MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Repeats of Clostridium difficile BI1

Total Repeats: 1241

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017177	TTTA	2	8	3	10	25 %	75 %	0 %	0 %	384359038
2	NC_017177	TTTG	2	8	540	547	0 %	75 %	25 %	0 %	384359039
3	NC_017177	TGTT	2	8	606	613	0 %	75 %	25 %	0 %	384359039
4	NC_017177	AATA	2	8	717	724	75 %	25 %	0 %	0 %	384359039
5	NC_017177	ATTT	2	8	935	942	25 %	75 %	0 %	0 %	384359039
6	NC_017177	TGTT	2	8	1010	1017	0 %	75 %	25 %	0 %	384359039
7	NC_017177	AAGA	2	8	1184	1191	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017177	TCTA	2	8	1210	1217	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017177	ATTT	2	8	1218	1225	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017177	TTTA	2	8	1261	1268	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017177	TCAA	2	8	1514	1521	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017177	TTTA	2	8	1573	1580	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017177	CATA	2	8	1591	1598	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017177	ATAG	2	8	1612	1619	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017177	TATT	2	8	1698	1705	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017177	TCCT	2	8	1748	1755	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017177	TAAA	2	8	1773	1780	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017177	AATA	2	8	2495	2502	75 %	25 %	0 %	0 %	384359041
19	NC_017177	ATTT	2	8	2580	2587	25 %	75 %	0 %	0 %	384359041
20	NC_017177	TAAA	2	8	3113	3120	75 %	25 %	0 %	0 %	384359041
21	NC_017177	ATGG	2	8	3222	3229	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017177	TAAA	2	8	3440	3447	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017177	TTTA	2	8	3625	3632	25 %	75 %	0 %	0 %	384359042
24	NC_017177	ACAT	2	8	3870	3877	50 %	25 %	0 %	25 %	384359042
25	NC_017177	TAAA	2	8	4188	4195	75 %	25 %	0 %	0 %	384359042
26	NC_017177	TATT	2	8	4565	4572	25 %	75 %	0 %	0 %	384359043
27	NC_017177	ATTT	2	8	4764	4771	25 %	75 %	0 %	0 %	384359043
28	NC_017177	AAGC	2	8	4796	4803	50 %	0 %	25 %	25 %	384359043
29	NC_017177	ATTC	2	8	4880	4887	25 %	50 %	0 %	25 %	384359043
30	NC_017177	ACTT	2	8	5060	5067	25 %	50 %	0 %	25 %	384359043
31	NC_017177	AAAG	2	8	5651	5658	75 %	0 %	25 %	0 %	384359044
32	NC_017177	ATAA	2	8	5822	5829	75 %	25 %	0 %	0 %	384359044
33	NC_017177	TATT	2	8	6518	6525	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017177	AATA	2	8	6537	6544	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017177	ATGT	2	8	6546	6553	25 %	50 %	25 %	0 %	384359046
36	NC_017177	AGAA	2	8	6969	6976	75 %	0 %	25 %	0 %	384359046
37	NC_017177	ATTT	2	8	7407	7414	25 %	75 %	0 %	0 %	384359047
38	NC_017177	AATA	2	8	7596	7603	75 %	25 %	0 %	0 %	384359047
39	NC_017177	TAAA	2	8	8326	8333	75 %	25 %	0 %	0 %	384359048
40	NC_017177	TAAA	2	8	8335	8342	75 %	25 %	0 %	0 %	384359048
41	NC_017177	ATTT	2	8	8478	8485	25 %	75 %	0 %	0 %	384359048
42	NC_017177	ATAA	2	8	9503	9510	75 %	25 %	0 %	0 %	384359049
43	NC_017177	ATTA	2	8	9791	9798	50 %	50 %	0 %	0 %	384359049
44	NC_017177	AAAG	2	8	10113	10120	75 %	0 %	25 %	0 %	384359050
45	NC_017177	AAAC	2	8	10482	10489	75 %	0 %	0 %	25 %	384359050
46	NC_017177	AATT	2	8	10493	10500	50 %	50 %	0 %	0 %	384359050
