MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Clostridium difficile BI1

Total Repeats: 52

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017177	ATCAGA	2	12	1126	1137	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_017177	AAATTA	2	12	3292	3303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017177	ATATTA	2	12	5442	5453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017177	TAAATT	2	12	10636	10647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017177	CCTAAA	2	12	13831	13842	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017177	AATGAA	2	12	25951	25962	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017177	ATCATA	2	12	32592	32603	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_017177	TCCTTT	2	12	36062	36073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017177	ATATAA	2	12	46114	46125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017177	GCTAAA	2	12	47933	47944	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_017177	ATATCT	2	12	49930	49941	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017177	ATTTAA	2	12	57669	57680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017177	AAATAT	2	12	61110	61121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017177	TTATTT	2	12	85246	85257	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017177	TCTTAA	2	12	87798	87809	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_017177	TATTTT	2	12	92897	92908	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017177	ATTTTA	2	12	95179	95190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017177	ATAATT	2	12	95244	95255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017177	TTTTAT	2	12	100653	100664	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017177	CTTTAT	2	12	104506	104517	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017177	AATATT	2	12	107638	107649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017177	ACTTTT	2	12	108328	108339	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_017177	AAAATG	2	12	110951	110962	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017177	TATTTT	2	12	120452	120463	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017177	ATTTAA	2	12	134261	134272	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017177	TATTTA	2	12	138919	138930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017177	ATTTAA	2	12	142829	142840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017177	CCTTCA	2	12	145007	145018	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_017177	TTTTTA	2	12	156060	156071	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017177	TGATAT	2	12	158614	158625	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017177	TTGTAT	2	12	167983	167994	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017177	TGTTTT	2	12	168974	168985	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017177	TGGAAA	2	12	169039	169050	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017177	TCCATT	2	12	176503	176514	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017177	TAATAT	2	12	186530	186541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017177	TTTATA	2	12	187701	187712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017177	TTTTTA	2	12	192151	192162	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017177	TAAAAG	2	12	195820	195831	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017177	TGATTT	2	12	200008	200019	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017177	ATTTTA	2	12	215861	215872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017177	TATAAT	2	12	217692	217703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017177	CTATTT	2	12	230540	230551	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_017177	TAAAAA	2	12	232280	232291	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017177	ATTTTT	2	12	232313	232324	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017177	AAAAGC	2	12	253487	253498	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_017177	AAATAG	2	12	253782	253793	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017177	AAATGA	2	12	253852	253863	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017177	AATTAG	2	12	267944	267955	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017177	TATTGT	2	12	285183	285194	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017177	ATAAAA	2	12	289945	289956	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017177	ATAAAT	2	12	293540	293551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017177	CTTATT	2	12	300223	300234	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.