MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium difficile BI1

Total Repeats: 3171

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017179	AAAC	2	8	10755	10762	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017179	GTGA	2	8	11202	11209	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017179	GTTT	2	8	12412	12419	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017179	GAAG	2	8	12809	12816	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017179	AGAA	2	8	12817	12824	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017179	GGTG	2	8	14247	14254	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017179	CGTA	2	8	14913	14920	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017179	TCAT	2	8	15508	15515	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017179	AAAC	2	8	16048	16055	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017179	GTGA	2	8	16495	16502	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017179	GAAG	2	8	18200	18207	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017179	AGAA	2	8	18208	18215	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017179	GGTG	2	8	19638	19645	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017179	CGTA	2	8	20304	20311	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017179	AGAA	2	8	21228	21235	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017179	AATT	2	8	23053	23060	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017179	AATA	2	8	24436	24443	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017179	TAAA	2	8	24615	24622	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017179	GGAA	2	8	25438	25445	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017179	TATT	2	8	28701	28708	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017179	GAAA	2	8	30054	30061	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017179	AATT	2	8	30066	30073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017179	TAAA	2	8	30106	30113	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017179	AAAT	2	8	30171	30178	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017179	ATAA	2	8	30227	30234	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017179	AAAC	2	8	30368	30375	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017179	GTGA	2	8	30815	30822	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017179	GTTT	2	8	32025	32032	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017179	GAAG	2	8	32422	32429	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017179	AGAA	2	8	32430	32437	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017179	GGTG	2	8	33860	33867	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017179	CGTA	2	8	34526	34533	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017179	TTTG	2	8	36276	36283	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017179	TTGA	2	8	39283	39290	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017179	ACAA	2	8	40016	40023	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017179	AAAT	2	8	43483	43490	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017179	TATT	2	8	43538	43545	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017179	TTAA	2	8	43546	43553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017179	GGTG	2	8	43703	43710	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017179	AAAT	2	8	45651	45658	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017179	TAAT	2	8	45666	45673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017179	AAAG	2	8	45802	45809	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017179	AATA	2	8	45931	45938	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017179	TAAT	2	8	45956	45963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017179	AAAG	2	8	46059	46066	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017179	ATTT	3	12	54400	54411	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017179	ATAA	2	8	56814	56821	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017179	TTAA	2	8	62233	62240	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017179	TGGT	2	8	62347	62354	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017179	AATT	2	8	62407	62414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017179	AGAT	2	8	63608	63615	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017179	TTAA	2	8	66801	66808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017179	ACTT	2	8	68636	68643	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017179	ATTT	2	8	68669	68676	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017179	TCAA	2	8	74809	74816	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017179	AAAT	2	8	80304	80311	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017179	TAAA	2	8	81781	81788	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017179	AATA	2	8	81985	81992	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017179	AAAT	2	8	82031	82038	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017179	AAAG	2	8	82045	82052	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017179	TAAA	2	8	82104	82111	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017179	ATAA	2	8	83817	83824	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017179	ATAA	2	8	86376	86383	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017179	ACGA	2	8	86449	86456	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017179	ATTA	2	8	86485	86492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017179	TTAT	2	8	90484	90491	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017179	AATT	2	8	92829	92836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017179	AAAG	2	8	97702	97709	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017179	AAAG	2	8	97723	97730	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017179	TAAA	2	8	97927	97934	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017179	TAAT	2	8	97945	97952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017179	ATTT	2	8	98948	98955	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017179	TAAT	2	8	103020	103027	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017179	GTAA	2	8	106735	106742	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017179	TCAG	2	8	106755	106762	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_017179	TGAT	2	8	107264	107271	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017179	TAAT	2	8	109971	109978	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017179	ATTT	2	8	114458	114465	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017179	AAGG	2	8	115990	115997	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017179	GTTA	2	8	124084	124091	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017179	TTTA	2	8	131829	131836	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017179	AATA	2	8	132206	132213	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017179	AAAC	2	8	133237	133244	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_017179	GTGA	2	8	133684	133691	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017179	GTTT	2	8	135054	135061	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017179	GAAG	2	8	135411	135418	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017179	AGAA	2	8	135419	135426	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017179	GGTG	2	8	136849	136856	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017179	CGTA	2	8	137515	137522	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_017179	AAAC	2	8	138814	138821	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_017179	GTGA	2	8	139261	139268	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017179	GTTT	2	8	140631	140638	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017179	GAAG	2	8	140988	140995	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017179	AGAA	2	8	140996	141003	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017179	GGTG	2	8	142426	142433	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017179	CGTA	2	8	143092	143099	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_017179	ATTT	2	8	143676	143683	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017179	TTCA	2	8	143688	143695	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_017179	TTAC	2	8	144069	144076	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_017179	ATAA	2	8	148605	148612	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017179	AATT	2	8	148808	148815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017179	ATAA	2	8	148871	148878	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017179	ATCT	2	8	149034	149041	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_017179	CAAA	2	8	149263	149270	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_017179	AAAC	2	8	149323	149330	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_017179	GTGA	2	8	149770	149777	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017179	GTTT	2	8	151140	151147	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017179	GAAG	2	8	151497	151504	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017179	AGAA	2	8	151505	151512	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017179	GGTG	2	8	152935	152942	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017179	CGTA	2	8	153601	153608	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_017179	TCAT	2	8	154196	154203	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_017179	AAAC	2	8	154736	154743	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_017179	GTGA	2	8	155183	155190	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017179	GTTT	2	8	156553	156560	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017179	GAAG	2	8	157012	157019	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017179	AGAA	2	8	157020	157027	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017179	GGTG	2	8	158450	158457	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017179	CGTA	2	8	159116	159123	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_017179	ATTT	2	8	159700	159707	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017179	TTTA	2	8	160790	160797	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017179	TATT	2	8	161515	161522	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017179	TAAA	2	8	163883	163890	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017179	ATTT	2	8	179534	179541	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017179	TAAA	2	8	179621	179628	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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127	NC_017179	AATA	2	8	182132	182139	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017179	ATTA	2	8	192982	192989	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017179	TAAA	2	8	195831	195838	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017179	GAAA	2	8	195947	195954	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017179	AGAT	2	8	195955	195962	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017179	TAAA	2	8	196125	196132	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017179	ATAA	2	8	196225	196232	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017179	ATAA	2	8	196942	196949	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017179	TATG	2	8	203132	203139	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017179	ATAA	2	8	204623	204630	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017179	GTTT	2	8	204641	204648	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017179	ATTT	2	8	205388	205395	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017179	TGAT	2	8	205416	205423	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017179	TAAT	2	8	206793	206800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017179	AAAT	2	8	209581	209588	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017179	AATT	2	8	216202	216209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017179	GCAG	2	8	216240	216247	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
144	NC_017179	TAAA	2	8	216500	216507	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017179	AGTT	2	8	216608	216615	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017179	TTTA	2	8	216622	216629	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017179	ATTT	2	8	216692	216699	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017179	TTAT	2	8	216712	216719	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017179	ATTA	2	8	216830	216837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017179	TAAA	2	8	217175	217182	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017179	GTAA	2	8	217722	217729	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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