Penta-nucleotide Coding Repeats of Clostridium difficile BI1

Total Repeats: 301

Go To Repeat Summary Page

Download The Result in

S.No.Genome IDMotifIterationsLengthStartEndA%T%G%C% Protein ID
1NC_017177ATATA2102824283360 %40 %0 %0 %384359041
2NC_017177TTCTT210359936080 %80 %0 %20 %384359042
3NC_017177CTTTT210401740260 %80 %0 %20 %384359042
4NC_017177AATTA2104782479160 %40 %0 %0 %384359043
5NC_017177TCTAT2106802681120 %60 %0 %20 %384359046
6NC_017177TAAAT2106818682760 %40 %0 %0 %384359046
7NC_017177ATAAG2106928693760 %20 %20 %0 %384359046
8NC_017177AAGAA2107029703880 %0 %20 %0 %384359046
9NC_017177TTAAA2107799780860 %40 %0 %0 %384359047
10NC_017177AAAAT2109226923580 %20 %0 %0 %384359048
11NC_017177AATAA2109949995880 %20 %0 %0 %384359050
12NC_017177TAAAT210100831009260 %40 %0 %0 %384359050
13NC_017177AATAG210102731028260 %20 %20 %0 %384359050
14NC_017177TTAAT210103341034340 %60 %0 %0 %384359050
15NC_017177TCCTT21011120111290 %60 %0 %40 %384359051
16NC_017177GAATT210113251133440 %40 %20 %0 %384359051
17NC_017177ATTTT210116341164320 %80 %0 %0 %384359051
18NC_017177TAAAA210156331564280 %20 %0 %0 %384359056
19NC_017177ATTTA210158171582640 %60 %0 %0 %384359057
20NC_017177GATTT210165121652120 %60 %20 %0 %384359058
21NC_017177ATATT210166891669840 %60 %0 %0 %384359058
22NC_017177TATTT210168251683420 %80 %0 %0 %384359058
23NC_017177AATAA210178881789780 %20 %0 %0 %384359058
24NC_017177AAGTG210193391934840 %20 %40 %0 %384359058
25NC_017177AAGAA210205272053680 %0 %20 %0 %384359058
26NC_017177ATAAA210210812109080 %20 %0 %0 %384359058
27NC_017177AAATA210219192192880 %20 %0 %0 %384359058
28NC_017177TTAAA210243482435760 %40 %0 %0 %384359059
29NC_017177TCTTT21024518245270 %80 %0 %20 %384359059
30NC_017177TTTTG21025768257770 %80 %20 %0 %384359060
31NC_017177TTATA210276042761340 %60 %0 %0 %384359063
32NC_017177TTTAA210283282833740 %60 %0 %0 %384359063
33NC_017177TAATA210303153032460 %40 %0 %0 %384359068
34NC_017177ATAGA210320793208860 %20 %20 %0 %384359071
35NC_017177AATTT210330433305240 %60 %0 %0 %384359072
36NC_017177ATTTA210335163352540 %60 %0 %0 %384359073
37NC_017177TGTTT21035413354220 %80 %20 %0 %384359074
38NC_017177GTTTA210358533586220 %60 %20 %0 %384359074
39NC_017177ATATA210383563836560 %40 %0 %0 %384359077
40NC_017177ATATT210383793838840 %60 %0 %0 %384359077
41NC_017177AAATT210423264233560 %40 %0 %0 %384359081
42NC_017177AATGA210425064251560 %20 %20 %0 %384359081
43NC_017177TATTT210441654417420 %80 %0 %0 %384359082
44NC_017177AATTT210444224443140 %60 %0 %0 %384359082
45NC_017177GAAAT210466184662760 %20 %20 %0 %384359084
46NC_017177AAAAG210467004670980 %0 %20 %0 %384359084
47NC_017177GAAAT210472674727660 %20 %20 %0 %384359085
48NC_017177CTAAA210488994890860 %20 %0 %20 %384359087
49NC_017177GTTTT21049145491540 %80 %20 %0 %384359087
50NC_017177ATTAA210505775058660 %40 %0 %0 %384359088
