MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Clostridium difficile BI1

Total Repeats: 10291

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017179	ATGC	2	8	457	464	25 %	25 %	25 %	25 %	384359320
2	NC_017179	AATA	2	8	583	590	75 %	25 %	0 %	0 %	384359320
3	NC_017179	AGAA	2	8	642	649	75 %	0 %	25 %	0 %	384359320
4	NC_017179	CAAA	3	12	692	703	75 %	0 %	0 %	25 %	384359320
5	NC_017179	AAAC	2	8	1976	1983	75 %	0 %	0 %	25 %	384359321
6	NC_017179	CAAA	2	8	2006	2013	75 %	0 %	0 %	25 %	384359321
7	NC_017179	TAGA	2	8	2046	2053	50 %	25 %	25 %	0 %	384359321
8	NC_017179	TAAT	2	8	2232	2239	50 %	50 %	0 %	0 %	384359321
9	NC_017179	TACT	2	8	2630	2637	25 %	50 %	0 %	25 %	384359321
10	NC_017179	CTTT	2	8	3164	3171	0 %	75 %	0 %	25 %	384359323
11	NC_017179	AATA	2	8	3313	3320	75 %	25 %	0 %	0 %	384359323
12	NC_017179	GGTT	2	8	3393	3400	0 %	50 %	50 %	0 %	384359323
13	NC_017179	AAAG	2	8	3413	3420	75 %	0 %	25 %	0 %	384359323
14	NC_017179	AAAT	2	8	3699	3706	75 %	25 %	0 %	0 %	384359323
15	NC_017179	GTAT	2	8	4215	4222	25 %	50 %	25 %	0 %	384359324
16	NC_017179	ATGG	2	8	4525	4532	25 %	25 %	50 %	0 %	384359324
17	NC_017179	TTTA	2	8	4542	4549	25 %	75 %	0 %	0 %	384359324
18	NC_017179	CTTT	2	8	4718	4725	0 %	75 %	0 %	25 %	384359324
19	NC_017179	TAAA	2	8	4830	4837	75 %	25 %	0 %	0 %	384359324
20	NC_017179	AAAT	2	8	5041	5048	75 %	25 %	0 %	0 %	384359324
21	NC_017179	TGAG	2	8	6217	6224	25 %	25 %	50 %	0 %	384359325
22	NC_017179	GATA	2	8	6653	6660	50 %	25 %	25 %	0 %	384359325
23	NC_017179	AAAG	2	8	6738	6745	75 %	0 %	25 %	0 %	384359325
24	NC_017179	AGTT	2	8	6895	6902	25 %	50 %	25 %	0 %	384359325
25	NC_017179	TAAA	2	8	7168	7175	75 %	25 %	0 %	0 %	384359325
26	NC_017179	ATAA	2	8	7953	7960	75 %	25 %	0 %	0 %	384359325
27	NC_017179	GTAA	2	8	8196	8203	50 %	25 %	25 %	0 %	384359325
28	NC_017179	AATG	2	8	8856	8863	50 %	25 %	25 %	0 %	384359326
29	NC_017179	ATTT	2	8	8920	8927	25 %	75 %	0 %	0 %	384359327
30	NC_017179	ATAA	2	8	8947	8954	75 %	25 %	0 %	0 %	384359327
31	NC_017179	TAAT	2	8	9062	9069	50 %	50 %	0 %	0 %	384359327
32	NC_017179	AAAT	2	8	9164	9171	75 %	25 %	0 %	0 %	384359328
33	NC_017179	AAAT	2	8	9346	9353	75 %	25 %	0 %	0 %	384359328
34	NC_017179	GATA	2	8	10070	10077	50 %	25 %	25 %	0 %	384359330
35	NC_017179	AGAT	2	8	10501	10508	50 %	25 %	25 %	0 %	384359330
36	NC_017179	AAGA	2	8	21920	21927	75 %	0 %	25 %	0 %	384359332
37	NC_017179	TAAT	2	8	22300	22307	50 %	50 %	0 %	0 %	384359332
38	NC_017179	TGAA	2	8	22390	22397	50 %	25 %	25 %	0 %	384359332
39	NC_017179	AAAT	2	8	22550	22557	75 %	25 %	0 %	0 %	384359332
40	NC_017179	TTCC	2	8	22588	22595	0 %	50 %	0 %	50 %	384359332
41	NC_017179	CAAG	2	8	24181	24188	50 %	0 %	25 %	25 %	384359333
42	NC_017179	AAAT	2	8	24370	24377	75 %	25 %	0 %	0 %	384359333
43	NC_017179	ATGT	2	8	26286	26293	25 %	50 %	25 %	0 %	384359335
44	NC_017179	AGAT	2	8	26309	26316	50 %	25 %	25 %	0 %	384359335
45	NC_017179	AGTG	2	8	27201	27208	25 %	25 %	50 %	0 %	384359335
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52	NC_017179	CTAT	2	8	29787	29794	25 %	50 %	0 %	25 %	384359339
53	NC_017179	AAGT	2	8	29833	29840	50 %	25 %	25 %	0 %	384359339
54	NC_017179	ATGG	2	8	40241	40248	25 %	25 %	50 %	0 %	384359341
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56	NC_017179	AATA	2	8	41272	41279	75 %	25 %	0 %	0 %	384359341
57	NC_017179	ATTT	2	8	41412	41419	25 %	75 %	0 %	0 %	384359341
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60	NC_017179	ATTT	2	8	42423	42430	25 %	75 %	0 %	0 %	384359341
61	NC_017179	AAAT	2	8	42706	42713	75 %	25 %	0 %	0 %	384359341
62	NC_017179	TAAA	2	8	43062	43069	75 %	25 %	0 %	0 %	384359341
63	NC_017179	ATGA	2	8	43253	43260	50 %	25 %	25 %	0 %	384359341
64	NC_017179	AGCA	2	8	43276	43283	50 %	0 %	25 %	25 %	384359341
65	NC_017179	TCAA	2	8	43412	43419	50 %	25 %	0 %	25 %	384359341
66	NC_017179	AACT	2	8	44035	44042	50 %	25 %	0 %	25 %	384359342
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71	NC_017179	ATAA	2	8	45426	45433	75 %	25 %	0 %	0 %	384359342
72	NC_017179	AAAT	2	8	46212	46219	75 %	25 %	0 %	0 %	384359343
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108	NC_017179	TTTA	2	8	56590	56597	25 %	75 %	0 %	0 %	384359350
109	NC_017179	TTAA	2	8	56962	56969	50 %	50 %	0 %	0 %	384359351
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111	NC_017179	TAAT	2	8	57112	57119	50 %	50 %	0 %	0 %	384359351
112	NC_017179	TACA	2	8	58231	58238	50 %	25 %	0 %	25 %	384359352
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115	NC_017179	GATG	2	8	58677	58684	25 %	25 %	50 %	0 %	384359352
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119	NC_017179	TAAA	2	8	60241	60248	75 %	25 %	0 %	0 %	384359353
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121	NC_017179	AATT	2	8	61189	61196	50 %	50 %	0 %	0 %	384359354
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124	NC_017179	TTTA	2	8	61544	61551	25 %	75 %	0 %	0 %	384359354
125	NC_017179	CCTA	2	8	62105	62112	25 %	25 %	0 %	50 %	384359354
126	NC_017179	ATGA	2	8	63324	63331	50 %	25 %	25 %	0 %	384359355
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138	NC_017179	TTAA	2	8	69146	69153	50 %	50 %	0 %	0 %	384359360
139	NC_017179	TAAA	2	8	69189	69196	75 %	25 %	0 %	0 %	384359360
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