MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Clostridium difficile BI1

Total Repeats: 54009

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017179	TAA	2	6	38	43	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359320
2	NC_017179	TAA	2	6	144	149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359320
3	NC_017179	TGC	2	6	366	371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384359320
4	NC_017179	GGA	2	6	427	432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384359320
5	NC_017179	TCA	2	6	471	476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384359320
6	NC_017179	AGT	2	6	504	509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384359320
7	NC_017179	TTC	2	6	516	521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384359320
8	NC_017179	GAA	2	6	571	576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384359320
9	NC_017179	CGA	2	6	615	620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384359320
10	NC_017179	AAG	2	6	653	658	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384359320
11	NC_017179	AGA	2	6	747	752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384359320
12	NC_017179	TTC	2	6	951	956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384359320
13	NC_017179	AAC	2	6	1014	1019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384359320
14	NC_017179	GAA	2	6	1030	1035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384359320
15	NC_017179	TCT	2	6	1066	1071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384359320
16	NC_017179	ACA	2	6	1219	1224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384359320
17	NC_017179	AGA	2	6	1260	1265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384359320
18	NC_017179	GAA	2	6	1270	1275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384359320
19	NC_017179	AAT	2	6	1567	1572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359321
20	NC_017179	ACA	2	6	1634	1639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384359321
21	NC_017179	ATT	2	6	1645	1650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359321
22	NC_017179	AGA	2	6	1672	1677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384359321
23	NC_017179	ATG	2	6	1701	1706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384359321
24	NC_017179	TGT	3	9	1759	1767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384359321
25	NC_017179	TTG	2	6	1815	1820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384359321
26	NC_017179	ATA	2	6	1842	1847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359321
27	NC_017179	GCA	2	6	1892	1897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384359321
28	NC_017179	GAA	2	6	1928	1933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384359321
29	NC_017179	TAG	2	6	2064	2069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384359321
30	NC_017179	GTT	2	6	2100	2105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384359321
31	NC_017179	ATT	2	6	2249	2254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359321
32	NC_017179	CAG	2	6	2314	2319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384359321
33	NC_017179	GAA	2	6	2465	2470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384359321
34	NC_017179	TAC	2	6	2575	2580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384359321
35	NC_017179	GAT	2	6	2612	2617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384359321
36	NC_017179	ATC	2	6	2653	2658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384359321
37	NC_017179	TAT	2	6	2801	2806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359322
38	NC_017179	AGG	2	6	2879	2884	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384359322
39	NC_017179	AAG	2	6	2905	2910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384359322
40	NC_017179	ATG	2	6	2926	2931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384359322
41	NC_017179	AAG	2	6	2942	2947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384359322
42	NC_017179	TTG	2	6	3111	3116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384359323
43	NC_017179	TAG	2	6	3144	3149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384359323
44	NC_017179	GGA	2	6	3239	3244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384359323
45	NC_017179	ATA	2	6	3258	3263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359323
46	NC_017179	ATT	2	6	3284	3289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359323
47	NC_017179	ACT	2	6	3346	3351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384359323
48	NC_017179	TGT	2	6	3364	3369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384359323
49	NC_017179	TAA	2	6	3487	3492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359323
50	NC_017179	TGA	2	6	3535	3540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384359323
51	NC_017179	TTA	2	6	3545	3550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359323
52	NC_017179	ATG	2	6	3558	3563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384359323
53	NC_017179	TGA	2	6	3712	3717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384359323
54	NC_017179	CAA	2	6	3875	3880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384359323
55	NC_017179	TAA	2	6	3921	3926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359323
56	NC_017179	GAA	2	6	3938	3943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384359323
57	NC_017179	GAT	2	6	3962	3967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384359323
58	NC_017179	AAT	2	6	4010	4015	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359323
59	NC_017179	TGA	2	6	4072	4077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384359323
60	NC_017179	TTA	2	6	4116	4121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359323
61	NC_017179	GGA	2	6	4133	4138	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384359323
62	NC_017179	GTA	2	6	4227	4232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384359324
63	NC_017179	ATA	2	6	4275	4280	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359324
64	NC_017179	AGG	2	6	4441	4446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384359324
65	NC_017179	GGA	2	6	4460	4465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384359324