51NC_017177GTATA210507385074740 %40 %20 %0 %384359088
52NC_017177ACTTA210541955420440 %40 %0 %20 %384359092
53NC_017177TCATT210545125452120 %60 %0 %20 %384359092
54NC_017177GAAGA210556715568060 %0 %40 %0 %384359094
55NC_017177AATTA210571705717960 %40 %0 %0 %384359094
56NC_017177ATATA210576405764960 %40 %0 %0 %384359094
57NC_017177AGAAA210581335814280 %0 %20 %0 %384359095
58NC_017177AGTTA210581685817740 %40 %20 %0 %384359095
59NC_017177TTAGA210585035851240 %40 %20 %0 %384359095
60NC_017177TTTAA210625506255940 %60 %0 %0 %384359099
61NC_017177TATAA210640386404760 %40 %0 %0 %384359099
62NC_017177ATAAA210655496555880 %20 %0 %0 %384359099
63NC_017177CAAAA210660436605280 %0 %0 %20 %384359100
64NC_017177AGATA210666206662960 %20 %20 %0 %384359100
65NC_017177TTAAA210676156762460 %40 %0 %0 %384359101
66NC_017177AAAGA210678886789780 %0 %20 %0 %384359102
67NC_017177AAGTT210685406854940 %40 %20 %0 %384359102
68NC_017177AAATT210697166972560 %40 %0 %0 %384359103
69NC_017177TACCT210724467245520 %40 %0 %40 %384359107
70NC_017177TTTCT21072476724850 %80 %0 %20 %384359107
71NC_017177GATTT210727407274920 %60 %20 %0 %384359108
72NC_017177TTAAC210738907389940 %40 %0 %20 %384359112
73NC_017177CATTT210747257473420 %60 %0 %20 %384359112
74NC_017177TTTAT210763447635320 %80 %0 %0 %384359115
75NC_017177AAGAC210765117652060 %0 %20 %20 %384359115
76NC_017177CAAAT210770917710060 %20 %0 %20 %384359115
77NC_017177ATGTT210772007720920 %60 %20 %0 %384359115
78NC_017177TATTT210781017811020 %80 %0 %0 %384359115
79NC_017177ATTAA210782377824660 %40 %0 %0 %384359115
80NC_017177AAATA210790797908880 %20 %0 %0 %384359116
81NC_017177AATAA210793777938680 %20 %0 %0 %384359117
82NC_017177AATTT210798637987240 %60 %0 %0 %384359117
83NC_017177TAAAT210800748008360 %40 %0 %0 %384359117
84NC_017177ATTGT210807058071420 %60 %20 %0 %384359118
85NC_017177ATGTT210832828329120 %60 %20 %0 %384359120
86NC_017177GTATA210838268383540 %40 %20 %0 %384359121
87NC_017177AAATA210839618397080 %20 %0 %0 %384359121
88NC_017177ATTTT210842268423520 %80 %0 %0 %384359121
89NC_017177ATAAA210857668577580 %20 %0 %0 %384359124
90NC_017177TAAAT210862438625260 %40 %0 %0 %384359125
91NC_017177AAAAT210865098651880 %20 %0 %0 %384359125
92NC_017177TTGGT21087369873780 %60 %40 %0 %384359126
93NC_017177TGTAT210889538896220 %60 %20 %0 %384359127
94NC_017177AAATA210914549146380 %20 %0 %0 %384359129
95NC_017177TAAAT210915859159460 %40 %0 %0 %384359129
96NC_017177TTGTT21091644916530 %80 %20 %0 %384359129
97NC_017177ATTAT210930439305240 %60 %0 %0 %384359132
98NC_017177TATGT210932899329820 %60 %20 %0 %384359132
99NC_017177AAATA210945929460180 %20 %0 %0 %384359135
100NC_017177AGTTA210949589496740 %40 %20 %0 %384359135
101NC_017177CAAAT210950879509660 %20 %0 %20 %384359135
102NC_017177TATCT210953729538120 %60 %0 %20 %384359136
