MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Clostridium difficile BI1

Total Repeats: 4521

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017177	AAT	2	6	110	115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359038
2	NC_017177	TTG	2	6	118	123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384359038
3	NC_017177	AAT	2	6	280	285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359039
4	NC_017177	AGA	2	6	324	329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384359039
5	NC_017177	TGA	2	6	339	344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384359039
6	NC_017177	AAT	2	6	397	402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359039
7	NC_017177	TAT	2	6	429	434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359039
8	NC_017177	TAA	3	9	438	446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359039
9	NC_017177	ATT	2	6	450	455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359039
10	NC_017177	ATT	2	6	497	502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359039
11	NC_017177	AAG	2	6	778	783	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384359039
12	NC_017177	TAA	2	6	903	908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359039
13	NC_017177	TAA	2	6	1033	1038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359039
14	NC_017177	TTA	2	6	1058	1063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017177	ATA	2	6	1095	1100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017177	GAA	2	6	1145	1150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017177	TCT	2	6	1153	1158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017177	TCT	2	6	1283	1288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017177	CTC	2	6	1301	1306	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_017177	CAT	2	6	1422	1427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017177	ATT	2	6	1507	1512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017177	TTC	2	6	1567	1572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017177	TTA	2	6	1625	1630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017177	AAG	2	6	1636	1641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017177	GAA	2	6	1655	1660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017177	TAT	2	6	1763	1768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017177	GAA	2	6	1881	1886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384359040
28	NC_017177	TAA	2	6	1900	1905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359040
29	NC_017177	CTT	2	6	1963	1968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384359040
30	NC_017177	GAA	2	6	1993	1998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384359040
31	NC_017177	TAA	2	6	2006	2011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359040
32	NC_017177	CAG	2	6	2215	2220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384359040
33	NC_017177	ATT	2	6	2276	2281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359040
34	NC_017177	ATA	3	9	2338	2346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017177	TTA	2	6	2406	2411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359041
36	NC_017177	TAA	2	6	2430	2435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359041
37	NC_017177	GAA	3	9	2477	2485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384359041
38	NC_017177	ATA	2	6	2511	2516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359041
39	NC_017177	ATT	4	12	2560	2571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359041
40	NC_017177	ATT	3	9	2634	2642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359041
41	NC_017177	ATT	3	9	2646	2654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359041
42	NC_017177	TAA	2	6	2671	2676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359041
43	NC_017177	TAA	2	6	2689	2694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359041
44	NC_017177	TTA	2	6	2724	2729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359041
45	NC_017177	ATA	2	6	2739	2744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359041
46	NC_017177	AGA	2	6	2875	2880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384359041
47	NC_017177	AAC	2	6	2947	2952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384359041
48	NC_017177	TTA	2	6	3066	3071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359041
49	NC_017177	ATA	2	6	3236	3241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017177	TTA	2	6	3363	3368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017177	TGA	2	6	3377	3382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017177	TAT	2	6	3502	3507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359042
53	NC_017177	ATA	2	6	3559	3564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359042
54	NC_017177	TCT	2	6	3878	3883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384359042
55	NC_017177	AAC	2	6	3933	3938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384359042
56	NC_017177	TTC	2	6	3963	3968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384359042
57	NC_017177	CAA	2	6	4009	4014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384359042
58	NC_017177	TAT	2	6	4227	4232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017177	ATT	2	6	4236	4241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017177	TAT	2	6	4283	4288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017177	CAA	2	6	4317	4322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017177	ATA	2	6	4333	4338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017177	ATT	2	6	4346	4351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359043
64	NC_017177	AGA	2	6	4368	4373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384359043
65	NC_017177	TTA	2	6	4403	4408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359043
66	NC_017177	GAG	2	6	4421	4426	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384359043
67	NC_017177	ATG	2	6	4464	4469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384359043
68	NC_017177	TCA	2	6	4510	4515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384359043
69	NC_017177	TTG	2	6	4539	4544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384359043