47	NC_017177	TAAT	2	8	10648	10655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017177	AGAT	2	8	10988	10995	50 %	25 %	25 %	0 %	384359051
49	NC_017177	GAAA	2	8	11756	11763	75 %	0 %	25 %	0 %	384359051
50	NC_017177	AAGT	2	8	11900	11907	50 %	25 %	25 %	0 %	384359051
51	NC_017177	ATTA	2	8	12068	12075	50 %	50 %	0 %	0 %	384359051
52	NC_017177	ATTA	2	8	12257	12264	50 %	50 %	0 %	0 %	384359051
53	NC_017177	TTGT	2	8	12615	12622	0 %	75 %	25 %	0 %	384359052
54	NC_017177	TTTA	3	12	12729	12740	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017177	TAAA	2	8	13027	13034	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017177	AAAT	2	8	13050	13057	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017177	TAAC	2	8	13303	13310	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_017177	TAAT	2	8	13681	13688	50 %	50 %	0 %	0 %	384359054
59	NC_017177	TAAT	2	8	13865	13872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017177	TAAA	2	8	13966	13973	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017177	AAAT	2	8	14004	14011	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017177	GTAT	2	8	14211	14218	25 %	50 %	25 %	0 %	384359055
63	NC_017177	ATCT	2	8	14478	14485	25 %	50 %	0 %	25 %	384359055
64	NC_017177	AAAT	2	8	14651	14658	75 %	25 %	0 %	0 %	384359055
65	NC_017177	ATGG	2	8	14880	14887	25 %	25 %	50 %	0 %	384359055
66	NC_017177	ATTT	2	8	15837	15844	25 %	75 %	0 %	0 %	384359057
67	NC_017177	CTTC	2	8	15860	15867	0 %	50 %	0 %	50 %	384359057
68	NC_017177	ATTT	2	8	15976	15983	25 %	75 %	0 %	0 %	384359057
69	NC_017177	TTTC	2	8	16274	16281	0 %	75 %	0 %	25 %	384359058
70	NC_017177	TAAA	2	8	16374	16381	75 %	25 %	0 %	0 %	384359058
71	NC_017177	GATA	2	8	16654	16661	50 %	25 %	25 %	0 %	384359058
72	NC_017177	AATA	2	8	16798	16805	75 %	25 %	0 %	0 %	384359058
73	NC_017177	TAAT	2	8	17196	17203	50 %	50 %	0 %	0 %	384359058
74	NC_017177	GTAA	2	8	17288	17295	50 %	25 %	25 %	0 %	384359058
75	NC_017177	AAAT	2	8	18108	18115	75 %	25 %	0 %	0 %	384359058
76	NC_017177	AGAA	2	8	18216	18223	75 %	0 %	25 %	0 %	384359058
77	NC_017177	AAAT	2	8	18243	18250	75 %	25 %	0 %	0 %	384359058
78	NC_017177	ATTT	2	8	18604	18611	25 %	75 %	0 %	0 %	384359058
79	NC_017177	TACT	2	8	18985	18992	25 %	50 %	0 %	25 %	384359058
80	NC_017177	ATAA	2	8	19013	19020	75 %	25 %	0 %	0 %	384359058
81	NC_017177	AAGT	2	8	19206	19213	50 %	25 %	25 %	0 %	384359058
82	NC_017177	AAGT	2	8	19291	19298	50 %	25 %	25 %	0 %	384359058
83	NC_017177	ATTT	2	8	20112	20119	25 %	75 %	0 %	0 %	384359058
84	NC_017177	TAAA	2	8	20640	20647	75 %	25 %	0 %	0 %	384359058
85	NC_017177	AAAT	2	8	21402	21409	75 %	25 %	0 %	0 %	384359058
86	NC_017177	GTAA	2	8	21764	21771	50 %	25 %	25 %	0 %	384359058
87	NC_017177	AAAT	2	8	22236	22243	75 %	25 %	0 %	0 %	384359058
88	NC_017177	AGGA	2	8	22560	22567	50 %	0 %	50 %	0 %	384359058
89	NC_017177	CATT	2	8	22720	22727	25 %	50 %	0 %	25 %	384359058
90	NC_017177	GATA	2	8	22852	22859	50 %	25 %	25 %	0 %	384359058
91	NC_017177	AATA	2	8	23135	23142	75 %	25 %	0 %	0 %	384359058
92	NC_017177	GGAA	2	8	23362	23369	50 %	0 %	50 %	0 %	384359058
93	NC_017177	CTTA	2	8	23534	23541	25 %	50 %	0 %	25 %	384359058
94	NC_017177	AATA	2	8	24044	24051	75 %	25 %	0 %	0 %	384359058
95	NC_017177	AGAA	2	8	24221	24228	75 %	0 %	25 %	0 %	384359058