103NC_017177ATTTT210963879639620 %80 %0 %0 %384359137
104NC_017177CTTGT21096524965330 %60 %20 %20 %384359137
105NC_017177AATAA210974039741280 %20 %0 %0 %384359139
106NC_017177GTTTT21098502985110 %80 %20 %0 %384359140
107NC_017177AATTT210988419885040 %60 %0 %0 %384359141
108NC_017177TAAGA210990229903160 %20 %20 %0 %384359141
109NC_017177ATTTA210991969920540 %60 %0 %0 %384359142
110NC_017177TTTAA210997169972540 %60 %0 %0 %384359142
111NC_017177ATATT210998169982540 %60 %0 %0 %384359142
112NC_017177TTAAT21010016210017140 %60 %0 %0 %384359143
113NC_017177AAATC21010085710086660 %20 %0 %20 %384359144
114NC_017177CCATT21010256410257320 %40 %0 %40 %384359145
115NC_017177CATTT21010327910328820 %60 %0 %20 %384359145
116NC_017177ACCAT21010373910374840 %20 %0 %40 %384359145
117NC_017177TCTGT2101043191043280 %60 %20 %20 %384359145
118NC_017177AAAGC21010504810505760 %0 %20 %20 %384359146
119NC_017177GATTT21010614410615320 %60 %20 %0 %384359147
120NC_017177AAATT21010630210631160 %40 %0 %0 %384359147
121NC_017177TTAAT21010680010680940 %60 %0 %0 %384359147
122NC_017177ATTTT21010728710729620 %80 %0 %0 %384359148
123NC_017177TTCTT2101080411080500 %80 %0 %20 %384359149
124NC_017177AAATA21010810310811280 %20 %0 %0 %384359149
125NC_017177TAAAT21010840210841160 %40 %0 %0 %384359150
126NC_017177AATTA21011014811015760 %40 %0 %0 %384359151
127NC_017177TCTTT2101122831122920 %80 %0 %20 %384359155
128NC_017177TGTTT2101132661132750 %80 %20 %0 %384359156
129NC_017177GTTTT2101134731134820 %80 %20 %0 %384359156
130NC_017177TATAT21011776811777740 %60 %0 %0 %384359158
131NC_017177TCTTA21011866511867420 %60 %0 %20 %384359158
132NC_017177TTTAC21011978211979120 %60 %0 %20 %384359158
133NC_017177TATCT21012366712367620 %60 %0 %20 %384359161
134NC_017177TTGAT21012562512563420 %60 %20 %0 %384359164
135NC_017177TCTGT2101260131260220 %60 %20 %20 %384359164
136NC_017177TCTAT21012658612659520 %60 %0 %20 %384359164
137NC_017177TTGAT21012778112779020 %60 %20 %0 %384359165
138NC_017177AAATT21012804312805260 %40 %0 %0 %384359165
139NC_017177AAATC21012903512904460 %20 %0 %20 %384359166
140NC_017177AGCCA21012952312953240 %0 %20 %40 %384359166
141NC_017177AGCCA21013551313552240 %0 %20 %40 %384359170
142NC_017177CTTTA21013729813730720 %60 %0 %20 %384359171
143NC_017177TAAAT21013805913806860 %40 %0 %0 %384359172
144NC_017177CAAAA21014197014197980 %0 %0 %20 %384359175
145NC_017177TATTT21014220514221420 %80 %0 %0 %384359175
146NC_017177AAATT21014232614233560 %40 %0 %0 %384359175
147NC_017177TTTAA21014878614879540 %60 %0 %0 %384359178
148NC_017177TATTT21015762715763620 %80 %0 %0 %384359186
149NC_017177TACAA21015827015827960 %20 %0 %20 %384359187
150NC_017177TCTTA21016294316295220 %60 %0 %20 %384359191
151NC_017177TCTCT2101630891630980 %60 %0 %40 %384359191
152NC_017177TTTCT2101643461643550 %80 %0 %20 %384359192