70	NC_017177	ATT	2	6	4671	4676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359043
71	NC_017177	CTT	2	6	4775	4780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384359043
72	NC_017177	CTT	2	6	4808	4813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384359043
73	NC_017177	ATT	2	6	4821	4826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359043
74	NC_017177	GTT	2	6	4913	4918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384359043
75	NC_017177	TGT	2	6	4949	4954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384359043
76	NC_017177	TAT	2	6	4962	4967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359043
77	NC_017177	GTA	2	6	4991	4996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384359043
78	NC_017177	TAT	2	6	5108	5113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359043
79	NC_017177	TAT	2	6	5130	5135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359043
80	NC_017177	TTA	2	6	5201	5206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359043
81	NC_017177	TCT	2	6	5245	5250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384359043
82	NC_017177	TCT	2	6	5254	5259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384359043
83	NC_017177	ATT	3	9	5302	5310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359043
84	NC_017177	ATT	2	6	5326	5331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359043
85	NC_017177	TAT	2	6	5379	5384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017177	TAA	2	6	5410	5415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017177	AAT	2	6	5423	5428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017177	TAA	2	6	5480	5485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017177	TAA	3	9	5488	5496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017177	GAG	2	6	5513	5518	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017177	ATT	2	6	5558	5563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017177	ATT	2	6	5575	5580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359044
93	NC_017177	TAA	2	6	5586	5591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359044
94	NC_017177	TTA	2	6	5667	5672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359044
95	NC_017177	TAC	2	6	5830	5835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384359044
96	NC_017177	TAA	2	6	5915	5920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359045
97	NC_017177	TCT	2	6	5976	5981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384359045
98	NC_017177	ATT	2	6	6068	6073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359045
99	NC_017177	ATT	2	6	6083	6088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359045
100	NC_017177	AAT	2	6	6100	6105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359045
101	NC_017177	TTA	2	6	6241	6246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359045
102	NC_017177	ATC	2	6	6335	6340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017177	TAT	2	6	6377	6382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017177	ATA	2	6	6386	6391	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017177	ATG	2	6	6424	6429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017177	ATA	2	6	6571	6576	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359046
107	NC_017177	AGA	2	6	6611	6616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384359046
108	NC_017177	GGA	2	6	6681	6686	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384359046
109	NC_017177	ATT	2	6	6687	6692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359046
110	NC_017177	TTG	2	6	6838	6843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384359046
111	NC_017177	TGA	2	6	6896	6901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384359046
112	NC_017177	TTG	2	6	7056	7061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384359046
113	NC_017177	TTA	2	6	7126	7131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017177	TAA	2	6	7256	7261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359047
115	NC_017177	CAA	2	6	7352	7357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384359047
116	NC_017177	TAA	2	6	7452	7457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359047
117	NC_017177	ATT	2	6	7462	7467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359047
118	NC_017177	GAA	2	6	7477	7482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384359047
119	NC_017177	ATT	2	6	7563	7568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359047
120	NC_017177	TAT	2	6	7668	7673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359047
121	NC_017177	TAA	2	6	7674	7679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359047
122	NC_017177	TAT	2	6	7753	7758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359047
123	NC_017177	TAA	2	6	7809	7814	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359047
124	NC_017177	AAT	2	6	7815	7820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359047
125	NC_017177	AGA	3	9	7947	7955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384359047
126	NC_017177	AAT	2	6	7957	7962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359047
127	NC_017177	TTA	2	6	7990	7995	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384359047
128	NC_017177	AGA	2	6	8019	8024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384359047
129	NC_017177	AGG	2	6	8068	8073	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017177	AGA	2	6	8138	8143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384359048
131	NC_017177	AGA	2	6	8363	8368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384359048
132	NC_017177	AGG	2	6	8377	8382	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384359048
133	NC_017177	TAA	2	6	8408	8413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359048
134	NC_017177	ATA	2	6	8431	8436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384359048
135	NC_017177	ACA	2	6	8451	8456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384359048
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137	NC_017177	CAG	2	6	8784	8789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384359048
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