465	75 %	0 %	25 %	0 %	384359338
68	NC_017179	TATT	2	8	28701	28708	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017179	TCAT	2	8	29022	29029	25 %	50 %	0 %	25 %	384359339
70	NC_017179	ACAT	2	8	29051	29058	50 %	25 %	0 %	25 %	384359339
71	NC_017179	AGAA	2	8	29252	29259	75 %	0 %	25 %	0 %	384359339
72	NC_017179	CTAT	2	8	29787	29794	25 %	50 %	0 %	25 %	384359339
73	NC_017179	AAGT	2	8	29833	29840	50 %	25 %	25 %	0 %	384359339
74	NC_017179	GAAA	2	8	30054	30061	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017179	AATT	2	8	30066	30073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017179	TAAA	2	8	30106	30113	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017179	AAAT	2	8	30171	30178	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017179	ATAA	2	8	30227	30234	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017179	AAAC	2	8	30368	30375	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017179	GTGA	2	8	30815	30822	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017179	GTTT	2	8	32025	32032	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017179	GAAG	2	8	32422	32429	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017179	AGAA	2	8	32430	32437	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017179	GGTG	2	8	33860	33867	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017179	CGTA	2	8	34526	34533	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_017179	TTTG	2	8	36276	36283	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017179	TTGA	2	8	39283	39290	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017179	ACAA	2	8	40016	40023	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_017179	ATGG	2	8	40241	40248	25 %	25 %	50 %	0 %	384359341
90	NC_017179	CAAA	2	8	40497	40504	75 %	0 %	0 %	25 %	384359341
91	NC_017179	AATA	2	8	41272	41279	75 %	25 %	0 %	0 %	384359341
92	NC_017179	ATTT	2	8	41412	41419	25 %	75 %	0 %	0 %	384359341
93	NC_017179	GAAG	2	8	41561	41568	50 %	0 %	50 %	0 %	384359341
94	NC_017179	ATCA	2	8	41667	41674	50 %	25 %	0 %	25 %	384359341
95	NC_017179	ATTT	2	8	42423	42430	25 %	75 %	0 %	0 %	384359341
96	NC_017179	AAAT	2	8	42706	42713	75 %	25 %	0 %	0 %	384359341
97	NC_017179	TAAA	2	8	43062	43069	75 %	25 %	0 %	0 %	384359341
98	NC_017179	ATGA	2	8	43253	43260	50 %	25 %	25 %	0 %	384359341
99	NC_017179	AGCA	2	8	43276	43283	50 %	0 %	25 %	25 %	384359341
100	NC_017179	TCAA	2	8	43412	43419	50 %	25 %	0 %	25 %	384359341
101	NC_017179	AAAT	2	8	43483	43490	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017179	TATT	2	8	43538	43545	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017179	TTAA	2	8	43546	43553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017179	GGTG	2	8	43703	43710	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017179	AACT	2	8	44035	44042	50 %	25 %	0 %	25 %	384359342
106	NC_017179	TAAA	2	8	44068	44075	75 %	25 %	0 %	0 %	384359342
107	NC_017179	ATAA	2	8	44595	44602	75 %	25 %	0 %	0 %	384359342
108	NC_017179	AGAT	2	8	44764	44771	50 %	25 %	25 %	0 %	384359342
109	NC_017179	TAAA	2	8	44845	44852	75 %	25 %	0 %	0 %	384359342
110	NC_017179	ATAA	2	8	45426	45433	75 %	25 %	0 %	0 %	384359342
111	NC_017179	AAAT	2	8	45651	45658	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017179	TAAT	2	8	45666	45673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017179	AAAG	2	8	45802	45809	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017179	AATA	2	8	45931	45938	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017179	TAAT	2	8	45956	45963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017179	AAAG	2	8	46059	46066	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017179	AAAT	2	8	46212	46219	75 %	25 %	0 %	0 %	384359343
118	NC_017179	ATAG	2	8	46244	46251	50 %	25 %	25 %	0 %	384359343
119	NC_017179	AGTG	2	8	46655	46662	25 %	25 %	50 %	0 %	384359344
120	NC_017179	TAGA	2	8	46977	46984	50 %	25 %	25 %	0 %	384359344
121	NC_017179	GCTA	2	8	47113	47120	25 %	25 %	25 %	25 %	384359345
122	NC_017179	AAAT	2	8	47146	47153	75 %	25 %	0 %	0 %	384359345
123	NC_017179	GAAC	2	8	47654	47661	50 %	0 %	25 %	25 %	384359345
124	NC_017179	AAAT	2	8	48374	48381	75 %	25 %	0 %	0 %	384359346
125	NC_017179	TTAT	2	8	48930	48937	25 %	75 %	0 %	0 %	384359346
126	NC_017179	AGCC	2	8	49009	49016	25 %	0 %	25 %	50 %	384359346
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128	NC_017179	CAGA	2	8	49255	49262	50 %	0 %	25 %	25 %	384359346
129	NC_017179	TTGA	2	8	49287	49294	25 %	50 %	25 %	0 %	384359346
130	NC_017179	GAAA	2	8	50171	50178	75 %	0 %	25 %	0 %	384359346
131	NC_017179	CACT	2	8	50250	50257	25 %	25 %	0 %	50 %	384359346
132	NC_017179	AATT	2	8	50362	50369	50 %	50 %	0 %	0 %	384359346
133	NC_017179	ATGT	2	8	50739	50746	25 %	50 %	25 %	0 %	384359347
134	NC_017179	CAGT	2	8	50883	50890	25 %	25 %	25 %	25 %	384359347
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136	NC_017179	AATA	2	8	52086	52093	75 %	25 %	0 %	0 %	384359347
137	NC_017179	ATGG	2	8	52306	52313	25 %	25 %	50 %	0 %	384359348
138	NC_017179	AAAC	2	8	52435	52442	75 %	0 %	0 %	25 %	384359348
139	NC_017179	AGTA	2	8	52743	52750	50 %	25 %	25 %	0 %	384359348
140	NC_017179	TAAA	2	8	53439	53446	75 %	25 %	0 %	0 %	384359349
141	NC_017179	TATT	2	8	53549	53556	25 %	75 %	0 %	0 %	384359349
142	NC_017179	ATTT	2	8	53664	53671	25 %	75 %	0 %	0 %	384359349
143	NC_017179	AGAA	2	8	53946	53953	75 %	0 %	25 %	0 %	384359349
144	NC_017179	TAAA	2	8	54072	54079	75 %	25 %	0 %	0 %	384359349
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