153NC_017177CCATT21016709616710520 %40 %0 %40 %384359194
154NC_017177AAATC21016810416811360 %20 %0 %20 %384359195
155NC_017177CTATA21016912816913740 %40 %0 %20 %384359196
156NC_017177TAAAT21017368917369860 %40 %0 %0 %384359202
157NC_017177ATTTT21017551017551920 %80 %0 %0 %384359204
158NC_017177CCATT21017638017638920 %40 %0 %40 %384359206
159NC_017177TTAAT21017668917669840 %60 %0 %0 %384359207
160NC_017177CTTTT2101770751770840 %80 %0 %20 %384359208
161NC_017177GTCTT2101792071792160 %60 %20 %20 %384359211
162NC_017177ATGTT21018057518058420 %60 %20 %0 %384359212
163NC_017177TCTTT2101810991811080 %80 %0 %20 %384359213
164NC_017177AAATC21018176418177360 %20 %0 %20 %384359214
165NC_017177ACATA21018270318271260 %20 %0 %20 %384359214
166NC_017177TGTTT2101830861830950 %80 %20 %0 %384359214
167NC_017177GTTTT2101831191831280 %80 %20 %0 %384359214
168NC_017177GCCAT21018317718318620 %20 %20 %40 %384359214
169NC_017177TTTTC2101863391863480 %80 %0 %20 %384359216
170NC_017177TGTAT21018674918675820 %60 %20 %0 %384359217
171NC_017177TTCTA21018900518901420 %60 %0 %20 %384359219
172NC_017177AAAAT21018903518904480 %20 %0 %0 %384359219
173NC_017177AAAAT21019637519638480 %20 %0 %0 %384359226
174NC_017177TAAAT21019647919648860 %40 %0 %0 %384359226
175NC_017177CTATC21019679319680220 %40 %0 %40 %384359227
176NC_017177ACTTA21019732519733440 %40 %0 %20 %384359227
177NC_017177AATGG21019871519872440 %20 %40 %0 %384359228
178NC_017177CTTTA21019878019878920 %60 %0 %20 %384359228
179NC_017177AACAA21019883919884880 %0 %0 %20 %384359228
180NC_017177AATAT21020169120170060 %40 %0 %0 %384359230
181NC_017177TTTCT2102029262029350 %80 %0 %20 %384359230
182NC_017177AAGAA21020321020321980 %0 %20 %0 %384359230
183NC_017177TTTTA21020355320356220 %80 %0 %0 %384359231
184NC_017177CATTT21020381920382820 %60 %0 %20 %384359231
185NC_017177TCATT21020432520433420 %60 %0 %20 %384359231
186NC_017177TGGTT2102052332052420 %60 %40 %0 %384359231
187NC_017177AAATA21020608620609580 %20 %0 %0 %384359231
188NC_017177TATCT21020774420775320 %60 %0 %20 %384359232
189NC_017177AATTT21020912920913840 %60 %0 %0 %384359233
190NC_017177AAAAC21020932920933880 %0 %0 %20 %384359234
191NC_017177TTTTC2102104872104960 %80 %0 %20 %384359236
192NC_017177TTTCT2102105562105650 %80 %0 %20 %384359236
193NC_017177ATTCT21021155221156120 %60 %0 %20 %384359238
194NC_017177ATATA21021265121266060 %40 %0 %0 %384359239
195NC_017177ATTTA21021384021384940 %60 %0 %0 %384359241
196NC_017177GCAAA21021389821390760 %0 %20 %20 %384359241
197NC_017177TCTTT2102151242151330 %80 %0 %20 %384359241
198NC_017177TATGT21021522821523720 %60 %20 %0 %384359242
199NC_017177AAATT21021628921629860 %40 %0 %0 %384359243
200NC_017177AAATT21021647121648060 %40 %0 %0 %384359244
201NC_017177CTTTG2102174522174610 %60 %20 %20 %384359245
202NC_017177TATCT21021785921786820 %60 %0 %20 %384359246