66	NC_017179	AGT	2	6	4606	4611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384359324
67	NC_017179	TGA	2	6	4669	4674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384359324
68	NC_017179	GGT	2	6	4802	4807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384359324
69	NC_017179	ATG	2	6	4854	4859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384359324
70	NC_017179	TGA	2	6	4885	4890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384359324
71	NC_017179	GGT	2	6	4976	4981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384359324
72	NC_017179	AGC	2	6	5002	5007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384359324
73	NC_017179	ATG	2	6	5061	5066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384359324
74	NC_017179	CAG	2	6	5103	5108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384359324
75	NC_017179	TGA	2	6	5206	5211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384359324
76	NC_017179	AGA	2	6	5227	5232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384359324
77	NC_017179	TAT	2	6	5667	5672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359324
78	NC_017179	TTC	2	6	5678	5683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384359324
79	NC_017179	GCA	2	6	5726	5731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384359324
80	NC_017179	AAG	2	6	5762	5767	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384359324
81	NC_017179	TTA	2	6	5804	5809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359324
82	NC_017179	GAA	2	6	5820	5825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384359324
83	NC_017179	AAC	2	6	5887	5892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384359324
84	NC_017179	TTA	2	6	5915	5920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359324
85	NC_017179	AGA	2	6	5932	5937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384359324
86	NC_017179	TGC	2	6	5938	5943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384359324
87	NC_017179	AGA	2	6	6007	6012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384359324
88	NC_017179	GAA	2	6	6069	6074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384359325
89	NC_017179	GAA	2	6	6105	6110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384359325
90	NC_017179	ATT	2	6	6130	6135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359325
91	NC_017179	AGA	2	6	6198	6203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384359325
92	NC_017179	TTG	2	6	6268	6273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384359325
93	NC_017179	CTG	2	6	6310	6315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384359325
94	NC_017179	TAT	2	6	6318	6323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359325
95	NC_017179	TAG	2	6	6367	6372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384359325
96	NC_017179	GCT	2	6	6414	6419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384359325
97	NC_017179	ACT	2	6	6461	6466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384359325
98	NC_017179	TGA	2	6	6509	6514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384359325
99	NC_017179	TTA	2	6	6558	6563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359325
100	NC_017179	GAT	2	6	6678	6683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384359325
101	NC_017179	TAA	2	6	6685	6690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359325
102	NC_017179	AGA	2	6	6806	6811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384359325
103	NC_017179	ATA	2	6	6834	6839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359325
104	NC_017179	AAT	2	6	7011	7016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359325
105	NC_017179	TAA	2	6	7054	7059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359325
106	NC_017179	AAG	2	6	7132	7137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384359325
107	NC_017179	TGT	2	6	7139	7144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384359325
108	NC_017179	AAG	2	6	7148	7153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384359325
109	NC_017179	ATA	2	6	7222	7227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359325
110	NC_017179	AAG	2	6	7270	7275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384359325
111	NC_017179	AAG	2	6	7404	7409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384359325
112	NC_017179	TGA	2	6	7436	7441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384359325
113	NC_017179	TAA	2	6	7459	7464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359325
114	NC_017179	AAT	2	6	7478	7483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359325
115	NC_017179	TGA	2	6	7499	7504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384359325
116	NC_017179	TGA	2	6	7562	7567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384359325
117	NC_017179	AGA	3	9	7676	7684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384359325
118	NC_017179	TAG	2	6	7718	7723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384359325
119	NC_017179	TAT	2	6	7726	7731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359325
120	NC_017179	CAG	2	6	7834	7839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384359325
121	NC_017179	ATG	2	6	7876	7881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384359325
122	NC_017179	TTA	2	6	7893	7898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359325
123	NC_017179	GAT	3	9	7989	7997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384359325
124	NC_017179	AAG	2	6	8032	8037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384359325
125	NC_017179	AAG	2	6	8053	8058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384359325
126	NC_017179	TGA	2	6	8075	8080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384359325
127	NC_017179	AGA	2	6	8141	8146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384359325
128	NC_017179	TGT	2	6	8150	8155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384359325
129	NC_017179	AGA	2	6	8231	8236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384359325
130	NC_017179	GAT	2	6	8331	8336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384359325
131	NC_017179	TTA	2	6	8368	8373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359325
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