96	NC_017177	TAAA	2	8	24236	24243	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017177	ATTT	2	8	24259	24266	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017177	TCAT	2	8	24446	24453	25 %	50 %	0 %	25 %	384359059
99	NC_017177	TAAG	2	8	24577	24584	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017177	TTTA	2	8	24910	24917	25 %	75 %	0 %	0 %	384359060
101	NC_017177	CCAT	2	8	25000	25007	25 %	25 %	0 %	50 %	384359060
102	NC_017177	ATTT	2	8	25075	25082	25 %	75 %	0 %	0 %	384359060
103	NC_017177	TGTT	2	8	25358	25365	0 %	75 %	25 %	0 %	384359060
104	NC_017177	AGTT	2	8	25591	25598	25 %	50 %	25 %	0 %	384359060
105	NC_017177	ATTT	2	8	25708	25715	25 %	75 %	0 %	0 %	384359060
106	NC_017177	ATTT	2	8	25722	25729	25 %	75 %	0 %	0 %	384359060
107	NC_017177	AATA	2	8	25846	25853	75 %	25 %	0 %	0 %	384359060
108	NC_017177	TAAT	2	8	25906	25913	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017177	AAAG	2	8	25991	25998	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017177	TTTA	2	8	26193	26200	25 %	75 %	0 %	0 %	384359061
111	NC_017177	TCAA	3	12	26300	26311	50 %	25 %	0 %	25 %	384359061
112	NC_017177	ATTT	2	8	26596	26603	25 %	75 %	0 %	0 %	384359061
113	NC_017177	TAAA	2	8	26888	26895	75 %	25 %	0 %	0 %	384359062
114	NC_017177	TACT	2	8	27022	27029	25 %	50 %	0 %	25 %	384359062
115	NC_017177	AGAA	2	8	27054	27061	75 %	0 %	25 %	0 %	384359062
116	NC_017177	ATTT	2	8	27192	27199	25 %	75 %	0 %	0 %	384359062
117	NC_017177	TAAT	2	8	27548	27555	50 %	50 %	0 %	0 %	384359063
118	NC_017177	TAAA	2	8	28211	28218	75 %	25 %	0 %	0 %	384359063
119	NC_017177	AAAT	2	8	28268	28275	75 %	25 %	0 %	0 %	384359063
120	NC_017177	CAAT	2	8	28546	28553	50 %	25 %	0 %	25 %	384359064
121	NC_017177	AAAT	2	8	28914	28921	75 %	25 %	0 %	0 %	384359064
122	NC_017177	TTTA	2	8	29288	29295	25 %	75 %	0 %	0 %	384359065
123	NC_017177	TAAA	2	8	29673	29680	75 %	25 %	0 %	0 %	384359066
124	NC_017177	AAAT	2	8	29746	29753	75 %	25 %	0 %	0 %	384359066
125	NC_017177	ATTT	2	8	29963	29970	25 %	75 %	0 %	0 %	384359067
126	NC_017177	TAAT	2	8	30362	30369	50 %	50 %	0 %	0 %	384359068
127	NC_017177	AGAA	2	8	30692	30699	75 %	0 %	25 %	0 %	384359069
128	NC_017177	GATG	2	8	30725	30732	25 %	25 %	50 %	0 %	384359069
129	NC_017177	AAAT	2	8	30820	30827	75 %	25 %	0 %	0 %	384359069
130	NC_017177	AATA	2	8	30828	30835	75 %	25 %	0 %	0 %	384359069
131	NC_017177	ATTA	2	8	31173	31180	50 %	50 %	0 %	0 %	384359069
132	NC_017177	TGTA	2	8	31255	31262	25 %	50 %	25 %	0 %	384359070
133	NC_017177	TAAT	2	8	32116	32123	50 %	50 %	0 %	0 %	384359071
134	NC_017177	TAAA	2	8	32481	32488	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017177	GTAG	2	8	32560	32567	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017177	TAAT	2	8	32767	32774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017177	TAAA	2	8	32989	32996	75 %	25 %	0 %	0 %	384359072
138	NC_017177	TTGA	2	8	33090	33097	25 %	50 %	25 %	0 %	384359072
139	NC_017177	TTGA	2	8	33204	33211	25 %	50 %	25 %	0 %	384359072
140	NC_017177	ATAA	2	8	33413	33420	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017177	ATAA	2	8	33443	33450	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017177	AACA	2	8	33719	33726	75 %	0 %	0 %	25 %	384359073
143	NC_017177	AATT	2	8	33946	33953	50 %	50 %	0 %	0 %	384359073
144	NC_017177	AACA	2	8	34125	34132	75 %	0 %	0 %	25 %	384359073
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