203NC_017177CCATC21021793621794520 %20 %0 %60 %384359246
204NC_017177AATTT21021841121842040 %60 %0 %0 %384359247
205NC_017177ATTAG21021873021873940 %40 %20 %0 %384359248
206NC_017177CTATA21021874021874940 %40 %0 %20 %384359248
207NC_017177TTTCT2102193452193540 %80 %0 %20 %384359249
208NC_017177TACTT21022002422003320 %60 %0 %20 %384359249
209NC_017177AAATT21022028722029660 %40 %0 %0 %384359250
210NC_017177ATTTT21022116322117220 %80 %0 %0 %384359250
211NC_017177TTTCA21022376322377220 %60 %0 %20 %384359252
212NC_017177TTTAT21022458822459720 %80 %0 %0 %384359253
213NC_017177CTTAG21022581222582120 %40 %20 %20 %384359253
214NC_017177GGAAA21022582222583160 %0 %40 %0 %384359253
215NC_017177CATCT21022734022734920 %40 %0 %40 %384359255
216NC_017177AATAG21022943822944760 %20 %20 %0 %384359257
217NC_017177GAAAA21022969022969980 %0 %20 %0 %384359257
218NC_017177TATTC21023105323106220 %60 %0 %20 %384359258
219NC_017177AGAAA21023201023201980 %0 %20 %0 %384359259
220NC_017177TAAAT21023223823224760 %40 %0 %0 %384359259
221NC_017177AAAAG21023299123300080 %0 %20 %0 %384359260
222NC_017177ATTTA21023461423462340 %60 %0 %0 %384359263
223NC_017177ATTTA21023467723468640 %60 %0 %0 %384359263
224NC_017177TTTTC2102354012354100 %80 %0 %20 %384359263
225NC_017177AAATA21023624323625280 %20 %0 %0 %384359263
226NC_017177CTTTT2102390802390890 %80 %0 %20 %384359264
227NC_017177CTTTT2102410442410530 %80 %0 %20 %384359265
228NC_017177AAAAC21024110624111580 %0 %0 %20 %384359265
229NC_017177CCAAC21024258524259440 %0 %0 %60 %384359266
230NC_017177ATTTT21024293224294120 %80 %0 %0 %384359266
231NC_017177TCATC21024327124328020 %40 %0 %40 %384359267
232NC_017177TGCTA21024356324357220 %40 %20 %20 %384359267
233NC_017177TTAAT21024390124391040 %60 %0 %0 %384359267
234NC_017177GTTTT2102441422441510 %80 %20 %0 %384359267
235NC_017177AAAAT21024497324498280 %20 %0 %0 %384359268
236NC_017177TCAAA21024561024561960 %20 %0 %20 %384359269
237NC_017177TTTAT21024618424619320 %80 %0 %0 %384359269
238NC_017177TAAAA21024644524645480 %20 %0 %0 %384359269
239NC_017177TTTTA21024647624648520 %80 %0 %0 %384359270
240NC_017177ATAGT21024810424811340 %40 %20 %0 %384359271
241NC_017177TGGAA21024819624820540 %20 %40 %0 %384359271
242NC_017177CATCT21024833824834720 %40 %0 %40 %384359272
243NC_017177TTTGC2102501952502040 %60 %20 %20 %384359275
244NC_017177TAAAA21025195325196280 %20 %0 %0 %384359277
245NC_017177TATTT21025209625210520 %80 %0 %0 %384359277
246NC_017177CATAG21025567925568840 %20 %20 %20 %384359279
247NC_017177TTTTA21025607225608120 %80 %0 %0 %384359279
248NC_017177AATTT21025689525690440 %60 %0 %0 %384359279
249NC_017177GCTTT2102572832572920 %60 %20 %20 %384359279
250NC_017177CCTTC2102575222575310 %40 %0 %60 %384359280
251NC_017177TATTT21025760125761020 %80 %0 %0 %384359280
