MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium difficile BI1

Total Repeats: 10591

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017179	ATT	2	6	1383	1388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017179	TTA	2	6	1473	1478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017179	CAA	2	6	1486	1491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017179	CTA	3	9	1495	1503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017179	TAC	2	6	1505	1510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017179	AGG	2	6	1547	1552	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017179	AGG	2	6	2792	2797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017179	GGC	2	6	10849	10854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017179	GCG	2	6	10897	10902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017179	ATA	2	6	10975	10980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017179	CGA	2	6	11075	11080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017179	GCA	2	6	11149	11154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017179	GCA	2	6	11189	11194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017179	CGC	2	6	11196	11201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_017179	GAG	2	6	11264	11269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017179	CAG	2	6	11292	11297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017179	GTA	2	6	11398	11403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017179	AGG	2	6	11481	11486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017179	GGC	2	6	11502	11507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017179	GAA	2	6	11744	11749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017179	GGT	2	6	11820	11825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017179	GTC	2	6	11834	11839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017179	CAT	2	6	11902	11907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017179	GGA	2	6	11946	11951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017179	ATC	2	6	11970	11975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017179	GTA	2	6	12015	12020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017179	TGC	2	6	12136	12141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017179	CAC	2	6	12181	12186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_017179	GAA	2	6	12227	12232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017179	GTC	2	6	12233	12238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017179	CCT	2	6	12307	12312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_017179	TTA	2	6	12605	12610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017179	GCG	2	6	12842	12847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017179	CAC	2	6	12948	12953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_017179	AGG	2	6	13039	13044	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017179	ACC	2	6	13046	13051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_017179	TAC	2	6	13065	13070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017179	AGC	2	6	13702	13707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017179	TAC	2	6	13780	13785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017179	ATG	2	6	13805	13810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017179	ACA	2	6	14005	14010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017179	TAC	2	6	14025	14030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017179	TAG	2	6	14167	14172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017179	TGT	2	6	14285	14290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017179	CCA	2	6	14336	14341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_017179	CGG	2	6	14501	14506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017179	CAA	2	6	14595	14600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017179	TAC	2	6	14701	14706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017179	ACC	2	6	14772	14777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_017179	GTA	2	6	14781	14786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017179	GGT	2	6	14996	15001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017179	TCA	2	6	15111	15116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017179	GTA	2	6	15129	15134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017179	CGT	2	6	15191	15196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017179	GCA	2	6	15446	15451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017179	ATT	2	6	15497	15502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017179	TTA	2	6	15645	15650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017179	AAT	2	6	15692	15697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017179	TGG	2	6	15775	15780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017179	CAC	2	6	15903	15908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_017179	ATT	2	6	15911	15916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017179	CAC	2	6	15991	15996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_017179	AAT	2	6	15997	16002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017179	GGC	2	6	16142	16147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017179	GCG	2	6	16190	16195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017179	ATA	2	6	16268	16273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017179	CGA	2	6	16368	16373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017179	GCA	2	6	16442	16447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017179	GCA	2	6	16482	16487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017179	CGC	2	6	16489	16494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_017179	GAG	2	6	16557	16562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017179	CAG	2	6	16585	16590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017179	GTA	2	6	16691	16696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017179	AGG	2	6	16774	16779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017179	GGC	2	6	16795	16800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017179	GAA	2	6	17037	17042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017179	GGT	2	6	17113	17118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017179	GTC	2	6	17127	17132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017179	CAT	2	6	17195	17200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017179	GGA	2	6	17239	17244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017179	ATC	2	6	17263	17268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017179	GTA	2	6	17308	17313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017179	TGC	2	6	17429	17434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017179	CAC	2	6	17474	17479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_017179	GAA	2	6	17520	17525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017179	GTC	2	6	17526	17531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017179	CCT	2	6	17600	17605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_017179	CTC	2	6	17723	17728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_017179	CCA	2	6	17733	17738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_017179	TAG	2	6	17773	17778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017179	TTA	2	6	17996	18001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017179	GCG	2	6	18233	18238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017179	CAC	2	6	18339	18344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_017179	AGG	2	6	18430	18435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017179	ACC	2	6	18437	18442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_017179	TAC	2	6	18456	18461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017179	AGC	2	6	19093	19098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017179	TAC	2	6	19171	19176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017179	ATG	2	6	19196	19201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017179	ACA	2	6	19396	19401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017179	TAC	2	6	19416	19421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017179	TAG	2	6	19558	19563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017179	TGT	2	6	19676	19681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017179	CCA	2	6	19727	19732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_017179	CGG	2	6	19892	19897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017179	CAA	2	6	19986	19991	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017179	TAC	2	6	20092	20097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017179	ACC	2	6	20163	20168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_017179	GTA	2	6	20172	20177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017179	GGT	2	6	20387	20392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017179	TCA	2	6	20502	20507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017179	GTA	2	6	20520	20525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017179	CGT	2	6	20582	20587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017179	GTT	2	6	20685	20690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017179	GCA	2	6	20837	20842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017179	ATT	2	6	20887	20892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017179	TGG	2	6	21079	21084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017179	TAA	2	6	21179	21184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017179	AAT	2	6	22711	22716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017179	TAT	2	6	23075	23080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017179	ATT	2	6	23085	23090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017179	AGG	2	6	23091	23096	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017179	TGA	2	6	24408	24413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017179	ATT	2	6	24457	24462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017179	CAG	2	6	24502	24507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017179	TCA	2	6	24513	24518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017179	ATT	2	6	24567	24572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017179	TAA	2	6	24608	24613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017179	GGA	2	6	24686	24691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017179	GCC	2	6	25369	25374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_017179	GTG	2	6	25383	25388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017179	TAT	2	6	27267	27272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017179	ATA	3	9	27276	27284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017179	AGG	2	6	27301	27306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017179	TCT	2	6	28361	28366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017179	TGT	2	6	28380	28385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017179	AAT	2	6	28647	28652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017179	ATA	2	6	28677	28682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017179	TCC	2	6	29925	29930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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