252NC_017177TAATA21025768125769060 %40 %0 %0 %384359280
253NC_017177ATCTA21025819625820540 %40 %0 %20 %384359281
254NC_017177AAATG21025835525836460 %20 %20 %0 %384359281
255NC_017177AGATA21026022926023860 %20 %20 %0 %384359283
256NC_017177AATTA21026058626059560 %40 %0 %0 %384359283
257NC_017177ACAAA21026213926214880 %0 %0 %20 %384359285
258NC_017177TATAA21026254826255760 %40 %0 %0 %384359285
259NC_017177TAATT21026440126441040 %60 %0 %0 %384359287
260NC_017177TCTTT2102644112644200 %80 %0 %20 %384359287
261NC_017177TAAAT21026554826555760 %40 %0 %0 %384359289
262NC_017177CTTTT2102686182686270 %80 %0 %20 %384359290
263NC_017177AACAA21026879826880780 %0 %0 %20 %384359290
264NC_017177ATTTT21027071827072720 %80 %0 %0 %384359291
265NC_017177AAAAC21027094427095380 %0 %0 %20 %384359291
266NC_017177TCAGT21027176227177120 %40 %20 %20 %384359291
267NC_017177ATTAT21027221827222740 %60 %0 %0 %384359291
268NC_017177TAAAA21027235927236880 %20 %0 %0 %384359292
269NC_017177TAAAT21027357727358660 %40 %0 %0 %384359294
270NC_017177AATTT21027371927372840 %60 %0 %0 %384359294
271NC_017177GAAGT21027515327516240 %20 %40 %0 %384359295
272NC_017177AAAAG21027565927566880 %0 %20 %0 %384359295
273NC_017177AAGAA21027599427600380 %0 %20 %0 %384359295
274NC_017177ATTAA21027606727607660 %40 %0 %0 %384359295
275NC_017177AGAAA21027615027615980 %0 %20 %0 %384359295
276NC_017177TAAAA21027622827623780 %20 %0 %0 %384359295
277NC_017177TTAAG21027666227667140 %40 %20 %0 %384359295
278NC_017177AACTA21027873727874660 %20 %0 %20 %384359297
279NC_017177GAATT21028176428177340 %40 %20 %0 %384359300
280NC_017177AATAT21028352228353160 %40 %0 %0 %384359303
281NC_017177TAAAA21028558428559380 %20 %0 %0 %384359304
282NC_017177AATTT21028847128848040 %60 %0 %0 %384359306
283NC_017177AAAAT21028875228876180 %20 %0 %0 %384359307
284NC_017177TTTAC21029027329028220 %60 %0 %20 %384359309
285NC_017177AAAAC21029043429044380 %0 %0 %20 %384359309
286NC_017177AATTT21029047529048440 %60 %0 %0 %384359309
287NC_017177AAAAT21029099729100680 %20 %0 %0 %384359310
288NC_017177ATTTA21029188129189040 %60 %0 %0 %384359312
289NC_017177GCTTT2102923472923560 %60 %20 %20 %384359312
290NC_017177AAAAC21029259529260480 %0 %0 %20 %384359312
291NC_017177AAAAC21029266129267080 %0 %0 %20 %384359312
292NC_017177AAAAC21029272729273680 %0 %0 %20 %384359312
293NC_017177TTAAT21029359229360140 %60 %0 %0 %384359313
294NC_017177CAATC21029378929379840 %20 %0 %40 %384359313
295NC_017177ATATA21029385429386360 %40 %0 %0 %384359313
296NC_017177AAAAT21029430129431080 %20 %0 %0 %384359314
297NC_017177ATAAA21029444529445480 %20 %0 %0 %384359314
298NC_017177TTTAA21029542629543540 %60 %0 %0 %384359315
299NC_017177TTATT21029579629580520 %80 %0 %0 %384359315
300NC_017177ATTTA21029748929749840 %60 %0 %0 %384359315
301NC_017177ATAAA21029764129765080 %20 %0 %0 %384359315